Sexually transmitted diseases (STDs) are a global concern because approximately 1 million new cases emerge daily. Most STDs are curable, but if left untreated, they can cause severe long-term health implications, including infertility and even death. Therefore, a test enabling rapid and accurate screening and genotyping of STD pathogens is highly awaited. Herein, we present the development of the DNA-based 6STD Genotyping 9G Membrane test, a lateral flow strip membrane assay, for the detection and genotyping of six STD pathogens, including Trichomonas vaginalis, Ureaplasma urealyticum, Neisser
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To evaluate the performance of a rapid multiplex microarray-based method (Unyvero BCU system, BCU) to identify microorganisms and detect antimicrobial resistance directly from positive blood culture (BC) bottles with polymicrobial growth, and to assess relevance of information provided for timely guidance of polymicrobial bloodstream infection treatment.
METHODS: Accuracy, time-to-actionable results and potential impact of BCU on antimicrobial treatment were compared with those of standard of care during a prospective study for the sample analysis (November 2017-November 2018) and a
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Testing of tumors by next generation sequencing (NGS) is impacted by relatively long turnaround times and a need for highly trained personnel. Recently, Idylla oncology assays were introduced to test for BRAF, EGFR, KRAS, and NRAS common hotspot mutations that do not require specialized trained personnel. Moreover, the interpretation of results is fully automated, with rapid turnaround time. Though Idylla testing and NGS have been shown to have high concordance in identifying EGFR, BRAF, KRAS, and NRAS hotspot mutations, there is limited experience on optimal ways the Idylla system can be used
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA) is an autosomal recessive disease characterized by progressive proximal muscle weakness and atrophy. Given the recent introduction of gene therapies, knowledge of the SMA carrier frequency in various populations has become important for developing screening programs for this disease. In total, 1,581 anonymous DNA samples from an umbilical cord blood bank were tested for SMN1 and SMN2 gene copies using a multiplex ligation-dependent probe amplification assay. Twenty-nine of the 1,581 newborns [1.83%; 95% confidence interval (CI), 1.25-2.66%] were SMA carriers with
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/PURPOSE: Early recognition of causative pathogens is critical for the appropriate management of central nervous system infection and improved outcomes. The BioFire® FilmArray® Meningitis/Encephalitis Panel (BioFire® ME Panel, BioFire Diagnostics) is the first U.S. Food and Drug Administration (FDA)-approved multiplex PCR assay that allows the rapid detection of 14 pathogens, including bacteria (n = 6), viruses (n = 7), and fungi (n = 1), from cerebrospinal fluid (CSF). The performance of the panel is expected to be dependent on the epidemiology of M/E in different geographical regio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rotavirus, adenovirus, norovirus and astrovirus are considered to be among the major causes of sporadic cases and outbreaks of acute gastroenteritis globally. Rapid and accurate identification of enteric viruses is still a challenge for the clinical laboratory. Recently, several molecular platforms for the detection of viral enteric pathogens have become available. In this study, the diagnostic accuracy of InGenius Gastrointestinal Viral (GV) Elite Panel, a newly developed one-step multiplex real-time RT-PCR assay simultaneously detecting rotavirus, adenovirus and astrovirus, was evaluated ret
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is one of the leading causes of human infections worldwide, with major dominant lineage circulating in particular geographical regions. The Brazilian Epidemic Clone (BEC, SCCmec III, ST 239) has been predominant in most Brazilian hospitals. Here, we report the prevalence of MRSA SCCmec type II exhibiting different STs, most of them belonging to CC5 in a tertiary hospital in Southern Brazil.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The copy number variation (CNV) is an important genetic marker in cancer and other diseases. To detect CNVs of specific genetic loci, the multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) is an appropriate approach, but the experimental optimization and probe synthesis are still great challenges. The multiplex competitive PCR is an alternative method for CNV detection. However, the construction of internal competitive template and establishment of a stable multiplex PCR system are the main limiting factors for this method. Here, we introduce a novel multiplex fluorescent competitive PCR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periprosthetic joint infection (PJI) is a catastrophic complication following total joint arthroplasty. Until now, the diagnosis of PJI is still confronted with difficulties, which is characterized by technical limitations. The question of whether sonication fluid PCR can provide high value in the diagnosis of PJI remains unanswered. This meta-analysis included 9 studies that evaluated PCR assays of sonication fluid for the diagnosis of PJI. The pooled sensitivity, specificity, Positive likelihood ratio (PLR), Negative likelihood ratio (NLR) and Diagnostic odds ratio (DOR) were 0.75 (95% confi
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious coryza, an upper respiratory tract disease in chickens, caused by Avibacterium paragallinarum, leads to huge economic losses. The disease is controlled through vaccination; but vaccination efficacy is dependent on correct identification of the infecting serovar, as limited cross-protection is reported amongst some serovars. Current identification methods include the heamagglutination inhibition test, which is demanding and could be subjective. To overcome this, molecular typing methods proposed are the Multiplex polymerase chain reaction (PCR) and Restriction Fragment Length Polymor…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Phenylketonuria (PKU), which primarily results from a deficiency of phenylalanine hydroxylase (PAH), is one of the most common inherited inborn errors of metabolism that impairs postnatal cognitive development. The incidence of various PAH variations differs by race and ethnicity. The aim of the present study was to characterize the PAH gene variants of a Han population from Northern China.
METHODS: In total, 655 PKU patients and their families were recruited for this study; each proband was diagnosed both clinically and biochemically with phenylketonuria. Subjects were sequential
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study aim was to investigate the prevalence and clinical relevance of viral findings by multiplex PCR from the nasopharynx of clinically septic patients during a winter season. During 11 weeks of the influenza epidemic period in January-March 2012, consecutive adult patients suspected to be septic (n = 432) were analyzed with cultures from blood and nasopharynx plus multiplex PCR for respiratory viruses on the nasopharyngeal specimen. The results were compared with those from microbiology analyses ordered as part of standard care. During the winter season, viral respiratory pathogens, main
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In 2005-2006 a major epidemics of Chikungunya disease occurred in South-West Indian Ocean islands. In Reunion Island, the magnitude of Chikungunya infection related symptoms was high and with over 38% of serological prevalence in the population. This epidemics illustrated the potential threat of emerging arboviral diseases for inhabitants of Reunion Island and elsewhere since vectors are worldwide distributed. A sentinel surveillance network was set-up to detect emerging pathogens associated with fever over 38 °C and in the absence of known etiologic causes. Leptospirosis is caused
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmodium knowlesi is a newly described zoonosis that causes malaria in the human population that can be severe and fatal. The study of P. knowlesi parasites from human clinical isolates is relatively new and, in order to obtain maximum information from patient sample collections, we explored the possibility of generating P. knowlesi genome sequences from archived clinical isolates. Our patient sample collection consisted of frozen whole blood samples that contained excessive human DNA contamination and, in that form, were not suitable for parasite genome sequencing. We developed a method to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Streptococcus pneumoniae, which cause noninvasive pneumococcal diseases, severely impair children's health. This study analyzed serotype distribution and antimicrobial resistance of S. pneumoniae from January 2012 to December 2012 in a Children's Hospital, Shanghai.
METHODS: A total of 328 pneumococcal isolates were serotyped by multiplex sequential PCR and/or capsule-quellung reaction. The minimum inhibitory concentrations for 11 antimicrobial agents were determined by broth microdilution method.
RESULTS: Among 328 strains, 19F (36.3%), 19A (13.4%), 6A (11.9%), 23F (11.0%), 14 (
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most cases of osteogenesis imperfecta (OI) are caused by heterozygous mutations in COL1A1 or COL1A2, the genes encoding the two type I procollagen alpha chains, proα1 (I) and proα2 (I). We report on a unique case of severe OI, a long term survivor of lethal type II OI, rather than progressively deforming type III, due to double substitutions of glycine residues in COL1A2 (p.Gly208Glu and p.Gly235Asp), located on the same allele. To the best of our knowledge, this is the first example of a patient with double COL1A2 glycine substitution mutations on the same allele. We show for the first time t
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: While many studies have suggested a possible link between breast cancer pathogenesis and infection by viruses, the role of viruses in breast carcinogenesis remains controversial.
OBJECTIVES: We analyzed the prevalence of 30 oncogenic human papillomaviruses (HPVs), Epstein-Barr virus (EBV), Kaposi's sarcoma herpes virus (KSHV) and six polyomaviruses in breast tumor specimens.
STUDY DESIGN: We analyzed breast specimens from 100 breast cancer patients (group 1) and 50 benign breast disease patients (group 2) from Shaanxi Province in China. We also screened for the viruses in blood s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alveolar echinococcosis is a zoonotic disease caused by the metacestode of Echinococcus multilocularis. Many species of small mammals, including arvicolid rodents or Ochotona spp., are natural intermediate hosts of the cestode. The main aim of this study was to identify natural intermediate hosts of E. multilocularis in Chenaran County, Razavi Khorasan Province, northeastern Iran, where the prevalence of infected wild and domestic carnivores is high.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: A program of trapping was carried out in five villages in which this cestode was reported in carnivo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Switches from the lymphoid to myeloid lineage during B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (BCP-ALL) treatment are considered rare and thus far have been detected in MLL-rearranged leukemia. Here, we describe a novel BCP-ALL subset, switching BCP-ALL or swALL, which demonstrated monocytosis early during treatment. Despite their monocytic phenotype, 'monocytoids' share immunoreceptor gene rearrangements with leukemic B lymphoblasts. All swALLs demonstrated BCP-ALL with CD2 positivity and no MLL alterations, and the proportion of swALLs cases among BCP-ALLs was unexpectedly high (4%). Th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.