The assembly of peptides into ordered nanostructures is increasingly recognized as both a bioengineering tool for generating new materials and a critical aspect of aggregation processes that underlie neurological diseases such as Alzheimer's disease, Parkinson's disease, and Huntington's disease. There is a major problem in understanding how extremely subtle sequence changes can lead to profound and often unexpected differences in self-assembly behavior. To better delineate the complex interplay of different microscopic driving forces in such cases, we develop a methodology to quantify and com
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Gram-negative bacteria, the peptidoglycan (PG) cell wall is a significant structural barrier for outer membrane protein assembly. In Aeromonas hydrophila, outer membrane multimerization of the type II secretion system (T2SS) secretin ExeD requires the function of the inner membrane assembly factor complex ExeAB. The putative mechanism of the complex involves the reorganization of PG and localization of ExeD, whereby ExeA functions by interacting with PG to form a site for secretin assembly and ExeB forms an interaction with ExeD. This mechanism led us to hypothesize that increasing the pore
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Macromolecular crowding has a profound impact on reaction rates and the physical properties of the cell interior, but the mechanisms that regulate crowding are poorly understood. We developed genetically encoded multimeric nanoparticles (GEMs) to dissect these mechanisms. GEMs are homomultimeric scaffolds fused to a fluorescent protein that self-assemble into bright, stable particles of defined size and shape. By combining tracking of GEMs with genetic and pharmacological approaches, we discovered that the mTORC1 pathway can modulate the effective diffusion coefficient of particles ≥20 nm in d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammation, the process aimed at restoring homeostasis after an insult, can be more damaging than the insult itself if uncontrolled, excessive, or prolonged. The inflammasome is an intracellular multimeric protein complex that regulates the maturation and release of proinflammatory cytokines of the IL-1 family in response to pathogens and endogenous danger signals. Growing evidence indicates that the inflammasome plays a key role in the pathogenesis of acute and chronic respiratory diseases. The inflammasome can be activated by the pathogens that account for the most prevalent infectious dis
СтатьяПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Among post-translational modifications of chromatin proteins taking place in DNA double strand break (DSB) repair, acetylation plays a prominent role. This review lists several facts and hypotheses concerning this process. Lack of acetyltransferase TIP60 (HIV-Tat interacting protein of 60 kDa) activity results in cells with defective DSB repair. The enzyme is present in the nucleus in a multimeric protein complex. TIP60 dependent activation of ATM (ataxia telangiectasia mutated kinase) is an early event in the response to DNA breakage. Other important acetylations are those of histones H4 and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The collagen IV scaffold serves as a fundamental structural unit of the basement membrane (BM). Understanding its structure, assembly, and function is essential for tissue engineering, the design of organoid models, and developing therapies for diseases such as Alport syndrome, Gould syndrome, psoriasis, eye abnormalities, hearing loss, and others, where collagen IV is required for structural integrity and functionality of the BM. The collagen IV molecule is a 400 nm long heterotrimer, comprising non-collagenous 1 (NC1), collagenous, and 7S domains. The assembly of the collagen IV scaffold inv
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyanobacteria are responsible for up to 80% of aquatic carbon dioxide fixation and have evolved a specialized carbon concentrating mechanism to increase photosynthetic yield. As such, cyanobacteria are attractive targets for synthetic biology and engineering approaches to address the demands of global energy security, food production, and climate change for an increasing world's population. The bicarbonate transporter BicA is a sodium-dependent, low-affinity, high-flux bicarbonate symporter expressed in the plasma membrane of cyanobacteria. Despite extensive biochemical characterization of Bic
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD) is a fatal neurodegenerative disorder resulting from an abnormal expansion of polyglutamine (polyQ) repeats in the N-terminus of the huntingtin protein. When the polyQ tract surpasses 35 repeats, the mutated protein undergoes misfolding, culminating in the formation of intracellular aggregates. Research in mouse models suggests that HD pathogenesis involves the aggregation of N-terminal fragments of the huntingtin protein (htt). These early oligomeric assemblies of htt, exhibiting diverse characteristics during aggregation, are implicated as potential toxic entities i
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human von Willebrand factor (vWF) plays a pivotal role in the mechanisms of blood clotting and platelet thrombus formation; it also binds and stabilizes factor VIII procoagulant protein. The biological functions of vWF are dependent on distinct molecular domains responsible for the specificity and affinity for ligands. The multimeric structure of vWF provides an array of binding sites that allow multivalent interactions, thus supporting the formation of stable platelet aggregates at the site of vascular injury, particularly under flow conditions characterized by high shear stress. Quantita
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary pulmonary hypertension (PPH) is a rare disorder, usually fatal. Although the cause of the disease is unknown, the vascular endothelium seems to play a key role. It has been proposed that a vascular endothelial dysfunction would provoke pulmonary vasoconstriction, platelet activation and thrombin formation; some of these events have already been proven. The presence of thrombosis in PPH patients has been demonstrated, and it seems to have a relationship with a vascular endothelium-dependent coagulation abnormality. Substances of endothelial cell origin capable of modifying the coagulati
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Virulent Newcastle disease virus (NDV, avian Avulavirus-1, APMV-1) induces a highly contagious and lethal systemic disease in gallinaceous poultry. APMV-1 antibody detection is used for surveillance and to control vaccination, but is hampered by cross-reactivity to other subtypes of avian Avulaviruses. Data are lacking concerning the applicability of NDV V proteins as differential diagnostic marker to distinguish vaccinated from virus-infected birds (DIVA strategy).
METHODS: Full length and C-terminally truncated nucleocapsid (NP) protein, and the unique C-terminal regions of the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intracellular Ca2+ channel TRPML3 regulates autophagy by multimerization in a phosphoinositide (PIP)-dependent manner; however, its role in other membrane dynamics remains unclear. Here, we report that TRPML3 regulates type III unconventional protein secretion (UcPS) through two distinct pathways: TMED10-channeled UcPS and secretory autophagy. TRPML3 interacted with TMED10 and macrophage migration inhibitory factor (MIF), a signal sequence-lacking pleiotropic cytokine whose secretion mechanism has remained undefined. We found that cytosolic MIF is transported to membrane-enclosed compartme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Among the most salient features that underpin the development of aging-related neurodegenerative disorders are the accumulation of protein aggregates and the decrease in cellular degradation capacity. Mammalian cells have evolved sophisticated quality control mechanisms to repair or eliminate the otherwise abnormal or misfolded proteins. Chaperones identify unstable or abnormal conformations in proteins and often help them regain their correct conformation. However, if repair is not an option, abnormal proteins are selectively degraded to prevent undesired interactions with other proteins or o
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein phosphorylation is a universal regulatory mechanism, controlling virtually all aspects of bacterial physiology and pathogenesis, yet histidine phosphorylation remains among the least understood. The histidine phosphocarrier protein HPr not only drives bacterial glucose transmembrane uptake through the phosphotransferase system (PTS), but also controls key enzymes for central carbon metabolism, including glycogen phosphorylase (GP). Here we report cryoEM structures of multimeric Escherichia coli EcGP and their complexes with EcHPr. The EM maps reveal an unanticipated density at H806 of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we investigated the mechanism of action of the 10-aminoacid RiLK1 peptide against Escherichia coli (strain ATCC 25922), both in vitro and in contaminated meat matrices. Therefore, a mass spectrometry-based functional proteomics platform was employed to identify specific molecular targets of RiLK1 in a membrane protein-enriched E. coli lysate and to obtain information on their interaction mechanism. This target deconvolution approach combines MS-limited proteolysis techniques, like Drug Affinity Responsive Target Stability (DARTS) and targeted-limited Proteolysis coupled with Mas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronaviruses can induce cell‒cell fusion that results in the formation of multinucleated syncytia through the interaction of viral spike proteins with host cell receptors. Quantifying syncytial formation is crucial for screening potential efficacious antiviral compounds. However, some traditional methods for syncytial quantification are often labor-intensive and limited by a low-throughput capacity. Therefore, we developed a novel high-throughput assay for the efficient quantification of syncytial formation induced by feline coronavirus (FCoV) and SARS-CoV-2. This assay, which is based on the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BIN1b was reported as an epididymis-specific beta-defensin antimicrobial peptide. In this paper, the recombinant BIN1b was expressed and purified by fusing with GB1-His tag. The size-exclusion gel filtration experiment indicated that the fusion protein GB1-BIN1b formed multimers at pH 7.4, and existed as monomer at pH 4.5. The oligomerization of GB1-BIN1b was only related to pH value, neither to NaCl concentration nor protein concentration. Far-UV circular dichroism (CD) spectra also showed the fusion protein had more ordered secondary structures at pH 4.5 than at pH 7.4, as a negative peak ap
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid fibrils are protein assemblies that are pathologically linked to neurodegenerative diseases. Fibril structures can aid development of highly specific ligands for diagnostic imaging and therapeutics. Solid-state NMR (SSNMR) is a viable approach to solving fibril structures; however, most SSNMR protocols require manual analysis of extensive spectral data, presenting a major bottleneck to determining structures. Standard automation; routines fall short for symmetric multimeric assemblies like amyloids due to high cross peak degeneracy and the need to account for multiple protein subunits.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) and apolipoprotein E (apoE) are among the strongest Alzheimer's disease (AD) genetic risk factors. TREM2 and apoE3 direct interaction has been established; however, molecular and structural insight into TREM2-apoE3 interactions and effects of AD-associated variants on TREM2-apoE3 interactions are not fully understood.
METHODS: We used consensus protein-protein docking and molecular dynamics simulations to determine an experimentally consistent TREM2-apoE3 complex structure and examine AD-associated TREM2 R47H, and apoE4 va
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Data on the prevalence of resistance-associated substitutions (RASs) and their implications for treatment with direct-acting antivirals (DAAs) are sparse in European patients with HCV genotype 4. This study investigated RASs before and after DAA failure in different genotype 4 subtypes and evaluated retreatment efficacies. Samples of 195 genotype 4-infected patients were collected in the European Resistance Database and investigated for NS3, NS5A and NS5B RASs. Retreatment efficacies in DAA failure patients were analysed retrospectively. After NS5A inhibitor (NS5Ai) failure, subtype 4r was fre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования