BACKGROUND: Pichia pastoris (Komagataella phaffii) is a promising production host, but the usage of methanol limits its application in the medicine and food industries.
RESULTS: To improve the constitutive expression of heterologous proteins in P. pastoris, four new potential transcription regulators (Loc1p, Msn2p, Gsm1p, Hot1p) of the glyceraldehyde triphosphate dehydrogenase promoter (pGAP) were revealed in this study by using cellulase E4 as reporter gene. On this basis, a series of P. pastoris strains with knockout or overexpression of transcription factors were constructed and the deleti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The C1 and C2 alcohols hold great promise as substrates for biomanufacturing due to their low cost and rich resources. Pichia pastoris is considered a preferred host for methanol and ethanol bioconversion due to its natural utilization of methanol and ethanol. However, the scarcity of strong and tightly regulated alcohol-inducible promoters limits its extended use. This study aimed to develop enhanced methanol- and ethanol-inducible promoters capable of improving gene expression in P. pastoris. Rational design strategies were employed to rewire the upstream regulatory sequence of the methanol-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
C. glabrata is an opportunistic fungal pathogen and the second most common cause of opportunistic fungal infections in humans, that has evolved virulence factors to become a successful pathogen: strong resistance to oxidative stress, capable to adhere and form biofilms in human epithelial cells as well as to abiotic surfaces and high resistance to xenobiotics. Hst1 (a NAD+-dependent histone deacetylase), Sum1 (putative DNA binding protein) and Rfm1 (connector protein) form a complex (HRS-C) and control the resistance to oxidative stress, to xenobiotics (the antifungal fluconazole), and adheren
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isolation and identification of Cryptococcus neoformans and pathogenic yeast-like fungi from pigeon droppings has been taken for a long time and requires various nutrients for its growth. In this study, we attempted to establish a rapid direct identification method of Cr. neoformans from pigeon dropping samples by nested-PCR using internal transcribed spacer (ITS) CAP64 and CNLAC1 genes, polysaccharide capsule gene and laccase-associated gene to produce melanin pigment, respectively, which are common genes of yeasts. The ITS and CAP64 genes were amplified in all pathogenic yeasts, but CNLAC1 w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The filamentous fungus Penicillium chrysogenum is used for the industrial production of β-lactam antibiotics. The pathway for β-lactam biosynthesis has been resolved and involves the enzyme phenylacetic acid CoA ligase that is responsible for the CoA activation of the side chain precursor phenylacetic acid (PAA) that is used for the biosynthesis of penicillin G. To identify ABC transporters related to β-lactam biosynthesis, we analyzed the expression of all 48 ABC transporters present in the genome of P. chryso-genum when grown in the presence and absence of PAA. ABC40 is significantly upregul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida albicans is a clinically significant fungal pathogen capable of adapting to diverse host environments, including steep oxygen gradients ranging from ~21% oxygen to anaerobic. The ability to withstand varied oxygen levels is paramount to establishing colonization and persisting in host niches, and oxygen deprivation can also augment antifungal resistance. In this study, we used RNA sequencing to compare the global transcriptomic profiles of two strains of C. albicans (SC5314 and CHN1) grown purely anaerobically to those grown aerobically. In C. albicans SC5314, we observed a strong indu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Antifungal resistance and tolerance are distinct responses exhibited by fungi when exposed to drugs. While considerable research has focused on azole tolerance in the human pathogen Candida albicans, studies in other fungal species remain limited.
OBJECTIVE: This study aims to conduct a comparative investigation of the adaptation of the model organism Saccharomyces cerevisiae and C. albicans to fluconazole in vitro.
METHODS: We performed experiments using laboratory strains of S. cerevisiae and C. albicans to evaluate their fluconazole tolerance and resistance under varying tem
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida albicans infection development depends on several factors associated with this etiological agent, including secreted aspartyl protease (Sap) production. Sap expression commonly occurs under selective pressure caused by the presence of antifungals. Fluconazole is the main antifungal drug used for treatment or prophylaxis. This study investigated the influence of inhibitory and sub-inhibitory fluconazole concentrations on Sap activity and their gene transcription for three clinical C. albicans isolates. Two isolates presented significant increases in Sap activity and transcription of SAP
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Penicillins and cephalosporins are beta-lactam antibiotics. The formation of hydrophobic penicillins has been reported in fungi only, notably Penicillium chrysogenum and Aspergillus (Emericella) nidulans, whereas the hydrophilic cephalosporins are produced by both fungi, e.g., Acremonium chrysogenum (cephalosporin C), and bacteria. The producing bacteria include Gram-negatives and Gram-positives, e.g., Streptomyces clavuligerus (cephamycin C) and Lysobacter lactamgenus (cephabacins), respectively. The evolutionary origin of beta-lactam biosynthesis genes has been the subject of discussion for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pullulan is an important polysaccharide. Although its synthetic pathway in Aureobasidium melanogenum has been elucidated, the mechanism underlying its biosynthesis as regulated by signaling pathway and transcriptional regulator is still unknown. In this study, it was found that the expression of the UGP1 gene encoding UDPG-pyrophosphorylase (Ugp1) and other genes which were involved in pullulan biosynthesis was controlled by the transcriptional activator Msn2 in the nuclei of yeast-like fungal cells. The Ugp1 was a rate-limiting enzyme for pullulan biosynthesis. In addition, the activity and s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emerging Candidozyma auris (formerly known as Candida auris, C. auris) has caused several outbreaks globally. While several studies explored the resistant biofilm formed by C. auris, little is known regarding the cells dispersed following biofilm formation. Herein, I investigated and characterized the cells dispersed from C. auris biofilms. Cells dispersed from biofilm developed in 96 well plate were isolated and counted. The antifungal susceptibility testing showed that the dispersed cells display similar antifungal susceptibility as the parent planktonic cells, except amphotericin B. Gen
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Major mechanisms of azole resistance in Aspergillus fumigatus involve overexpression of the azole target protein encoded by cyp51A. The elevated expression originates from the duplication of an enhancer element in its promoter, serving as a binding platform for AtrR and SrbA, two central transcription factors that orchestrate the activation of ergosterol biosynthesis genes and azole resistance. Alongside AtrR and SrbA, several other transcription factors were shown to be crucial to mediate azole tolerance. Here, we unveil RttA as a further protein involved in the regulation of ergosterol biosy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sexual development is a fundamental process that promotes environmental adaptation and the emergence of highly virulent and drug-resistant isolates in the human fungal pathogen Cryptococcus neoformans. Although the genetic factors involved in the sexual life cycle have been extensively investigated in this pathogenic fungus, the critical regulator(s) beyond transcriptional machinery remain poorly understood. Rei1, a conserved C2H2-type zinc finger protein, functions as a 60S ribosome biogenesis factor and plays a crucial role in maintaining cellular growth at low temperature in yeast. In this
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fungi produce millions of clonal asexual conidia (spores) that remain dormant until favourable conditions occur. Conidia contain abundant stable messenger RNAs but the mechanisms underlying the production of these transcripts and their composition and functions are unknown. Here, we report that the conidia of three filamentous fungal species (Aspergillus nidulans, Aspergillus fumigatus, Talaromyces marneffei) are transcriptionally active and can synthesize mRNAs. We find that transcription in fully developed conidia is modulated in response to changes in the environment until conidia leave the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Las21 (Yj1062W) is a member of the major facilitator super family, possessing multimembrane spanning domains. The LAS21 gene was identified as a responsible gene for a Saccharomyces cerevisiae mutan which shows sensitivity to a local anestheticum, tetracaine. The null las21 mutant (las21 delta) is viable but shows temperature sensitive growth. We found, in addition to this phenotype, that the las21 delta strain shows a number of defects; mating deficiency, calcofluor resistance, and formation of Zymolyase sensitive spores. Temperature sensitive growth of the las21 delta mutant was found to be
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Cryptococcus neoformans is the leading cause of fungal meningitis worldwide. Previous studies have characterized the cryptococcal transcriptome under various stress conditions, but a comprehensive profile of the C. neoformans transcriptome in the human host has not been attempted. Here, we extracted RNA from yeast cells taken directly from the cerebrospinal fluid (CSF) of two AIDS patients with cryptococcal meningitis prior to antifungal therapy. The patients were infected with strains of C. neoformans var. grubii of molecular type VNI and VNII. Using RNA-seq, we compared the trans
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Upon exposure to echinocandins, growing yeast cells begin to accumulate cell wall damage and eventually die, resulting in therapeutic effects. While resistance to echinocandins is well studied, tolerance and persistence mechanisms that may also contribute to clinical failures and relapses remain understudied. In time-kill assays with micafungin in vitro, the opportunistic pathogen Candida glabrata exhibited biphasic kinetics of cell death. Modeling with exponential decay equations distinguished a fast-dying major population from a slow-dying minor population, indicative of persiste
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent data suggests one fungus, Aspergillus fumigatus, causes more deaths annually than HIV or malaria combined. Coupled with rapid emergence of antifungal drug resistance, the limited range of effective treatments, and mortality rates of >50%, aspergillosis represents a major challenge in infectious diseases. Recent studies have identified long-noncoding RNAs (lncRNAs) involved in drug resistance and virulence in pathogenic yeasts such as Candida spp. However, there is very limited knowledge of lncRNAs in human pathogenic moulds, including A. fumigatus. Here we exploit transcriptomics data o
DatasetСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The small ubiquitin-like modifier (SUMO) is pivotal to SUMOylation and exerts diverse roles in filamentous fungi, yet its roles in the production of carbohydrate-active enzymes (CAZymes) and organic acids remain unclear and few studies have addressed its functions in Aspergillus niger, a filamentous fungus with dual roles in food fermentation and food spoilage. This study identified a single SUMO homologue (Smt3) in Pu-erh tea-isolated A. niger RAF106 and characterized its functions via multi-phenotypic and transcriptional analyses. smt3 deletion caused defects in fungal growth, correlating wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Infections caused by the emerging pathogenic yeast Clavispora (Candida) lusitaniae can be difficult to manage due to multi-drug resistance. Resistance to the frontline antifungal fluconazole (FLZ) in Candida spp. is commonly acquired through gain-of-function (GOF) mutations in the gene encoding the transcription factor Mrr1. These activated Mrr1 variants enhance FLZ efflux via upregulation of the multi-drug transporter gene MDR1. Recently, it was reported that, unlike in the well-studied Candida albicans species, C. lusitaniae and Candida parapsilosis with activated Mrr1 also have
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования