BACKGROUND: It is well known that chronic inflammation plays a pivotal role in the development of hepatitis B virus (HBV) related hepatocellular carcinoma (HCC). However, the causes behind aberrant expression of inflammation-related genes occurred in HCC remain unclear.
METHODS: We performed array-based analyses to comprehensively investigate the contributions of DNA methylation and somatic copy number aberration (SCNA) to the aberrant expression of 1,027 inflammation-related genes in 30 HCCs and paired non-tumor tissues. The results were validated in public datasets and an additional sample
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The oncogenic transcription factor MYC is pathologically activated in many human malignancies. A paradigm for MYC dysregulation is offered by Burkitt lymphoma, where chromosomal translocations leading to Immunoglobulin gene-MYC fusion are the crucial initiating oncogenic events. However, Burkitt lymphoma cases with no detectable MYC rearrangement but maintaining MYC expression have been identified and alternative mechanisms can be involved in MYC dysregulation in these cases.
METHODS: We studied the microRNA profile of MYC translocation-positive and MYC translocation-negative Burk
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heparanase is an endoglycosidase that specifically cleaves heparan sulfate side chains of heparan sulfate proteoglycans, the major proteoglycans in the extracellular matrix and cell surfaces. Traditionally, heparanase activity was implicated in cellular invasion associated with angiogenesis, inflammation, and cancer metastasis. More recently, heparanase up-regulation was documented in an increasing number of primary human tumors. Iotan this study, we sought to investigate the expression of heparanase messenger RNA (mRNA) in normal cervical tissue and intraepithelial cervical lesion and its cli
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUNDS AND AIMS: Liver cancer is the sixth most common type of cancer and the fifth leading cause of cancer mortality worldwide. Scribble has been shown to function as a neoplastic tumor suppressor gene in most tumors. Our previous studies reported that down-regulation or mislocalization of Scribble was sufficient to initiate mammary tumorigenesis and NSCLC. Recently, it was reported that Scribble was highly expressed in hepatocellular carcinoma (HCC). We aim to study how it was up-regulated and the contradictory role of Scribble in HCC.
METHODS AND RESULTS: Using a mouse model of carbon
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell immortalization is the initial step for cancer development. To identify the differentially expressed genes regulated by DNA methylation over the course of human primary bronchial epithelial cell (HPBECs) immortalization, an immortalized HBE cell line (HBETT) was generated via introduction of an SV40 LT and a catalytic subunit of human telomerase reverse transcriptase (hTERT) into the HPBECs. Microarrays of mRNA and DNA methylation were performed to compare the transcriptomes and DNA methylomes between these two types of cells. The results from the mRNA microarray revealed many genes whose
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current genomic technologies have immensely improved disease classification and prognostication of major subtypes of B-cell lymphomas. This novel genetic information has not only aided in diagnosis, but has also revealed a landscape of critical molecular events that determine the biological and clinical behavior of a lymphoma. In this review, we summarized the genetic characteristics of major subtypes of B-cell lymphomas, including diffuse large B cell lymphoma (DLBCL), follicular lymphoma (FL), Burkitt lymphoma (BL), and mantle cell lymphoma (MCL). We illustrated how genomic profiling had ide
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic cancer (PC) is among the most aggressive and lethal malignancies, characterized by development within a complex tumor microenvironment (TME) that includes a desmoplastic stroma composed of extracellular matrix (ECM) and various cellular components.
OBJECTIVES: This study aims to elucidate the cellular and molecular mechanisms regulating PC progression through an integrated analysis of single-cell pseudotime trajectories and intercellular communication.
MATERIAL AND METHODS: We constructed pseudotime trajectories using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from PC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular senescence plays a context-dependent role in gastric cancer (GC), functioning both through tumor-suppressive arrest and the tumor-promoting senescence-associated secretory phenotype. However, its systematic integration into prognostic models remains limited. Here, we develop a novel interpretable framework to identify and validate a robust senescence-related gene signature for GC prognosis. We first introduce a dual-model interpretable feature selection strategy that integrates a biologically informed Kolmogorov-Arnold Network with a tabular foundation model to identify cancer-associa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immune checkpoint blockade (ICB) has improved outcomes for a subset of colorectal cancer (CRC) patients, yet the cellular determinants that drive heterogeneous treatment responses remain insufficiently understood. The extent to which ICB reshapes immune populations across tumor, blood, and adjacent normal tissues at single-cell resolution is largely unexplored.
METHODS: We reanalyzed spatiotemporal single-cell RNA-sequencing data from CRC patients treated with Pembrolizumab or Sintilimab, profiling immune and stromal compartments across pre- and post-treatment tumor, blood, and no
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Ulcerative colitis (UC) is an inflammatory disease characterized by colonic epithelial damage. With prolonged disease duration, the risk of malignant transformation increases significantly. However, the mechanisms driving the progression from chronic inflammation to tumorigenesis remain incompletely understood. This study aimed to identify a set of genes that may contribute to the transition from healthy controls (HC) to UC and ultimately to colitis-associated colorectal cancer (CAC).
METHODS: We conducted bioinformatic analysis of four Gene Expression Omnibus (GEO) datasets to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients diagnosed with breast cancer exhibit a diverse range of prognostic outcomes due to the varied nature of the disease across different patient groups. To address this complexity and enhance prognostic predictions based on gene expression data from breast cancer samples, this study has developed an integrated deep learning method that combines Convolutional Neural Networks (CNN) with Bidirectional Long Short-Term Memory (BiLSTM) networks. This automated pipeline conducts a correlation analysis using Pearson correlation to derive a reliable 236-gene set, ensuring no data contamination fro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Macrophage-related genes (MRGs), a group of pivotal regulators governing macrophage differentiation, polarization, and function, have increasingly been recognized as critical modulators in tumor progression and immune evasion. However, the molecular expression profiles of MRGs and their intricate relationships with the immune microenvironment in breast cancer (BRCA) remain insufficiently investigated.
METHODS: We first used bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing data from the TCGA and GEO databases, we analyzed the molecular expression patterns and clinical relevance o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple Negative Breast Cancer is a clinically aggressive and molecularly heterogeneous subtype of breast cancer that currently lacks effective targeted therapies. Recognising biologically distinct subtypes within this disease is crucial for enhancing diagnosis, prognosis, and therapeutic approaches. This study introduces a comprehensive analytical framework that integrates unsupervised clustering, differential gene expression analysis, pathway enrichment, and explainable machine learning to delineate robust molecular subtypes of Triple Negative Breast Cancer and their corresponding biological
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Complement factor B (CFB), a key component of the alternative complement pathway, has been implicated in tumor-related inflammation; however, its causal role and therapeutic relevance in breast cancer remain unclear. By integrating genetic epidemiology, multiomics transcriptomics analyses, and AI-assisted drug prediction, we aimed to clarify the biological and clinical significance of CFB in breast cancer.
RESULTS: Mendelian randomization analysis suggested a potential causal association between circulating CFB levels and breast cancer risk (OR = 1.048, 95% CI: 1.018-1.078, p = 0.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer is the most common non-cutaneous cancer in men in the United States. Oxidative stress, induced by chronic prostatic inflammation, impairs normal protective mechanisms in the prostate and increases the risk for cancer progression. We reported that Phellodendron amurense extract (Nexrutine) had similar effects as exercise in reducing highly aggressive tumors in the transgenic adenocarcinoma of the mouse prostate (TRAMP) model. Here, we examined changes in the transcriptome to understand how these two interventions affect prostate cancer. Twenty-four, 8-10 weeks old male TRAMP mic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: KLK2 is an androgen-regulated gene critical in prostate cancer biology with multiple KLK2-targeted therapies in clinical development. We investigated KLK2 RNA expression patterns and associations with molecular features to provide context for emerging KLK2-targeted treatments.
EXPERIMENTAL DESIGN: DNA/RNA next-generation sequencing was performed on 7,078 prostate cancer specimens. KLK2-high/low RNA expression was defined as ≥75th/<25th percentiles (transcripts per million, TPM). KLK2 expression was evaluated across histologic subtypes, disease states, and metastatic sites, with corre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kirsten rat sarcoma viral oncogene homologue (KRAS) is mutated in over 90% of pancreatic ductal adenocarcinomas (PDAC), where hotspot alterations in codons 12, 13, and 61 drive tumour initiation and progression. Although distinct biochemical properties have been described for individual KRAS mutants, whether they generate unique allele-specific signalling programmes in PDAC cells remains unresolved. Here, we systematically interrogated the molecular consequences of seven common KRAS mutant variants in reconstituted isogenic, KRAS-deficient PDAC cell lines by integrated transcriptomic, proteomi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anterior gradient protein 2 (AGR2), a member of the protein disulfide isomerase family, plays a critical role in endoplasmic reticulum proteostasis and has been implicated in breast cancer progression. However, the downstream regulatory programs and signaling pathways governed by AGR2 remain incompletely defined. Here, we employed CRISPR-Cas9-mediated knockout of AGR2 in breast cancer cells to systematically investigate the functional and transcriptional consequences of AGR2 loss. AGR2 depletion resulted in significant suppression of cell migration, invasion, and chemoresistance. Unbiased tran
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To systematically evaluate the prognostic significance of mitochondrial ATP synthase subunits in breast cancer and to investigate the clinical relevance, biological function, and metabolic role of ATP5F1B in breast cancer progression.
METHODS: Publicly available breast cancer transcriptomic profiles with matched clinical annotations were analyzed in a family-level screen of mitochondrial ATP synthase subunits. ATP5F1B was prioritized and was evaluated by loss- and gain-of-function assays in AU565 and HCC1428 cells. Differential expression and functional enrichment analyses were pe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer remains a major global health burden, and environmental endocrine-disrupting chemicals may contribute to breast-cancer-related phenotypes. Methyl-4-hydroxybenzoate (MEP; methylparaben) is a widely used preservative with reported weak estrogenic activity, but its molecular association with breast cancer remains incompletely defined. In this study, we used an integrative exploratory framework combining target prediction, breast-cancer expression datasets, protein-protein interaction analysis, functional enrichment, single-cell transcriptomic signature analysis, molecular docking, m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования