Pineoblastoma is a clinically aggressive childhood brain tumor composed of distinct molecular subgroups with divergent driver genes, demographics, and clinical outcomes. To identify developmental origins and mechanisms governing disease pathogenesis, we derive single-cell transcriptomes from pineal parenchymal tumors, aligning malignant cells with developmental counterparts to retrace cellular origins. Integrative computational analyses map pineoblastoma origins to transient, cycling pinealocyte progenitors during development. Lineage-specific perturbation of suspected drivers in the early pin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Lung adenocarcinoma (LUAD) remains a leading cause of cancer-related mortality, necessitating identification of novel biomarkers for precision therapy. Herein, we aimed to investigate the role of efferocytosis-related genes (ERGs) in LUAD progression, focusing on ADAM9 as a potential prognostic and therapeutic target.
METHODS: TCGA-LUAD datasets including 517 tumor and 59 normal tissues were applied to perform consensus clustering, LASSO regression, and immune infiltration algorithms. A prognostic model was constructed and validated via survival analysis and nomogram. Single-cell s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanomas display distinct transcriptomic states, but it remains unclear how they associate with clinical outcomes. We performed digital spatial RNA profiling (DSP-RNA) of metastatic tumors from patients to investigate how transcriptomic states correlate with melanoma specific survival (MSS) and acral melanoma (AM). We performed DSP-RNA across a tissue microarray constructed from 111 patients with in-transit metastatic melanoma (ITM) diagnosed from 1990 to 2020. Data quality control, noise correction, and normalization yielded high-quality profiles from 105 patients, including 30 (36%) who rec
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nowadays, most cancer research still depends on traditional cell culture in Petri dishes or cell culture flasks which do not have the ability to mimic physiological-like conditions in vitro. However, the behavior of cancer cells strongly relies on the interaction with their extracellular microenvironment. Consequently, current advanced approaches focus on three-dimensional (3D) cell culture to overcome such limitations and to enable a better understanding of fundamental processes including cancer development, progression, apoptosis and invasion. However, transcriptional adaptation to and tempo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cholangiocarcinoma (CCA) is a highly heterogeneous malignancy with a poor prognosis. However, the molecular mechanisms underlying CCA and its treatment options remain unclear and limited.
AIMS: This study aims to identify novel prognostic biomarkers and potential therapeutic targets for CCA through transcriptomics and whole-exome sequencing analysis.
METHODS AND RESULTS: We analyzed the relationship between overall survival and various risk factors in 255 CCA samples from a published dataset and 36 samples from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database. Transcriptomics analysis was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Pancreatic adenocarcinoma (PAAD) is characterized by a desmoplastic, profoundly immunosuppressive tumor microenvironment (TME). Adhesion G protein-coupled receptors (aGPCRs) regulate cell-matrix interactions and immune modulation, yet their specific roles in PAAD remain poorly understood. This study aimed to identify novel tumor-specific aGPCRs and define their functional and immunological landscape.
MATERIALS AND METHODS: Transcriptomic profiles from The Cancer Genome Atlas (TCGA)-PAAD (n=178+4) and the Genotype-Tissue Expression (GTEx)-Pancreas (n=165) cohorts were integrate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung adenocarcinoma (LUAD) is characterized by marked cellular heterogeneity, yet how malignant epithelial states contribute to immune regulation and clinical outcomes remains incompletely defined. We integrated single-cell RNA-sequencing data to map the cellular landscape of LUAD and identify malignant epithelial cells based on inferred copy-number alterations. Epithelial states were further examined through trajectory inference, transcription factor analysis, and cell-cell communication profiling. Single-cell-derived genes were subsequently integrated with TCGA and independent GEO cohorts to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ObjectiveLung cancer is the leading cause of cancer-related mortality worldwide, with lung adenocarcinoma representing the predominant subtype. The increasing incidence of lung adenocarcinoma underscores the urgent need to establish novel therapeutic targets for clinical intervention.MethodsWe performed Mendelian randomization and colocalization analyses on large-scale lung adenocarcinoma genome-wide association study datasets. Bulk transcriptome and single-cell RNA sequencing were further applied to explore the function of candidate targets and related cell types.ResultsMendelian randomizatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Prostate cancer (PCa) is a leading cause of cancer-related mortality worldwide, highlighting the need for improved prognostic tools. The integration of artificial intelligence (AI) and machine learning (ML) with multi-omics data offers new opportunities for biomarker discovery and risk stratification. Methods: We integrated bulk transcriptomic data from GSE116918 (training, n = 248) and three cross-cohort consistency evaluation cohorts (TCGA-PRAD, GSE70769, GSE46602), focusing on 1087 epithelial-mesenchymal transition (EMT)-associated genes. Using consensus clustering, weighted gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To provide a novel direction for the diagnosis of gastric cancer (GC). The differentially expressed blood microRNAs (miRNAs) in gastric carcinoma were screened through SangerBox using the datasets GSE113486, GSE112264, and GSE113740. The miRNA-target genes prediction, conduct Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) functional enrichment analyses were performed with the Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) 6.8. STRING analysis was further investigated with Cytoscape. The correlations among the expression levels of key miRNAs and p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Solid pseudopapillary neoplasm of the pancreas (SPN) is a rare tumor primarily affecting middle-aged women, typically characterized by indolent behavior but occasionally demonstrating malignant potential through invasive growth and metastasis. To elucidate the molecular mechanisms driving this heterogeneity, a multi-omics approach was applied to analyze paired metastatic lesions, primary tumors, and normal pancreatic tissues. Methylation profiling via the Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChip identified 2425 differentially methylated positions (DMPs) in metastatic versus primary lesions,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Basement membranes (BMs) and tumor-associated macrophages (TAMs) are crucial stromal components in pancreatic cancer (PC), critically influencing disease progression. Bulk and single-cell RNA-seq (scRNA-seq) data were acquired from publicly available databases. Through integration of multiple machine learning algorithms, we developed and validated a BM-related subtype and prognostic signature in PC cohorts. The expression profiles of BM-related genes in PC were verified using experimental approaches. We further investigated the functional mechanisms of a core gene in PC progression. Additional
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung cancer is one of the most prevalent malignancies worldwide, and the metastasis of nonsmall cell lung cancer often leads to rapid deterioration of patient conditions, with brain metastasis (BM) being the most detrimental. The mechanisms underlying lung cancer brain metastasis remain incompletely understood.
OBJECTIVE: This study aimed to elucidate the molecular mechanisms of lung cancer brain metastasis and identify potential biomarkers and therapeutic targets.
METHODS: The high invasiveness of H1975-BM51 cells was verified using Western blotting, cell invasion assays, and th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic cancer (PC) is characterized by an exceptionally poor prognosis, primarily attributable to its aggressive metastatic behavior and high recurrence rates. Liver metastasis is the predominant distant metastasis model of PC. Moreover, invasion and metastasis of PC are closely associated with the remodeling or loss of basement membrane (BM). Consequently, identifying pivotal genes involved in PC liver metastasis (PCLM) and BM could pave the way for more effective and precise targeted therapies. This study aims to construct a prognostic model based on PCLM and BM-related genes
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cryoablation induces antitumor immune responses. Spatial transcriptomic landscape technology has been used to determine the micron-level panoramic transcriptomics of tissue slices in situ.
METHODS: The effects of cryoablation on the immune microenvironment in non-small cell lung cancer (NSCLC) were explored by comparing the Whole Transcriptome Atlas (WTA) panel of immune cells before and after cryoablation using the spatial transcriptomic landscape.
RESULTS: The bioinformatics analysis showed that cryoablation significantly affected the WTA of immune cells, particularly genes rel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Metastasis is the major cause of thyroid cancer morbidity and mortality. However, the mechanisms are still poorly understood.
METHODS: We performed genome-wide transcriptome analysis comparing gene expression profile of metastatic thyroid cancer cells (Met) with primary tumor cells established from transgenic mouse models of papillary thyroid cancer (PTC), follicular thyroid cancer (FTC), poorly differentiated thyroid cancer (PDTC), and anaplastic thyroid cancer (ATC).
RESULTS: Genes involved in tumor microenvironment (TME), inflammation, and immune escape were significantly ov
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Platinum-based chemotherapy resistance remains a critical barrier in colorectal cancer (CRC) treatment. In this study, cytogenetic karyotyping was combined with transcriptomic profiling (RNA-seq) to elucidate resistance mechanisms by comparing two CRC cell lines: oxaliplatin-sensitive HCT116 and its resistant derivative HCT116 oxpl-R. Karyotyping unveiled tetraploidization and extensive genomic rearrangements in resistant cells, accompanied by prominent transcriptomic changes: 1807 differentially expressed genes (1216 upregulated and 519 downregulated). Pathway enrichment highlighted altered r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pleomorphic rhabdomyosarcoma is a rare soft-tissue tumor that occupies an uncertain middle ground between rhabdomyosarcoma and undifferentiated pleomorphic sarcoma. With its relative rarity, aggressiveness, and lack of detailed characterization, it presents a challenging task for therapeutic treatment. In this case study, we use single-cell transcriptomics to investigate the heterogeneous landscape of pRMS and the tumor microenvironment. We demonstrate that the tumor populations in pRMS have a clear division into myogenic and non-myogenic clusters, with the non-myogenic clusters having more nu
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Oncocytic cell tumours (OCTs), previously referred to as Hürthle cell tumours of the thyroid, are a subset of thyroid and endocrine neoplasms that pose diagnostic and therapeutic challenges owing to their unpredictable clinical behaviour. The transcriptomic and proteomic landscapes of OCTs remain poorly characterized compared with those of mitochondrion-rich neoplasms (MRNs: thyroid tumours with ≥75% oncocytic cells that share similar morphology but harbour nuclear driver mutations consistent with their respective histotypes rather than mitochondrial alterations).
METHODS: We pe
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are key regulators of gene expression with critical roles in oncogenic signaling. Endometrial cancer (EC) has been redefined with the identification of POLE-ultramutated tumors which, despite their hypermutated phenotype, show more favorable prognosis. We profiled miRNA expression in tumor tissues from forty (40) EC patients and twenty (20) healthy controls using qPCR panels. POLE exonuclease domain mutations (P286R, V411L) were genotyped, and subgroup analyses were conducted between POLE-mutated (n = 7) and POLE-wild-type (n = 33) tumors. Bioinformatic analyses included val
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования