BACKGROUND: Leptospirosis is a world-widely distributed zoonosis. Humans become infected via exposure to pathogenic Leptospira spp. from con … lated to either cell surface structures or carbohydrate transport and metabolism. We also found two genomic islands (GIs) in strain Lai containing genes divergently absent in other strains. Because genes encoding proteins with potential pathogenic functions are located within GIs, these elements might contribute to the variations in disease manifestation. Differe …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flores Island, Indonesia, was inhabited by the small-bodied hominin species Homo floresiensis, which has an unknown evolutionary relationship to modern humans. This island is also home to an extant human pygmy population. Here we describe genome-scale single-nucleotide polymorphism data and whole-genome sequences from a contemporary human pygmy population living on Flores near the cave where H. floresiensis was found. The genomes of Flores pygmies reveal a complex history of admixture with Denisovans and Neanderthals but no evidence for gene flow with other archaic hominins. Modern individuals
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Vibrio cholerae remains a global health threat, driven by epidemic strains and sporadic infections associated with non-toxigenic lineages. We report the genomic characterization of a V. cholerae O1 Ogawa isolate (V86/24) recovered from a human case in Brazil (2024) with no travel history. We performed antimicrobial susceptibility testing, whole-genome sequencing (WGS), and in silico analyses, including SNP-based phylogenetic and pangenome analyses (V86/24 + 62 public genomes; total N = 63), resistome, and virulome. The isolate showed intermediate susceptibility to imipenem but was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The aim of this study was to characterise the co-occurrence of blaKPC and blaNDM in a K64-ST11 carbapenem-resistant Klebsiella p … me analysis showed that KPWX136 carried a large number of virulence-associated genes. Meanwhile, 26 genomic islands and 6 prophages were predicted within the genome.
CONCLUSION: Genetic characterisation of K. pneumoniae KPWX136 co-harbouring blaNDM-5 and blaKPC-2 showed that it carried not only 25 resistance genes and a large number virulence factors but also va …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Physiological ageing and tumorigenesis are both associated with epigenomic alterations in human tissue cells, the most extensively investigated of which entails de novo cytosine methylation (i.e., hypermethylation) within the CpG dinucleotides of CpG islands. Genomic regions that become hypermethylated during tumorigenesis are generally believed to overlap regions that acquire methylation in normal tissues as an effect of ageing. To define the extension of this overlap, we analysed the DNA methylomes of 48 large-bowel tissue samples taken from women of different ages during screening colonosco
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-typhoid Salmonella are among the main causes of foodborne diseases worldwide. However, information on rare serovars is scarce, limiting the understanding of their prevalence, distribution and pathogenesis. Salmonella enterica serovar Inganda (S. Inganda) is a rare non-typhoid serovar. Considering the few existing reports, and the current use of genomics, this study characterized for the first time the antimicrobial resistance, pathogenic potential and diversity of S. Inganda genomes worldwide. A S. Inganda strain from human feces in 2018 in Brazil (SI264) had its resistance determined agai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella Enteritidis is a major foodborne pathogen, and the emergence of multidrug-resistant (MDR) S. Enteritidis poses a serious public h … evealed the presence of multiple mobile genetic elements (MGEs), including plasmids, prophages, and genomic islands, which may have facilitated the acquisition and dissemination of ARGs. Notably, several ARGs, including blaCTX-M-55, blaTEM-141, blaTEM-1B, aph(3')-IIa, aph(3'')-Ib, aph(6)-Id, tet(A), floR, fosA3, and sul2, were identified on plasmids. In addition, …
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Salmonella enterica serovar Goldcoast has been identified as the agent responsible for multistate epidemic outbreaks in humans. However, knowledge regarding the antimicrobial resistance and transmission of S. Goldcoast is scarce. This study aimed to investigate the genomic features of a multidrug-resistant S. Goldcoast sequence type 358 strain in China.
METHODS: Antimicrobial susceptibility of S. enterica strain SalGC_ZJ_53 was determined by microdilution broth assay. Whole genomic DNA was extracted and sequenced using the Illumina NovaSeq platform. De novo genome assembly was per
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The IGF-II/mannose 6-phosphate receptor (IGF-IIR/Man-6-P) up-regulation correlates with heart disease progression and its signaling cascades directly trigger pathological cardiac hypertrophy, fibrosis, and cardiomyocytes apoptosis. IGF-IIR gene expression/ suppression is able to prevent myocardial remodeling. However, the regulating mechanisms for the IGF-IIR gene remain unclear. This study performed reverse transcriptase PCR (RT-PCR) and methylation-specific PCR (MS-PCR) to detect expression and DNA methylation of CpG islands within the IGF-IIR genomic DNA region. Our finding revealed that th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
West Nile virus (WNV) is a priority pathogen that poses a high risk for public health emergencies of global concern. Although WNV is endemic to Africa, only few (n=63) whole genomic sequences are available from the continent. In this Review, we examined the status of the molecular testing and genomic sequencing of WNV across Africa and mapped its global spatiotemporal spread. WNV has been detected in 39 African countries, the Canary Islands, and Réunion Island. Although publications, including those with molecular data, originated from 24 of these countries, genomic sequences were available fr
СтатьяСистематический обзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Acinetobacter baumannii has emerged as a prevalent multidrug-resistant nosocomial pathogen worldwide. Here we report the draft g … gene blaADC-25 and the virulence factor gene for penicillin-binding protein G (pbpG) as well as 17 genomic islands and 14 insertion sequences were identified in the genome of A. baumannii Ab174.
CONCLUSION: The genome sequence of A. baumannii strain Ab174 can be used as a reference sequence for the new ST1688. These data will facilitate further understanding of …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seven genomes of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi were sequenced on the Ion Torrent PGM platform, generating high-quality scaffolds over 2.35 Mbp. This bacterium is the causative agent of disease known as "pigeon fever" which commonly affects horses worldwide. The pangenome of biovar equi was calculated and two phylogenomic approaches were used to identify clustering patterns within Corynebacterium genus. Furthermore, other comparative analyses were performed including the prediction of genomic islands and prophages, and SNP-based phylogeny. In the phylogenomic tree, C. pseudotub…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study reports the isolation and characterization of Bacteriovorax sp. As-1, a predatory bacterium recovered from the gut of oxytetracyc … usceptibility to tetracyclines, aminoglycosides, sulfonamides, and fluoroquinolones, located within genomic islands, and flanked by insertion sequences, suggesting acquisition via horizontal gene transfer (HGT). In addition to these, mutations were also detected in gyrA gene that confer resistance to ciprofloxacin. Phenotypic assays confirmed Bacteriovorax sp. As …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the complete genome sequence of Helicobacter cinaedi strain PAGU611, isolated in a case of human bacteremia. The PAGU611 genome comprises a 2,078,348-bp chromosome and a 23,054-bp plasmid. The chromosome contains a unique genomic island, encoding a type VI secretion system and clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR) loci.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Head and neck squamous cell carcinomas (HNSCC) often metastasise to the cervical lymph nodes. It is known for HNSCC as well as other cancers that progression from normal tissue to primary tumour and finally to metastatic tumour is characterised by an accumulation of genetic mutations. DNA methylation, an epigenetic modification, can result in loss of gene function in cancer, similar to genetic mutations such as deletions and point mutations. We have investigated the DNA methylation phenotypes of both primary HNSCC and metastatic tumours from 13 patients using restriction landmark genomic scann
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To explore the antimicrobial resistance phenotypes and whole genome characteristics of toxigenic Vibrio cholerae O139 strains in Henan Province, elucidate the evolving epidemiological trends of cholera outbreaks, and decipher molecular genetic variation patterns of the pathogen, thereby providing a reference for cholera prevention and control in the region. Methods: Drug susceptibility assay, whole genome sequencing assay, and bioinformatics analysis of 11 toxigenic Vibrio cholerae O139 strains isolated in Henan Province from 2001 to 2024. Results: All 11 strains were multi-drug res
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yellow-eyed penguins (hoiho/takaraka, Megadyptes antipodes) are among the world's rarest penguins and considered taonga (treasured) species in Aotearoa New Zealand. Since 2019, chicks on the New Zealand mainland have been affected by a deadly neonatal disease, respiratory distress syndrome, contributing to a decline to fewer than 115 breeding pairs. To investigate the putative genetic basis of this disease, we generated high-quality whole-genome data from 249 individuals spanning the species range, including New Zealand mainland (Northern range) and sub-Antarctic Enderby (Auckland Islands) and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whether gene flow acts as a creative or constraining force on local adaptation is a fundamental question in evolutionary biology, yet its role in the evolution of sexually selected traits remains poorly understood. Here we combine whole-genome and functional analyses to investigate how geological isolation is associated with the evolution of sexually selected traits. We focused on the stag beetle genus Prosopocoilus of the Izu Islands, Japan. In the mainland population (MLP), males possess sexually selected enlarged mandibles. In contrast, across the Izu Islands, relative mandible size decreas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Typhi (S. Typhi) is the aetiologic agent of typhoid fever in humans. The burden of typhoid is highest in low- and middle-income countries such as Pakistan. Moreover, the increasing emergence of antibiotic-resistant and hypervirulent S. Typhi strains highlights the need for deeper genomic understanding as current treatment regimens become progressively less effective. Therefore, this study analyzed publicly available S. Typhi genomes from Pakistan to characterize genomic diversity, sequence types, plasmid content, and antimicrobial resistance and virulence profiles.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A first strong evidence of person-to-person transmission of Legionnaires' Disease (LD) was recently reported. Here, we characterize the genetic backbone of this case-related Legionella pneumophila strain ("PtVFX/2014"), which also caused a large outbreak of LD. PtVFX/2014 is phylogenetically divergent from the most worldwide studied outbreak-associated L. pneumophila subspecies pneumophila serogroup 1 strains. In fact, this strain is also from serogroup 1, but belongs to the L. pneumophila subspecies fraseri. Its genomic mosaic backbone reveals eight horizontally transferred regions encompassi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования