Metastatic melanoma remains a mostly incurable disease. Although newly approved targeted therapies are efficacious in a subset of patients, resistance and relapse rapidly ensue. Alternative therapeutic strategies to manipulate epigenetic regulators and disrupt the transcriptional program that maintains tumor cell identity are emerging. Bromodomain and extraterminal domain (BET) proteins are epigenome readers known to exert key roles at the interface between chromatin remodeling and transcriptional regulation. Here, we report that BRD4, a BET family member, is significantly upregulated in prima
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heavy metals that are harmful to humans include arsenic, cadmium, chromium, lead, mercury, and nickel. Some metals or their related compounds may even cause cancer. However, the mechanism underlying heavy metal-induced cancer remains unclear. Increasing data show a link between heavy metal exposure and aberrant changes in both genetic and epigenetic factors via non-targeted multiple toxicogenomic technologies of the transcriptome, proteome, metabolome, and epigenome. These modifications due to heavy metal exposure might provide a better understanding of environmental disorders. Such informativ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis and atopic dermatitis (AD) are skin diseases that are characterized by polarized CD4+ T cell responses. During the polarization of naïve CD4+ T cells, DNA methylation plays an important role in the regulation of gene transcription. In this study, we profiled the genome-wide DNA methylation status of naïve CD4+ T cells in patients with psoriasis or AD and healthy controls using a ChIP-seq method. Only psoriasis patient T cells, not those of AD patients, showed distinct hypomethylation (>4-fold) compared to healthy control T cells in twenty-six regions of the genome ranging in size fro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
According to the "small baby syndrome hypothesis," low birthweight and intrauterine growth restriction (IUGR) occurring in westernized countries mainly through altered placental flow, have been linked to increased metabolic syndrome risk in later life. Independency and causal mechanisms of this phenomenological association are a matter of controversy. By means of epidemiological as well as experimental methods, using meta-analyses and different rodent models of pre- and/or neonatal malnutrition and altered placental flow (uterine artery ligation; Lig), we systematically addressed the phenomeno
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Radiation-induced lung injury (RILI) is a common complication of radiotherapy. Although berberine (BBR) has been suggested to be associated with reduced RILI incidence, the underlying mechanisms remain unknown. Here, we investigated whether the gut microbiota mediates the radioprotective effects of BBR using a C57BL/6 RILI mouse model with 20 Gy thoracic irradiation (n = 6 per group). BBR (100 mg/kg) and inosine (INO, 300 mg/kg) were administered orally in vivo. Antibiotic depletion and fecal microbiota transplantation were performed to assess microbiota dependence. Lung injury was assessed by
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervical lesion progression is accompanied by epigenomic alterations, but reproducible methylation features across public cohorts require cautious re-analysis.
STUDY DESIGN AND METHODS: We performed a secondary analysis of public Illumina 450K methylation cohorts: GSE46306 as discovery (20 normal, 17 CIN3, six carcinoma), GSE99511 and GSE186835 as validation, and TCGA-CESC tumors for methylation-RNA expression association. Shared autosomal CpGs were screened for monotonic grade-associated change, cross-cohort directional consistency, promoter annotation, regional aggregation, samp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ever-increasing global demand for food and feed, coupled with population growth and climate change, necessitates the development of high-yielding and stress-resilient crops. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) technology has emerged as a transformative genome-editing tool due to its efficiency, precision, and ability to generate targeted genetic modifications. This review highlights recent advances in CRISPR genome editing, including base editing, prime editing, and novel Cas variants, together with emerging approaches such as epigenome editing, mitochondrial
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The liver plays a dynamic role in maintaining whole-body homeostasis through its control of nutrient metabolism, detoxification, and immune regulation. Autophagy, a conserved lysosomal degradation pathway, is central to these functions, enabling hepatocytes to adapt to fluctuations in nutrient availability, hormonal signals, and cellular stress. Hepatic autophagy is tightly regulated by nutrient and energy-sensing pathways, including AMPK, mTOR, the coordinated actions of insulin and glucagon, and transcriptional regulators TFEB, FOXO proteins, PPAR isoforms, FXR, and NRF2. Epigenomic mechanis
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The molecular landscape of pediatric B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (BCP-ALL) has been extensively characterized through single-modality studies. However, the interplay between molecular modalities and their collective influence on treatment response and outcomes remains poorly understood.
METHODS: We integrated genomic, epigenomic, transcriptomic, and ex vivo drug response data from 1231 patients diagnosed with BCP-ALL. Using Multi-Omics Factor Analysis, we identified signatures explaining key aspects of the integrative molecular landscape, referred to as cross-mod
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present targeted ATAC-see (tATAC-see), a visual genomics assay for site-specific chromatin profiling. By integrating the in situ visualization of ATAC-see with antibody-tethered tagmentation, tATAC-see captures chromatin states at defined protein-occupied domains with the simplicity of standard immunofluorescence. Modulating the spatial interaction radius of Tn5 via salt titration enables extended tagmentation of local chromatin environments near the target. We validated this imaging-based method by capturing the expanded chromatin neighborhoods of active euchromatin (H3K27ac, H3K4me3) alon
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MYCN amplification is a recurrent, high-risk molecular hallmark across diverse tumors, most notably neuroectodermal malignancies. Although MYCN-driven tumors uniformly exhibit robust intrinsic resistance to ferroptosis, the mechanistic link between MYCN and the ferroptotic pathway remains undefined. Here, we charted the genomic and epigenomic landscape of neuroectodermal tumors by combining single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics (ST), CUT&Tag, and deep-coverage mass spectrometry proteomics. This integrative atlas identified UBE2C as a spatially resolved, MYCN-controlled driver gene. MYCN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
East Asians can be more susceptible to heavy alcohol consumption than others, due to genetic variations. In addition, alcohol drinking has been suspected as a cause of type 2 diabetes (T2D). To clarify the integrated toxic mechanisms of alcohol on T2D in East Asians, we performed epigenome-wide association studies using methylation profiling arrays among four groups of South Korean men (N = 80): drinking (DK), diabetic (DM), both drinking and diabetic (DK + DM), and non-drinking and non-diabetic controls (Con). We screened hypermethylated or hypomethylated sites in both DK and DM, compared to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The COVID-19 pandemic had profound effects for both infected and uninfected individuals. We aimed to identify acute and chronic epigenetic alterations from SARS-CoV-2 infection and/or lockdown measures.
METHODS: Both infected and uninfected participants from the TwinsUK cohort (n = 139) provided longitudinal whole-blood samples (Spring 2020, Spring 2021). Cross-sectional and longitudinal DNA methylome [DNAm] changes, including epigenetic ageing clocks, were assessed, and EWAS (Epigenome-Wide Association Studies) were performed. Changes in epigenetic ageing clocks were compared w
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Targeted therapies can induce responses in patients with relapsed/refractory T-cell lymphoma (R/R TCL) but are not curative. Genetic mutations associated with epigenetic and transcriptional dysregulation are common in many TCL subtypes, and drugs that modulate the epigenome and that target transcriptional regulators have synergistic activity in TCL. We hypothesized that fixed duration treatment with multiagent combinations of these drugs could produce deep responses leading to durable remissions. In a phase 1 trial, we tested escalating doses of lenalidomide added to romidepsin, azacitidine, a
СтатьяКлиническое исследование I фазыПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastroesophageal reflux disease (GERD) is a highly prevalent gastrointestinal disorder with complex genetic underpinnings.While genome-wide association studies (GWAS) have identified several GERD-associated loci, traditional GWAS approaches rely on stringent significance thresholds and may miss variants with modest effects that still contribute to disease biology. To enhance the discovery of GERD-associated loci, we developed InsightGWAS, a Transformer-based deep learning model. Using transfer learning, the model was pre-trained on major depressive disorder GWAS data and fine-tuned with GERD G
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant genomes exhibit extensive structural diversity generated by large-scale genomic alterations, collectively known as structural variations (SVs). Unlike single nucleotide polymorphisms (SNPs) and small insertions/deletions (indels), SVs can reshape genome architecture through changes in sequence content, gene dosage, regulatory landscapes, and chromosome organization. Recent advances in long-read sequencing (LRS), pan-genome construction, and multi-omics technologies have greatly expanded our ability to identify and interpret SVs across plant species. In this review, we summarize recent pr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early diagnosis remains challenging, recurrence rates remain high, and platinum resistance frequently develops in ovarian cancer (OC), collectively representing major barriers to long-term patient survival. DNA methylation (DNAm), as a relatively stable yet dynamically modifiable epigenetic signature, can capture alterations in tumor states and evolutionary trajectories associated with therapeutic pressure. Meanwhile, the circadian rhythm system regulates multiple cancer-related processes, including DNA damage repair, cell-cycle progression, metabolic adaptation, and immune microenvironment re
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rising global temperatures pose a serious threat to the productivity of farmed animals. Prolonged heat exposure impairs growth, reproduction and immunity; suppresses feed intake; and disrupts intestinal barriers, leading to substantial economic losses. Conventional cooling strategies offer limited relief, spurring research into the underlying molecular dysregulation. Epigenetic mechanisms link heat stress (HS) to gene expression. Specific nutrients that modulate these mechanisms could help mitigate HS. This review critically summarizes how methyl donors, short-chain fatty acids (SCFAs), vitami
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neurodevelopmental disorders (NDDs) are genetically heterogeneous, and standard genomic testing frequently yields variants of uncertain significance (VUS) or misses cryptic structural variants. Episignature analysis, which detects disorder specific genome-wide DNA methylation patterns, has emerged as a functional tool to resolve diagnostic uncertainty.
CASE PRESENTATION: We report a 7-year-old female with global developmental delay, autism spectrum disorder, epilepsy, microcephaly, and a distinctive facial gestalt. Initial trio whole-exome sequencing identified inconclusive VUSs i
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermatogenesis is an intricately regulated epigenetic process, yet the exact chromatin dynamics during human meiosis and their systemic failure in non-obstructive azoospermia remain elusive due to the sparsity of single-cell epigenomic data in previous studies. Here, leveraging a high-quality scATAC-seq approach, we mapped over 810,000 cis-regulatory elements across human spermatogenesis. We uncovered a highly synchronized, wave-like activation of master transcription factor networks that precisely orchestrates meiotic progression. Crucially, we traced the dynamic process of opening and closi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования