Gastric cancer (GC) prognosis remains suboptimally defined by conventional clinicopathological parameters, necessitating integrative multi-omics approaches to unravel molecular heterogeneity. This study established a robust multi-omics prognostic framework through synergistic analysis of transcriptomic, epigenomic, and clinical data from 108 GC patients. Genome-wide expression profiling and methylation array analysis identified 1,243 survival-associated transcripts and 8,742 prognostic CpG sites, with cross-omics integration via similarity network fusion revealing three molecular subtypes exhi
Оценочное исследованиеСтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-operative recurrence rates of stage I non-small cell lung cancer (NSCLC) range from 20% to 40%. Nonetheless, the molecular mechanisms underlying recurrence hitherto remain largely elusive. Here, we generate genomic, epigenomic and transcriptomic profiles of paired tumors and adjacent tissues from 122 stage I NSCLC patients, among which 57 patients develop recurrence after surgery during follow-up. Integrated analyses illustrate that the presence of predominantly solid or micropapillary histological subtypes, increased genomic instability, and APOBEC-related signature are associated with r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic neuroendocrine tumors (pNETs) are rare malignancies, accounting for 1-2% of pancreatic cancers, with an incidence of ≤1 case per 100,000 individuals annually. Originating from pancreatic endocrine cells, pNETs display significant clinical and biological heterogeneity. Traditional classification based on proliferative grading does not fully capture the complex mechanisms involved, such as oxidative stress, mitochondrial dysfunction, and tumor-associated macrophage infiltration. Recent advances in molecular profiling have revealed key oncogenic drivers, including MEN1 (menin 1), DAXX
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isolated environments such as islands can provide restricted dietary resources of varying quality. This has a major impact on evolution of island species, and can lead to rapid morphological adaptation, especially in small mammals. To understand the impact of diet quality on the masticatory apparatus in the model species Mus musculus domesticus, we quantitatively analysed the main masticatory muscles and the mandibular morphology in semi-natural populations kept on different diets for six generations. The investigation of individuals of the F5 generation raised on high quality (HQ) or standard
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing embryos are susceptible to fluctuations in the nutrients and metabolites concentrations within the reproductive tract, which can lead to alterations in their developmental trajectory. Ketotic dairy cows have diminished fertility, and elevated levels of the ketone body beta-hydroxybutyrate (BHB) have been associated with poor embryonic development. We used an in vitro model based on either in vitro fertilization (IVF) or parthenogenesis to investigate the effects of BHB on the preimplantation bovine embryo development, epigenome, and transcriptome. Embryo culture medium was supplemen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico2025eng
DNA methylation, histone modifications, and regulation of non-coding RNA are all epigenetic modifications affecting cancer cells of origin and progression. These changes lead to changed expression of genes, which in turn is the reason for cancer occurrence in the form of inhibition of tumor suppressor genes or activation of oncogenes. Epigenetic changes, as opposed to genetic mutations, are reversible; thus, they seem to be interesting targets for therapeutic interventions. Current review summarizes the various types of epidrugs -DNA methyltransferase inhibitors (DNMTis), histone deacetylase i
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant alterations in genome copy number, chromatin accessibility, and transcriptional programs all play pivotal roles in cancer. The Numbat algorithm has been widely adopted to perform copy number variation (CNV) inference from single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data. Here, we introduce Numbat-multiome that extends the capabilities of Numbat to perform CNV inference from both scRNA-seq and accessible chromatin profiles (through single-cell Assay of Transposase [Tn5]-Accessible Chromatin sequencing [scATAC-seq] data), either separately or in an integrated manner. Our approach unifies dat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the developing vertebrate retina, progenitor cells proliferate and differentiate into specialized neurons with remarkable spatial and temporal precision. This process is coordinated by multiple interactions between the genome and the epigenome. Chromatin remodeling plays an important role in the regulation of retinal cell type-specific transcriptional programs. Vertebrate switch/sucrose non-fermentable (SWI/SNF) complexes, also known as Brg1/Brg-associated factors (BAF complexes)are multi-subunit, ATP-dependent chromatin-remodeling complexes assembled from homologous subunit families. The A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly-epigenetic scores (PEGS) are surrogate measures that help capture individual-level risk. Understanding how the associations between PEGS and cardiometabolic risk factors vary by demographics and health behaviors is crucial for lowering the burden of cardiometabolic diseases. We used results from established epigenome-wide association studies to construct trait-specific PEGS from whole blood DNA methylation for systolic and diastolic blood pressure (SBP, DBP), body mass index (BMI), C-reactive protein (CRP), high- and low-density lipoprotein cholesterol (HDL-C, LDL-C), triglycerides (TG),
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Migraine pathophysiology involves epigenetic mechanisms, but key molecular regulators remain poorly defined. This study aimed to elucidate these mechanisms using a comprehensive multi-omics approach. METHODS: We established a nitroglycerin (NTG)-induced migraine-like mouse model. Sensory hypersensitivity was assessed via behavioral tests, and neuronal activation was evaluated by immunofluorescence staining for c-Fos in the trigeminal nucleus caudalis. Integrated transcriptomic profiling (RNA-seq) and epigenomic analysis (ATAC-seq) were performed, followed by differential expression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Hyperinsulinemic hypoglycemia (HI) can be the presenting feature of Kabuki syndrome (KS), which is caused by loss-of-function variants in KMT2D or KDM6A. As these genes play a critical role in maintaining methylation status in chromatin, individuals with pathogenic variants have a disease-specific epigenomic profile-an episignature.
OBJECTIVE: We evaluated the pathogenicity of 3 novel partial KDM6A duplications identified in 3 individuals presenting with neonatal-onset HI without typical features of KS at the time of genetic testing.
METHODS: Three different partial KDM6A duplicatio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orofacial clefts are the most common form of congenital craniofacial malformation worldwide. The etiology of these birth defects is multifactorial, involving genetic and environmental factors. However, in most cases, the underlying causes remain unexplained, precluding a molecular understanding of disease mechanisms. Here, we integrated genome-wide association data, targeted resequencing of case and control cohorts, tissue- and cell-type-specific epigenomic profiling, and genome architecture analyses to molecularly dissect a genomic locus associated with an increased risk of non-syndromic orof
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antigen specificity is the central trait distinguishing adaptive from innate immune function. Assembly of antigen-specific T cell and B cell receptors occurs through V(D)J recombination mediated by the Recombinase Activating Gene endonucleases RAG1 and RAG2 (collectively called RAG). In the absence of RAG, mature T and B cells do not develop and thus RAG is critically associated with adaptive immune function. In addition to adaptive T helper 2 (Th2) cells, group 2 innate lymphoid cells (ILC2s) contribute to type 2 immune responses by producing cytokines like Interleukin-5 (IL-5) and IL-13. Alt
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The prevalence of tetralogy of Fallot (TOF), a common congenital heart defect, has increased over the last two decades.
METHODS: Genome-wide CpG methylation patterns were assessed and analyzed in relation to gestational air pollution exposure among 24 infants with TOF and 24 sex-matched control infants without a birth defect from a North Carolina population-based, case-control study of major structural birth defects (2006-2011). Air pollution exposure during obstetric weeks 3-8 was assigned based on self-reported residence. DNA was extracted from residual newborn blood spots, and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Papaver somniferum (opium poppy) is a major source of benzylisoquinoline alkaloids (BIAs), including pharmaceutically important compounds such as morphine and noscapine. While the enzymatic pathways underlying BIA biosynthesis are well-characterized, the epigenetic mechanisms that govern tissue- and genotype-specific alkaloid accumulation remain poorly understood.
RESULTS: This study presents a comparative DNA methylation analysis of stem and capsule tissues from P. somniferum cultivars with distinct alkaloid profiles. High-alkaloid-yielding cultivars exhibited hypomethylation of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Cancer drug resistance is multifactorial, driven by heritable (epi)genetic changes but also by phenotypic plasticity. In this study, we dissected the drivers of resistance by perturbing organoids derived from patients with colorectal cancer longitudinally with drugs in sequence. Combined longitudinal lineage tracking, single-cell multiomics analysis, evolutionary modeling, and machine learning revealed that different targeted drugs select for distinct subclones, supporting rationally designed drug sequences. The cellular memory of drug resistance was encoded as a heritable epigenet
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA modifications have recently gained great attention due to their extensive regulatory effects in a wide range of cellular networks and signaling pathways. In cardiovascular diseases (CVDs), several RNA changes, called "epitranscriptome" alterations, are found in all RNA molecules (tRNA, rRNA, mRNA, and ncRNAs). Unlike the epigenetic process, which influences the progression of atherosclerosis (AS), its transcriptional and post-transcriptional regulatory mechanisms are still unknown. Here, we described the main epitranscriptome signs to provide new insights into AS, including m6A, m5C, m1A,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Chromatin interactions, particularly those between promoters and distal enhancers, enable precise gene regulation in specialized tissues, like the cochlea in the inner ear. Disruptions in these long-range interactions between enhancers and gene promoters are linked to hereditary hearing loss. For many genes important to cochlear development and function, the distal regulatory elements that control their expression remain unknown. Identifying these elements and studying their regulatory roles is challenging due to their distance from target genes and the spatial complexity of chro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Defining consequential differences in intestinal epithelial stem cells in healthy humans vs those with inflammatory bowel disease (Crohn's disease and ulcerative colitis) is essential for the development of much needed therapies to restore the epithelial barrier and maintain its fidelity.
METHODS: We used single-cell transcriptomic and epigenomic approaches in matched patient tissues and organoids to investigate epithelial gene expression and function in children with no pathological diagnosis in the lower gastrointestinal tract and healthy adults compared with those with C
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is a leading cause of cancer mortality globally, with particularly high burdens among people living with HIV (PLWH) in low-resource settings like Nigeria. Effective early detection remains a major challenge due to limited access to imaging-based surveillance and the low sensitivity of current biomarkers such as alpha-fetoprotein (AFP). We conducted an epigenome-wide association study (EWAS) of circulating cell-free DNA (ccfDNA) methylation in a Nigerian cohort of HIV-positive individuals (n = 245), spanning HCC, cirrhosis (FibroScan ≥12.3 kPa), fibrosis (FibroSca
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования