The celebrated Abakaliki smallpox data have appeared numerous times in the epidemic modelling literature, but in almost all cases only a specific subset of the data is considered. The only previous analysis of the full data set relied on approximation methods to derive a likelihood and did not assess model adequacy. The data themselves continue to be of interest due to concerns about the possible re-emergence of smallpox as a bioterrorism weapon. We present the first full Bayesian statistical analysis using data-augmentation Markov chain Monte Carlo methods which avoid the need for likelihood
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Для определения возможных очагов вспышек лихорадки денге летом и зимой представляется Байесовская сеть убеждений (ББН) для оценки потенциального риска возникновения и распространения вируса денге в Западной Австралии (WA). В модели оцениваются вероятности двух видов событий, которые должны произойти до вспышки: 1) введение вирусных и комарных векторов в места, где плотность населения высока; и 2) темпы роста населения переносчиков болезней, на которые влияют климатические факторы. Результаты показали, что если бы в ВА были созданы либо Aedes aegypti, либо Ae. albopictus, то три центра в северн
СтатьяПолный текст не найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comparative genomic sequencing is a major surveillance tool in the Polio Laboratory Network. Due to the rapid evolution of polioviruses (~1 % per year), pathways of virus transmission can be reconstructed from the pathways of genomic evolution. Here, we describe three main phylogenetic methods; estimation of genetic distances, reconstruction of a maximum-likelihood (ML) tree, and estimation of substitution rates using Bayesian Markov chain Monte Carlo (MCMC). The data set used consists of complete capsid sequences from a survey of poliovirus sequences available in GenBank.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chins, which are unique to humans, have generated considerable debate concerning their evolutionary origins, yet a consensus has remained elusive. Many have argued that chins are adaptations for chewing stress, speech, or sexual ornamentation. Alternatively, some have suggested that chins are spandrels-byproducts of selection operating elsewhere in the mandible or face. Lastly, chins could be the product of genetic drift. The questions addressed by this study are: [1] whether chins represent an exceptionally derived morphological condition, and [2] if this can be interpreted as the product of
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In clinical trials, continuous monitoring of event incidence rate plays a critical role in making timely decisions affecting trial outcome. For example, continuous monitoring of adverse events protects the safety of trial participants, while continuous monitoring of efficacy events helps identify early signals of efficacy or futility. Because the endpoint of interest is often the event incidence associated with a given length of treatment duration (e.g., incidence proportion of an adverse event with 2 years of dosing), assessing the event proportion before reaching the intended treatment durat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the basis for intracellular motion is critical as the field moves toward a deeper understanding of the relation between Brownian forces, molecular crowding, and anisotropic (or isotropic) energetic forcing. Effective forces and other parameters used to summarize molecular motion change over time in live cells due to latent state changes, e.g., changes induced by dynamic micro-environments, photobleaching, and other heterogeneity inherent in biological processes. This study discusses limitations in currently popular analysis methods (e.g., mean square displacement-based analyses)
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In evaluating the risk of exposure to health hazards, characterizing the dose-response relationship and estimating acceptable exposure levels are the primary goals. In analyses of health risks associated with exposure to ionizing radiation, while there is a clear agreement that moderate to high radiation doses cause harmful effects in humans, little has been known about the possible biological effects at low doses, for example, below 0.1 Gy, which is the dose range relevant to most radiation exposures of concern today. A conventional approach to radiation dose-response estimation based on simp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PREMISE OF THE STUDY: Whereas population genetic studies have examined allopolyploids, comparable studies of naturally occurring autopolyploids remain rare. To address fundamental questions regarding autopolyploidy, we undertook a detailed population genetic study of one of the classic examples of autopolyploidy, Galax urceolata (Diapensiaceae), which comprises diploid, triploid, and autotetraploid cytotypes. Galax is endemic to the Appalachian Mountains, the adjacent piedmont, sandhills, and coastal plain and represents perhaps the most widely known example of autopolyploidy in nature.
METHO
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is an opportunistic protozoan parasite that infects a wide range of animals, including humans. The T. gondii eukaryotic translation initiation factor 4A (eIF4A) protein is expressed in the tachyzoite, but its expression is markedly downregulated in the bradyzoite, and it is therefore considered to be associated with tachyzoite virulence. The present study examined sequence variation in the eIF4A gene among nine strains of different genotypes from different hosts and geographical localities using polymerase chain reaction amplification, sequence analysis, and phylogenetic reco
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Knowledge of the prognostic factors predicting treatment outcome in anorexia nervosa (AN) measured with health-related quality of life (HRQoL) is limited.
AIMS: We performed a novel statistical analysis to identify factors predicting treatment outcome in AN.
METHODS: 39 patients entering treatment of an ICD-10-defined AN completed the 15D HRQoL survey, the Eating Disorder Inventory (EDI) and a questionnaire evaluating self reported health status and eating habits before and 2 years after the start of treatment. The analysis was based on a Bayesian approach, which allows analyses
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: There were 11 pairwise meta-analysis on the efficacy of β-blockers (including atenolol, propranolol, bisoprolol, metoprolol and nadolol), calcium channel blockers (including amlodipine, diltiazem, felodipine, nifedipine and verapamil), and nitrates (including isosorbide dinitrate, isosorbide mononitrate and nitroglycerin) in treating stable angina pectoris. No network meta-analytic study has been published to evaluate the efficacies of these antianginal drugs. Current clinical guidelines (eg, National Institute of Health and Care Excellence (NICE) clinical guideline 126) are only
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This paper introduces a new constrained model and the corresponding algorithm, called unsupervised Bayesian linear unmixing (uBLU), to identify biological signatures from high dimensional assays like gene expression microarrays. The basis for uBLU is a Bayesian model for the data samples which are represented as an additive mixture of random positive gene signatures, called factors, with random positive mixing coefficients, called factor scores, that specify the relative contribution of each signature to a specific sample. The particularity of the proposed method is that uBLU const
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This article reports on the development of a "harmonized" PBPK model for the toxicokinetics of perchloroethylene (tetrachloroethylene or perc) in mice, rats, and humans that includes both oxidation and glutathione (GSH) conjugation of perc, the internal kinetics of the oxidative metabolite trichloroacetic acid (TCA), and the urinary excretion kinetics of the GSH conjugation metabolites N-Acetylated trichlorovinyl cysteine and dichloroacetic acid. The model utilizes a wider range of in vitro and in vivo data than any previous analysis alone, with in vitro data used for initial, or "baseline," p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Experience has long-term effects on perceptual appearance (Q. Haijiang, J. A. Saunders, R. W. Stone, & B. T. Backus, 2006). We asked whether experience affects the appearance of structure-from-motion stimuli when the optic flow is caused by observer ego-motion. Optic flow is an ambiguous depth cue: a rotating object and its oppositely rotating, depth-inverted dual generate similar flow. However, the visual system exploits ego-motion signals to prefer the percept of an object that is stationary over one that rotates (M. Wexler, F. Panerai, I. Lamouret, & J. Droulez, 2001). We replicated this fi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The short-term effects of particulate matter (PM) on mortality and morbidity differ by geographic location and season. Several hypotheses have been proposed for this variation, including different exposures with air conditioning (AC) versus open windows.
METHODS: Bayesian hierarchical modeling was used to explore whether AC prevalence modified day-to-day associations between PM10 and mortality, and between PM2.5 and cardiovascular or respiratory hospitalizations, for those 65 years and older. We considered yearly, summer-only, and winter-only effect estimates and 2 types of AC (ce
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lateral transfer of mobile DNA is a hallmark of bacteria with a free-living replicative stage; however, its significance in obligate intracellular bacteria and other heritable endosymbionts remains controversial. Comparative sequence analyses from laboratory stocks infected with Wolbachia pipientis provide some of the most compelling evidence that bacteriophage WO-B transfers laterally between infections of the same insect host. Lateral transfer between coinfections, however, has been evaluated neither in natural populations nor between closely related Wolbachia strains. Here, we analyze bacte
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolutionary timing and spread of the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC), one of the most successful groups of bacterial pathogens, remains largely unknown. Here, using mycobacterial tandem repeat sequences as genetic markers, we show that the MTBC consists of two independent clades, one composed exclusively of M. tuberculosis lineages from humans and the other composed of both animal and human isolates. The latter also likely derived from a human pathogenic lineage, supporting the hypothesis of an original human host. Using Bayesian statistics and experimental data on the variabili
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper addresses two main questions: first, why should Bayesian and other innovative, data-dependent design models be put into practice and, secondly, given the past dearth of actual applications, how might one example of such a design be implemented in a genuine example trial? Clinical trials amalgamate theory, practice and ethics, but this last point has become relegated to the background, rather than taking often a more appropriate primary role. Trial practice has evolved but has its roots in R. A. Fisher's randomized agricultural field trials of the 1920s. Reasons for, and consequences
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this paper, I develop new approaches for the detection of spatial clustering in case-control data. One method is based upon drawing Thiessen polygons around each control. It is unnecessary to actually draw or compute the boundaries of the polygons; it is sufficient to count, for each control, the number of cases that are closer to that control than to any other control. A second method is similar to the Cuzick-Edwards method, which is based on counts of cases that are among the k-nearest neighbours of cases, but is instead based upon the number of cases within a specified distance of cases.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.