MedElevator Войти в исследования
Открытая медицинская библиотека

Результаты поиска

Медицинские публикации, первоисточники и полные тексты.
Для клинического вопроса, нового знания и следующего исследования.

Ищем по исходному запросу. Уточняем медицинские термины для поиска на других языках…

Результаты поиска

476 публикаций

Поиск: 21 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 42 с найденным полным текстом

Fungal secondary metabolites as a potential inhibitor of T315I- BCR::ABL1 mutant in chronic myeloid leukemia by molecular docking, molecular dynamics simulation and binding free energy exploration approaches.

BACKGROUND: Chronic Myeloid Leukemia (CML) is particularly challenging to treat due to the T315I BCR::ABL1 mutation. Although fungal metabol … nol B, showed favorable drug-likeness. Molecular dynamics parameters, including RMSD, RMSF, Rg, and SASA, confirmed that Phellifuropyranone A and Meshimakobnol B bind stably to the T315I-BCR::ABL1 mutant protein. Additionally, PCA, DCCM, and free energy landscapes analyses validated the consistency of the molecular dynamics parameters. MM/PBSA analysis …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 39674654Открыть статью

Virtual screening, pharmacokinetics, molecular dynamics and binding free energy analysis for small natural molecules against cyclin-dependent kinase 5 for Alzheimer's disease.

Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder and characterized by brain cell death, memory loss and is the most comm … root mean square fluctuation (RMSF), Rg, number of hydrogen bonds, solvent accessible surface area (SASA), principal component analysis (PCA) and binding free energy analysis we have found that out of four inhibitors ZINC85877721 and ZINC96116231 showed good binding free energy of -198.84 and -159.32 kJ.mol-1, respectively, and also good in other struc …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 30688165Открыть статью

Discovery of metabolite biomarkers for cerebral ischemia-reperfusion injury based on metabolomics: neurotoxic mechanism and functional validation of a flavopiridol -related metabolite.

OBJECTIVE: To investigate the role and potential mechanism of metabolite alterations during cerebral ischemia-reperfusion injury (CIRI) and … complex formed by the FRM and SRC remained structurally stable, as evidenced by balanced RMSD, Rg, SASA, and P-L-RMSD values. The calculated binding free energy was -32.48 kcal/mol, with key residues LEU-393, MET-341, and GLU-339 contributing significantly to the interaction, suggesting potential biological activity. CONCLUSION: This study reveals a …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 42889012Открыть статью

Integrative Multi-Omics and Molecular Simulations Identify PRKCD as a Biological Modulator in Colon Adenocarcinoma: Validation With Phoenix dactylifera Phytochemicals and Comparison With Rottlerin.

Colorectal cancer (CRC) is the leading cause of cancer-related deaths worldwide. Colon adenocarcinoma (COAD), the most common histological s … arameters, including backbone RMSD, RMSF, radius of gyration (Rg), solvent-accessible surface area (SASA), hydrogen-bond counts, principal component analysis (PCA), and free-energy landscape (FEL) profiling, all indicated stable conformations for the two complexes. The lead phytocompound showed very similar behaviour to the positive control, thereby re …

СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 42053760Открыть статью

Computational QSAR and structure-based identification of plerixafor-derived PIM-1 kinase inhibitors in diffuse large B-Cell lymphoma.

INTRODUCTION: Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is the most common and aggressive subtype of non-Hodgkin lymphoma, with a substantial pr … MSF) in the active site, and favorable Radius of Gyration (Rg) and Solvent Accessible Surface Area (SASA) profiles. RESULTS: Additional MM/GBSA, Principal Component Analysis (PCA), Dynamic Cross-Correlation Matrix (DCCM), and free energy landscape (FEL) analyses further supported complex stability and restricted conformational dynamics. DISCUSSION: C …

СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 42434599Открыть статью

Molecular insights into nilvadipine-hemoglobin interactions: conformational dynamics and binding mechanisms.

Understanding the molecular basis of drug-protein interactions is essential for predicting pharmacokinetics and potential off-target effects … er-residue fluctuations (RMSF < 0.3 nm), and negligible changes in solvent-accessible surface area (SASA). Together, these data demonstrate that Nilvadipine forms a stable, hydrophobically driven complex with Hb without perturbing its global fold, suggesting that Hb may serve as a transient reservoir for the drug in circulation. This integrative study …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 41229954Открыть статью

Identification of novel drug targets and small molecule discovery for MRSA infections.

INTRODUCTION: The topmost deadliest microorganism, namely, methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), causes dreadful infections li … results were validated by evaluating molecular dynamic simulation parameters like RMSD, RMSF, ROG, SASA, and PCA. Through analyzing these parameters, catechin provided a more stable, compact nature and less solvent exposure with HssR than vancomycin. Moreover, the predicted binding free energy for HssR-catechin was found to be -23.0 kcal/mol, which wa …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 40303563Открыть статью

In-silico design and evaluation of a novel mRNA vaccine against human bocavirus 1: A neglected viral pathogen.

Human Bocavirus 1 (HBoV1) majorly affects infants and children, resulting severe lower respiratory tract infections. Since its first identif … lysis (PCA), radius of gyration (Rg), MM-PBSA binding free energy, solvent-accessible surface area (SASA), dynamic cross-correlation matrix (DCCM), and normal mode analysis (NMA), were performed to check the stability and binding affinity of the MEV with human Toll-like receptor 4 (TLR4) and TLR2. These simulations confirmed the complex's structural st …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 41343928Открыть статью

Molecular docking, molecular dynamics, MM/PBSA approaches and bioactivity studies of nepetanudoside B isolated from endemic Nepeta aristata.

Nepetanudoside B (NNB) was isolated from aerial parts of endemic Nepeta aristata crude extract (CH3OH-CHCl3) using silica gel (n-hexane, met … s were performed for the interactions of NNB-BChE with MM/PBSA binding free energey RMSD, RMSF, Rg, SASA, and also the number of hydrogen bonds was calculated. The suitability and effectiveness of NNB have been proven in the food and pharmaceutical industries. The NNB molecule may lead to development studies as a BChE inhibitor.

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 38288959Открыть статью

Phenolic compounds of Theobroma cacao L. show potential against dengue RdRp protease enzyme inhibition by In-silico docking, DFT study, MD simulation and MMGBSA calculation.

BACKGROUND: Currently, there is no antiviral medication for dengue, a potentially fatal tropical infectious illness spread by two mosquito s … ron-acceptor groups for catechin. The MD simulation result also demonstrated favourable RMSD, RMSF, SASA and H-bonds in at the binding pocket of DENV3-NS5 RdRp for catechin as compared to panduratin A. CONCLUSION: According to the present findings, catechin showed high binding affinity and sufficient drug-like properties with the appropriate ADMET pro …

СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 38483871Открыть статью

In silico exploration of potent flavonoids for dengue therapeutics.

Dengue poses a persistent and widespread threat with no effective antiviral drug available till now. Several inhibitors have been developed … ecular dynamics simulations in terms of various geometrical parameters; RMSD, RMSF of residues, Rg, SASA, H-bond, and RPDF. The binding free energy changes of these adducts were calculated by the MM/PBSA solvation model with negative values (from -38.01±7.53 to -17.75±11.03 kcal/mol) indicating the sustained spontaneity of the forward reaction and favo …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 39666626Открыть статью

Biochemical and molecular docking-based strategies of Acalypha indica and Boerhavia diffusa extract by targeting bacterial strains and cancer proteins.

Antibiotic-resistant microbes have emerged around the world, presenting a risk to health. Plant-derived drugs have become a potential source … in the root mean square deviation (RMSD), radius of gyration (Rg), solvent accessible surface area (SASA), hydrogen bond and root mean square fluctuation (RMSF) and the binding free energy by MM-PBSA method. This study indicates that methanol extracts of A. indica and B. diffusa may play a crucial role in developing antibiotic-resistant and cancer drug …

СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 38146734Открыть статью

In silico repurposing of CNS drugs for multiple sclerosis.

Multiple sclerosis (MS) is an autoimmune neurodegenerative disease affecting numerous people worldwide. While the relapsing subtypes of MS a … inding pocket to interact with adjacent polar and apolar residues. Solvent accessible surface area (SASA) fluctuations confirmed the results of binding trajectory analysis and showed that non-polar hydrophobic interactions played significant roles in acquired stabilities. Our results on lurasidone binding pattern were interestingly in accordance with p …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 36958175Открыть статью

Designing of a Multi-epitope Vaccine against the Structural Proteins of Marburg Virus Exploiting the Immunoinformatics Approach.

Marburg virus disease (MVD) caused by the Marburg virus (MARV) generally appears with flu-like symptoms and leads to severe hemorrhagic feve … d), radius of gyration (Rg), root mean square fluctuations (RMSF), solvent-accessible surface area (SASA), and hydrogen bonds, have been taken into account to demonstrate the inflexible and rigid nature of receptor molecules and the constructed vaccine. Inclusively, our findings suggested the vaccine constructs' ability to regulate promising immune res …

СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 34870027Открыть статью

Tunicamycin Mediated Inhibition of Wall Teichoic Acid Affects Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes Cell Morphology, Biofilm Formation and Virulence.

The emergence of bacterial resistance to therapeutic antibiotics limits options for treatment of common microbial diseases. Subinhibitory an … (InlB) and Listeria adhesion protein (LAP) in L. monocytogenes, and a S. aureus surface protein A (SasA) in S. aureus. Tunicamycin-treated bacteria or the bacterial WTA preparation suppressed NF-κB and inflammatory cytokine production (TNFα, and IL-6) from murine macrophage cell line (RAW 264.7) indicating the reduced WTA level possibly attenuates an …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 30034372Открыть статью

Antiobesity effects of bamboo salt in C57BL/6 mice.

Antiobesity effects of bamboo salt (BS) were evaluated compared with those of purified salt and solar salt by oral administration in a diet-induced obesity model using C57BL/6 mice. Compared with other salts, BS, especially nine times baked BS (BS-9×), significantly reduced body weight, food efficiency ratio, and weights of epididymal adipose tissue and liver in high-fat diet-fed mice. Furthermore, BS suppressed the expression of adipogenic factors, such as CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBPα), peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARγ), and sterol regulatory element-bin

СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 25675137Открыть статью

Investigation of a novel TBC1D24 variation causing autosomal dominant non-syndromic hearing loss.

Hearing loss is considered one of the most common sensory neurological defects, with approximately 60% of cases attributed to genetic factor … nd conformational dynamics. Molecular dynamics simulations indicated changes in RMSD, RMSF, Rg, and SASA of the mutant structure. We computed the onset age of non-syndromic hearing loss associated with mutations in the TBC1D24 gene and identified variations in the hearing progression time and annual threshold deterioration across different frequencies. …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 38413761Открыть статью

Molecular docking and simulation studies against nucleoside diphosphate kinase (NDK) of Pseudomonas aeruginosa with secondary metabolite identified by genome mining from paenibacillusehimensis.

Pseudomonas aeruginosa is one of the leading opportunistic pathogens that causes nosocomial pneumonia and mostly in people with cystic fibro … t clearly showed that the values stayed at ∼1.45 nm- 1.55 nm showing compactness and stability. The SASA stayed at the range ∼80nm2 and at least one total number of hydrogen bonds was shown throughout the 150 ns simulation for all three possible ligand-protein complexes. In the RMSF plot, the maximum fluctuation was ranged from ∼0.4-0.42 nm at the rang …

СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 36651083Открыть статью

Ability to predict surgical outcomes by surgical Apgar score: a systematic review.

BACKGROUND: The Surgical Apgar score (SAS) is a straightforward and unbiased measure to assess the probability of experiencing complications … the correlation between SAS and any modified/adjusted SAS (m SAS, (Modified SAS). eSAS, M eSAS, and SASA), and complications before, during, and after surgeries. Nevertheless, the study excluded letters to the editor, reviews, and case reports. Additionally, the researchers employed Begg and Egger's regression model to evaluate publication bias. RESUL …

Систематический обзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 37723504Открыть статью

Anti-Alopecia Activity of Coumarin Derivatives Isolated from Merremia peltata Leaves and Computational Study of Their Binding to Androgen Receptors Using Molecular Docking and Molecular Dynamic Simulation.

Alopecia is a condition in which hair on the scalp or other areas of the body is lost or falls out excessively. Nutritional deficiency cause … e parameters binding free energy calculated using the MM-PBSA method and complex stability based on SASA, PCA, RMSD, and RMSF showed that scopolin (1) has a good affinity for androgens receptors. The ADME-Tox prediction for scopolin (1) showed good results for the parameters of skin permeability, absorption and distribution. Therefore, scopolin (1) is …

СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

PMID 37242452Открыть статью