Avian leukosis virus (ALV) remains a major threat to the poultry industry due to its ability to establish persistent infection, induce immunosuppression, and promote tumorigenesis. Despite progress in eradication programs, effective control is hindered by subclinical infection, vertical transmission, and rapid viral evolution. A key limitation lies in the complexity of host-virus interactions, which are governed by multi-layered regulatory processes that cannot be fully resolved by studies focusing on single genes, pathways, or omics layers. In addition, the lack of robust and dynamic phenotyp
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serious non-AIDS events (SNAEs), including non-AIDS malignancies, cardiovascular disease, and hepatic complications, remain major causes of mortality in treated HIV infection. These outcomes are driven by persistent immune activation, systemic inflammation, and metabolic dysfunction despite effective viral suppression with antiretroviral therapy (ART). To investigate mechanisms underlying SNAE pathogenesis, we performed a cross-site multi-omic analysis integrating plasma proteins, plasma metabolites, and mucosal microbiomes in 82 ART-treated people with HIV (PWH) and 10 people without HIV from
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The fecal lipidomic changes underlying the colorectal adenoma-carcinoma sequence remain incompletely characterized, particularly regarding the continuous metabolic trajectory and heterogeneity of precancerous adenomas. We aimed to use publicly available multi-omics data and an integrative computational framework to identify candidate lipidomic features associated with a CRC-like metabolic state in adenomas.
METHODS: We developed an extreme-phenotype machine learning strategy using fecal lipidomics from healthy controls and colorectal cancer (CRC) patients (Study ID: ST003798) to b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Parkinson's disease (PD) is associated with gut microbiome shifts. These shifts are mainly described at taxonomic level, but the functional consequences remain unclear. To obtain insight into the functional disruptions of the gut microbiome in PD, we used an integrated multi-omics approach, comparing gut microbiomes of individuals with PD, prodromal PD, and healthy controls.
RESULTS: Meta-metabolomics, the most discriminatory and robust omics level, was selected to Guide the analysis. We identified 11 metabolites that were differentially abundant between the groups, among which β-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanisms underlying lymph node metastasis (LNM) in papillary thyroid carcinoma (PTC) remain elusive. This study integrated single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data, spatial transcriptomics (ST) data, and bulk transcriptomic data. Analyses revealed that N1-stage tumors exhibit a highly active immune-inflammatory microenvironment with an increase in immunosuppressive cells. Successfully disseminated tumor clones achieve immune escape by downregulating antigen presentation mechanisms. Pseudotime analysis uncovered a shared developmental trajectory and significant functional heterogeneity
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's Disease (AD) is the most prevalent neurodegenerative disorder, characterized by progressive cognitive decline. Early and accurate diagnosis is crucial for improving patient outcomes, yet current diagnostic methods remain invasive, costly, and limited in accessibility. This study leverages artificial intelligence (AI) and machine learning approaches to perform a multi-omics analysis, integrating proteomics and transcriptomics data to identify potential biomarkers for early AD prediction. Using multiple AD-related databases and AI-powered literature review tools, we extracted and ana
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer disease (AD) polygenic risk scores (ADPRS) built from cell-type (ct) specific genetic variants can be used to infer cell-type contributions to AD. We derived two ct-ADPRSs using variants near single-nuclei RNA-seq (snRNA) derived cell-type specific genes or on single-nuclei ATAC-seq (snATAC) derived cell-type specific accessible chromatin regions. We generated a multi-omic ct-ADPRS for eight neuron subtypes using both single-nuclei datasets. SnATAC-derived ct-ADPRSs demonstrated considerably lower correlations among cell types (average r = 0.071) than snRNA-derived ct-ADPRSs (average
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is highly heterogeneous, with relapse occurring in the majority of cases, and recent advancements in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), sc-metabolism profiling, and bulk RNA-seq have facilitated the identification of cell subpopulations and metabolic reprogramming at the single-cell level, uncovering novel molecular mechanisms. This study aims to establish a multi-omics atlas of MM, characterizing the cell subpopulations and signaling pathways that drive immune evasion and disease progression. Additionally, sc-metabolic profiling identifies reprogramming patterns and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Root rot disease poses a devastating threat to Coptis chinensis Franch, a medicinal plant prized for its bioactive alkaloids. To dissect its defense mechanisms, we conducted integrated transcriptomic and metabolomic analyses on resistant (R), early-stage infected (S-ES), and late-stage infected (S-LS) plants Our findings reveal a disease severity-dependent escalation in flavonoid metabolism. Key metabolites, such as kaempferol and quercetin derivatives, were significantly increased compared to R, paralleled by progressive upregulation of biosynthetic genes (PAL, CHS, CHI, FLS). Strikingly, sal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The primary objective of this study is to comprehensively investigate the genetic association between mitochondrial gene expression, methylation, and primary open-angle glaucoma (POAG) using Mendelian randomization (MR) analysis.
METHODS: In this study, mitochondrial-related genes and methylation sites were extracted from two expression quantitative trait locus (eQTL) datasets (eQTLGen and GTEx V8) and one methylation quantitative trait loci dataset for summary data-based Mendelian randomization (SMR) analysis and heterogeneity in dependent instrument (HEIDI) testing. Further MR anal
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mineral weathering bacteria are known to mobilize the nutrients entrapped in minerals using acidification- and chelation-driven mineral weathering (MWe) mechanisms. Through these mechanisms, bacteria are expected to play important roles in soil nutrient cycling and tree nutrition. Among the most effective MWe bacteria identified, Collimonas are particularly interesting due to their occurrence in the rhizosphere and their ability to acidify their environment using a glucose methanol choline oxidoreductase and to mobilize iron using malleobactin. Until now, the regulations of these functions acc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer (BCa), the most prevalent malignancy of the urinary system, is strongly associated with environmental factors including smoking and industrial chemical exposure. Although previous studies have explored the relationship between various environmental pollutants and BCa mechanisms, there is still a need for an in-depth analysis of the specific effects and particular roles of these pollutants. This study investigates the molecular mechanisms linking environmental pollutant exposure to bladder carcinogenesis through a multi-omics integrative analysis that systematically elucidates th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paraquat (PQ), a widely used non-selective herbicide, poses significant health risks, with as little as 30 mL potentially causing fatal poisoning due to acute lung injury (ALI). Despite frequent cases, effective treatments for PQ poisoning are limited, highlighting the need for in-depth investigation into the mechanisms underlying PQ-induced ALI. Resveratrol was identified as a therapeutic agent based on the key differentially regulated pathways. This study investigates the potential therapeutic effects of Resveratrol on Paraquat-induced acute lung injury (ALI) through both in vivo and in vitr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Air pollution has emerged as a significant risk factor for acute kidney injury (AKI), yet the molecular mechanisms underlying this association remain poorly defined. This study aimed to elucidate the nephrotoxic effects of representative air pollutants and identify molecular targets involved in pollutant-induced AKI.
METHODS: We developed a multi-layered computational and experimental framework integrating omics-based target prediction, network toxicology, machine learning, Mendelian randomization (MR), single-cell profiling, molecular docking with dynamic simulations, and analysi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rumen flatulence is a diet-related rumen disease in ruminants. This study induced a rumen flatulence model in Xizang sheep using alfalfa (HRF) and wheatgrass (MRF). The aim was to understand the rumen microbiota diversity in healthy and pathological states, host-microbiota interactions, and the molecular mechanisms of rumen flatulence. Results showed that the pH in the HRF and MRF groups was lower than that in the natural grass group (LRF). SCFA concentrations varied between groups: in HRF, 2-BA and CA increased; in MRF, 4-MVA and 5-MCA rose. Microbial analysis indicated that the alpha- and be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Spontaneous abortion is a complex disorder with a significant genetic component. Identifying genetic variants influencing spontaneous abortion risk could unveil biological pathways and potential therapeutic targets.
METHODS: We performed Mendelian randomization using cis- and trans-protein quantitative trait loci (pQTLs) as instrumental variables to assess causal effects of circulating proteins on spontaneous abortion. Proteins exhibiting differential expression between sexes were excluded. KEGG pathway enrichment was employed to investigate the pathways affected by susceptibility
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atrazine (ATZ), a frequently used herbicide, has well-documented toxicities in various organisms, yet its specific impact on skeletal muscle remains largely uncharted. Here, we found that ATZ inhibited myotube formation in C2C12 myoblasts and decreased both body weight and the cross-sectional areas of type IIA, IIB, and IIX myofibers in mice. Furthermore, ATZ drove muscle fiber shifting from mixed oxidative/glycolytic type IIA to fast-glycolytic type IIB, reduced satellite stem cell abundance, and contributed to excessive lipid accumulation. Mechanistically, transcriptomic analyses indicated t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Steroid-induced osteonecrosis of the femoral head (SIONFH) represents a global therapeutic challenge, and its pathogenesis requires in-depth investigation. While oxidative stress is recognized as a critical contributor to SIONFH, the underlying mechanism remains incompletely elucidated.
METHODS: In this study, multi-omics analysis of clinical specimens was performed to screen for oxidative stress-related molecules in SIONFH and identify hub molecules among them. Subsequently, the functional significance of these hub molecules was validated via Gene Ontology (GO) analysis and both
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hydroxyurea (HU) is an antitumor drug. However, HU exposure is associated with diminished ovarian reserve (DOR). Zi Chong granules, a Chinese Medicine, can protect against DOR, but little is known regarding its underlying mechanisms of DOR treatment, and thus the target of the present study.
METHODS: Seventy-two female Kunming (KM) mice (4-6 weeks old) were randomly divided into three groups: the control group (Con), the hydroxyurea group (HU), and the Zi Chong group (ZC). The Con group received saline, while the HU and ZC groups were administered hydroxyurea (400 mg/kg/d) by gava
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Leukopenia is caused by numerous factors, and modern drug therapies have obvious side effects, Qijiao Shengbai Capsule (QJSB) is a compound prescription developed from Miao medicine, widely used in clinical treatment of leukopenia. However, its mechanism of action for treating leukopenia remains unclear.
OBJECTIVES: This study aims to investigate the active ingredients, effects and underlying mechanism of QJSB on leukopenia.
MATERIALS AND METHODS: In this study, the chemical components of QJSB and serum constituents were identified using UPLC-Q-Qrbitrap HRMS technology. The pot
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования