Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) is the etiologic agent of paratuberculosis disease affecting ruminants worldwide. The aim of this study was to identify potential candidate antigens and epitopes by bio and immuno-informatic tools which could be later evaluated as vaccines and/or diagnosis. 110 protein sequences were selected from MAP K-10 genome database: 48 classified as putative enzymes involved in surface polysaccharide and lipopolysaccharide synthesis, as membrane associated and secreted proteins, 32 as conserved membrane proteins, and 30 as absent from other mycobacterial
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The cardiac-brain connection has been identified as the basis for multiple cardio-cerebral diseases. However, effective therapeutic targets for these diseases are still limited. Therefore, this study aimed to identify pleiotropic and specific therapeutic targets for cardio-cerebral diseases using Mendelian randomization (MR) and colocalization analyses.
METHODS: This study included two large protein quantitative trait loci studies with over 4,000 plasma proteins were included in the discovery and replication cohorts, respectively. We initially used MR to estimate the associations
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are several notable challenges inherent for fully characterizing the entirety of the human saliva proteome using bottom-up approaches, including polymorphic isoforms, PTMs, unique splice variants, deletions, and truncations. To address these challenges, we have developed a top-down based LC-MS/MS approach, which cataloged 20 major human salivary proteins with a total of 83 proteoforms, containing a broad range of PTMs. Among these proteins, several previously reported disease biomarker proteins were identified at the intact protein level, such as beta-2 microglobulin. In addition, intact
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study the effects of GSM 1800 MHz radiofrequency electromagnetic fields (RF EMF) exposure on protein expression profile of human breast cancer cell line (MCF-7), as to exploring the possible effects on normal cell physiological function.
METHODS: MCF-7 cells were continuously or intermittently (5 minutes field on followed by 10 minutes off) exposed to RF EMF for different duration (1 hour, 3 hours, 6 hours, 12 hours, or 24 hours) at an average specific absorption rate (SAR) of 3.5 W/kg. The extracted proteins were separated by 2-dimensional electrophoresis and the protein-spot d
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A database search for similarities between sequenced parts of the Arabidopsis thaliana genome with known sulfurtransferase sequences from Escherichia coli and mammals was undertaken to obtain information about plant sulfurtransferase-like proteins. One gene and several homologous EST clones were identified. One of the EST clones was used for screening an Arabidopsis cDNA library. The isolated full-length clone consists of 1134 bp and encodes a 42.6 kDa protein that includes a putative transit peptide sequence of about 7.1 kDa. Sequence comparisons with known sulfurtransferases from different o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant lipid research depends on accessible databases that connect genes, pathways, and prior literature. However, currently available resources are fragmented, species-limited, and lack AI-powered interfaces for integrated querying. FatPlants 2.0 addresses these issues by integrating ARALIP, PlantFADB, and new Cuphea/Pennycress experimental data into a unified platform with 14 000 genes/proteins, 110 pathways across 5 species, and 57 000+ curated publications. The platform features LipidBot, an AI agent enabling natural language queries via graph-based pathway search and retrieval-augmented ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alopecia areata (AA) is an autoimmune disease typified by nonscarring hair loss. It manifests as a heterogeneous disorder with diverse clinical presentations and variable treatment responses, underscoring the significance of identifying novel biomarkers for precision management.
OBJECTIVE: This study aims to explore the relationship between metabolic reprogramming-related genes (MRRGs) and the risk of developing AA.
METHODS: MRRGs were identified through the GeneCards database and existing literature. Genetic instruments were obtained from the eQTLGen database, and AA-related dat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Qingfei Tongluo Plaster (QFP), an improved Chinese medicine hospital preparation, is an attractive treatment option due to its well clinical efficacy, convenience, economy, and patient compliance in the treatment of respiratory syncytial virus (RSV) pneumonia. The aim of this study was to investigate the efficacy mechanism of QFP on RSV rats from the perspective of alleviating lung inflammation and further explore the changes of serum metabolites and metabolic pathways in RSV rats under the influence of QFP.
METHODS: This study used network pharmacological methods and molecular doc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim To develop of a protein panel to identify patients with progressive chronic heart failure with reduced left ventricular ejection fraction (HFrEF) based on proteomic analysis of blood fractions.Material and methods The study included 81 patients with HFrEF associated with postinfarction myocardial scarring or dilated cardiomyopathy. Patients were enrolled both in a stable period (n=48) and with signs of decompensated heart failure (n=33). Proteomic chromatography-mass-spectrometric analysis of blood plasma and extracellular vesicles (EVs) was performed in all patients. The analysis id
СтатьяПоиск полного текста в очередиОригинал на русском
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cough variant asthma (CVA) is a common disease with high incidence among children. Cough is the main clinical symptom and Chinese medicine (CM) has an exact effect on CVA. However, the rules of herb formulation, the pharmacodynamic substances, and the mechanism remained unclear. Therefore, we conducted this article to explore medication rules and molecular mechanism of CM against CVA in children using data mining, network pharmacology, molecular docking, and molecular dynamics simulation. Relevant literatures were collected from China National Knowledge Infrastructure, Chinese Scientific and T
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteusins are a family of bacterial ribosomal peptides that largely remain hypothetical genome-predicted metabolites. The only known members are the polytheonamide-type cytotoxins, which have complex structures due to numerous unusual posttranslational modifications (PTMs). Cyanobacteria contain large numbers of putative proteusin loci. To investigate their chemical and pharmacological potential beyond polytheonamide-type compounds, we characterized landornamide A, the product of the silent osp gene cluster from Kamptonema sp. PCC 6506. Pathway reconstruction in E. coli revealed a peptide com
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin D is recognized to play important roles not only in the bone metabolism and the regulation of Ca amount in the blood but also in the onset of immunological diseases. These physiological actions caused by vitamin D are triggered by the specific interaction between vitamin D receptor (VDR) and vitamin D. In the present study, we investigated the interactions between VDR and vitamin D derivatives using ab initio molecular simulation, in order to elucidate the reason for the significant difference in their effects on VDR activity. Based on the results simulated, we elucidated which parts o
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Degenerative diseases with abnormal protein aggregates are characterized by the accumulation of proteins with variable posttranslational modifications including phosphorylation, glycoxidation, oxidation, and nitration. Myofibrillar myopathies, including myotilinopathies and desminopathies, are characterized by the intracytoplasmic focal accumulation of proteins in insoluble aggregates in muscle cells. By using single immunohistochemistry, monodimensional gel electrophoresis and Western blotting, and bidimensional gel electrophoresis, in-gel digestion, and mass spectometry, desmin was demonstra
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, artificial intelligence methods based on the analysis of heterogeneous graphs of biomedical networks have become widely used for predicting molecular interactions. In particular, graph neural networks (GNNs) effectively identify missing edges in gene networks - such as protein-protein interaction, gene-disease, drug-target, and other networks - thereby enabling the prediction of new biological relationships. To reconstruct gene networks, cognitive systems for automatic text mining of scientific publications and databases are often employed. One such AI-driven platform, ANDSyst
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The placenta is a vital organ in bovine reproduction, crucial for blood supply, nutrient transport, and embryonic development. It plays an essential role in the intrauterine growth of calves. However, the molecular mechanisms governing placental function in calves remain inadequately understood.
METHODS: We established transcriptome and proteome databases for low-birth-weight (LB) and high-birth-weight (HB) calf placentae, identifying key genes and proteins associated with birth weight through bioinformatics analyses that included functional enrichment and protein-protein interact
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Minimal-change nephrotic syndrome is an idiopathic disease in which protein leaks through podocytes into the urine. We used proteomic tools to examine differences of plasma protein expression in healthy rats and rats with doxorubicin-induced nephropathy treated with or without prednisone.
METHODS: Healthy three-month-old Sprague-Dawley male rats were randomly chosen for one injection of doxorubicin (5.5 mg/kg) through the caudal vein to induce nephropathy (n = 50) or the same volume of saline (control, n = 20). After 1 week, 25 rats in the nephropathy group received topical predni
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Mycobacterium bovis P55 gene, located downstream from the gene that encodes the immunogenic lipoprotein P27, has been characterized. The gene was identical to the open reading frame of the Rv1410c gene in the genome of Mycobacterium tuberculosis H37Rv, annotated as a probable drug efflux protein. Genes similar to P55 were present in all species of the M. tuberculosis complex and other mycobacteria such as Mycobacterium leprae and Mycobacterium avium. By Western blotting, P55 was located in the membrane fraction of M. bovis. When transformed into Mycobacterium smegmatis after cloning, P55 c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atherosclerosis is a complex disease in which smooth muscle cells (SMC) play a fundamental role. Work from several laboratories has suggested that in experimental models of atheromatosis SMC heterogeneity is important in the establishment of intimal thickening. Moreover it has been shown that SMC cultured from different situations in vivo maintain distinct phenotypic features in vitro. In order to find proteins differentially expressed in SMC cultured from newborn and aged rats, total protein extracts were separated by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2D-PAGE), high-resoluti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer cells dramatically increase L-lactate production, fueling lysine lactylation (Kla) – a posttranslational modification that rewires protein function and links metabolic flux to gene and pathway regulation. Although emerging studies implicate Kla in diverse diseases, its role in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) remains poorly understood. Here, we performed global lactylomic profiling of immunoprecipitated lactylated proteins from PDAC and normal pancreatic cell lines, as well as from patient-derived tumors and adjacent normal tissues. Mass spectrometry revealed distinct Kla signatu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dedicator of cytokinesis 2(DOCK2) protein, an atypical guanine nucleotide exchange factor (GEFs), is a member of the DOCKA protein subfamily. DOCK2 protein deficiency is characterized by early-onset lymphopenia, recurrent infections, and lymphocyte dysfunction, which was classified as combined immune deficiency with neutrophil abnormalities as well. The only cure is hematopoietic stem cell transplantation. Here, we report two patients harboring four novel DOCK2 mutations associated with recurrent infections including live attenuated vaccine-related infections. The patient's condition was p
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.