Water transport across cellular membranes is mediated by a family of membrane proteins known as AQPs (aquaporins). AQPs were first discovered on the basis of their ability to be inhibited by mercurial compounds, an experiment which has followed the AQP field ever since. Although mercury inhibition is most common, many AQPs are mercury insensitive. In plants, regulation of AQPs is important in order to cope with environmental changes. Plant plasma membrane AQPs are known to be gated by phosphorylation, pH and Ca²⁺. We have previously solved the structure of the spinach AQP SoPIP2;1 (Spinacia ol
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precision fermentation is a well-established biotechnology which has recently emerged as a platform for manufacturing nature-equivalent dairy proteins, including β-lactoglobulin (BLG). Here, we compare fermentation-derived BLG (f-BLG) with milk-derived BLG (m-BLG) from primary to quaternary structure and relate these findings to aggregation under UHT-like conditions. LC-MS and LC-MS/MS revealed that f-BLG consists of several proteoforms, predominantly a mature sequence containing an N-terminal "EAEA" extension. Despite this modification, 2D methyl NMR and SEC-UV-MALS confirmed equivalent terti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apolipoprotein A-I (apoA-I) accepts cholesterol and phospholipids from ATP-binding cassette transporter A1 (ABCA1)-expressing cells to form high-density lipoprotein (HDL). Human apoA-I has two tertiary structural domains and the C-terminal domain (approximately amino acids 190-243) plays a key role in lipid binding. Although the high lipid affinity region of the C-terminal domain of apoA-I (residues 223-243) is essential for the HDL formation, the function of low lipid affinity region (residues 191-220) remains unclear. To evaluate the role of residues 191-220, we analyzed the structure, lipid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spastin, the most common locus for mutations in hereditary spastic paraplegias, and katanin are related microtubule-severing AAA ATPases involved in constructing neuronal and non-centrosomal microtubule arrays and in segregating chromosomes. The mechanism by which spastin and katanin break and destabilize microtubules is unknown, in part owing to the lack of structural information on these enzymes. Here we report the X-ray crystal structure of the Drosophila spastin AAA domain and provide a model for the active spastin hexamer generated using small-angle X-ray scattering combined with atomic d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid β-peptide (Aβ) is directly linked to Alzheimer's disease (AD). In its monomeric form, Aβ aggregates to produce fibrils and a range of oligomers, the latter being the most neurotoxic. Dysregulation of Ca(2+) homeostasis in aging brains and in neurodegenerative disorders plays a crucial role in numerous processes and contributes to cell dysfunction and death. Here we postulated that calcium may enable or accelerate the aggregation of Aβ. We compared the aggregation pattern of Aβ(1-40) and that of Aβ(1-40)E22G, an amyloid peptide carrying the Arctic mutation that causes early onset of the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oligomers are the key suspects in protein aggregation-linked diseases, such as Alzheimer's and Type II diabetes, and most likely exert their toxicity by interacting with lipid membranes. However, the "which oligomer" question remains an obstacle in understanding the disease mechanism, as the exact identity of the toxic oligomer(s) is not yet known. Oligomers exist as a mixture of species of different sizes (i.e. as different 'n-mers') in a physiological solution, making it difficult to determine the properties of individual species. Here we demonstrate a method based on single-molecule photo-b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Barbiturates induce anesthesia by modulating the activity of anionic and cationic pentameric ligand-gated ion channels (pLGICs). Despite more than a century of use in clinical practice, the prototypic binding site for this class of drugs within pLGICs is yet to be described. In this study, we present the first X-ray structures of barbiturates bound to GLIC, a cationic prokaryotic pLGIC with excellent structural homology to other relevant channels sensitive to general anesthetics and, as shown here, to barbiturates, at clinically relevant concentrations. Several derivatives of barbiturates cont
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thiol oxidation is a probable outcome of cellular oxidative stress and is linked to degenerative disease progression. In addition, protein thiol redox reactions are increasingly identified as a mechanism to regulate protein structure and function. We assessed the effect of hypothiocyanous acid on the cytoskeletal protein tubulin. Total cysteine oxidation by hypothiocyanous and hypochlorous acids was monitored by labeling tubulin with 5-iodoacetamidofluorescein and by detecting higher molecular weight inter-chain tubulin disulfides by Western blot under nonreducing conditions. Hypothiocyanous a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mercurial compounds are known to inhibit water permeation through aquaporins (AQPs). Although in the last years some hypotheses were proposed, the exact mechanism of inhibition is still an open question and even less is known about the inhibition of the glycerol permeation through aquaglyceroporins. Molecular dynamics (MD) simulations of human aquaporin-3 (AQP3) have been performed up to 200ns in the presence of Hg(2+) ions. For the first time, we have observed the unbiased passage of a glycerol molecule from the extracellular to cytosolic side. Moreover, the presence of Hg(2+) ions covalently
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid fiber formation and the possible polymorphism of molecular arrangements depend on the polypeptide length and composition. Here, we seek the chemical clues underlying these processes. Our starting point is based on the experimental observation that some short peptide segments are able to develop fibers that are very similar to those of their original parent proteins. We focus our study on the NFGAILSS peptide, derived from the human islet amyloid polypeptide (residues 22-29). This peptide turned out to be a perfect example, illustrating the fact that the amyloid microscopic organization
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The identification of similar three-dimensional (3D) amino acid patterns among different proteins might be helpful to explain the polypharmacological profile of many currently used drugs. Also, it would be a reasonable first step for the design of novel multitarget compounds. Most of the current computational tools employed for this aim are limited to the comparisons among known binding sites, and do not consider several additional important 3D patterns such as allosteric sites or other conserved motifs. In the present work, we introduce Geomfinder2.0, which is a new and improved version of ou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The type-2 peroxisomal targeting signal (PTS2) is one of two peptide motifs destining soluble proteins for peroxisomes. This signal acts as amphiphilic α-helix exposing the side chains of all conserved residues to the same side. PTS2 motifs are recognized by a bipartite protein complex consisting of the receptor PEX7 and a co-receptor. Cargo-loaded receptor complexes are translocated across the peroxisomal membrane by a transient pore and inside peroxisomes, cargo proteins are released and processed in many, but not all species. The components of the bipartite receptor are re-exported into the
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interleukin 18 (IL18) is a cytokine that plays an important role in inflammation as well as host defense against microbes. Mammals encode a soluble inhibitor of IL18 termed IL18 binding protein (IL18BP) that modulates IL18 activity through a negative feedback mechanism. Many poxviruses encode homologous IL18BPs, which contribute to virulence. Previous structural and functional studies on IL18 and IL18BPs revealed an essential binding hot spot involving a lysine on IL18 and two aromatic residues on IL18BPs. The aromatic residues are conserved among the very diverse mammalian and poxviruses IL18
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The catecholaldehyde hypothesis posits that 3,4-dihydroxyphenylacetaldehyde (DOPAL), an obligate intermediary metabolite of dopamine, is an autotoxin that challenges neuronal homeostasis in catecholaminergic neurons. DOPAL toxicity may involve protein modifications, such as oligomerization of α-synuclein (AS). Potential interactions between DOPAL and other proteins related to catecholaminergic neurodegeneration, however, have not been systemically explored. This study examined DOPAL-induced protein-quinone adduct formation ("quinonization") and protein oligomerization, ubiquitination, and aggr
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The major virulence factor of enterotoxigenic Escherichia coli is the heat-labile enterotoxin (LT), an AB5 toxin closely related to the cholera toxin. LT consists of six subunits, the catalytically active A-subunit and five B-subunits arranged as a pentameric ring (LTB), which enable the toxin to bind to the epithelial cells in the intestinal lumen. LTB has two recognized binding sites; the primary binding site is responsible for anchoring the toxin to its main receptor, the GM1-ganglioside, while the secondary binding site recognizes blood group antigens. Herein, we report the 1H, 13C, 15N ma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ultraviolet radiation (UVR) exposure is a major risk factor for age-related cataract, a protein-aggregation disease of the human lens often involving the major proteins of the lens, the crystallins. γD-Crystallin (HγD-Crys) is abundant in the nucleus of the human lens, and its folding and aggregation have been extensively studied. Previous work showed that HγD-Crys photoaggregates in vitro upon exposure to UVA/UVB light and that its conserved tryptophans are not required for aggregation. Surprisingly, the tryptophan residues play a photoprotective role because of a distinctive energy-transfer
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Members of the Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP) family control cytoskeletal dynamics by promoting actin filament nucleation with the Arp2/3 complex. The WASP relative WAVE regulates lamellipodia formation within a 400-kilodalton, hetero-pentameric WAVE regulatory complex (WRC). The WRC is inactive towards the Arp2/3 complex, but can be stimulated by the Rac GTPase, kinases and phosphatidylinositols. Here we report the 2.3-ångstrom crystal structure of the WRC and complementary mechanistic analyses. The structure shows that the activity-bearing VCA motif of WAVE is sequestered by a combi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In human brain the flavoprotein D-amino acid oxidase (hDAAO) is responsible for the degradation of the neuromodulator D-serine, an important effector of NMDA-receptor mediated neurotransmission. Experimental evidence supports the concept that D-serine concentration increase by hDAAO inhibition may represent a valuable therapeutic approach to improve the symptoms in schizophrenia patients. This study investigated the effects on hDAAO conformation and stability of the substrate D-serine (or of the pseudo-substrate trifluoro-D-alanine), the FAD cofactor, and two inhibitors (benzoate, a classical
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid deposition accompanies over 20 degenerative diseases in human, including Alzheimer's, Parkinson's, and prion diseases. Recent studies revealed the importance of other type of protein aggregates, e.g., non-specific aggregates, protofibrils, and small oligomers in the development of such diseases and proved their increased toxicity for living cells in comparison with mature amyloid fibrils. We carried out a comparative structural analysis of different monomeric and aggregated states of beta(2)-microglobulin, a protein responsible for hemodialysis-related amyloidosis. We investigated the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Solute binding proteins (SBPs) are of central physiological relevance for prokaryotes. These proteins present substrates to transporters, but they also stimulate different signal transduction receptors. SBPs form a superfamily of at least 33 protein Pfam families. To assess possible links between SBP sequence and the ligand recognized, we have inspected manually all SBP three-dimensional structures deposited in the protein data bank and retrieved 748 prokaryotic structures that have been solved in complex with bound ligand. These structures were classified into 26 SBP Pfam families. The analys
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования