OBJECTIVE: To identify cell senescence-related genes and immune cell infiltration characteristics in intervertebral disc degeneration (IVDD) using bioinformatics and investigate their biological functions and signaling pathways.
METHODS: GSE56081 and GSE23130 datasets were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. The former was used for the analysis of differentially expressed genes (DEGs) and the latter was used as the validation set. Intersection analysis of DEGs and cell senescence-related genes was performed to screen for senescence-related differentially expressed gene
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We have previously reported that patients with a history of binge eating disorder or bulimia nervosa are more likely to have rare, damaging mutations in glucagon-like peptide 1 and glucagon-like peptide 1 receptor. Little is known about the role of the closely related glucagon-like peptide 2 (GLP-2) pathway in regulation of feeding behaviors.
RESULTS: The 2-162144091-T-C single nucleotide polymorphism in the GLP-2 region of the GCG gene was observed to be shared by a mother and two of her children with a history of binge eating. Subsequent analysis of patients who presented to our
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Dermatomyositis (DM) is frequently associated with interstitial lung disease (ILD); however, the molecular mechanisms underlying this association remain unclear. This study aimed to employ bioinformatics approaches to identify potential molecular mechanisms linking DM and ILD.
METHODS: GSE46239 and GSE47162 were analysed to identify common differentially expressed genes (DEGs). These DEGs underwent Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopaedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis. A protein-protein interaction (PPI) network was constructed to identify hub genes and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite its high preventability and curability, tuberculosis (TB) remains a leading cause of morbidity and mortality worldwide. One factor that contributes to the susceptibility and progression of various diseases is immune escape. Therefore, the primary aim of our study was to explore the involvement of immune escape-related genes in the pathogenesis of TB. Two TB datasets retrieved from the gene expression omnibus database were used to identify differentially expressed genes (DEGs). Machine learning was used to identify the hub immune escape-related genes (HIERGs). Weighted gene co-expressio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Peri-implantitis is the main cause of failure of implant treatment, and there is little research on its molecular mechanism. This study aimed to identify key biomarkers and immune infiltration of peri-implantitis using a bioinformatics method. MATERIAL AND METHODS Three Gene Ontology (GO) gene expression profiles were selected from the Gene Expression Omnibus. Differentially expressed genes (DEGs) were identified by the LIMMA package, and functional correlations of DEGs were analyzed by Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analysis. Information on immune-related
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The deadly cardiovascular condition known as Stanford type A aortic dissection (TAAD) carries a high risk of morbidity and mortality. One important step in the pathophysiology of the condition is the influx of immune cells into the aorta media, which causes medial degeneration. The purpose of this work was to investigate the potential pathogenic significance of immune cell infiltration in TAAD and to test for associated biomarkers.
METHODS: The National Center for Biotechnology Information (NCBI) Gene Expression Omnibus (GEO) database provided the RNA sequencing microarray data (G
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis increases the risk of developing various cancers, including colon cancer. The pathogenesis of the co-occurrence of psoriasis and cancer is not yet clear. This study is aimed at analyzing the pathogenesis of psoriasis combined with cancer by bioinformatic analysis. Skin tissue data from psoriasis (GSE117239) and intestinal tissue data from colon cancer (GSE44076) were downloaded from the GEO database. One thousand two hundred ninety-six common differentially expressed genes and 688 common shared genes for psoriasis and colon cancer were determined, respectively, using the limma R pack
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Keratoconus (KC) is a condition characterized by progressive corneal steepening and thinning. However, its pathophysiological mechanism remains vague. We mainly performed literature mining to extract bioinformatic and related data on KC at the RNA level. The objective of this study was to explore the potential pathological mechanisms of KC by identifying hub genes and key molecular pathways at the RNA level.
METHODS: We performed an exhaustive search of the PubMed database and identified studies that pertained to gene transcripts derived from diverse corneal layers in patients with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is the leading public health problem worldwide. However, the side effects accompanying anti-cancer therapies, particularly those pertaining to cardiotoxicity and adverse cardiac events, have been the hindrances to treatment progress. Long QT syndrome (LQTS) is one of the major clinic manifestations of the anti-cancer drug associated cardiac dysfunction. Therefore, elucidating the relationship between the LQTS and cancer is urgently needed. Transcriptomic sequencing data and clinic information of 10,531 patients diagnosed with 33 types of cancer was acquired from TCGA database. A pan-can
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spontaneous preterm birth (sPTB) is a global disease that is a leading cause of death in neonates and children younger than 5 years of age. However, the etiology of sPTB remains poorly understood. Recent evidence has shown a strong association between metabolic disorders and sPTB. To determine the metabolic alterations in sPTB patients, we used various bioinformatics methods to analyze the abnormal changes in metabolic pathways in the preterm placenta via existing datasets.
METHODS: In this study, we integrated two datasets (GSE203507 and GSE174415) from the NCBI GEO database for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Several clinical trials have shown that immunotherapy plays a pivotal role in the treatment of patients with metastatic synovial sarcoma. Immune-related genes (IRGs) have been demonstrated to predict the immunotherapy response in certain malignant tumours. However, the clinical significance of IRGs in patients with synovial sarcoma (SS) is still unclear.
METHODS: We first combined the immune-related ImmPort gene set to search for SS related to metastatic and differentially expressed immune-related genes (DEIRGs) in the GSE40021 dataset from the GEO database. The soft tissue sarcom
СтатьяВалидационное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Angiogenesis is associated with tumour growth, infiltration, and metastasis. This study aimed to detect the mechanisms of angiogenesis-related genes (ARGs) in multiple myeloma (MM) and to construct a new prognostic model.
METHODS: MM research foundation (MMRF)-CoMMpass cohort, GSE47552, GSE57317, and ARGs were sourced from public databases. Differentially expressed genes (DEGs) in the tumour and control cohorts in GSE47552 were determined through differential expression analysis and were enriched with Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analyses.
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The progressive neurometabolic disorder X-linked adrenoleukodystrophy (ALD) is caused by pathogenic variants in the ABCD1 gene, which encodes the peroxisomal ATP-binding transporter for very-long-chain fatty acids. The clinical spectrum of ALD includes adrenal insufficiency, myelopathy, and/or leukodystrophy. A complicating factor in disease management is the absence of a genotype-phenotype correlation in ALD. Since 1999, most ABCD1 (likely) pathogenic and benign variants have been reported in the ABCD1 Variant Database. In 2017, following the expansion of ALD newborn screening, the database w
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Primary open-angle glaucoma (POAG) is the most common type of glaucoma. The potential influence of some DEGs on the progression of POAG was still incomplete. In this study, we integrated transcriptome data with clinical data to investigate the relationship between them in POAG patients.
METHODS: The gene expression profile (GSE27276) from Gene Expression Omnibus (GEO) was used to identify DEGs. The LIMMA package of R was used to identify the DEGs (Diboun et al., 2006). The adjusted P values (adj P value) were calculated instead to avoid the appearance of false-positive results. Ge
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thyroid carcinoma (THCA) has a low mortality rate, but its incidence has been rising over the years. We need to pay attention to its progression and prognosis. In this study, a transcriptome sequencing analysis and bioinformatics methods were used to screen key genes associated with THCA development and analyse their clinical significance and diagnostic value.
METHODS: We collected 10 pairs of THCA tissues and noncancerous tissues, these samples were used for transcriptome sequencing to identify disordered genes. The gene expression profiles were obtained from the Gene Expression
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aimed to explore candidate genes and their potential interaction mechanism critical to the pathophysiology of Turner syndrome by using the Gene Expression Omnibus database.
METHODS: GSE58435 data set was obtained by querying the Gene Expression Omnibus database. Differentially expressed genes (DEGs) were screened using R and subsequently annotated by Gene Ontology. Functional enrichment analysis was performed based on the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes database for annotation, visualization, and integrated discovery. A protein-protein interaction network of dif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tongue squamous cell carcinoma (TSCC) is characterized by aggressive invasion and poor prognosis. Currently, immune checkpoint inhibitors may prolong overall survival compared with conventional treatments. However, PD1/PDL1 remain inapplicable in predicting the prognosis of TSCC; thus, it is urgent to explore the genetic characteristics of TSCC.
MATERIALS AND METHODS: We utilized single-sample gene set enrichment analysis (ssGSEA) to classify TSCC patients from the TCGA database into clusters with different immune cell infiltrations. ESTIMATE (immune-related scores) and CIBERSORT
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast density is strongly associated with breast cancer risk; however, studies on the association between density changes and breast cancer risk have controversial results. The aim of our study was to determine the association between breast density changes and breast cancer risk in East-Asian women. We included 3 301 279 women aged ≥40 years screened for breast cancer twice during 2009 to 2010 and 2011 to 2012. Data were obtained from the National Health Insurance Service (NHIS) database. Breast density was evaluated using the Breast Imaging-Reporting and Data System (BI-RADS). Relative risk
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The circulating metabolome provides unique insights into multiple sclerosis (MS) pathophysiology, but existing studies are relatively small or characterized limited metabolites. We test for differences in the metabolome between people with MS (PwMS; n = 637 samples) and healthy controls (HC; n = 317 samples) and assess the association between metabolomic profiles and disability in PwMS. We then assess whether metabolic differences correlate with changes in cellular gene expression using publicly available scRNA-seq data and whether identified metabolites affect human immune cell function. In P
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Toxic epidermal necrolysis and Stevens-Johnson syndrome comprise life-threatening, drug-induced mucocutaneous disease spectrum. Interest in cyclosporine, a calcineurin inhibitor that can block the function of T-cells, has increased with the discovery of the importance of granulysin in apoptosis in toxic epidermal necrolysis. In our hospital, cyclosporine is given to Stevens-Johnson syndrome/toxic epidermal necrolysis patients as an adjunctive therapy.
AIMS: This study is an observational, record-based study comparing the effectiveness and safety of patients receiving cyclosporine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования