OBJECTIVE: To evaluate the effects of erythritol on functional cariogenic traits in separate single-species Streptococcus mutans and Lacticaseibacillus acidophilus models and to characterize relative species composition in a simplified dual-species biofilm.
DESIGN: Functional microbial, biochemical, structural, molecular, and hard-tissue outcomes were evaluated in separate single-species models. Species-specific qPCR was used to quantify the relative abundance of S. mutans and L. acidophilus in a simplified dual-species biofilm.
RESULTS: Erythritol reduced bacterial growth and viable colony
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Culture-independent methods have the potential to improve diagnosis of bloodstream infections by directly identifying microorganisms from whole blood without the need for culture. However, performance is limited by abundant human DNA, inhibitory components, and low concentrations of circulating microorganisms. Human DNA depletion and bacterial enrichment methods may overcome these challenges by selectively lysing human cells or by directly isolating bacteria, enabling the use of larger blood volumes. We compared three manual methods processing up to 10 mL of whole blood: Polaris and Ultra Deep
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: To develop an in-house reference control DNA standard targeting the RLEP region of Mycobacterium leprae for use in quantitative polymerase chain reaction (qPCR) diagnostics, aiming to reduce dependence on animal models and external sources.
METHOD: Previously characterized DNA samples from patients with leprosy were used to amplify and sequence the 450-base pair RLEP region. A specific 131-base pair segment within this region was targeted for qPCR assay development. The amplified products were purified; sequenced using Illumina next-generation sequencing technology; and validate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glanders is a zoonotic disease caused by Burkholderia mallei (Bm). Bm is phylogenetically similar to B. pseudomallei (Bp), the causative agent of melioidosis, making it difficult to differentiate between them. Recently, the PCR method recommended by the World Organisation for Animal Health (WOAH) failed to detect a Kuwait strain of Bm, and the WOAH has cautioned that ongoing Bm evolution may lead to the emergence of variants that escape standard assays. Therefore, this study aimed to develop a novel real-time PCR method to discriminate between Bm and Bp. Local and web-based BLAST searches iden
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are small, non-coding RNAs that play critical roles in post-transcriptional gene regulation and are involved in various biological processes, including cancer progression. Efficient extraction of miRNAs from cultured cells and tissue samples is crucial for downstream applications, including quantitative real-time PCR (qRT-PCR), next-generation sequencing (NGS), and microarray analysis. This chapter provides reliable protocols for extracting high-quality RNA and microRNAs from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues and cultured cells. It compares manual and automated
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica subsp. enterica serotype Dublin is a cattle-adapted serotype that poses significant health risks to humans and calves. This study determined the prevalence of Salmonella dublin in milk from dairy cows in Algeria using real-time PCR and analyzed associated risk factors. Two hundred thirty milk samples from 31 cattle farms in the Khenchela region were analyzed using real-time PCR targeting the vagC gene. A questionnaire-based survey identified potential risk factors. Results showed S. dublin detection in 9.56% (22/230) of milk samples (95% CI: 5.76-13.37%). Risk factor analys
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The aim of this study was to investigate the resilience of Streptococcus mutans (S. mutans) and Candida albicans (C. albicans) cross-kingdom biofilms in response to environmental stresses.
MATERIALS AND METHODS: The growth kinetics of S. mutans, C. albicans, and their co-culture in planktonic form were assessed using a BioScreen system. Biofilms were established on 96-well plates for a duration of 48 h, after which microbial counts were determined. The biofilms were then subjected to different stress conditions, including oxidative, acid, osmotic, and heat stress, for 2 h. The sur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tritrichomonas foetus is a notable reproductive pathogen in cattle, and the processes of sample collection, handling, transportation, and testing present considerable challenges for surveillance initiatives. Advancements include the development of a direct detection method for T. foetus using reverse-transcription quantitative real-time PCR. We compared the stability of samples in 3 different media: PBS, sterile saline, and lactated Ringer solution over periods of 24-120 h, with storage temperatures of 0°C, 20°C, 37°C, and 54.5°C to mimic shipping of samples in various environmental temperatur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Trypanosomatidae family includes protozoa of broad medical and veterinary interest that infect various vertebrates, including humans, an … amples were analyzed using the serological technique of Immunofluorescence Antibody Test (IFAT) and real-time Polymerase Chain Reaction (qPCR) using specific primers for T. cruzi. Spatial visualization through maps showing the distribution of positive cases in the different municipalities studied was also performed. In the IFAT test, three (03) samples from dogs from the municipalit …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anaplasmosis is a tick-borne disease caused by species of the genus Anaplasma. In dogs anaplasmosis is caused by Anaplasma phagocytophilum and Anaplasma platys. These bacteria are in the family Anaplasmataceae in the order Rickettsiales. Anaplasma platys is a Gram-negative bacterium that is of public health and veterinary importance. This pathogen exclusively infects platelets and causes infectious cyclic thrombocytopenia in dogs. Infection occurs through the bite of an infected ixodid tick, Rhipicephalus sanguineus, which is the principal vector and is also known to transmit Ehrlichia canis,
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Artemisinin partial resistance (ART-R) has spread throughout Southeast Asia and mutations in Pfkelch13, the molecular marker of resistance, are widely reported in East Africa. Effective in vitro assays and robust phenotypes are crucial for monitoring populations for the emergence and spread of resistance. The recently developed extended Recovery Ring-stage Survival Assay used a qPCR-based readout to reduce the labour intensiveness for in vitro phenotyping of ART-R and improved correlation with the clinical phenotype of ART-R. Here, the assay is extended and refined to include measu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to systematically evaluate and compare the performance of two laboratory-developed assays (LDAs) and three commercially available real-time PCR assays for the detection of Candida auris. The analytical sensitivity, specificity and limit of detection (LOD) of each assay were assessed, alongside their clinical sensitivity in identifying C. auris colonisation.
METHODS: Ten C. auris strains representing five clades, as well as genetically related yeasts, common yeast species, and dermatophytes, were used to assess assay sensitivity and cross reactivity. Clinical and e
СтатьяОценочное исследованиеСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: TaqMan-probed quantitative PCR (qPCR) is highly valued for diagnosing Entamoeba histolytica infections (amebiasis). However, unclear cycle threshold (Ct) values often yield low-titer positive results, complicating interpretation. This study aimed to optimize qPCR primer-probe sets with logically determined cut-off Ct value using droplet digital PCR (ddPCR).
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Amplification efficacy was evaluated using ddPCR by measuring absolute positive droplet counts (APD) and mean fluorescence intensity at different PCR cycles and annealing temperatures (AT). A pri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives The leopard (Panthera pardus), an apex predator listed in CITES Appendix I and classified as Vulnerable by the IUCN, is undergoing severe population declines driven by habitat loss, human-wildlife conflict, and illegal trade. Rapid and reliable species and individual identification is critical for conservation and forensic applications, particularly when analyzing highly processed or degraded seized wildlife products, where morphological identification is often impossible. We aimed to develop and validate a robust multiplex quantitative real-time PCR (qPCR) assay combined
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Schistosomiasis, primarily caused by Schistosoma japonicum (Sj) in Asia, remains a major health concern in the Philippines, affe … ironment. To address these issues, this study refined an environmental DNA (eDNA)-based qualitative real-time polymerase chain reaction assay by making it field-applicable and multiplex, to detect both the parasite S. japonicum and its intermediate snail host, Oncomelania hupensis quadrasi (Ohq), using water samples. We surveyed the 30 sentinel sites quarterly-from July 2023 to Marc …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pigeon virus diarrhea is very common in the clinic, which has caused great damage to the pigeon industry. Pigeon adenovirus constitutes a significant pathogen responsible for pigeon viral diarrhea. Among them, Pigeon adenovirus 1 (PiAdV-1) and Pigeon adenovirus 2 (PiAdV-2) are the most common adenoviruses discovered in pigeon diseases in recent years. Infection with these viruses is common in clinical settings, which makes differential diagnosis more difficult. At present, real-time PCR is one of the most widely used techniques for the identification and detection of pathogens. This study pres
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Residual host cell DNA in biological products requires precise quantification to meet regulatory safety standards. This study presents the development and validation of a qPCR assay for detecting and quantifying residual Vero cell DNA in rabies vaccine formulations. A SYBR Green-based quantitative PCR (qPCR) assay targeting the Vero cell-specific alpha-satellite DNA sequence was developed and validated in accordance with regulatory guidelines. The method was evaluated for specificity, sensitivity, linearity, precision, and robustness using a certified genomic DNA standard. The assay exhibited
СтатьяВалидационное исследованиеОценочное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study explores the application value of real-time fluorescence quantitative PCR for repeated detection of Mycobacterium DNA in sputum for the diagnosis of pulmonary tuberculosis (TB). A total of 111 patients who were ultimately clinically diagnosed with pulmonary tuberculosis and sought treatment at Bozhou People's Hospital from January 2019 to March 2021 were selected. Mycobacterium DNA in sputum was detected by quantitative real-time PCR. The patients with TB were divided into Groups 1, 2, and 3 according to the number of sputum DNA examinations for Mycobacterium TB after admission. Gro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background & objectives The global target set by the United Nations (UN) high-level meeting on Tuberculosis (TB) for coverage of rapid molecular tests is 100 per cent by 2027. Rapid, affordable molecular tests for early detection of TB are the need of the hour. This study aimed to evaluate the diagnostic accuracy of an open real-time PCR (RT-PCR) assay, Quantiplus®, with reference to Mycobacteria Growth Indicator Tube (MGIT) liquid culture. Methods We conducted a prospective multi-centric diagnostic accuracy study of Quantiplus® assay (version 2.0) at three sites in India for the detection of
Оценочное исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since 2013, the World Health Organization has recommended the use of rapid molecular tests as the initial diagnostic step for Mycobacterium tuberculosis (MTB) infection to enhance the control of tuberculosis. In recent years, the prevalence of infections by non-tuberculous mycobacteria (NTM) in humans has also risen, particularly in countries with low tuberculosis incidence, such as Italy. Therefore, the rapid differentiation between NTM and Mycobacterium tuberculosis complex is crucial for timely therapeutic decisions. This study evaluates a new rapid molecular assay, Standard M10 MTB/NTM, de
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.