OBJECTIVE: We aimed to infer and describe Mexico City's HIV genetic transmission network from 2021 through 2022 by characterizing its members based on time since HIV acquisition, as well as sociodemographic, clinical, and behavioural characteristics. Additionally, we assessed clustering potential according to time since HIV acquisition.
METHODS: Individuals with a recent HIV diagnosis at the largest HIV clinic in Mexico City were invited to participate, completing self-administered questionnaires on sociodemographic, clinical, and behavioural characteristics. Blood samples were collected for
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: This study reports on findings from the first preconception screening performed in Russia and provides a comprehensive discussion of the significant results and challenges faced during the implementation of the project. Methods: Using a targeted sequencing panel of 33 genes (associated with 29 autosomal recessive and 4 X-linked diseases), we analyzed 165 couples considering pregnancy. The screening design also included analysis of the frequent pathogenic variants in the SMN1, DMD, CFTR, and CYP21A2 genes that may not be detected through the next-generation sequencing app
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Peters-Plus syndrome (PTRPLS) is an autosomal recessive congenital disorder of glycosylation caused by biallelic pathogenic variants in the ß 1,3-glucosyltransferase gene (B3GLCT). To date, homozygous or compound heterozygous splicing, truncating, missense variants, and whole gene deletions have been reported in the B3GLCT gene. Our aim was to investigate the role of small copy number variations (CNVs) in this condition alongside the clinical features of the patients.
METHODS: The study included eleven patients from six consanguineous families originating from the same village. Cli
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Over activation of c-MYC oncogene (gene locus: 8q24.21) - predominantly due to the amplification of the gene - is a critical genetic imbalance involved in malignant transformation of normal epithelia. Our aim was to explore the differences in c-MYC protein expression in a series of laryngeal (LSCC) and hypopharyngeal squamous cell carcinomas (HPSCCs).
MATERIALS AND METHODS: We retrospectively analyzed a set of sixty (n=60) paraffin embedded laryngeal-hypopharyngeal squamous cell carcinomas (L-PHSCC) tissue sections by immunocytochemistry (IHC) for the detection of c-MYC protei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is the most common B-cell non-Hodgkin lymphoma (NHL). Despite the availability of clinical and molecular algorithms applied for the prediction of prognosis, in up to 30%-40% of patients, intrinsic or acquired drug resistance occurs. Constitutional genetics may help to predict R-CHOP resistance. This study aimed to validate previously identified single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the literature as potential predictors of R-CHOP resistance in DLBCL patients, SNPs. Methods: Twenty SNPs, involved in R-CHOP pharmacokinetics/pharmacodynamics or other
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Unraveling the intricate centromere structure of human chromosomes holds profound implications, illuminating fundamental genetic mechanisms and potentially advancing our comprehension of genetic disorders and therapeutic interventions. This study rigorously identified and structurally analyzed alpha satellite higher-order repeats (HORs) within the centromere of human chromosome 15 in the complete T2T-CHM13 assembly using the high-precision GRM2023 algorithm. The most extensive alpha satellite HOR array in chromosome 15 reveals a novel cascading HOR, housing 429 15mer HOR copies, containing 4-,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Treatment and preventative advances for chronic obstructive pulmonary disease (COPD) have been slow due, in part, to limited subphenotypes. We tested if unsupervised machine learning on CT images would discover CT emphysema subtypes with distinct characteristics, prognoses and genetic associations.
METHODS: New CT emphysema subtypes were identified by unsupervised machine learning on only the texture and location of emphysematous regions on CT scans from 2853 participants in the Subpopulations and Intermediate Outcome Measures in COPD Study (SPIROMICS), a COPD case-control study,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modules consisting of antibiotic resistance genes (ARGs) flanked by inverted repeat Xer-specific recombination sites were thought to be mobile genetic elements that promote horizontal transmission. Less frequently, the presence of mobile modules in plasmids, which facilitate a pdif-mediated ARGs transfer, has been reported. Here, numerous ARGs and toxin-antitoxin genes have been found in pdif site pairs. However, the mechanisms underlying this apparent genetic mobility is currently not understood, and the studies relating to pdif-mediated ARGs transfer onto most bacterial genera are lacking. W
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate potential variation in the euploid blastocyst rate and live birth rate (LBR) per single frozen euploid blastocyst transfer, among 4 unique United States reproductive genetics laboratories. Analyses were limited to blastocysts derived from vitrified donor oocytes, to minimize variation in oocyte quality.
DESIGN: Retrospective cohort study from 2016 to 2020.
SETTING: Donor Egg Bank Database.
PATIENT(S): Patients undergoing in vitro fertilization with donor oocytes. We excluded patients with uterine factor, male factor, or surgically extracted sperm. Only healthy women <
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To automatically classify retinal atrophy according to its etiology, using fundus autofluorescence (FAF) images, using a deep learning model.
METHODS: In this study, FAF images of patients with advanced dry age-related macular degeneration (AMD), also called geographic atrophy (GA), and genetically confirmed inherited retinal diseases (IRDs) in late atrophic stages [Stargardt disease (STGD1) and Pseudo-Stargardt Pattern Dystrophy (PSPD)] were included. The FAF images were used to train a multi-layer deep convolutional neural network (CNN) to differentiate on FAF between atrophy in th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: von Willebrand disease (VWD) is the most common inherited bleeding disorder and caused by an absence, deficiency or defect in von Willebrand factor (VWF). VWD is currently classified into six different types: 1, 2A, 2B, 2N, 2M, 3. Notably, 2M VWD is more often misdiagnosed as 2A or type 1 VWD than properly identified as 2M VWD.
AIM: To describe an algorithmic approach to better ensure appropriate identification of 2M VWD, and reduce its misdiagnosis, as supported by sequential laboratory testing.
METHODS: Comparative assessment of types 1, 2A, 2B and 2M VWD using various labora
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using computer algorithms and commercial DNA synthesis, one or more ORFs of a microbial pathogen such as a virus can be recoded and deoptimized by several strategies that may involve the introduction of up to thousands of nucleotide (nt) changes without affecting amino acid (aa) coding. The synonymous recoding strategies that have been applied to RNA viruses include: deoptimization of codon or codon-pair usage, which may reduce protein expression among other effects; increased content of immunomodulatory CpG and UpA RNA, which increase immune responses and thereby restrict viral replication; a
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In this study we integrated the CNV (copy number variation) and WssGWAS (weighted single-step approach for genome-wide association) analyses to increase the knowledge about number of piglets born alive, an economically important reproductive trait with significant impact on production efficiency of pigs.
RESULTS: A total of 3892 samples were genotyped with the Porcine SNP80 BeadChip. After quality control, a total of 57,962 high-quality SNPs from 3520 Duroc pigs were retained. The PennCNV algorithm identified 46,118 CNVs, which were aggregated by overlapping in 425 CNV regions (CN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT.—: Distinction of hydatidiform moles from nonmolar specimens and subclassification of hydatidiform moles as complete hydatidiform mole versus partial hydatidiform mole are important for clinical practice and investigational studies. Risk of persistent gestational trophoblastic disease and clinical management differ for these entities. Diagnosis based on morphology is subject to interobserver variability and remains problematic, even for experienced gynecologic pathologists.
OBJECTIVES.—: To explain how ancillary techniques target the unique genetic features of hydatidiform moles to es
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Germline pathogenic mutations in cancer susceptibility genes result in inherited cancer syndromes. In the Afrikaner population of South Africa (SA), three founder mutations in the BRCA genes that lead to hereditary breast and ovarian cancer syndrome (HBOCS) have been identified.
OBJECTIVES: To investigate the uptake and type of molecular testing performed on patients for HBOCS, to determine the prevalence of the three Afrikaner founder BRCA mutations as well as non-founder BRCA mutations in the study population, and to analyse the utility of two mutation prediction models (Breast
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Aim of this study was to investigate the prevalence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), extended-spectrum (ESBL) and plasmid-mediated AmpC beta-lactamase producing Gram-negative bacteria in children.
METHODS: Antibiotic susceptibility of MRSA and beta-lactamase producing Gram-negative bacteria was determined by disc diffusion and broth microdilution methods according to CLSI guidelines. Methicillin resistance was confirmed by the presence of mecA gene by PCR. The genetic characterization of S. aures was performed using spa-typing and the algorithm based upon repeat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer cachexia is a complex and multifactorial disease. Evolving definitions highlight the fact that a diverse range of biological processes contribute to cancer cachexia. Part of the variation in who will and who will not develop cancer cachexia may be genetically determined. As new definitions, classifications and biological targets continue to evolve, there is a need for reappraisal of the literature for future candidate association studies. This review summarizes genes identified or implicated as well as putative candidate genes contributing to cachexia, identified through diverse technol
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: HIV-1 is typically categorized by genetically distinct viral subtypes. Viral subtypes are usually compartmentalized by ethnicity and transmission group and, thus, convey important epidemiological information, as well as possibly influencing the rate of disease progression. We aim to describe the prevalence and time trends of subtypes observed among key populations living with HIV-1 in the UK.
DESIGN: Analyses of reverse transcriptase and protease sequences generated from HIV-1-positive antiretroviral-naive patients as part of routine resistance testing between 2002 and 2010 in all
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A variety of high throughput genome-wide assays enable the exploration of genetic risk factors underlying complex traits. Although these studies have remarkable impact on identifying susceptible biomarkers, they suffer from issues such as limited sample size and low reproducibility. Combining individual studies of different genetic levels/platforms has the promise to improve the power and consistency of biomarker identification. In this paper, we propose a novel integrative method, namely sparse group multitask regression, for integrating diverse omics datasets, platforms, and populations to i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Circulating estrogen levels are relevant in glaucoma phenotypic traits. We assessed the association between an estrogen metabolism single nucleotide polymorphism (SNP) panel in relation to primary open angle glaucoma (POAG), accounting for gender.
METHODS: We included 3,108 POAG cases and 3,430 controls of both genders from the Glaucoma Genes and Environment (GLAUGEN) study and the National Eye Institute Glaucoma Human Genetics Collaboration (NEIGHBOR) consortium genotyped on the Illumina 660W-Quad platform. We assessed the relation between the SNP panels representative of estrogen m
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.