Microbacterium species have been isolated from a wide range of hosts and environments, including heavy metal-contaminated sites. Here, we present a comprehensive analysis on the phylogenetic distribution and the genetic potential of 70 Microbacterium belonging to 20 different species isolated from heavy metal-contaminated and non-contaminated sites with particular attention to secondary metabolites gene clusters. The analyzed Microbacterium species are divided in three main functional clades. They share a small core genome (331 gene families covering basic functions) pointing to high genetic d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Talaromyces marneffei (T. marneffei) is a medically important opportunistic dimorphic fungus that infects both humans and bamboo rats. However, the mechanisms of transmission and pathogenicity of T. marneffei are poorly understood. In our study, we combined Illumina and PacBio sequencing technologies to sequence and assemble a complete genome of T. marneffei. To elucidate the transmission route and source, we sequenced three additional T. marneffei isolates using Illumina sequencing technology. Variations among isolates were used to develop a multilocus sequence typing (MLST) system comprising
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acyl carrier proteins (ACPs) are central hubs in polyketide and fatty acid biosynthetic pathways, but the fast motions of the ACP's phosphopantetheine (Ppant) arm make its conformational dynamics difficult to capture using traditional spectroscopic approaches. Here we report that converting the terminal thiol of Escherichia coli ACP's Ppant arm into a thiocyanate activates this site to form a selective cross-link with the active site cysteine of its partner ketoacyl synthase (FabF). The reaction releases a cyanide anion, which can be detected by infrared spectroscopy. This represents a practic
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanin pigments are substances produced by a broad variety of pathogenic microorganisms, including bacteria, fungi, and helminths. Microbes predominantly produce melanin pigment via tyrosinases, laccases, catecholases, and the polyketide synthase pathway. In fungi, melanin is deposited in the cell wall and cytoplasm, and melanin particles ("ghosts") can be isolated from these fungi that have the same size and shape of the original cells. Melanin has been reported in several human pathogenic dimorphic fungi including Paracoccidioides brasiliensis, Sporothrix schenckii, Histoplasma capsulatum,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of antimicrobial resistance necessitates the exploration of novel bioactive compounds. We conducted this study to explore the biological capabilities of R6, an endophytic actinomycete isolated from Ocimum tenuiflorum. The strain exhibited significant antibacterial activity, particularly against ESBL-producing Escherichia coli (20 mm) and Klebsiella pneumoniae (25 mm). Moderate antifungal activity was also observed against Aspergillus fumigatus (9–10 mm). Cytotoxicity screening using the MTT assay revealed 75% cell mortality at 100 mg/mL against Baby Hamster Kidney fibroblast (BHK
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maklamicin, which is produced by the endophytic Micromonospora sp. NBRC 110955, is a spirotetronate-class antibiotic possessing anti-microbial activity against Gram-positive bacteria, and has several unique structural features different from other spirotetronates. Here we describe identification and characterization of the maklamicin biosynthetic (mak) gene cluster through draft genome sequencing, genomic library screening, and gene disruption. Sequence analysis revealed that a plausible maklamicin cluster resides in a 152 kb DNA region encoding 46 open reading frames, 24 of which can be assig
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Climate change-associated abiotic stresses threaten agricultural productivity, creating a need for sustainable strategies that improve plant resilience. Pteridic acids F and H (PTA-F and PTA-H), originally isolated from Streptomyces iranensis HM 35, are plant growth-promoting polyketides with reported activity under drought and salinity stress. However, reported production was extremely low (~ 0.08 and 0.02 mg/L), limiting further development and application. Here, we established a heterologous production platform for PTA biosynthesis by cloning the 68-kb type I polyketide synthase biosyntheti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colibactins are hybrid polyketide-nonribosomal peptides produced by Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, and other Enterobacteriaceae harboring the pks genomic island. These genotoxic metabolites are produced by pks-encoded peptide-polyketide synthases as inactive prodrugs called precolibactins, which are then converted to colibactins by deacylation for DNA-damaging effects. Colibactins are bona fide virulence factors and are suspected of promoting colorectal carcinogenesis when produced by intestinal E. coli Natural active colibactins have not been isolated, and how they induce DNA damage
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tetracyclines are clinically important aromatic polyketides whose biosynthesis is catalysed by bacterial type II polyketide synthases (PKSs). Tetracyclines are biosynthesized starting with an amide-containing malonamate starter unit and the resulting C-2 carboxyamide is critical for the antibiotic activities. In this work, we genetically verified that an amidotransferase, OxyD, and a thiolase, OxyP, are involved in the biosynthesis and incorporation of the starter unit. First, two mutations, R248T and D268N, were found to be present in OxyD* encoded in Streptomyces rimosus ATCC 13224, a strain
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The oligoketide ('polyketide') synthase leading to the formation of proansamycin X in Amycolatopsis mediterranei also prematurely releases a range of acyclic intermediates from the enzyme complex. We intended to study the chemical biology of this ectopic chain release using RifA as a model protein system; however, we were unable to clone the rifA gene in its entirety. Restriction analysis of cosmid clones revealed that rifA is subject to random deletions at high frequency, especially in central regions of the locus. Examination of the gene sequence in this region reveals a high concentration o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing bacterial resistance to antibiotics with conventional targets has focused attention on antibiotics with unconventional targets. One promising candidate, the acetyl-CoA carboxylase (ACC) inhibitor andrimid, is a potent, broad-spectrum antibiotic with high selectivity for prokaryotic ACC. Here, we report the use of a DNA-based approach to clone the andrimid biosynthetic gene cluster from Pantoea agglomerans, yielding a cosmid that confers robust andrimid production on Escherichia coli. This gene cluster encodes a hybrid nonribosomal peptide/polyketide (NRP/PK) synthase with several un
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peloruside A, a polyketide macrolide identified in the marine sponge Mycale hentscheli, is a promising anticancer drug candidate due to its ability to stabilize tubulin at a nontaxoid binding site. Substantial efforts were made to improve the supply of this scarce substance through chemical synthesis and mariculture, however, sustainable production has yet to be achieved. Recent microbiome sequencing suggested that bacterial producers are responsible for all M. hentscheli bioactive compounds, but the identity of the peloruside producer remained unknown. Furthermore, a candidate peloruside poly
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rifamycin and its derivatives are natural products that belong to the class of antibiotic-active polyketides and have significant therapeutic relevance within the therapy scheme of tuberculosis, a worldwide infectious disease caused by Mycobacterium tuberculosis. Improving the oral bioavailability of rifamycin B was achieved through semisynthetic modifications, leading to clinically effective derivatives such as rifampicin. Genetic manipulation of the rifamycin polyketide synthase gene cluster responsible for the production of rifamycin B in the Amycolatopsis mediterranei strain S699 represent
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tetracyclines (TCs) are medically important antibiotics from the polyketide family of natural products. Chelocardin (CHD), produced by Amycolatopsis sulphurea, is a broad-spectrum tetracyclic antibiotic with potent bacteriolytic activity against a number of Gram-positive and Gram-negative multi-resistant pathogens. CHD has an unknown mode of action that is different from TCs. It has some structural features that define it as 'atypical' and, notably, is active against tetracycline-resistant pathogens. Identification and characterization of the chelocardin biosynthetic gene cluster from A. sulph
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemical investigation on fermented products by the fungal strain Westerdykella dispersa Ca4-13 isolated from edible oysters Crassostrea angulata collected from Taiwan resulted in the isolation of seven chemical entities. Their structures were elucidated by spectroscopic analysis to be westeroic acid A (1), westeroic acid B (2), westeroic acid C (3), auranticin A (4), auranticin B (5), pilobolusone C (6), and epi-radicinol (7). Among these, westeroic acid A (1) is a novel C14 polyketide with a γ-lactone functionality, while westeroic acids B (2) and C (3) are two rare C28 polyketides with a un
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Six new 36-membered polyol macrolides, kronopolitides A-F (1-6), active against Trypanosoma cruzi were isolated by bioassay-guided fractionation from an extract of the strain Streptomyces kronopolitis CA-143054. Kronopolitides were identified from the screening of microbial natural products libraries using a high-throughput parasite cell-based phenotypic imaging platform targeting identification of new bioactive compounds against the parasites Leishmania donovani and Trypanosoma cruzi. The planar structures were determined using a combination of 1D and 2D NMR data and HRMS. The relative and ab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite the potential for faster postoperative recovery and the ease of direct intraoperative injection, intrathecal morphine is rarely provided in lumbar spine surgery.
OBJECTIVE: To evaluate the safety and efficacy of intrathecal morphine following lumbar fusion.
METHODS: We randomly assigned 150 patients undergoing elective instrumented lumbar fusion to receive a single intrathecal injection of morphine (0.2 mg) or placebo (normal saline) immediately prior to wound closure. The primary outcome was pain on the visual-analogue scale during the first 24 h after surgery. Secondary
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic bacteria of the Burkholderia pseudomallei group cause severe infectious diseases such as glanders and melioidosis. Malleicyprols were identified as important bacterial virulence factors, yet the biosynthetic origin of their cyclopropanol warhead has remained enigmatic. By a combination of mutational analysis and metabolomics we found that sulfonium acids, dimethylsulfoniumpropionate (DMSP) and gonyol, known as osmolytes and as crucial components in the global organosulfur cycle, are key intermediates en route to the cyclopropanol unit. Functional genetics and in vitro analyses uncov
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Based on genomic analysis, polyketide synthase (PKS) and nonribosomal peptide synthetase (NRPS) pathways account for biosynthesis of the majority of the secondary metabolites produced by the entomopathogenic fungus Metarhizium robertsii. To evaluate the contribution of these pathways to M. robertsii fitness and/or virulence, mutants deleted for mrpptA, the Sfp-type 4' phosphopantetheinyl transferase gene required for their activation were generated. ΔmrpptA strains were deficient in PKS and NRPS activity resulting in colonies that lacked the typical green pigment and failed to produce the nonr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A marine-derived actinobacteria Streptomyces sp. M10 was identified as a prolific antifungal compounds producer and shared a 99.02 % 16S ribosomal RNA (rRNA) sequence similarity with that of Streptomyces marokkonensis Ap1(T), which can produce polyene macrolides. To further evaluate its biosynthetic potential, the 7,207,169 bp Streptomyces sp. M10 linear chromosome was sequenced and mined for identifiable secondary metabolite-associated gene clusters. A total of 20 secondary metabolite-associated gene clusters were deduced, including three polyketide synthases (PKSs), four non-ribosomal peptid
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования