Hepatitis C Virus (HCV) is a plus-strand RNA virus that replicates its genome via a minus-strand intermediate, which in turn is the template for the synthesis of progeny plus-strand genomes. In order to characterize sequence elements in the HCV 5'-untranslated region (5'UTR) that are possibly involved in the regulation of minus-strand RNA synthesis starting at the genome's 3'end, we used a replicon system in which a possible function of these sequences is uncoupled from other functions like translation regulation. For the specific detection by RT-qPCR of minus strands newly synthesized in the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The worldwide emergence and spread of antimicrobial-resistant pathogens pose a significant risk to public health. The ESKAPE group of pathogens-specifically Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, and Enterobacter species has gained notoriety due to its multidrug-resistance and causing hospital-acquired infections. These pathogens are linked to higher rates of morbidity and mortality, as well as substantial economic burden. Bacterial small regulatory RNAs (sRNAs) represent a distinct class of RNA molecules and serve k
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-testicular sperm maturation and storage within the epididymis is a key determinant of gamete quality and fertilization competence. Here we demonstrate that mouse spermatozoa possess a complex small non-protein-coding RNA (sRNA) profile, the composition of which is markedly influenced by their epididymal transit. Thus, although microRNAs (miRNAs) are highly represented in the spermatozoa of the proximal epididymis, this sRNA class is largely diminished in mature spermatozoa of the distal epididymis. Coincident with this, a substantial enrichment in Piwi-interacting RNA (piRNA) abundance in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae is the waterborne bacterium responsible for worldwide outbreaks of the acute, potentially fatal cholera diarrhea. The primary factors this human pathogen uses to cause the disease are controlled by a complex regulatory program linking extracellular signaling inputs to changes in expression of several critical virulence genes. Recently it has been uncovered that many non-coding regulatory sRNAs are important components of the V. cholerae virulence regulon. Most of these sRNAs appear to require the RNA-binding protein, Hfq, to interact with and alter the expression of target gene
СтатьяПоддержка правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rising prevalence of multidrug-resistant bacteria poses a looming threat to healthcare and necessitates novel therapeutic strategies beyond conventional antibiotics. One such organism is Serratia marcescens, which possesses a broad range of virulence factors and has been listed as a high-priority pathogen by the WHO due to its increasing antibiotic resistance. Small RNAs are promising targets against antibiotic-resistant bacteria, as they are key regulators of bacterial gene expression. This study aimed to identify novel sRNA and elucidate their roles in regulating virulence-as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus mutans is considered the key contributor to human dental caries. The LuxS/AI-2 quorum‑sensing (QS) system in S. mutans plays a crucial role in the development of cariogenic oral biofilms. Many QS systems rely on regulation carried out by small RNAs (sRNAs) to achieve optimal performance. However, the identities and functions of sRNAs in S. mutans QS system are not well elucidated. Here, we identify two novel sRNAs named SmqsR2 and SmqsR4 (Streptococcus mutans quorum-sensing-related small RNA 2 and 4), which respond to luxS expression and support biofilm formation by mediating exo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pathways involving triacylglycerol (TAG) accumulation are thought to play a crucial regulatory role in bacterial growth and metabolism. Despite this understanding, little is known about the biological functions and regulatory mechanisms of small RNAs in Mycobacterium. Mycobacterium smegmatis (M. smegmatis), a type of Mycobacterium, serves as a model organism to investigate the molecular, physiological, and drug resistance features of M. tuberculosis.
RESULTS: In this study, we demonstrated that overexpression of B11 significantly affects bacterial growth and colony morphology, inc
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-transcriptional regulation by small RNAs and post-translational modifications (PTM) such as lysine acetylation play fundamental roles in physiological circuits, offering rapid responses to environmental signals with low energy consumption. Yet, the interplay between these regulatory systems remains underexplored. Here, we unveil the cross-talk between sRNAs and lysine acetylation in Streptococcus mutans, a primary cariogenic pathogen known for its potent acidogenic virulence. Through systematic overexpression of sRNAs in S. mutans, we identified sRNA SmsR1 as a critical player in modulati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Embryos of the annual killifish Austrofundulus limnaeus are the most anoxia-tolerant vertebrate. Annual killifish inhabit ephemeral ponds, producing drought and anoxia-tolerant embryos, which allows the species to persist generation after generation. Anoxia tolerance and physiology vary by developmental stage, creating a unique opportunity for comparative study within the species. A recent study of small ncRNA expression in A. limnaeus embryos in response to anoxia and aerobic recovery revealed small ncRNAs with expression patterns that suggest a role in supporting anoxia tolerance. MitosRNAs,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Shigella is a human pathogen that causes shigellosis, an acute invasive intestinal infection. Recent studies in the model bacterium Escherichia coli (E. coli) provided evidence that small regulatory RNAs (sRNAs) can contribute to antimicrobial resistance or susceptibility. One of the sRNAs is SdsR, which increases sensitivity of E. coli against fluoroquinolone by repressing the drug efflux pump, TolC. However, no reports exist about the effect of SdsR on fluoroquinolone resistance in Shigella sonnei (S. sonnei). In this study, we established the effect of SdsR on the sensitivity of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are non-coding small RNA molecules that can be secreted into the circulation and which exist in remarkably stable forms. Circulating miRNAs regulate numerous biological process and are aberrantly expressed in pathological conditions. Differentially expressed circulating miRNAs have received attention as potential biomarkers for many diseases. In this study, we revealed that miR-515-5p was significantly upregulated in maternal serum from preeclampsia patients in comparison to normal pregnant women. Bioinformatics prediction and a dual-luciferase reporter gene assay revealed t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combining RNA sequencing, ribosome profiling, and mass spectrometry, we elucidate the contribution of non-canonical translation to the proteome and major histocompatibility complex (MHC) class I immunopeptidome. Remarkably, of 14,498 proteins identified in three human B cell lymphomas, 2,503 are non-canonical proteins. Of these, 28% are novel isoforms and 72% are cryptic proteins encoded by ostensibly non-coding regions (60%) or frameshifted canonical genes (12%). Cryptic proteins are translated as efficiently as canonical proteins, have more predicted disordered residues and lower stability,
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The extent of genetic variability following acute infection of tamarins with GB virus B (GBV-B) is not known. In this study we attempted to define the quasispecies variation of GBV-B 17 days post-infection, by PCR amplification of GBV-B RNA extracted from serum and liver. Cloning followed by sequencing revealed a small number of changes in the three regions studied, namely the 5' untranslated region, E2 and NS3. Moreover, there was no region of high amino acid variability in E2, akin to hypervariable region 1 of hepatitis C virus. This was further confirmed by analysing sequences from two addi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are small, noncoding RNA molecules, typically 22 to 25 nucleotides long, that serve as critical regulators of gene expression at the post-transcriptional level. By binding to specific messenger RNAs (mRNAs), miRNAs can lead to translational repression or mRNA degradation, thereby modulating various cellular processes. While computational tools utilizing algorithmic models have been developed to predict miRNA-mRNA interactions, experimental validation remains essential. To ensure the reliability of these predictions, laboratory techniques have been continuously refined to enh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) methylation has been widely regarded in numerous biological functions including CR. Nonetheless, the molecular process of m6A methylation behind CR in non-small cell lung cancer (NSCLC) has no apparent significance. We identified in this study that the expression of FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase (FTO) was downregulated in CR NSCLC tissues and cells in vivo and in vitro. Additionally, RIP-seq indicated that loss of FTO contributed to the elevated m6A methylation at 5'-untranslated region of RNAs which were closely connected with tumor resistance and mali
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: The aim of the present study was to develop a colorimetric LAMP assay for the detection of enteroviruses belonging to species A-D targeting the 5' untranslated region (5' UTR) of enteroviruses genome.
METHODS AND RESULTS: The RNA was converted to cDNA by the reverse transcriptase and then amplified via LAMP by the WarmStart®Bst DNA polymerase, simultaneously in a single reaction tube, so we shortened the reaction time to 50 min. The sensitivity of the assay regarding Enterovirus B, C and D was determined to be 0·30 CCID50 assay-1 while the sensitivity for Enterovirus A was 3·00 CCID50 a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yersinia pestis, the cause of the disease plague, forms biofilms to enhance flea-to-mammal transmission. Biofilm formation is dependent on exopolysaccharide synthesis and is controlled by the intracellular levels of the second messenger molecule cyclic diguanylate (c-di-GMP), but the mechanisms by which Y. pestis regulates c-di-GMP synthesis and turnover are not fully understood. Here we show that the small RNA chaperone Hfq contributes to the regulation of c-di-GMP levels and biofilm formation by modulating the abundance of both the c-di-GMP phosphodiesterase HmsP and the diguanylate cyclase
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hypopharyngeal gland is an important organ for honey bees to secrete royal jelly, and its secretory activity varies with the age of workers. However, by now, the regulation mechanism of hypopharyngeal gland development is still unclear. Here, the expression profiles of miRNAs in the hypopharyngeal gland of newly emerged workers, nurses, and foragers were investigated via small RNA sequencing. From these three stages, 81 known miRNAs and 135 novel miRNAs have been identified. A total of 85 miRNAs showed expression differences between different development stages, and their target genes were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acquired resistance to epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKIs) severely limits clinical efficacy. Myeloid zinc finger 1 (MZF1) inhibited EGFR phosphorylation and internalization by maintaining zinc homeostasis, which suggested its potential as a therapeutic target for resensitization. The two MZF1 splice variants exhibited functional divergence. MZF1S demonstrated significantly reduced Zn2+-binding capacity compared with MZF1L owing to C2H2 domain deletion. Although MZF1S was specifically upregulated in resistant patients, MZF1L predominated in treatment-sensiti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exosomes facilitate intercellular communication and play a critical role in tumor development. Circular RNA (circRNA), a major component of exosomes, is involved in cancer metastasis through exosome-mediated delivery. This study identified a novel non-small-cell lung cancer (NSCLC)-associated circRNA, circ_0008803 in exosomes. We found that circ_0008803 promoted the migration and invasion of NSCLC cells in vitro and facilitated tumor growth in vivo. Using confocal microscopy, we observed that circ_0008803 was encapsulated in exosomes and transported to recipient cells. Upon release into recipi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования