The first step in the evaluation of the short child is to decide whether growth parameters in the context of the history are abnormal or a variant of normal. If growth is considered abnormal, system and hormonal tests are likely to be required, followed by more directed testing, such as skeletal survey and/or genetic screening with karyotype or microarray. In a small percentage of short children in whom a diagnosis has not been reached, this will need to be followed by detailed genetic analysis; currently, exome sequencing using targeted panels relevant to the phenotype is the commonly used te…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most somatic mutations that arise during normal development are present at low levels in single or multiple tissues depending on the developmental stage and affected organs. However, the effect of human developmental stages or mutations of different organs on the features of somatic mutations is still unclear. Here, we performed a systemic and comprehensive analysis of low-level somatic mutations using deep whole-exome sequencing (average read depth ~500×) of 498 multiple organ tissues with matched controls from 190 individuals. Our results showed that early clone-forming mutations shared betw…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is estimated that approximately 25% of nonobstructive azoospermia (NOA) cases are caused by single genetic anomalies, including chromosom … ethodology of mutation screening and functional verification. Fortunately, recent advances in whole exome sequencing and Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)-Cas9 have greatly promoted research on the etiology of human infertility and made improvements possible. In this review, we have summarized the pathogenic mutations fo …
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ornithine transcarbamylase deficiency (OTCD) is the most common X-linked hereditary disorder of urea cycle disorders that is caused by neonatal hyperammonemia. OTC gene sequence variations are common causes of OTCD. The current study presents a 28-month-old baby girl proband with phenotypical characteristics of OTCD such as irritability, somnolence, intermittent vomiting, and high levels of serum ammonium. Whole-exome sequencing revealed a de novo c.275G>A p.(Arg92Gln) variant within the OTC gene. In silico analysis revealed a possible differential affinity between wild-type and mutant OTCase,…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nonsyndromic craniosynostosis is one of the most common anomalies treated by craniofacial surgeons. Despite optimal surgical management, nearly half of affected children have subtle neurocognitive deficits. Whereas timing and type of surgical intervention have been studied, the possibility of genetic influence on neurodevelopment in nonsyndromic craniosynostosis patients remains unexplored.
METHODS: The authors performed whole-exome sequencing for 404 case-parent trios with sporadic nonsyndromic craniosynostosis. Statistical analyses were performed to assess the burden of de novo …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biallelic pathogenic variants in the TANGO2 (transport and Golgi organization 2 homolog) gene have been identified as causing a rare metabolic disorder characterized by susceptibility to recurrent rhabdomyolysis, lactic acidosis, encephalopathy, and life-threatening tachyarrhythmias. Recently published reports suggest variable clinical severity and phenotypes. This study details five new patients from two families with biallelic pathogenic variants in the TANGO2 gene identified by whole exome sequencing and includes the largest number of affected individuals from a single family reported to da…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Epidemiological and clinical observations as well as familial clustering support the existence of a genetic predispositio … esting the existence of additional important contributors to disease risk. The application of whole-exome sequencing has identified associations with disease activity and prognosis. Finally, gene expression studies of circulating immune cells have identified shared and unique pathways between sarcoidosis and other granulomatous diseases.
SUMMARY: Sarco …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The goal of this study was to identify MSX1 gene variants in multiple Chinese families with nonsyndromic oligodontia and analyse the functional influence of these variants. Whole-exome sequencing (WES) and Sanger sequencing were performed to identify the causal gene variants in five families with nonsyndromic oligodontia, and a series of bioinformatics databases were used for variant confirmation and functional prediction. Phenotypic characterization of the members of these families was described, and an in vitro analysis was performed for functional evaluation. Five novel MSX1 heterozygous va…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Efforts to address health disparities are often limited by the lack of robust computational tools for inferring genetic ancestry … stry for samples with even a hundred markers and is applicable to any genomic data, including whole exome sequencing (WES) and RNA sequencing (RNA-Seq) data. Applying AncestryGeni to a real-world genomic dataset obtained from the Multiple Myeloma Research Foundation (MMRF) CoMMpass study, we show that it is more accurate than the commonly used FastNGSad …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Noonan syndrome (NS) diagnosis may be challenging because of diverse clinical manifestations. This case report highlights a novel role for MAP3K7 in NS. A 10.4-year-old female patient presented with short stature and clinical findings suggestive of RASopathy. Despite atypical facial features, the patient met two major van der Burgt diagnostic criteria. Initial genetic testing for known NS-associated genes did not find any variants. Later, whole exome sequencing identified a unique de novo heterozygous variant [c.65C>A, p.(P22H)] in MAP3K7. This variant, categorized as a variant of uncertain si…
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary spherocytosis (HS) is the most frequently observed chronic non-immune hemolytic disorder caused by altered red cell membrane function. SPTB gene mutation is one of the most common causes of HS, but pathogenicity analyses and pathogenesis research on these mutations have not been widely conducted. In this study, a novel heterozygous mutation of the SPTB gene (c.1509_1518del; p.K503Nfs*67) was identified in a Chinese family with HS by whole-exome sequencing (WES) and was then confirmed by Sanger sequencing. Next, the pathogenicity and pathogenesis of this mutation were studied using p…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autism spectrum disorder (ASD) comprises a group of neurodevelopmental disorders characterized by impaired social interaction and communication, and restricted, repetitive patterns of behaviors, interests, or activities. It had been demonstrated that potassium channels played a key role in regulating neuronal excitability, which was closely associated with neurological diseases including epilepsy, ataxia, myoclonus, and psychiatric disorders. In recent years, a growing body of evidence from whole-genome sequencing and whole-exome sequencing had identified several ASD susceptibility genes of po…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital hydrocephalus (CH), characterized by enlarged brain ventricles, is considered a disease of pathological cerebrospinal fluid (CSF) accumulation and, therefore, treated largely by neurosurgical CSF diversion. The persistence of ventriculomegaly and poor neurodevelopmental outcomes in some post-surgical patients highlights our limited knowledge of disease mechanisms. Recent whole-exome sequencing (WES) studies have shown that rare, damaging de novo and inherited mutations with large effect contribute to ~ 25% of sporadic CH. Interestingly, multiple CH genes are key regulators of neural…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Primary microcephaly is genetically heterogeneous. Despite the rapid evolution of scientific information and bioinformatic tools, etiology remains elusive in more than half of the affected population. A substantial fraction of these undiagnosed cases is anticipated to have large structural variations in one of the causative genes. This class of variations has been difficult to detect by exome sequencing.
CASE PRESENTATION: We report a sibling pair with global developmental delay, microcephaly, and brain abnormalities who were recruited under the Indian Undiagnosed Disease Progra…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anterior segment dysgenesis (ASD) comprises a wide spectrum of developmental conditions affecting the cornea, iris, and lens, which may be associated with abnormalities of other organs. To identify disease-causing variants, we performed exome sequencing in 24 South Florida families with ASD. We identified 12 likely causative variants in 10 families (42%), including single nucleotide or small insertion-deletion variants in B3GLCT, BMP4, CYP1B1, FOXC1, FOXE3, GJA1, PXDN, and TP63, and a large copy number variant involving PAX6. Four variants were novel. Each variant was detected only in one fami…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aminoacyl transfer RNA (tRNA) synthetase complex-interacting multifunctional protein I is a noncatalytic component of tRNA multi-synthetase … who display congenital opisthotonus, microcephaly, severe developmental delay, and seizures. Whole exome sequencing was used to identify a premature stop codon in the AIMP1 gene (g. 107248613_c.115C>T; p.(Gln39). In the absence of whole exome sequencing, we propose that decreased N-acetylaspartic acid peaks on magnetic resonance spectroscopy could act …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing availability of next-generation sequencing technologies has revealed several limitations of diagnosis-driven traditional clinicogenetic disease classifications, particularly among patients with an atypical or mixed phenotype. Hereditary spastic paraplegia (HSP) and spinocerebellar ataxia (SCA) are two such disease entities with an often overlapping presentation, in which next generation exome sequencing has played a key role in identification of genes causing disease along a continuum of ataxia and spasticity. We describe a patient who presented with features of both ataxia and spas…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Several studies have reported diagnostic yields up to 57% for rapid exome or genome sequencing (rES/GS) as a single test in neonatal intensive care unit (NICU) patients, but the additional yield of rES/GS compared with other available diagnostic options still remains unquantified in this population.
METHODS: We retrospectively evaluated all genetic NICU consultations in a 2-year period.
RESULTS: In 132 retrospectively evaluated NICU consultations 27 of 32 diagnoses (84.4%) were made using standard genetic workup. Most diagnoses (65.6%) were made within 16 days. Diagnostic ES yield w…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования