Triple-negative breast cancer (TNBC), the deadliest form of this disease, lacks a targeted therapy. TNBC tumors that fail to respond to chemotherapy are characterized by a repressed IFN/signal transducer and activator of transcription (IFN/STAT) gene signature and are often enriched for cancer stem cells (CSCs). We have found that human mammary epithelial cells that undergo an epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) following transformation acquire CSC properties. These mesenchymal/CSCs have a significantly repressed IFN/STAT gene expression signature and an enhanced ability to migrate and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Activation-induced deaminase (AID) initiates immunoglobulin class switch recombination (CSR) by deaminating cytosines within transcription-generated single-stranded DNA in switch regions. R-loops formed during switch-region transcription are thought to expose AID substrates; however, how AID engages and organizes these complex nucleic acid structures remain unclear. Here, combining ensemble biochemistry with single-molecule colocalization and fluorescence resonance energy transfer (FRET) analyses, we uncover an unexpected role for AID as a DNA synapsis factor. AID preferentially promotes synap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Perylenediimide (PDI) and its derivatives are widely studied for their photophysical and photochemical properties, making them promising candidates for photonic materials, organic semiconductors, and molecular qubits. However, the lack of control over their aggregation pathways and charge-transfer coupling severely limits their uses. Here, we report the synthesis of PDI-DNA bioconjugates as a new class of "programmable atom equivalents" (PAEs), in which a single PDI core is covalently linked to two DNA strands. Unlike conventional PAE superlattices formed by slow thermal annealing, the vapor-d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), which are formed during incomplete combustion of organic materials, may cause cancer through DNA damage mediated by formation of bulky DNA adducts from PAH reactive metabolites. The airway epithelium is a primary route of exposure for inhaled PAHs, and primary human bronchial epithelial cells (HBECs) in monolayer or organotypic cultures offer a more realistic testing scenario compared to traditional cell lines. However, lack of knowledge about their capacity to mediate DNA damage through generation of reactive chemical intermediates limits their use in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organometallic η6-arene ruthenium(II) complexes with 3-chloro-6-(1H-pyrazol-1-yl)pyridazine (Ru1, Ru2, and Ru5) and 3-chloro-6-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-1-yl)pyridazine (Ru3-4) N,N' heterocyclic and η6-arene (cymene (Ru1-4) or toluene (Ru 5)) have been synthesized. The ruthenium(II) complexes have common "three-legged piano-stool" pseudo-octahedral structures known for half-sandwich complexes. Evolution of their UV-Visible absorption spectra in PBS buffer or DMSO over 24 h confirmed their good solvolysis stability. Titrations of the complexes with the calf thymus DNA (CT-DNA) were monitored usi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Copper-containing compounds known as Casiopeı́nas are biologically active molecules which show promising antineoplastic effects against several cancer types. Two possible hypotheses regarding the mode of action of the Casiopeı́nas have emerged from the experimental evidence: the generation of reactive oxygen species or the ability of the compounds to bind and interact with nucleic acids. Using robust molecular dynamics simulations, we investigate the interaction of four different Casiopeı́nas with the DNA duplex d(GCACGAACGAACGAACGC). The studied copper complexes contain either 4-7- or 5-6-sub
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Although mitochondrial diseases often cause abnormal myocardial development, the mechanisms by which mitochondria influence heart growth and function are poorly understood.
OBJECTIVE: To investigate these disease mechanisms, we studied a genetic model of mitochondrial dysfunction caused by inactivation of Tfam (transcription factor A, mitochondrial), a nuclear-encoded gene that is essential for mitochondrial gene transcription and mitochondrial DNA replication.
METHODS AND RESULTS: Tfam inactivation by Nkx2.5Cre caused mitochondrial dysfunction and embryonic lethal myocardial hypo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
7,8-hydroxy-2'-deoxyguanosine (8-OHdG) is an abundant DNA lesion formed by oxidation of the nucleoside 2'-deoxyguanosine (2-dG) and one of the most studied and accepted oxidative stress biomarkers. 8-OHdG has a strong carcinogenic potential, and prolonged oxidative stress heightens pathological conditions and especially cancer risk. Our aim was to develop, validate and apply a reliable method to assess DNA oxidation in genomic cellular DNA of sensible target organs such as brain. A procedure to isolate and digest the DNA of brain tissue properly for further detection of 8-OHdG and 2-dG by Ultr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reverse transcriptases (RTs) play a major role in the replication of Retroviridae, Metaviridae, Pseudoviridae, Hepadnaviridae and Caulimoviridae. RTs are enzymes that are able to synthesize DNA using RNA or DNA as templates (DNA polymerase activity), and degrade RNA when forming RNA/DNA hybrids (ribonuclease H activity). In retroviruses and LTR retrotransposons (Metaviridae and Pseudoviridae), the coordinated action of both enzymatic activities converts single-stranded RNA into a double-stranded DNA that is flanked by identical sequences known as long terminal repeats (LTRs). RTs of retrovirus
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
XPD-like helicases constitute a prominent DNA helicase family critical for many aspects of genome maintenance. These enzymes share a unique structural feature, an auxiliary domain stabilized by an iron-sulphur (FeS) cluster, and a 5'-3' polarity of DNA translocation and duplex unwinding. Biochemical analyses alongside two single-molecule approaches, total internal reflection fluorescence microscopy and high-resolution optical tweezers, have shown how the unique structural features of XPD helicase and its specific patterns of substrate interactions tune the helicase for its specific cellular fu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
O⁶-methylguanine (O⁶-MeG) and O⁶-carboxymethylguanine (O⁶-CMG) are characteristic promutagenic and toxic DNA adducts formed by nitrosated glycine derivates and N-nitrosopeptides. Since endogenous nitrosation has been hypothesised as a plausible origin for the association between red and processed meat intake and colorectal cancer, a highly sensitive, fast and specific quantitative assay is needed to correlate the dose of individual DNA adducts with the effects of food consumption and individual digestive and metabolic processes. An ultra-high pressure liquid chromatography-tandem mass spectrom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammalian genomes encode at least 15 distinct DNA polymerases, functioning as specialists in DNA replication, DNA repair, recombination, or bypass of DNA damage. Although the DNA polymerase zeta (polzeta) catalytic subunit REV3L is important in defense against genotoxins, little is known of its biological function. This is because REV3L is essential during embryogenesis, unlike other translesion DNA polymerases. Outstanding questions include whether any adult cells are viable in the absence of polzeta and whether polzeta status influences tumorigenesis. REV3L-deficient cells have properties th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DIP-STRs are compound markers formed by a deletion/insertion polymorphism linked to a microsatellite. They enable the deconvolution of unbalanced DNA mixtures from two individuals, up to 1000 fold excess of one contributor. In practice, this novel tool allows to test for the presence of a DNA of interest in traces appearing not useful because of the masking effect of the major DNA contributor. Thus far two sets of DIP-STRs have been published: the first set was described as proof-of-principle, while the second set was specifically developed for forensic applications. Here, we report on the fir
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral subunit vaccines contain the specific antigen deemed most important for development of protective immune responses. Typically, the chosen antigen is a surface protein involved in cellular entry of the virus, and neutralizing antibodies may prevent this. For influenza, hemagglutinin (HA) is thus a preferred antigen. However, the natural trimeric form of HA is often not considered during subunit vaccine development. Here, we have designed a vaccine format that maintains the trimeric HA conformation while targeting antigen toward major histocompatibility complex class II (MHCII) molecules o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To explore whether acute cellular DNA damage response is induced upon hepatitis B virus (HBV) infection and the effects of the HBV infection.
METHODS: We incubated HL7702 hepatocytes with HBV-positive serum, mimicking a natural HBV infection process. We used immunoblotting to evaluate protein expression levels in HBV-infected cells or in non-infected cells; immunofluorescence to show ATR foci ands Chk1 phosphorylation foci formation; flow cytometry to analyze the cell cycle and apoptosis; ultraviolet (UV) radiation and ionizing radiation (IR)-treated cells to mimic DNA damage; and Trypan
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ospA gene of Borrelia burgdorferi encodes an outer membrane protein which is a major antigen of the Lyme disease agent. Two sequence-specific sets of oligonucleotide primers were used to specify the amplification of the ospA coding sequence by the polymerase chain reaction. One set allowed the entire ospA sequence to be amplified, while the other primed amplification of a truncated form of ospA lacking the first 17 codons specified by the wild-type ospA structural gene, residues believed to constitute a signal sequence which normally would direct localization of the ospA protein to the Bor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) contains a partially double-stranded relaxed circular DNA (rcDNA) genome that is converted into a covalently closed circular DNA (cccDNA) in the nucleus of the infected hepatocyte by cellular DNA repair machinery. cccDNA associates with nucleosomes to form a minichromosome that transcribes RNA to support the expression of viral proteins and reverse transcriptional replication of viral DNA. In addition to the de novo synthesis from incoming virion rcDNA, cccDNA can also be synthesized from rcDNA in the progeny nucleocapsids within the cytoplasm of infected hepatocytes vi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pentad of thrombocytopenia, hemolytic anemia, mild renal dysfunction, neurologic signs, and fever, classically characterizes the syndrome of thrombotic thrombocytopenic purpura (TTP). TTP usually occurs in adults as an acquired form but a congenital form in children has also been described. In the latter case, the initial presentation is often with neonatal jaundice and thrombocytopenia. The disorder may subsequently take a relapsing course. Deficiency of a recently identified novel metalloprotease, the von Willebrand factor (vWF)-cleaving protease, originating from mutations i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An efficient adenovirus infection results in high-level accumulation of viral DNA and mRNAs in the infected cell population. However, the average viral DNA and mRNA content in a heterogeneous cell population does not necessarily reflect the same abundance in individual cells. Here, we describe a novel padlock probe-based rolling-circle amplification technique that enables simultaneous detection and analysis of human adenovirus type 5 (HAdV-5) genomic DNA and virus-encoded mRNAs in individual infected cells. We demonstrate that the method is applicable for detection and quantification of HAdV-5
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
beta-Lapachone and certain of its derivatives directly bind and inhibit topoisomerase I (Topo I) DNA unwinding activity and form DNA-Topo I complexes, which are not resolvable by SDS-K+ assays. We show that beta-lapachone can induce apoptosis in certain cells, such as in human promyelocytic leukemia (HL-60) and human prostate cancer (DU-145, PC-3, and LNCaP) cells, as also described by Li et al. (Cancer Res., 55: 0000-0000, 1995). Characteristic 180-200-bp oligonucleosome DNA laddering and fragmented DNA-containing apoptotic cells via flow cytometry and morphological examinations were observed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.