GBM, a malignant brain tumor prevalent in adults, can be treated using Electric field (EF) therapy. However, the underlying mechanism of EF-based GBM therapy is not well understood. In this study, we used bioinformatics and MD analysis to explore CA9 in EF therapy for GBM. CA9 was identified as a differentially expressed gene (DEG) sensitive to EF stimulation in GBM using GEO and TCGA for integrated analysis. Elevated CA9 expression was associated with reduced overall survival in GBM patients, indicating that CA9 was an adverse prognostic factor. Single-cell data demonstrated that CA9 expressi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Since leishmaniasis is one of the health problems in many countries, the development of preventive vaccines against it is a top priority. Peptide vaccines may be a new way to fight the Leishmania infection. In this study, a silicon method was used to predict and analyze B and T cells to produce a vaccine against cutaneous leishmaniasis.
MATERIALS AND METHODS: Immunodominant epitope of Leishmania were selected from four TSA, LPG3, GP63, and Lmsti1 antigens and linked together using a flexible linker (SAPGTP). The antigenic and allergenic features, 2D and 3D structures, and physicoc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydial major outer membrane protein (MOMP) is the major protein constituent of the bacterial pathogen Chlamydia trachomatis. Chlamydia trachomatis Serovars D-K are the leading cause of genital tract infections which can lead to infertility or ectopic pregnancies. A vaccine against Chlamydia is highly desirable but currently not available. MOMP accounts for ~ 60% of the chlamydial protein mass and is considered to be one of the lead vaccine candidates against C. trachomatis. We report on the spectroscopic analysis of C. trachomatis native MOMP Serovars D, E, F, and J as well as C. muridarum
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disease-associated silent mutations are considered to affect the accurate pre-messenger RNA (mRNA) splicing either by influencing regulatory elements, leading to exon skipping, or by creating a new cryptic splice site. This study describes a new molecular pathological mechanism by which a silent mutation inhibits splicing and leads to intron retention. We identified a heterozygous silent mutation, c.7464C>T, in exon 44 of the von Willebrand factor (VWF) gene in a family with type 1 von Willebrand disease. In vivo and ex vivo transcript analysis revealed an aberrantly spliced transcript, with i
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to analyze the effect of ultrasonication treatment on the functional, structural, and rheological properties of rice bean protein isolate (RBPI) and subsequently use the optimized RBPI to formulate the 3D-printable food inks. Ultrasonication was applied at increasing treatment intensities (5-30 min), at a constant frequency of 40 kHz. FTIR, UV-Vis Spectroscopy, XRD, and SEM analysis confirmed that ultrasonication efficiently modified the secondary and tertiary structure of RBPI without altering its primary structure. These structural modifications resulted in signific
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human plasma gelsolin (pGSN) is an 83 kDa actin-binding protein involved in cytoskeletal remodeling, inflammation, and host defense. Its clinical relevance as a biomarker and potential therapeutic agent, particularly in conditions like sepsis, acute respiratory distress syndrome (ARDS), and cystic fibrosis, has driven interest in scalable recombinant expression. However, high-yield production of functionally active gelsolin is hindered by its complex structure and folding requirements. To address this, we developed a scalable, high-yield bacterial expression system that achieves among the high
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clarity and refractivity of the eye lens are mediated by the highly soluble crystallin proteins. Post-translational modifications impact solubility and stability of the structural and refractive βγ-crystallins, eventually leading to cataract. Such damaged proteins are kept in solution by the holdase chaperone α-crystallins, maintaining lens transparency over decades despite the absence of protein turnover. It was previously found that a short peptide from human αA-crystallin (mini-αA-crystallin [MAAC]) retains some chaperone activity, with hydrophobic interactions hypothesized to mediate c
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Abrupt aggregation of misfolded proteins is the underlying molecular cause of Alzheimer disease (AD) and Parkinson disease (PD). Both AD and PD are severe pathologies that affect millions of people around the world. A small 42 amino acid long peptide, known as amyloid β (Aβ), aggregates in the frontal cortex of AD patients forming oligomers and fibrils, highly toxic protein aggregates that cause progressive neuron death. Similar aggregates of α-synuclein (α-Syn), a small protein that facilitates neurotransmitter release, are observed in the midbrain, hypothalamus, and thalamus of people with P
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mitochondrial outer membrane creates a diffusion barrier between the cytosol and the mitochondrial intermembrane space, allowing the exchange of metabolic products, important for efficient mitochondrial function in neurons. The ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 (GDAP1) is a mitochondrial outer membrane protein with a critical role in mitochondrial dynamics and metabolic balance in neurons. Missense mutations in the GDAP1 gene are linked to the most common human peripheral neuropathy, Charcot-Marie-Tooth disease (CMT). GDAP1 is a distant member of the glutathione-S-tr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spirulina protein isolate (SPI) is a bio-polymer that can be used in the design and synthesis of hydrogels due to its biodegradability and non-toxicity. Herein, dual-crosslinked hydrogels were synthesized based on spirulina protein isolate through covalent crosslinking with genipin and metal coordination with Zn2+, and used as delivery systems. From the analysis of colorimetric indices, a high correlation between color changes and the reaction of cross-linkers with amine group structure was observed. By increasing genipin concentration in the range of 5-15 mM, the degree of cross-linking incre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective To investigate the effect of rhoptry protein 38 (ROP38) from Toxoplasma gondii (T. gondii) on the maturation of dendritic cells (DCs) by Toll-like receptor 4 (TLR4) induction in vitro. Methods The total RNA from T. gondii RH strain was extracted by guanidine thiocyanate method, and then cDNA was synthesized with reverse transcription reaction. After ROP38 gene was amplified by PCR, the recombinant pGEX-4T-ROP38 was constructed and expressed under IPTG induction. The recombinant ROP38 protein was detected by SDS-PAGE and Western blot analysis. The secondary structure and antigenicity
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mature and potentially motile spermatozoa stored in cauda epididymis in an inactive state for approximately 30 days; however, during ejaculation they regain motility. To understand the actual molecular mechanism of the sperm quiescence during caudal stay, a proteinaceous quiescence factor (QF) has been purified from caprine epididymal plasma to apparent homogeneity. In the present study complete purification, detailed characterization as well as mechanistic pathway of QF has been described. QF is purified to 215-fold with 45% activity recovery. It is a 59 kDa monomeric protein with isoelectric
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The model describing the structure and conformational preferences of the HIV-Haiti V3 loop in the geometric spaces of Cartesian coordinates and dihedral angles was generated in terms of NMR spectroscopy data published in literature. To this end, the following successive steps were put into effect: (i) the NMR-based 3D structure for the HIV-Haiti V3 loop in water was built by computer modeling methods; (ii) the conformations of its irregular segments were analyzed and the secondary structure elements identified; and (iii) to reveal a common structural motifs in the HIV-Haiti V3 loop regardless
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AA amyloidosis is one of the most prevalent forms of systemic amyloidosis and affects both humans and other vertebrates. In this study, we compare MAS solid-state NMR data with a recent cryo-EM study of fibrils involving full-length murine SAA1.1. We address the question whether the specific requirements for the reconstitution of an amyloid fibril structure by cryo-EM can potentially yield a bias towards a particular fibril polymorph. We employ fibril seeds extracted from in to vivo material to imprint the fibril structure onto the biochemically produced protein. Sequential assignments yield t
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Membrane-embedded molecular machines are utilized to move water-soluble proteins across these barriers. Anthrax toxin forms one such machine through the self-assembly of its three component proteins--protective antigen (PA), lethal factor, and edema factor. Upon endocytosis into host cells, acidification of the endosome induces PA to form a membrane-inserted channel, which unfolds lethal factor and edema factor and translocates them into the host cytosol. Translocation is driven by the proton motive force, composed of the chemical potential, the proton gradient (ΔpH), and the membrane potentia
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how single nucleotide polymorphisms (SNPs) lead to disease at a molecular level provides a starting point for improved therapeutic intervention. SNPs in the innate immune receptor nucleotide oligomerisation domain 2 (NOD2) can cause the inflammatory disorders Blau Syndrome (BS) and early onset sarcoidosis (EOS) through receptor hyperactivation. Here, we show that these polymorphisms cluster into two primary locations: the ATP/Mg(2+)-binding site and helical domain 1. Polymorphisms in these two locations may consequently dysregulate ATP hydrolysis and NOD2 autoinhibition, respecti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anaerobic unsaturated fatty acid synthesis in bacteria occurs through the introduction of a double bond into the growing acyl chain. In the Escherichia coli model system, FabA catalyzes both the dehydration of beta-hydroxydecanoyl-ACP and the isomerization of trans-2-decenoyl-ACP to cis-3-decenoyl-ACP as the essential step. A second dehydratase, FabZ, functions in acyl chain elongation but cannot carry out the isomerization reaction. Enterococcus faecalis has two highly related FabZ homologs. One of these, termed EfFabN, carries out the isomerization reaction in vivo, whereas the other, EfFabZ
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The surface envelope glycoprotein (SU) of Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1), gp120(SU) plays an essential role in virus binding to target CD4+ T-cells and is a major vaccine target. Gp120 has remarkably high levels of N-linked glycosylation and there is considerable evidence that this "glycan shield" can help protect the virus from antibody-mediated neutralization. In recent years, however, it has become clear that gp120 glycosylation can also be included in the targets of recognition by some of the most potent broadly neutralizing antibodies. Knowing the site-specific glycosylation
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The random non-standard peptide integrated discovery (RaPID) system has proven to be a powerful approach to discover de novo natural product-like macrocyclic peptides that inhibit protein functions. We have recently reported three macrocyclic peptides that bind to Pyrococcus furiosus multidrug and toxic compound extrusion (PfMATE) transporter and inhibit the transport function. Moreover, these macrocyclic peptides were successfully employed as cocrystallization ligands of selenomethionine-labeled PfMATE. In this report, we disclose the details of the RaPID selection strategy that led to the id
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: The intracellular pathogen Burkholderia pseudomallei causes the disease melioidosis, a major source of morbidity and mortality in southeast Asia and northern Australia. The need to develop novel antimicrobials is compounded by the absence of a licensed vaccine and the bacterium's resistance to multiple antibiotics. In a number of clinically relevant Gram-negative pathogens, DsbA is the primary disulfide oxidoreductase responsible for catalyzing the formation of disulfide bonds in secreted and membrane-associated proteins. In this study, a putative B. pseudomallei dsbA gene was evaluated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.