We initially attempted to isolate a Vibrio cholerae O1 El Tor biotype that carries a novel variant of the cholera toxin gene (ctxAB) from environmental waters of Indonesia, where the seventh cholera pandemic by V. cholerae O1 El Tor biotype began. Nested PCR targeting the gene revealed that a total of eight strains were found to carry ctxAB. However, sequencing of the 16S rRNA genes of these isolates showed they were not V. cholerae but were either Klebsiella, Enterobacter, Pantoea, or Aeromonas. Subsequent nested PCR assays targeting all genes known to be encoded on the CTX phage (i.e., zot,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial and fungal secondary metabolism is a rich source of novel bioactive compounds with potential pharmaceutical applications as antibiotics, anti-tumor drugs or cholesterol-lowering drugs. To find new drug candidates, microbiologists are increasingly relying on sequencing genomes of a wide variety of microbes. However, rapidly and reliably pinpointing all the potential gene clusters for secondary metabolites in dozens of newly sequenced genomes has been extremely challenging, due to their biochemical heterogeneity, the presence of unknown enzymes and the dispersed nature of the necessary
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxic shock syndrome (TSS) is an acute, serious systemic illness caused by bacterial superantigens. Nonavailability of a suitable animal model until recently has hampered an in-depth understanding of the pathogenesis of TSS. In the current study, we characterized the early molecular events underlying TSS using our HLA-DR3 transgenic mouse model. Gene expression profiling using DNA microarrays identified a rapid and significant upregulation of several pro- as well as anti-inflammatory mediators, many of which have never been previously described in TSS. In vivo administration of staphylococcal
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD8 is expressed on cytotoxic T-cells where it functions as a co-receptor for the TCR by binding to MHC class I proteins that present peptides on the cell surface. In this study we describe the cloning and sequencing of full length cDNAs encoding CD8alpha and CD8beta from Atlantic halibut (Hippoglossus hippoglossus L.) and subsequent isolation and characterization of the CD8alpha and CD8beta genes. The predicted halibut CD8alpha and CD8beta proteins are similar to those of mammals and other fish. Real time RT-PCR revealed that the highest levels of CD8 mRNA were found in the thymus, while some
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diversity and dynamics of bacterial populations in Saint-Nectaire, a raw-milk, semihard cheese, were investigated using a dual culture-dependent and direct molecular approach combining single-strand conformation polymorphism (SSCP) fingerprinting and sequencing of 16S rRNA genes. The dominant clones, among 125 16S rRNA genes isolated from milk, belonged to members of the Firmicutes (58% of the total clones) affiliated mainly with the orders Clostridiales and the Lactobacillales, followed by the phyla Proteobacteria (21.6%), Actinobacteria (16.8%), and Bacteroidetes (4%). Sequencing the 16S
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Horizontal gene transfer (HGT) has contributed substantially to the evolution of arthropod genomes, yet the functional significance of many horizontally acquired genes remains poorly understood. The hawthorn spider mite, Amphitetranychus viennensis, is a devastating agricultural pest whose high fecundity and overwintering diapause afford its exceptional ecological resilience. Through a genome-wide screen, we identified 37 high-confidence horizontally transferred genes (HTGs) in A. viennensis. Among these candidates, we prioritized AvPBL, a gene encoding pantothenate-β-alanine ligase, for funct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: We describe the case of a 73-year old male who was found to be a carrier of an blaNDM -producing Citrobacter freundii shortly after admission. During his admission, he developed abdominal abscesses and received multiple courses of piperacillin-tazobactam. In the following months, he was found to carry three other carbapenemase-positive species: Klebsiella oxytoca, Raoultella planticola and Serratia marscescens. RESULTS: Two of these strains had clustering carbapenem-sensitive isolates cultured before. The species all carried an blaNDM-7 encoding incX3 plasmid, which demonstrated hori
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Riboswitch-mediated control of gene expression without the interference of potentially immunogenic proteins is a promising approach for the development of tailor-made tools for biological research and the advancement of gene therapies. However, the current selection of applicable ligands for synthetic riboswitches is limited and strategies have mostly relied on de novo selection of aptamers. Here, we show that the bacterial xanthine I riboswitch aptamer recognizes oxypurinol, the active metabolite of the widely prescribed anti-gout drug allopurinol (Zyloprim®). We have characterized the aptame
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Photocaged compounds are chemical conjugates that are designed to release an active molecule upon exposure to light of a specific wavelength. In recent years, photocaged inducer molecules such as caged isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (cIPTG) have been increasingly used as a powerful tool for light-driven gene expression in bacteria, allowing researchers to precisely and noninvasively tune the expression of specific target genes. In this chapter, we present a guideline for the synthesis of 6-nitropiperonyl photocaged IPTG (NP-cIPTG) as well as its in vivo application as an optochemical on
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate the corneal bacterial microbiome in patients with keratoconus using next-generation sequencing and develop a new perspective on the pathogenesis of the disease.
METHODS: This prospective observational study included 10 patients with keratoconus who underwent corneal crosslinking procedure and 10 healthy controls who underwent photorefractive keratectomy. Patients included in the study were aged 18 years or older. The demographic and clinical characteristics of participants were recorded. Corneal epithelial samples were collected between March 2021 and June 2021. Isolat
Наблюдательное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The high incidence of bacterial respiratory infections has led to a focus on evaluating the human respiratory microbiome. Studies based on culture-based and molecular methods have shown an increase in the bacterial community that includes the bacterial phyla Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, and Proteobacteria in the oropharynx of healthy individuals. Therefore, recognizing this microbial compound and subsequently identifying those carriers of specific pathogens can be of great help in predicting future infections and their control. In this prospective study, we sought to characterize
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Risk factors for carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) acquisition/infection and associated clinical outcomes have been evaluated in the context of clonal, species-specific outbreaks. Equivalent analyses for complex, multi-species outbreaks, which are increasingly common, are lacking.
METHODS: Between December 2010 and January 2017, a case-control study of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing organism (KPCO) acquisition was undertaken using electronic health records from inpatients in a US academic medical centre and long-term acute care hospital (LTACH)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: FBLIM1 gene has been recently demonstrated to be involved in the pathogenesis of bone sterile inflammation. The aim of the study is to evaluate the prevalence of FBLIM1 gene variants in a cohort of 80 Italian patients with Chronic Non-bacterial Osteomyelitis (CNO).
METHODS: The coding regions of FBLIM1 gene were sequenced in a cohort of 80 patients with CNO using DNA extracted from blood lymphocytes, and PCR products were sequenced. Only rare (global MAF < 2%), coding variants detected were considered. Clinical evaluation of patients with rare variants and those without was perfor
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: New antibiotic resistance determinants are generally discovered too late, long after they have irreversibly emerged in pathogens and spread widely. Early discovery of resistance genes, before or soon after their transfer to pathogens could allow more effective measures to monitor and reduce spread, and facilitate genetics-based diagnostics.
RESULTS: We modified a functional metagenomics approach followed by in silico filtering of known resistance genes to discover novel, mobilised resistance genes in class 1 integrons in wastewater-impacted environments. We identified an integron-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alishewanella sp. WH16-1 is a heavy metal-resistant bacterium. Previously, a putative YebC family regulator gene, designated ruvR, was associated with Cr(VI) resistance. In this study, comprehensive analyses were performed to study the role of ruvR and its adjunct putative DNA repairing genes, ruvCAB, in the heavy metal resistance of Alishewanella sp. WH16-1. RT-PCR analysis showed that ruvR is cotranscribed with ruvCAB. Gene mutation and complementation experiments indicated that ruvRCAB contributes to Cr(VI), As(III), Sb(III), and Cd(II) resistance in vivo. Random amplification of polymorphi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The type III secretion system (T3SS) of Pseudomonas aeruginosa is a powerful tool for direct protein delivery into mammalian cells and has successfully been used to deliver various exogenous proteins into mammalian cells. In the present study, transcription activator-like effector nuclease (TALEN) proteins have been efficiently delivered using the P. aeruginosa T3SS into mouse embryonic stem cells (mESCs), human ESCs (hESCs), and human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) for genome editing. This bacterial delivery system offers an alternative method of TALEN delivery that is highly efficie
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontitis, one of the most common diseases in the world, is caused by a mixture of pathogenic bacteria and inflammatory host responses and often treated by antimicrobials as an adjunct to scaling and root planing (SRP). Our study aims to elucidate explorative and descriptive temporal shifts in bacterial communities between patients treated by SRP alone versus SRP plus antibiotics. This is the first metagenomic study using an Ion Torrent Personal Genome Machine (PGM). Eight subgingival plaque samples from four patients with chronic periodontitis, taken before and two months after interventi
СтатьяМногоцентровое исследованиеРандомизированное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The purpose of this study was to examine the presence of bacteria in synovial fluids from patients with temporomandibular joint disorder (TMD) by polymerase chain reaction (PCR) targeting the 16S ribosomal RNA (rRNA) gene, followed by cloning and sequencing.
STUDY DESIGN: Universal bacterial primers were used to amplify 16S rRNA genes in 28 synovial fluid samples from 27 patients with TMD (TMD group) as well as control subjects: 5 patients with dislocation of TMJ (non-TMD group). Subsequently, PCR amplicons were purified and cloned. Partial 16S rRNA sequences of the cloned insert w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the last decade, as a result of the widespread use of PCR and DNA sequencing, 16S rDNA sequencing has played a pivotal role in the accurate identification of bacterial isolates and the discovery of novel bacteria in clinical microbiology laboratories. For bacterial identification, 16S rDNA sequencing is particularly important in the case of bacteria with unusual phenotypic profiles, rare bacteria, slow-growing bacteria, uncultivable bacteria and culture-negative infections. Not only has it provided insights into aetiologies of infectious disease, but it also helps clinicians in choosing ant
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental pathogens are organisms that normally spend a substantial part of their lifecycle outside of human hosts, but when introduced into humans are capable of causing disease. Such organisms are often able to transition between disparate environments ranging from the soil to the cytosol of host cells. The food-borne bacterial pathogen Listeria monocytogenes serves as a model system for understanding how an environmental organism makes the transition into mammalian hosts. A transcriptional regulatory protein known as PrfA appears to serve as a critical switch, enabling L. monocytogenes
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования