OBJECTIVE: To construct a competitive endogenous RNA (ceRNA) regulatory network in blood exosomes of patients with ovarian cancer (OC) using bioinformatics and explore its pathogenesis.
METHODS: The exoRbase2.0 database was used to download blood exosome gene sequencing data from patients OC and normal controls and the expression profiles of exosomal mRNA, long non-coding RNA (lncRNA), and circular RNA (circRNA) were detected independently using R language for differential expression analysis. TargetScan and miRanda databases were combined for the prediction and differential expression of mRN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Identification of the etiology, molecular mechanisms, and carcinogenic pathways of tongue squamous cell carcinoma (TSCC) is crucial for developing new diagnostic and therapeutic strategies. This study used bioinformatics methods to identify key genes in TSCC and explored the potential functions and pathway mechanisms related to the malignant biological behavior of TSCC.
METHODS: Gene chip data sets (i.e., GSE13601 and GSE34106) containing the data of both TSCC patients and normal control subjects were selected from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Using a gene expressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Brassica napus is the third leading source of vegetable oil in the world after soybean and oil palm. The accumulation of gene sequences, especially expressed sequence tags (ESTs) from plant cDNA libraries, has provided a rich resource for genes discovery including potential antimicrobial peptides (AMPs). In this study, we used ESTs including those generated from B. napus cDNA libraries of seeds, pathogen-challenged leaves and deposited in the public databases, as a model, to perform in silico identification and consequently in vitro confirmation of putative AMP activities through a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The infiltration of regulatory T cells (Tregs) in lung adenocarcinoma (LUAD) is associated with a poor prognosis. The present study aimed to explore the potential function of Treg marker genes in prognosis and immunotherapy using the transcriptome profiles of five LUAD cohorts sourced from public databases. Among them, the single-cell dataset GSE131907 was employed to identify cell types in lung cancer tissues and to identify Treg markers. The prognostic Treg markers were screened using univariate Cox and Least Absolute Shrinkage and Selection Operator regression analyses. Subsequently, a prog
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Some salivary proteins seem to be differently abundant among caries-free (CF) and caries-affected (CA) individuals, but previous results are contradictory precluding that definitive conclusion be drawn. A pooled analysis of the available evidence may provide more robust data on identifying oral cavity protein patterns among CF and CA individuals. This systematic review and meta-analysis (PROSPERO CRD42021269079) aimed to compare the oral cavity protein abundance among caries-free and caries-affected individuals.
METHODS: This study was conducted following PRISMA guidelines. PubMed,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To use proteomic analysis to identify qualitatively and quantitatively mammalian protein components of commercial veterinary vaccines against canine distemper, leptospirosis, borreliosis, and rabies.
SAMPLE: 25 licensed veterinary vaccines (from 4 different manufacturers) against canine distemper and leptospirosis, borreliosis, and rabies (3-year and 1-year durations of immunity).
PROCEDURES: Duplicate samples from a single-lot vial of each vaccine were prepared by acetone precipitation and proteolysis with trypsin and Lys-C protease mix. Peptides mixtures (1 μg) were analyzed by
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: ChangPu YuJin Tang (CPYJT) is a Chinese herbal formula that has been shown to be an effective therapeutic strategy for pediatric patients with Tourette Syndrome (TS). Using an integrated strategy of network pharmacology and animal model, the aim of this study was to investigate the mechanism of CPYJT in the treatment of TS.
METHODS: Compound libraries of CPYJT were established using databases, such as the Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP). The TCMSP database and Swiss Target Prediction database were used to predict the targets
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Burkholderia pseudomallei (BP) infections claims tens of thousands of lives worldwide every year. The bacterium's distinctive characteristics include antibiotic resistance, virulence and ability to survive in stressful environments. The B. pseudomallei genome sequencing and annotation reveal that about 25% of the genes encode hypothetical proteins (HPs). As such, characterising the HPs could shed light on the mechanisms that contribute to the above characteristics. Over the last decade, genome sequencing and annotation technologies have advanced drastically. Furthermore, artificial intelligenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To analyze proteins in the tissue of pterygia, and to investigate their potential roles in pterygia, using the comparative proteomic technique of Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation (iTRAQ) coupled with offline 2DLC-MS/MS, Western-bolt.
METHOD: The tissue of pterygia and healthy conjunctiva was collected from 10 pterygia patients (6 females, 4 males; average age was 52 years old; average course of disease was 6 years) in our hospital from September, 2015 to March, 2016. iTRAQ was used to analyze proteins in the patients' pterygia and healthy conjunctiva. Proteins wit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the present study was to identify a child hepatoblastoma serum biomarker that is unaffected by inflammatory factors, with the ultimate aim of finding an effective method for the early diagnosis of hepatoblastoma. The magnetic bead-based weak cation exchange chromatography technique was used to process serum harvested from 30 children with hepatoblastoma, 20 children with systemic inflammatory response syndrome (SIRS) and 20 healthy children. Proteins differentially expressed in SIRS were excluded from consideration as biomarkers for hepatoblastoma. Proteins differentially expressed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied 15 strains of group C (Streptococcus equi subsp. equisimilis) [corrected] isolated from the throats of college students with acute pharyngitis and 5 strains isolated from patients with noninfectious problems. Nineteen of the 20 strains resisted phagocytic killing during incubation in normal human blood, suggesting that they might express M proteins. Genomic DNA from all 20 strains hybridized with a probe corresponding to the carboxyterminal one-third of the group A M-protein gene emm24, a region that is highly conserved among M proteins of group A and group G streptococci. The DNA s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tuberculosis (TB), a global infectious threat, has seen a concerning rise in aminoglycoside-resistant Mycobacterium tuberculosis (M.tb) strains. The potential role of capsule proteins remains largely unexplored. This layer acts as the primary barrier for tubercle bacilli, attempting to infiltrate host cells and subsequent disease development.
METHODS: The study aims to bridge this gap by investigating the differentially expressed capsule proteins in aminoglycoside-resistant M.tb clinical isolates compared with drug-sensitive isolates employing two-dimensional gel electrophoresis,
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The present study aimed to identify proteins obtained from pulp tissue and correlate with each clinical diagnosis (healthy pulp, inflamed pulp, and necrotic pulp).
MATERIALS AND METHODS: A total of forty-five molars were used. Three biological replicas were evaluated. Lysis and sonication were used for protein extraction. Protein quantification was assessed by using the Bradford technique, and shotgun proteome analysis was performed by nanoUPLC-MSE using a Synapt G2 mass spectrometer. Mass spectra data were processed using the Waters PLGS software, and protein identification was d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To analyze and identify the proteomic differences between liquefied after-cataracts and normal lenses by means of liquefied chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS).
METHODS: Three normal lenses and three liquefied after-cataracts were exposed to depolymerizing reagents to extract the total proteins. Protein concentrations were separated using two-dimensional gel electrophoresis (2-DE). The digitized images obtained with a GS-800 scanner were then analyzed with PDQuest7.0 software to detect the differentially-expressed protein spots. These protein spots were cut from the gel us
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bioactive protein components from snake venom complexes have been utilized for studies of enzymology, structural biology, and pharmacology. The Gloydius shedaoensis snake (GSS) is the only snake species found exclusively at the Chinese Shedao (snake) Island in Dalian. To investigate the protein components of Chinese GSS venom (GSSV), we initialized a proteomic assay for GSSV by the combination of sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis with high-performance liquid chromatography (HPLC)-nanoelectrospray ionization tandem mass spectrometry (nESI-MS/MS). Thirty gel bands vis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella melitensis is a facultative intracellular pathogen which is able to survive and replicate within phagocytic cells. Therefore, it has to adapt to a range of different hostile environments. In order to understand the mechanisms of intracellular survival employed by virulent B. melitensis 16M, an initial approach consisting of analysis of the differences in patterns of protein synthesis in response to heat, oxidative, and acid pH stresses by two-dimensional (2-D) polyacrylamide gel electrophoresis was used. Depending on the stress, this involved about 6.4 to 12% of the 676 protein spots
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatoblastoma (HB) is the most common malignant liver tumor in pediatric patients. Even though the 5-year survival rate of HB patients has reached 80%, the prognosis in patients with high-risk features remain poor. This study aimed to establish the proteomic signature of HB to discover novel biomarkers and therapeutic targets.
METHODS: HPLC-MS/MS coupled with bioinformatic analyses were performed to identify the differentially expressed proteins and related GO/KEGG pathways in HB tumor tissues. Molecular biology experiments in HepG2 and Huh6 cells were conducted to validate findi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to give significant information for the research and treatment of knee osteoarthritis (KOA) targets, using bioinformatics methods to uncover the associated genes of KOA and explore their expression and clinical importance. GEO database was used to analyze differential genes of KOA, R was used to perform pathway enrichment analysis and functional annotation of differential genes, a protein-protein interaction network of differential genes was constructed, core modules of the protein-protein interaction network of relationship targets were screened, and common genes of 2 protein
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Domestic cat blastocysts cultured without the zona pellucida exhibit reduced implantation capacity. However, the protein expression profile has not been evaluated in these embryos. The objective of this study was to evaluate the protein expression profile of domestic cat blastocysts cultured without the zona pellucida. Two experimental groups were generated: (1) domestic cat embryos generated by IVF and cultured in vitro (zona intact, (ZI)) and (2) domestic cat embryos cultured in vitro without the zona pellucida (zona-free (ZF group)). The cleavage, morula, and blastocyst rates were estimated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PI3K/AKT/mTOR pathway is a significant target for cancer drug discovery. Many efforts have focused on discovering new inhibitors against key kinase proteins involved in this pathway for cancer treatment. PI3K/mTOR dual inhibitors, such as PKI-179, have been reported to be more effective than agents that act only on a single protein target. The present computational study aimed to discover triple target inhibitors against PI3K, AKT, and mTOR proteins. Accordingly, the PI3K protein bound with the ligand was used as input for e-pharmacophore modelling to generate the pharmacophore hypothesis
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.