Neutrophil extracellular traps are essential in the development and advancement of multiple myeloma (MM). However, research investigating the prognostic value with NET-related genes (NRGs) in MM has been limited. Patient transcriptomic and clinical information was sourced from the gene expression omnibus database. Cox regression analysis with a univariate approach was employed to explore the link between NRGs and overall survival (OS). Kaplan-Meier methods were applied to assess variations in survival rates. A nomogram integrating clinical data and predictive risk metrics was crafted using mul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
(1) Background: Following the discovery of the adipokine/hormone asprosin, a substantial amount of research has provided evidence for its role in the regulation of glucose homeostasis, as well as appetite, and insulin sensitivity. Its levels are dysregulated in certain disease states, including breast cancer. To date, little is known about its role in endometrial cancer (EC). The present study investigated the effects of asprosin on the transcriptome of the Ishikawa and NOU-1 EC cell lines, and assessed the expression of asprosin's candidate receptors (TLR4, PTPRD, and OR4M1) in health and dis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunotherapy has limited effectiveness in prostate cancer (PCa), often classified as a "cold tumor" due to immune-related long non-coding RNAs (lncRNAs) and mRNAs. We developed and validated a consensus immune-related lncRNA and mRNA signature (ILMS) to enhance immunotherapy efficacy for PCa patients. By analyzing seven independent datasets, including our own, we confirmed that ILMS is a robust predictor of biochemical recurrence (BCR). Compared to 70 other published signatures, ILMS showed the highest ability to anticipate PCa prognosis. Single-cell analysis indicated that ILMS-high patients
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroendocrine prostate cancer (NEPC), a subtype of prostate cancer (PCa) with poor prognosis and high heterogeneity, currently lacks accurate markers. This study aims to identify a robust NEPC classifier and provide new perspectives for resolving intra- tumoral heterogeneity. Multi-omics analysis included 19 bulk transcriptomics, 14 single-cell transcriptomics, 1 spatial transcriptomics, 16 published NE signatures and 10 cellular experiments combined with multiple machine learning algorithms to construct a novel NEPC classifier and classification. A comprehensive single-cell atlas of prostate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Prostate cancer (PCa) is the most frequently diagnosed cancer in men and a leading cause of cancer-related death. While prostate-specific antigen is a widely used biomarker, its specificity is limited. This study investigated the prognostic significance of gene subsets associated with the ubiquitin-proteasome pathway in PCa.
MATERIALS AND METHODS: We analyzed transcriptomic and clinical data of 94 early-onset (age <55) patients with prostate cancer using public dataset. Differentially expressed genes linked to the ubiquitin-proteasome system were identified across cancer progr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serotonin plays a regulatory role in cancer progression, but its role in glioblastoma growth, the most frequent and aggressive malignant brain tumor, is unclear. The expression and cellular distribution pattern of key components of the serotoninergic system in glioblastoma cells have not been fully characterized. Using transcriptomic analysis of public datasets, we identified subtype-specific expression pattern of serotonin-related genes. The biosynthetic enzymes tryptophan hydroxylase 1 and 2 and the serotonin transporter (SERT/SLC6A4) were enriched in the classical (CL) and proneural (PN) mo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) is a highly prevalent malignancy among men. Castration-resistant prostate cancer (CRPC) is the main pathological type leading to the death of patients. Due to the lack of effective early diagnostic biomarkers, the treatment of CRPC is often lagging. Ferroptosis is a new discovered pathway of cell death. The diagnostic value of ferroptosis-related genes for CRPC is still uncertain. In this study, we identified 10 differently expressed FRGs between 145 hormone-sensitive PCa (HSPC) and 49 CRPC. A novel ferroptosis-related genes (FRGs) signature was constructed using seven FR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Motor proteins play significant roles in cancer progression, but their involvement in biochemical recurrence (BCR) of prostate cancer remains unclear. The objective of the study is to develop a prognostic indicator for BCR using machine learning (ML) and motor protein-related genes (MPRGs).
METHODS: The prognosis relevance of the MPRGs in prostate cancer was analyzed by univariate Cox regression. Feature selection and model construction were performed using combinations of multiple machine learning algorithms. Model performance was assessed using receiver operating characteristic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fatty-acid metabolism (FAM) is rewired in bladder cancer (BLCA), yet its impact on intratumoral diversity and patient outcome is unclear.
METHODS: To characterize FAM heterogeneity, we integrated spatial and single-cell transcriptomic approaches. We employed high-dimensional weighted correlation network analysis (hdWGCNA) alongside five distinct enrichment methods (ssGSEA, AddModuleScore, AUCell, singscore, and UCell) to identify modules with elevated FAM activity. Subsequently, machine learning algorithms were applied to bulk RNA sequencing datasets to pinpoint the key gene with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, research on the relationship between coagulation system abnormalities and tumor immunity has been widely reported. Bladder cancer (BC), as an immunogenic tumor, holds great promise in immunotherapy. The role of coagulation-related genes in predicting the prognosis of BC patients and the efficacy of immunotherapy remains to be explored. In this study, we utilized the TCGA data system to analyze the biological functions of coagulation-related genes (CRGs) in BC patients. Additionally, we employed multiple machine learning methods (LASSO regression, SVM-RFE regression, and random
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Osteosarcoma (OS), a malignant tumor originating in the bone or cartilage, primarily affects children and adolescents. Notably, glycolysis is the main target for metabolic programming to ensuring the energy supply for cancer. This study aimed to establish a glycolysis-related gene (GRG) risk signature in OS to comprehensively assessing the pathogenic, prognosis, and their application in predicting drug response.
METHODS: mRNA expression profiles were acquired from the Gene Expression Omnibus (GEO, GSE16091, GSE39058, and GSE21257). Using the non-negative matrix factorization
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Disulfidptosis is a newly discovered form of cell death associated with tumorigenesis, particularly under oxidative stress and metabolic disorder conditions. Currently, the biological mechanisms of disulfidptosis-related genes (DRGs) in head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) remain unclear.
METHODS: The study includes sections on methodologies, data sources, clinical data collection, subtype establishment, identification and analysis of differentially expressed genes, genetic variation, and the construction and validation of a DRG prognostic model. Various analyses are cond
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Uveal melanoma (UM), the most common primary intraocular malignancy in adults, shows racial disparities in incidence, genetic drivers, and clinical outcomes. While most prognostication models are based on Caucasian populations, Asians demonstrate distinct molecular profiles, necessitating population-specific risk stratification.
METHODS: This study analyzed 53 Asian UM tumors, 17 normal choroidal tissues (TRACE database), and 80 Caucasian UM samples (TCGA database). Differential gene analysis, immune microenvironment profiling, and survival modeling were performed. A 7-gene progno
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycosis fungoides (MF) is characterized by stepwise evolution from patch to plaque and sometimes to tumor. Identifying patients with early-stage MF who could progress to an advanced stage is challenging. This study investigated changes in transcriptomic expression and the tumor microenvironment associated with MF progression. Spatially resolved transcriptomic profiling was conducted using CD3, CD4, and CD30 morphology markers. In the lymphoma cell area, genes linked to collagen fibril assembly and regulation of interleukin-4 were upregulated as the disease progressed from patch- to plaque-stag
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervical cancer (CC) is a highly heterogeneous malignancy primarily driven by persistent infection with high-risk human papillomavirus (HPV). However, comprehensive analyses of heterogeneity in the immune microenvironment, particularly its spatial heterogeneity, between HPV-positive and HPV-negative CC remain limited, despite their critical clinical significance.
METHODS: We performed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and spatial transcriptomics (ST) sequencing on collected cervical cancer samples, integrating scRNA-seq, ST, and bulk RNA-seq to analyze distinct cell subtypes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) remains a formidable challenge in oncology, with its pathogenesis and progression influenced by myriad factors. Among them, the pervasive organic synthetic compound, bisphenol A (BPA), previously linked with various adverse health effects, has been speculated to play a role. This study endeavors to elucidate the complex interplay between BPA, the immune microenvironment of HCC, and the broader molecular landscape of this malignancy.
METHODS: A comprehensive analysis was undertaken using data procured from both The Cancer Genome Atlas and the Comparat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genomic, genetic and cellular events regulating the onset, growth and survival of rare, choroid plexus neoplasms remain poorly understood. Here, we examine the heterogeneity of human choroid plexus tumors by single-nucleus transcriptome analysis of 23,906 cells from four disease-free choroid plexus and eleven choroid plexus tumors. The resulting expression atlas profiles cellular and transcriptional diversity, copy number alterations, and cell-cell interaction networks in normal and cancerous choroid plexus. In choroid plexus tumor epithelial cells, we observe transcriptional changes that
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Metastasis is the major cause of cancer death. However, what types of heterogenous cancer cells in primary tumour and how they metastasise to the target organs remain largely undiscovered.
DESIGN: We performed single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomic analysis in primary colorectal cancer (CRC) and metastases in the liver (lCRC) or ovary (oCRC). We also conducted immunofluorescence staining and functional experiments to examine the mechanism.
RESULTS: Integrative analyses of epithelial cells reveal a stem-like cell cluster with high protein tyrosine phosphatase recepto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tailoring optimal treatment for individual cancer patients remains a significant challenge. To address this issue, we developed PERCEPTION (PERsonalized Single-Cell Expression-Based Planning for Treatments In ONcology), a precision oncology computational pipeline. Our approach uses publicly available matched bulk and single-cell (sc) expression profiles from large-scale cell-line drug screens. These profiles help build treatment response models based on patients' sc-tumor transcriptomics. PERCEPTION demonstrates success in predicting responses to targeted therapies in cultured and patient-tumo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumour microenvironment harbours diverse stress factors that affect the progression of multiple myeloma (MM), and the survival of MM cells heavily relies on crucial stress pathways. However, the impact of cellular stress on clinical prognosis of MM patients remains largely unknown. This study aimed to provide a cell stress-related model for survival and treatment prediction in MM. We incorporated five cell stress patterns including heat, oxidative, hypoxic, genotoxic, and endoplasmic reticulum stresses, to develop a comprehensive cellular stress index (CSI). Then we systematically analysed the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования