After frog auricles have been in contact with a suspension of bacteria or bacteria-free supernatant fluid, newly synthesized bacterial ribonucleic acid (RNA) is recovered in animal cells. It appears that the presence of bacterial deoxyribonucleic acid (DNA)-dependent RNA polymerase is necessary for the transcription of bacterial DNA in the host cells. This phenomenon seems to be related to a transfer of DNA and DNA-dependent RNA polymerase from bacteria into animal cells.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: In looking for a possible infectious cause for interstitial cystitis (IC), we previously determined that bladder tissue specimens from both IC patients and controls were uniformly positive by polymerase chain reaction assay (PCR) for bacterial 16S ribosomal RNA genes from various genera including Escherichia, Propionobacterium, Acinetobacter, and Salmonella. We therefore determined whether the biopsy forceps might be contaminated with bacterial DNA.
MATERIALS AND METHODS: A total of 23 samples were obtained following disinfection of 6 cold-cup bladder biopsy forceps (2 to 5 specimens
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Temporomandibular joint (TMJ) involvement in juvenile idiopathic arthritis (JIA) occurs in up to 80% of affected children. The purpose of this study was to investigate the presence of bacterial DNA in synovial fluid, and to compare this with clinical and immunological findings in children with JIA, adults with persistent JIA, and adults with rheumatoid arthritis, in order to detect whether bacteria contribute to inflammation in TMJ arthritis. Synovial fluid and skin swab samples were collected from 30 patients (54 TMJs). Bacterial detection was performed using 16S rRNA pyrosequencing. Bacteria
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Bacterial vaccines were first developed and used in the late 1800s to prevent chicken cholera and anthrax. Bacterial pneumonia vaccines were widely used during the 1918 influenza pandemic, despite the influenza A/H1N1 virus not yet being identified. Studies showed that bacterial pathogens, including Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, and Streptococcus pyogenes, contributed significantly to fatal secondary bacterial pneumonias during the pandemic. In this study, we aimed to characterize the microbial composition of two ampules of a mixed bacterial influenza
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To explore the antibody response to Z-DNA, a DNA conformation with a zig-zag structure, blood of patients with systemic lupus erythematosus (SLE) and otherwise healthy individuals (NHS) were assayed by ELISA using brominated poly(dGdC), a synthetic Z-DNA antigen. These studies showed that SLE patients commonly express antibodies to Z-DNA; NHS also had binding in this assay. In SLE blood, levels of antibodies to Z-DNA were related to those to B-DNA using calf thymus DNA as a source of B-DNA; cross-reactivity was demonstrated by adsorption experiments using DNA cellulose. As shown by dissociatio
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Some herpesviruses have been detected in middle ear fluid (MEF) of patients with acute otitis media (AOM), but their role in middle ear disease is unknown. We examined 73 middle ear fluid samples from 73 children with acute otitis media for the presence of four major herpesviral DNA, respiratory viral genomes, and bacterial DNA by multiplex polymerase chain reaction (PCR). Herpesviruses were detected in 16 specimens (22%), with 18 viral infections were identified overall. Respiratory viruses were detected in 35 specimens (48%), 39 viral infections overall. Bacterial DNA was detected in 51 spec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shotgun metagenomic sequencing is a powerful tool for studying bacterial communities in their natural habitats or sites of infection, without the need for cultivation. However, low microbial signals in metagenomic sequencing can be overwhelmed by host DNA contamination, resulting in decreased sensitivity for microbial read detection. Several commercial kits and other methods have been developed to enrich bacterial sequences; however, these assays have not been tested extensively for human intestinal tissues yet. Therefore, the objective of this study was to assess the effectiveness of various
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA sliding clamps are essential for processive DNA synthesis in all domains of life and are loaded by ATP-dependent clamp loaders that recognize recessed 3' ends. How clamp loaders function at nicks and small single-stranded DNA (ssDNA) gaps-common DNA repair intermediates-remains unclear. Here, we show that the bacterial E. coli DnaX clamp loader uses a mechanism distinct from its eukaryotic counterpart. Whereas eukaryotic replication factor C (RFC) unwinds DNA at the recessed 3' end and stabilizes the 5'-dsDNA (double-stranded DNA) at a shoulder site, the bacterial DnaX-complex neither unwi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of two factors, storage and the bacterial DNA extraction method, that potentially affect the 16S rRNA-based profiling of the microbiota in the feces of Japanese adults, were evaluated. Profiles of the microbiota in feces stored in DESS (DMSO-EDTA-salt solution) for 1, 2 and 3 weeks at room temperature, and for 3 weeks at 4°C were compared with those in fresh feces and feces stored in guanidine thiocyanate solution for 3 weeks at 4°C. None of the storage variables (preservation solution, temperature and duration) considerably affected α- and β-diversity of the fecal microbiota and OT
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bacterial translocation is a frequent event in cirrhosis leading to an increased inflammatory response. Splanchnic adrenergic system hyperactivation has been related with increased bacterial translocation. We aim at evaluating the interacting mechanism between hepatic norepinephrine and inflammation during liver damage in the presence of bacterial-DNA.
ANIMALS AND METHODS: Forty-six mice were included in a 16-week protocol of CCl(4)-induced cirrhosis. Laparotomies were performed at weeks 6, 10, 13 and 16. A second set of forty mice injected with a single intraperitoneal dose of CC
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate mechanisms for the induction of anti-DNA antibodies in systemic lupus erythematosus (SLE), the specificity of anti-DNA antibodies was determined in sera from SLE patients and normal control subjects. As a marker of these responses, the reactivity to single-stranded DNA of various mammalian and bacterial species origin was tested by enzyme-linked immunosorbent assay. Patients with SLE demonstrated serum antibodies to all six types of DNA tested, whereas normal control subjects showed appreciable antibody responses only to DNA obtained from Micrococcus lysodeikticus (MC) and Staph
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To report a patient with Neisseria meningitidis endophthalmitis without associated meningitis with full visual recovery, with early detection of the microorganism using polymerase chain reaction (PCR) analysis.
DESIGN: Retrospective, observational case report.
PARTICIPANTS: One patient with endogenous endophthalmitis.
METHODS: Polymerase chain reaction analysis and culture of the intraocular fluid sample. Polymerase chain reaction analysis was performed with a universal (16S rRNA) primer set to detect bacterial DNA, and subsequently a specific probe was used to detect Neisseria spe
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA sliding clamps are essential for processive DNA synthesis in all domains of life and are loaded by ATP-dependent clamp loaders that recognize recessed 3' ends. How clamp loaders function at nicks and small ssDNA gaps-common intermediates during DNA repair-remains incompletely understood. Here, we show that the bacterial Escherichia coli DnaX clamp loader employs a fundamentally different mechanism from its eukaryotic counterpart. Whereas eukaryotic RFC unwinds DNA at the recessed 3' end and stabilizes the 5'-dsDNA at a dedicated shoulder site, the bacterial DnaX-complex neither unwinds DNA
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Prospective service evaluation of the utility of molecular methods to analyse neonatal gastric aspirate specimens in a single neonatal unit and associated maternity unit. 43 newborn infants investigated for sepsis with median gestational age of 39 weeks (range 31-41 weeks) and median birth weight 3050 grams (range 1250-4220 g). Gastric aspirates routinely collected within 12h of birth were analysed using conventional and molecular methods for bacterial detection, bacterial DNA load and sequencing to identified bacterial species.
RESULTS: Bacterial DNA loads varied from 0.03 to 173
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA plasmids are widely used for delivering proteins and RNA in genome editing. However, their bacterial components can lead to inactivation, cell toxicity, and reduced efficiency compared to minicircle DNA (mcDNA), which lacks such bacterial sequences. Existing commercial kits that recombine plasmids into mcDNA within proprietary bacterial strains are labor-intensive, yield inconsistent results, and often produce endotoxin-contaminated low-quality mcDNA. To address this challenge, we developed Plasmid2MC, a novel cell-free method utilizing ΦC31 integrase-mediated recombination to efficiently
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study reports the results of a collaborative study undertaken by two independent research groups to (a) confirm recent PCR-based detection of Yersinia pestis DNA in human teeth from medieval plague victims in France, and (b) to extend these observations over five different European burial sites believed to contain plague victims dating from the late 13th to 17th centuries. Several different sets of primers were used, including those previously documented to yield positive results on ancient DNA extracts. No Y. pestis DNA could be amplified from DNA extracted from 108 teeth belonging to 61
Историческая статьяСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Sarcoidosis is an incurable, chronic granulomatous disease primarily involving the lungs and lymph nodes of unknown aetiology, treated with non-specific anti-inflammatory/immunosuppressive drugs. Persistently symptomatic patients worsen with a disabling, potentially fatal clinical course. To determine a possible infectious cause, we correlated in a case-control study the clinical information with the presence of bacterial DNA in sarcoidosis mediastinal lymph nodes compared with control lymph nodes resected during cancer surgery.
METHODS: We retrospectively studied formalin-fixed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial meningoencephalitis (BME) in cattle is responsible for economic losses due to mortality, neurological impairment, and decreased productivity. The use of cerebrospinal fluid (CSF) bacterial culture-the gold standard for antemortem bacterial detection-is limited by its lengthy processing times and potential false negatives. With this study we wanted to determine whether 16S rRNA gene real-time quantitative PCR (16S rRNA qPCR) of DNA extracted from CSF could be used to detect BME in cattle. We applied a modified low-biomass microbial investigation protocol to extract CSF DNA from 15 hea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine whether or not the bacterial DNA which was detected by PCR comes from viable bacteria.
METHOD: Observing the affection of middle ear effusion (MEE) on DNA viscosity and enzymatic digestion of DNA.
RESULT: The middle ear effusion and DNA are stable and DNase 1 rapidly digests DNA. The effusion does not seem to degrade DNA. The middle ear effusion signficantly inhibits DNase 1.
CONCLUSION: Middle ear effusion provides an inhibition of the enzymatic digestion of purified DNA. Thus any DNA found in effusion by PCR techniques could well be fossilized remains and chronic o
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The etiology of chronic pelvic pain syndrome (CPPS) remains obscure. Although, bacterial etiology has frequently been suggested, evidence of both bacterial involvement in CPPS and the presence of normal bacterial flora in the prostate remain uncertain.
MATERIALS AND METHODS: We investigated the presence of bacterial DNA using polymerase chain reaction (PCR) techniques on prostatic tissue samples obtained in radical prostatectomy from 10 patients with moderate to severe symptoms of CPPS and 10 nonsymptomatic patients with localized prostate cancer. For symptom evaluation we used th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования