CONTEXT: Analysis of diagnostic information in pathology reports for the purposes of clinical or translational research and quality assessment/control often requires manual data extraction, which can be laborious, time-consuming, and subject to mistakes.
OBJECTIVE: We sought to develop, employ, and evaluate a simple, dictionary- and rule-based natural language processing (NLP) algorithm for generating searchable information on various types of parameters from diverse surgical pathology reports.
DESIGN: Data were exported from the pathology laboratory information system (LIS) into extensible
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying organs within histology images is a fundamental and non-trivial step in toxicological digital pathology workflows as multiple organs often appear on the same whole slide image (WSI). Previous works in automated tissue classification have investigated the use of single magnifications, and demonstrated limitations when attempting to identify small and contiguous organs at low magnifications. In order to overcome these shortcomings, we present a multi-magnification convolutional neural network (CNN), called MMO-Net, which employs context and cellular detail from different magnificatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early detection of tooth-related diseases in patients plays a key role in maintaining their dental health and preventing future complications. Since dentists are not overly attentive to tooth-related diseases that may be difficult to judge visually, many patients miss timely treatment. The 5 representative tooth-related diseases, that is, coronal caries or defect, proximal caries, cervical caries or abrasion, periapical radiolucency, and residual root can be detected on panoramic images. In this study, a web service was constructed for the detection of these diseases on panoramic i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to identify and assess the prevalence of vaccine-hesitancy-related topics on Twitter in the periods before and after the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) outbreak. Using a search query, 272,780 tweets associated with anti-vaccine topics and posted between 1 January 2011, and 15 January 2021, were collected. The tweets were classified into a list of 11 topics and analyzed for trends during the periods before and after the onset of COVID-19. Since the beginning of COVID-19, the percentage of anti-vaccine tweets has increased for two topics, "government and politics" and "cons
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe the design, implementation, and impact of a data harmonization, data quality checking, and dynamic report generation application in an international observational HIV research network. The IeDEA Harmonist Data Toolkit is a web-based application written in the open source programming language R, employs the R/Shiny and RMarkdown packages, and leverages the REDCap data collection platform for data model definition and user authentication. The Toolkit performs data quality checks on uploaded datasets, checks for conformance with the network's common data model, displays the results bo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Learning causal effects from observational data, e.g. estimating the effect of a treatment on survival by data-mining electronic health records (EHRs), can be biased due to unmeasured confounders, mediators, and colliders. When the causal dependencies among features/covariates are expressed in the form of a directed acyclic graph, using do-calculus it is possible to identify one or more adjustment sets for eliminating the bias on a given causal query under certain assumptions. However, prior knowledge of the causal structure might be only partial; algorithms for causal structure discovery ofte
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with Type I Diabetes (T1D) must take insulin injections to prevent the serious long term effects of hyperglycemia. They must also be careful not to inject too much insulin because this could induce (potentially fatal) hypoglycemia. Patients therefore follow a "regimen" that determines how much insulin to inject at each time, based on various measurements. We can produce an effective regimen if we can accurately predict a patient's future blood glucose (BG) values from his/her current features. This study explores the challenges of predicting future BG by applying a number of machine l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iron is a vital mineral for the proper function of hemoglobin which is also a protein needed to transport oxygen in the blood. The lack of iron in human blood causes a range of serious health problems including "anemia." In this article, the COntAneRS (Clinical ONTology-based Iron Deficiency-ANEmia- Recommendation System) is proposed as a clinical decision support system to diagnose iron deficiency and manage its treatment. The applied methodologies and main technical contributions of this study are discussed in four aspects: (1) Iron Deficiency Domain Ontology (IDDOnt), (2) Semantic Web Rule
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Study the impact of local policies on near-future hospitalization and mortality rates.
MATERIALS AND METHODS: We introduce a novel risk-stratified SIR-HCD model that introduces new variables to model the dynamics of low-contact (e.g., work from home) and high-contact (e.g., work on-site) subpopulations while sharing parameters to control their respective R0(t) over time. We test our model on data of daily reported hospitalizations and cumulative mortality of COVID-19 in Harris County, Texas, from May 1, 2020, until October 4, 2020, collected from multiple sources (USA FACTS, U.S. B
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Electronic medical records (EMRs) contain large amounts of rich clinical information. Developing EMR-based case definitions, also known as EMR phenotyping, is an active area of research that has implications for epidemiology, clinical care, and health services research.
OBJECTIVE: This review aims to describe and assess the present landscape of EMR-based case phenotyping for the Charlson conditions.
METHODS: A scoping review of EMR-based algorithms for defining the Charlson comorbidity index conditions was completed. This study covered articles published between January 2000 and
СтатьяScoping ReviewПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Novel coronavirus disease 2019 (COVID-19) vaccine administration has faced distribution barriers across the United States. We sought to delineate our vaccine delivery experience in the first week of vaccine availability, and our effort to prioritize employees based on risk with a goal of providing an efficient infrastructure to optimize speed and efficiency of vaccine delivery while minimizing risk of infection during the immunization process.
OBJECTIVE: This article aims to evaluate an employee prioritization/invitation/scheduling system, leveraging an integrated electronic healt
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congestive Heart Failure (CHF) is among the most prevalent chronic diseases worldwide, and is commonly associated with comorbidities and complex health conditions. Consequently, CHF patients are typically hospitalized frequently, and are at a high risk of premature death. Early detection of an envisaged patient disease trajectory is crucial for precision medicine. However, despite the abundance of patient-level data, cardiologists currently struggle to identify disease trajectories and track the evolution patterns of the disease over time, especially in small groups of patients with specific d
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This article investigates the association between changes in electronic health record (EHR) use during the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic on the rate of burnout, stress, posttraumatic stress disorder (PTSD), depression, and anxiety among physician trainees (residents and fellows).
METHODS: A total of 222 (of 1,375, 16.2%) physician trainees from an academic medical center responded to a Web-based survey. We compared the physician trainees who reported that their EHR use increased versus those whose EHR use stayed the same or decreased on outcomes related to depressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic health conditions are on the rise and are putting high economic pressure on health systems, as they require well-coordinated prevention and treatment. Among chronic conditions, chronic wounds such as cardiovascular leg ulcers have a high prevalence. Their treatment is highly interdisciplinary and regularly spans multiple care settings and organizations; this places particularly high demands on interoperable information exchange that can be achieved using international semantic standards, such as Systematized Nomenclature of Medicine-Clinical Terms (SNOMED CT).
OBJECTIVE: T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Guillain-Barré Syndrome (GBS) is a neurological disorder affecting people of any age and sex, mainly damaging the peripheral nervous system. GBS is divided into several subtypes, in which only four are the most common, demanding different treatments. Identifying the subtype is an expensive and time-consuming task. Early GBS detection is crucial to save the patient's life and not aggravate the disease. This work aims to provide a primary screening tool for GBS subtypes fast and efficiently without complementary invasive methods, based only on clinical variables prospected in consultation, taken
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute coronary syndrome (ACS) in women is a growing public health issue and a death leading cause. We explored whether the hospital healthcare trajectory was characterizable using a longitudinal clustering approach in women with ACS. From the 2009-2014 French nationwide hospital database, we extracted spatio-temporal patterns in ACS patient trajectories, by replacing the spatiality by their hospitalization cause. We used these patterns to characterize hospital healthcare flows in a visualization tool. We clustered these trajectories with kmlShape to identify time gap and tariff profiles. ACS h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glaucoma is a serious eye disease characterized by dysfunction and loss of retinal ganglion cells (RGCs) which can eventually lead to loss of vision. Robust mass screening may help to extend the symptom-free life for the affected patients. The retinal optic nerve fiber layer can be assessed using optical coherence tomography, scanning laser polarimetry (SLP), and Heidelberg Retina Tomography (HRT) scanning methods which, unfortunately, are expensive methods and hence, a novel automated glaucoma diagnosis system is needed. This paper proposes a new model for mass screening that aims to decrease
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic kidney disease (DKD) is one of the most crucial causes of chronic kidney disease (CKD). However, the efficacy and biomedical mechanisms of Chinese herbal medicine (CHM) for DKD in clinical settings remain unclear.
OBJECTIVE: This study aimed to analyze the outcomes of DKD patients with CHM-only management and the possible molecular pathways of CHM by integrating web-based biomedical databases and real-world clinical data.
METHODS: A total of 152,357 patients with incident DKD from 2004 to 2012 were identified from the National Health Insurance Research Database (NHIRD) i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Keratoconus is a disorder characterized by progressive thinning and distortion of the cornea. If detected at an early stage, corneal collagen cross-linking can prevent disease progression and further visual loss. Although advanced forms are easily detected, reliable identification of subclinical disease can be problematic. Several different machine learning algorithms have been used to improve the detection of subclinical keratoconus based on the analysis of multiple types of clinical measures, such as corneal imaging, aberrometry, or biomechanical measurements.
OBJECTIVE: The aim
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Predictive models for critical events in the intensive care unit (ICU) might help providers anticipate patient deterioration. At the heart of predictive model development lies the ability to accurately label significant events, thereby facilitating the use of machine learning and similar strategies. We conducted this study to establish the validity of an automated system for tagging respiratory and hemodynamic deterioration by comparing automatic tags to tagging by expert reviewers.
METHODS: This retrospective cohort study included 72,650 unique patient stays collected from Electro
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования