State-of-the-art mass spectrometers combined with modern bioinformatics algorithms for peptide-to-spectrum matching (PSM) with robust statistical scoring allow for more variable features (i.e., post-translational modifications) being reliably identified from (tandem-) mass spectrometry data, often without the need for biochemical enrichment. Semi-specific proteome searches, that enforce a theoretical enzymatic digestion to solely the N- or C-terminal end, allow to identify of native protein termini or those arising from endogenous proteolytic activity (also referred to as "neo-N-termini" analy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is the most prevalent heritable cardiomyopathy. HCM is considered to be caused by mutations in cardiac sarcomeric protein genes. Recent research suggests that the genetic foundation of HCM is much more complex than originally postulated. The clinical presentations of HCM are very variable. Some mutation carriers remain asymptomatic, while others develop severe HCM, terminal heart failure, or sudden cardiac death. Heterogeneity regarding both genetic mutations and the clinical course of HCM hinders the establishment of universal genotype-phenotype correlations.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) infection is a major risk factor for hepatocellular carcinoma (HCC) development and is a global public health issue. High performance biomarkers can aid the early detection of HCC development in HBV-infected individuals. In addition, advances in the understanding of the pathogenesis of HBV infection and in clinical laboratory techniques have enabled the establishment of disease-specific tests, prediction of the progression of liver diseases, including HCC, and auxiliary diagnosis of HCC, using blood-based methods instead of biopsies of liver or HCC tissues. Viral factor
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the last years, the X-linked cyclin-dependent kinase-like 5 (CDKL5) gene has been associated with epileptic encephalopathies characterized by the early onset of intractable epilepsy, severe developmental delay, autistic features, and often the development of Rett syndrome-like features. Still, the role of CDKL5 in neuronal functions is not fully understood. By way of a yeast two hybrid screening we identified the interaction of CDKL5 with shootin1, a brain specific protein acting as a determinant of axon formation during neuronal polarization. We found evidence that CDKL5 is involved, at le
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For several decades, serological biomarkers of neuromuscular diseases as dystrophies, myopathies and myositis have been limited to routine clinical biochemistry panels. Gauging the pathological progression is a prerequisite for proper treatment and therefore identifying accessible, easy to monitor biomarkers that can predict the disease progression would be an important advancement. Most muscle diseases involve accelerated muscle fiber degradation, inflammation, fatty tissue substitution and/or fibrosis. All these pathological traits have been shown to give rise to serological peptide biomarke
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The p63 transcription factor, homolog to the p53 tumor suppressor gene, plays a crucial role in epidermal and limb development, as its mutations are associated to human congenital syndromes characterized by skin, craniofacial and limb defects. While limb and skin-specific p63 transcriptional targets are being discovered, little is known of the post-translation modifications controlling ΔNp63α functions. Here we show that the p300 acetyl-transferase physically interacts in vivo with ΔNp63α and catalyzes its acetylation on lysine 193 (K193) inducing ΔNp63α stabilization and activating specific t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The autoantigen for the major type of linear IgA bullous dermatosis (LAD, lamina lucida type) is the shed ectodomain of BP180. However, it is unknown why most LAD sera react with the shed ectodomain but not with the intact BP180/type XVII collagen.
OBJECTIVE: The aim of this study was to characterize the unique cleavage-dependent epitope(s) in the shed ectodomain.
METHODS: We used a monoclonal antibody (MAb-1337) and six LAD sera, which reacted preferentially with the shed ectodomain of BP180. The location and characteristics of the epitopes for these antibodies were analyzed mai
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shigella flexneri, a gram-negative bacterium responsible of bacillary dysentery, uses multiple strategies to overcome host immune defense. We have decrypted how this bacterium manipulates host-cell chromatin binders to take control of immune gene expression. We found that OspF, an injected virulence factor previously identified as a repressor of immune gene expression, targets the chromatin reader HP1γ. Heterochromatin Protein 1 family members specifically recognize and bind histone H3 methylated at Lys 9. Although initially identified as chromatin-associated transcriptional silencers in heter
СтатьяКомментарийПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Huntington's disease gene encodes the protein huntingtin (Htt), a soluble protein that largely distributes to the cytoplasm where about half the protein is found in association with membranes. Early studies on Huntington's disease patients suggested changes in membrane phospholipids. Furthermore, changes in phospholipid biosynthetic enzymes have been found in HD cell models using genetic methods. Recent investigations prove that Htt associates with membranes by direct interactions with phospholipids in membranes. Htt contains at least two membrane binding domains, which may work in concert
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homeostasis of serotonergic transmission critically depends on the rate of serotonin reuptake via its plasma membrane transporter (SERT). SERT activity is tightly regulated by multiple mechanisms, including physical association with intracellular proteins and post-translational modifications, such as phosphorylation, but these mechanisms remain partially understood. Here, we show that SERT C-terminal domain recruits both the catalytic and regulatory subunits of the Ca(2+)-activated protein phosphatase calcineurin (CaN) and that the physical association of SERT with CaN is promoted by CaN activ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
After the success of the mass spectrometry (MS) round table that was held at the first Swiss Proteomics Society congress (SPS'01) in Geneva, the SPS has organized a proteomics application exercise and allocated a full session at the SPS'02 congress. The main objective was to encourage the exchange of expertise in protein identification, with a focus on the use of mass spectrometry, and to create a bridge between the users' questions and the instrument providers' solutions. Two samples were sent to fifteen interested labs, including academic groups and MS hardware providers. Participants were a
Conference ProceedingsПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although Alzheimer's disease (AD) is traditionally viewed as a disorder of cerebral amyloid‑β (Aβ) accumulation, emerging evidence has shifted attention toward impaired clearance mechanisms as a primary driver of sporadic disease. Central to this paradigm shift is the glymphatic system and its obligate facilitator, aquaporin‑4 (AQP4), whose polarized localization at astrocytic endfeet is essential for efficient interstitial solute clearance. Loss of AQP4 polarization, termed depolarization, is consistently observed in AD mouse models as a driver of glymphatic failure and in human postmortem ti
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mimicking cell membrane glycocalyx, saccharide modification of nanoparticles offers a potent means to regulate their in vivo fate. Here, we investigate how glycosylation (i.e., glucose, galactose, fructose, mannose, and N-acetylglucosamine) regulates liposomal nanoparticle interactions with plasma proteins and immune cells, which further determine their biodistribution and therapeutic efficacy. While fructose conferred the greatest enhancement in tumor cell uptake in vitro, N-acetylglucosamine-modified nanoparticles achieved the highest tumor accumulation and markedly attenuated systemic clear
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis has a high morbidity and mortality rate, and effective therapeutic options remain limited. Lipopolysaccharide (LPS) is known to induce significant changes in the expression of forkhead box O (FOXO) transcription factor family members, and the mechanisms by which various drugs, including dexamethasone, treat sepsis are associated with the FOXO signaling pathway. Increased FOXO3 expression can reduce levels of inflammatory mediators, such as interleukin-1 (IL-1) and interleukin-6 (IL-6), by more than one-third. However, FOXO proteins not only regulate inflammatory activity but also functi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is characterized by a complex molecular landscape driven by recurrent genetic alterations. While genomic and transcriptomic profiling have identified core drivers, they often fail to provide robust biomarkers due to the significant decoupling of mRNA and protein levels, as well as the critical role of post-translational modifications in tumor biology. This review synthesizes current evidence from landmark proteogenomic initiatives, such as the Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC), and independent multi-omic studies. It evaluates the integ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Arginine biosynthesis is frequently suppressed in cancer because of the loss of argininosuccinate synthase 1 (ASS1) expression, rendering cancer cells reliant on extracellular arginine. This feature has driven the development of systemic arginine-depleting strategies, which are clinically safe but offer limited clinical benefit. In this study, we demonstrated that under arginine scarcity, cancer cells with low ASS1 expression resort to aberrant mRNA translation, characterized by ribosomal frameshifts and amino acid misincorporations. Although aberrant proteins originated from most
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, the repertoire of human small nucleolar noncoding RNAs (snoRNAs) and their potential functions has expanded with the discovery of new snoRNAs and messenger RNA (mRNA) targets, for which snoRNA-guided modifications may influence their stability, translatability, and splicing. We previously identified snoRNAs that are abundant in healthy human muscle progenitor cells. In this study, we demonstrated that SNORA40 and SNORA70 loss-of-function impairs myogenic differentiation. Interestingly, gain-of-function can rescue impaired differentiation muscle progenitor cells in myotonic dystrophy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rising incidence of fluconazole-resistant C. albicans presents a substantial challenge to global health, especially in resource-limited settings.
AIM: To delineate the proteomic and β-hydroxybutyrylome changes associated with fluconazole resistance and identify potential novel therapeutic approaches.
METHODS: We performed comprehensive proteomic and β-hydroxybutyrylome analyses on fluconazole-resistant and -susceptible C. albicans strains. Lysine β-hydroxybutyrylation levels were quantified using Western blotting (WB), and the synergistic interactions between β-hydroxybutyrat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic reprogramming plays a central role in tumors. However, the key drivers modulating reprogramming of gluconeogenesis/lipogenesis are poorly understood. Here, we try to identify the mechanism by which histone acetyltransferase 1 (HAT1) confers reprogramming of gluconeogenesis/lipogenesis in liver cancer. Diethylnitrosamine (DEN)/carbon tetrachloride (CCl4)-induced hepatocarcinogenesis was hardly observed in HAT1-knockout mice. Multi-omics identified that HAT1 modulated gluconeogenesis and lipogenesis in liver. Protein phosphatase 2 scaffold subunit alpha (PPP2R1A) promoted gluconeogenes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of effective vaccines necessitates a delicate balance between maximizing immunogenicity and minimizing safety concerns. Subunit vaccines, while generally considered safe, often fail to elicit robust and durable immune responses. Nanotechnology presents a promising approach to address this dilemma, enabling subunit antigens to mimic critical aspects of native pathogens, such as nanoscale dimensions, geometry, and highly repetitive antigen display. Various expression systems, including Escherichia coli (E. coli), yeast, baculovirus/insect cells, and Chinese hamster ovary (CHO) ce
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования