This study investigated the impact of tissue preservation methods on protein profiles analyzed by reversed-phase liquid chromatography-high-resolution mass spectrometry (LC-HRMS) using data-independent acquisition (DIA). Proteomic profiles from formalin-fixed, formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE), and fresh-frozen human brain tissues (cortex and hippocampus, n = 6) were compared, including an FFPE-specific protein extraction kit (n = 4). Formalin-fixed samples more closely resembled fresh-frozen profiles than FFPE or FFPE-Kit samples, while still showing high correlation and overlap wit…
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chemical compositions of the essential oil and of the non-polar extracts (petroleum ether, dichloromethane) of the aerial parts (flowers, leaves and stems) of Salvia argentea L. were determined by GC-FID and gas chromatography-mass spectrometry analysis. 14-Hydroxy-α-humulene (40.1%) was recognised as the main constituents of the essential oil of S. argentea, together with 1,3,8-p-menthatriene (12.1%), globulol (7.4%) and β-sesquiphellandrene (5.8%). Tritriacontane (9.9% and 14.1%), heptacosane (8.4% and 10.5%), hentriacontane (8.3% and 10.9%), tetradecanal (8.4% and 10.2%) and methyldotri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent data indicate that gastroenteropancreatic neuroendocrine tumours (GEP-NETs) have a hypomethylated long interspersed element (LINE1) promoter. To answer the question, of whether LINE1 may be of value in assessing the malignant potential of GEP-NETs, we analysed LINE1 methylation in different organs.
MATERIALS AND METHODS: A total of 58 GEP-NETs of gastric (n=14), pancreatic (n=15), small intestine (n=17), appendix (n=8), colorectal (n=4) and non-neoplastic tissues were analysed using DNA isolation, bisulphite-treatment and pyrosequencing.
RESULTS: LINE1 hypomethylation was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bisphosphonate related osteonecrosis of the jaw (BRONJ) is rare but potentially severe, and the etiopathology and risk factors are poorly defined. To date, it has not been possible to induce BRONJ in a large animal model, a shortfall this study aims to redress. Ten two-year-old adult Göttingen minipigs were split into two groups. Five pigs (group 1) were administered intravenously a weekly dose of a bisphosphonate (zoledonate 0.05mg/kg body weight, approximating the oncologic dose in humans) and five pigs (group 2) served as controls. After 6 weeks, tooth extractions were performed in the uppe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study deals with the development of an oral controlled-release dosage form of a highly water-soluble antiepileptic drug. In this respect, drug-loaded spheroid particles close to 380 μm in diameter and composed of lipid binders were prepared by prilling. The purpose here was to thoroughly characterize the controlled-release mechanism of the drug in aqueous pH-6.8 buffered dissolution medium. Water and drug diffusion pathways as well as related kinetic parameters were determined by theoretical analysis of experimental data. Conventional in-vitro experiments performed by analytical high perf
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Morphologic heterogeneity within an individual tumor is well-recognized by histopathologists in surgical practice. While this often takes the form of areas of distinct differentiation into recognized histological subtypes, or different pathological grade, often there are more subtle differences in phenotype which defy accurate classification (Figure 1). Ultimately, since morphology is dictated by the underlying molecular phenotype, areas with visible differences are likely to be accompanied by differences in the expression of proteins which orchestrate cellular function and behavior, and there
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thymoma is a heterogeneous group of tumors in biology and clinical behavior. Even though thymoma is divided into five subgroups following the World Health Organization classification, the nature of the disease is mixed within the subgroups.
RESULTS: We investigated the molecular characteristics of genetic changes variation of thymoma using cDNA microarray based-comparative genomic hybridization (CGH) with a 17 K cDNA microarray in an indirect, sex-matched design. Genomic DNA from the paraffin embedded 39 thymoma tissues (A 6, AB 11, B1 7, B2 7, B3 8) labeled with Cy-3 was co-hybri…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We planned to analyze the prevalence and distribution of beta-amyloid deposition in the HIV+ brain in the HAART era. Our working hypothesis is that long term survival, aging and the secondary effects of HAART may contribute to increased beta-amyloid accumulation in this patient population.
METHODS: Paraffin embedded archival brain autopsy tissues were assessed by immunocytochemistry for beta-amyloid. Detailed in-vivo neuro-behavioral assessments and ApoE genotyping were available for a subset of the studied population.
RESULTS: Immunoreactivity with the antibodies 4G8 and 6E10 wa…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Estrogen (ER) and progesterone receptor (PgR) status was analysed in paraffin-embedded breast cancer material with immunohistochemical (IHC) technique and compared with corresponding analyses in cytosols (CYT). ER showed the same status (positive/negative) with both methods in 88% of the samples (352/402). The concordance was also high for PgR status (81% [321/394]). Besides values near cut-off, heterogeneity in the distribution of receptor positive and negative nuclei within a tumour sample was the main reason for discordances. Histological type, presence of sclerosis, necrosis and non-invasi…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oesophageal adenocarcinomas arising in Barrett's epithelium occasionally present as multiple lesions. This could be due to either a multifoc … whole genome of each specimen. Five cancerous regions were selected and subsequently dissected from paraffin-embedded tissue blocks. The use of archival materials enabled a targeted collection of representative tumour locations. Multiple genetic aberrations were detected by CGH in all cancer sites. Losses on 3p, 4, 7q, 18q, and Y, as well as gains on 8q, 9 …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paraffin-embedded specimens from 21 patients (mean age 49 years) with malignant melanocytic tumors of the central nervous system were studied. Extraneuronal primary tumors were situated at the trunk (38%), the lower (14%) or upper extremity (10%), and the head/neck region (5%). In 33% no extraneural primary tumor could be detected. The tumor location was frontal (19%), occipital (19%), parietal, spinal, multifocally (14%, respectively), or temporal (5%). Four subtypes were distinguished according to the predominant histological cell type: pleomorphic, epithelioid, spindle- and mixed-cell tumor…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An increase in the number of Ag-NORs has been described as a possible marker for histopathological cancer diagnosis. The ultrastructural correlation of the reaction, however, has never been elucidated. In tissue samples of the endocervix of the uterus, we compared the ultrastructural configuration of Ag-NORs with the number of Ag-NORs dots. Light microscopic studies showed that the number of Ag-NORs in adenocarcinoma cells significantly increased, but the relation to the bromodeoxyuridine labeling index was not determined. By electron microscopy, Ag-NORs were only observed in the nucleoli and
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A pathological hallmark of motor neuron disease (MND) is the presence of ubiquitinated inclusions in lower motor neurons. Recently, ubiquitin-immunoreactive inclusions have been found in neocortical and hippocampal neurons, indicating that in some cases there may be extensive extra-motor involvement. We have observed that some cases of MND with dementia (MND-D), had ubiquitinated inclusions in the amygdala. In order to study this systematically, we examined 18 cases of 'typical' MND, 4 cases of MND-D and 12 neurologically normal and abnormal controls, using antibodies against ubiquitin and a r
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The autometallographic silver enhancement technique has been used to demonstrate the ultrastructural localization of mercury in the testes of adult rats. Administration of mercuric chloride or methyl mercuric chloride in the drinking water (20 mg/L for 12 weeks) resulted in intracellular accumulations of mercury in the interstitial Leydig cells as well as in the Sertoli cells of the seminiferous tubules.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5 oil dispersants and a sample of paraffin were devoid of mutagenic activity in the Ames reversion test, with and without S9 mix, using 7 his- S. typhimurium strains (TA1535, TA1537, TA1538, TA97, TA98, TA100, TA102). However, 3 dispersants produced direct DNA damage in E. coli WP2, which was not repairable in repair-deficient strains (WP2uvrA, CM871, TM1080), as shown by two different DNA-repair test procedures. The uvrA excision-repair system was in all cases the most important mechanism involved in repairing the DNA damage produced by oil dispersants, while the combination of uvrA with othe…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq) on formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples maps accessible chromatin in archival tissues, but DNA degradation and crosslinking remain significant challenges when processing these samples. Here, we present a protocol for Omni-ATAC-seq on degraded human small-cell lung cancer (SCLC) FFPE-derived samples. We detail steps for successful nuclei isolation, efficient tagmentation, and optimal library amplification to overcome the low signal-to-noise ratio. This protocol enables high-quality epigenetic profiling, turnin…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sarcocystis spp. cause pigeon protozoan encephalitis, a neuronal disease. A female pigeon exhibiting torticollis had a necrotic area in the cerebral hemisphere surrounded by lesions with perivascular cuffing, gliosis, granulomatous foci, and meningitis. Non-necrotic lesions were also observed in the brainstem. Intact and degenerative schizonts were observed within the neuropils and neurons in the lesions. Deoxyribonucleic acid (DNA) was extracted from paraffin-embedded brain tissues and genetically analyzed after gel electrophoresis to determine Sarcocystis spp. using specific primer sets for …
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
VEXAS (vacuoles, E1 enzyme, X-linked, auto-inflammatory, somatic) syndrome is an inflammatory disorder with hematological and systemic features. A recent study demonstrated that the dermal infiltrate in neutrophilic dermatosis from VEXAS patients is derived from the pathological UBA1-mutated myeloid clone. Neutrophilic dermatosis is, however, only one of the various skin involvements observed in VEXAS syndrome. We analyzed 10 formalin-fixed paraffin-embedded skin biopsies from genetically confirmed VEXAS syndrome. UBA1 mutation was found in the biopsies related to neutrophilic dermatitis but i…
Письмо в редакциюПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For over half a century, thousands of tons of triphenylphosphine oxide Ph3P(O) have been produced every year from the chemical industries as a useless chemical waste. Here we disclose efficient transformations of Ph3P(O) with cheap resource-abundant metallic sodium finely dispersed in paraffin oil. Ph3P(O) can be easily and selectively transformed to three reactive organophosphorus intermediates-sodium diphenylphosphinite, sodium 5H-benzo[b]phosphindol-5-olate and sodium benzo[b]phosphindol-5-ide-that efficiently give the corresponding functional organophosphorus compounds in good yields. Thes…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 55-year-old woman presented 18 months after a trip to Ecuador with night sweat, malaise, and an unclear lesion of the lung. Computed tomography of the lung showed a nodular lesion of 14 mm. Antibodies against Histoplasma capsulatum were detected in the complement fixation text (CFT) and IgG western blot. Re-examination of a formalin fixed paraffin embedded (FFPE) lung-biopsy revealed yeasts after silver staining, compatible with H. capsulatum , which was verified by extraction and amplification of DNA from FFPE. After therapy with itraconazole 400 mg/day, the patient showed an uneventful cli…
Клинический случайАннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.