BACKGROUND: Systemic sclerosis (SSc) is a rare autoimmune fibrosing disease with an incompletely understood genetic and non-genetic etiology. Defining its etiology is important to allow the development of effective predictive, preventative, and therapeutic strategies. We conducted this epigenomic study to investigate the contributions of DNA methylation to the etiology of SSc while minimizing confounding due to genetic heterogeneity.
METHODS: Genomic methylation in whole blood from 27 twin pairs discordant for SSc was assayed over 450 K CpG sites. In silico integration with reported different
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bisphenol A (BPA) is a ubiquitous industrial chemical that has been identified as an endocrine disrupting compound (EDC). There is growing concern that early life exposures to EDCs, such as BPA, can adversely affect the male reproductive tract and function. This study was conducted as part of the Consortium Linking Academic and Regulatory Insights on BPA Toxicity (CLARITY-BPA) to further delineate the toxicities associated with continuous exposure to BPA from early gestation, and to comprehensively examine the elicited effects on testes and sperm. NCTR Sprague Dawley rat dams were gavaged from
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The integration of engineered nanomaterials (ENM) is well-established and widespread in clinical, commercial, and domestic applications. Cardiovascular dysfunctions have been reported in adult populations after exposure to a variety of ENM. As the diversity of these exposures continues to increase, the fetal ramifications of maternal exposures have yet to be determined. We, and others, have explored the consequences of ENM inhalation during gestation and identified many cardiovascular and metabolic outcomes in the F1 generation. The purpose of these studies was to identify genetic
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fetal development is a crucial window of susceptibility in which exposure-related alterations can be induced on the molecular level, leading to potential changes in metabolism and development. The placenta serves as a gatekeeper between mother and fetus, and is in contact with environmental stressors throughout pregnancy. This makes the placenta as a temporary organ an informative non-invasive matrix suitable to investigate omics-related aberrations in association with in utero exposures such as ambient air pollution.
OBJECTIVES: To summarize and discuss the current evidence and d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental factors profoundly affect the addictive potential of drugs of abuse and may also modulate the neuro-anatomical/neuro-chemical impacts of uncontrolled drug use and relapse propensity. This study examined the impact of environmental enrichment on heroin self-administration, addiction-related behaviors, and molecular processes proposed to underlie these behaviors. Male Sprague-Dawley rats in standard and enriched housing conditions intravenously self-administered similar amounts of heroin over 14 days. However, environmental enrichment attenuated progressive ratio, extinction, and r
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Placental immune editing switches (PIES) have not evolved to prevent or to cause cancer but to make feto-maternal immune tolerance possible, which is at the very core of our placental mammalian ('Eutherian') nature. Aggressive epithelial cancers might be an unfortunate 'side effect' of this highly sophisticated biological nature. Microenvironmental properties in the placenta and decidua are thought to be a key to feto-maternal immune tolerance. Recently, in 2016-2018, we published the first human genomic and epigenomic evidence of similar gene expression profiles in immune regulatory genes in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Migraine is a common heritable neurovascular disorder typically characterised by episodic attacks of severe pulsating headache and nausea, often accompanied by visual, auditory or other sensory symptoms. Although genome-wide association studies have identified over 40 single nucleotide polymorphisms associated with migraine, there remains uncertainty about the casual genes involved in disease pathogenesis and how their function is regulated.
RESULTS: We performed an epigenome-wide association study, quantifying genome-wide patterns of DNA methylation in 67 migraine cases and 67 co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАTwin StudyПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Preeclampsia is known to be a leading cause of mortality and morbidity among mothers and their infants. Approximately 3-8% of all pregnancies in the US are complicated by preeclampsia and another 5-7% by hypertensive symptoms. However, less is known about its long-term influence on infant neurobehavioral development. The current review attempts to demonstrate new evidence for imprinting gene dysregulation caused by hypertension, which may explain the link between maternal preeclampsia and neurocognitive dysregulation in offspring.
METHOD: Pub Med and Web of Science databases were sea
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic processes control the embryonic development into multicellular organisms and determine the functional differences of genetically identical cells and individuals. They are also involved in a variety of complex functions such as learning and memory consolidation and have been implicated in aging processes. Beyond the actual genetic information encoded in the DNA sequence, epigenetic modifications in particular DNA methylation and various histone modifications shape the chromatin into a transcriptional permissive or repressive state. DNA methylation patterns are altered by environmenta
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose: To identify potential molecular hubs that regulate oncogenic kinases and target them to improve treatment outcomes for glioblastoma patients.Experimental Design: Data mining of The Cancer Genome Atlas datasets identified nicotinamide-N-methyl transferase (NNMT) as a prognostic marker for glioblastoma, an enzyme linked to the reorganization of the methylome. We tested our hypothesis that NNMT plays a crucial role by modulating protein methylation, leading to inactivation of tumor suppressors and activation of oncogenes. Further experiments were performed to understand the underlying bi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are short non-coding RNAs that act as important regulators of gene expression as part of the epigenetic machinery. In addition to posttranscriptional gene silencing by miRNAs, the epigenetic mechanisms also include DNA methylation, histone modifications and their crosstalk. Epigenetic modifications were reported to play an important role in many disease onsets and progressions and can be used to explain several features of complex diseases, such as late onset and fluctuation of symptoms. However, miRNAs not only function as a part of epigenetic machinery, but are also epigen
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Traditional toxicological paradigms have relied on factors such as age, genotype, and disease status to explain variability in responsiveness to toxicant exposure; however, these are neither sufficient to faithfully identify differentially responsive individuals nor are they modifiable factors that can be leveraged to mitigate the exposure effects. Unlike these factors, the epigenome is dynamic and shaped by an individual's environment. We sought to determine whether baseline levels of specific chromatin modifications correlated with the interindividual variability in their ozone (O3)-mediated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myelination of the peripheral nervous system is required for axonal function and long term stability. After peripheral nerve injury, Schwann cells transition from axon myelination to a demyelinated state that supports neuronal survival and ultimately remyelination of axons. Reprogramming of gene expression patterns during development and injury responses is shaped by the actions of distal regulatory elements that integrate the actions of multiple transcription factors. We used ChIP-seq to measure changes in histone H3K27 acetylation, a mark of active enhancers, to identify enhancers in myelina
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
About two-thirds of human congenital heart disease involves second heart field-derived structures. Histone-modifying enzymes, histone deacetylases (HDACs), regulate the epigenome; however, their functions within the second heart field remain elusive. Here we demonstrate that histone deacetylase 3 (HDAC3) orchestrates epigenetic silencing of Tgf-β1, a causative factor in congenital heart disease pathogenesis, in a deacetylase-independent manner to regulate development of second heart field-derived structures. In murine embryos lacking HDAC3 in the second heart field, increased TGF-β1 bioavailab
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrauterine growth restriction (IUGR) confers heritable alterations in DNA methylation, rendering risk of adult metabolic syndrome (MetS). Because CpG methylation is coupled to intake of essential nutrients along the one-carbon pathway, we reasoned that essential nutrient supplementation (ENS) may abrogate IUGR-conferred multigenerational MetS. Pregnant Sprague-Dawley rats underwent bilateral uterine artery ligation causing IUGR in F1. Among the F2 generation, IUGR lineage rats were underweight at birth (6.7 vs. 8.0 g, P < 0.0001) and obese by adulthood (p160: 613 vs. 510 g; P < 0.0001). Dual
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Systemic lupus erythematosus (SLE) is the prototypic systemic autoimmune disease. Genome-wide (GW) association studies have identified more than 40 disease-associated loci, together accounting for only 10-20% of disease heritability. Gene expression represents the intermediate phenotype between DNA and disease phenotypic variation, and provides insights regarding genetic and epigenetic effects. We review data on gene expression and regulation in SLE by our group and other investigators.
MATERIALS AND METHODS: Systematic PubMed search for GW expression studies in SLE published sinc
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prenatal undernutrition affects offspring phenotype via changes in the epigenetic regulation of specific genes. We hypothesized that pregnant females that were fed a calcium (Ca)-deficient diet would have offspring with altered hepatic glucocorticoid-related gene expression and altered epigenetic gene regulation. Female Wistar rats ate either a Ca-deficient or control diet from 3 weeks before conception to 21 days after parturition. Pups were allowed to nurse from their original mothers and then euthanized on day 21. Methylation of individual cytosine-guanine dinucleotides in the phosphoenolpy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The association between oxidative stress and coronary artery disease (CAD) is well documented. However, the role of epigenetic factors contributing to oxidative stress is relatively unexplored. In this study, we aimed to explore the impact of DNA methylation profile in BCL2/E1B adenovirus interacting protein 3 (BNIP3), extracellular superoxide dismutase (EC-SOD) and glutathione-S-transferase P1 (GSTP1) on the oxidative stress in CAD. Further, the contribution of folate pathway genetic polymorphisms in regulating epigenome was elucidated. The expression of BNIP3, EC-SOD, and GSTP1 were studied
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Few studies have evaluated the association between DNA methylation in white blood cells (WBC) and the risk of breast cancer. The evaluation of WBC DNA methylation as a biomarker of cancer risk is of particular importance as peripheral blood is often available in prospective cohorts and easier to obtain than tumor or normal tissues. Here, we used prediagnostic blood samples from three studies to analyze WBC DNA methylation of two ATM intragenic loci (ATMmvp2a and ATMmvp2b) and genome-wide DNA methylation in long interspersed nuclear element-1 (LINE1) repetitive elements. Samples were from a cas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A growing body of evidence suggests that the intrauterine (IU) environment has a significant and lasting effect on the long-term health of the growing fetus and the development of metabolic disease in later life as put forth in the fetal origins of disease hypothesis. Metabolic diseases have been associated with alterations in the epigenome that occur without changes in the DNA sequence, such as cytosine methylation of DNA, histone posttranslational modifications, and micro-RNA. Animal models of epigenetic modifications secondary to an altered IU milieu are an invaluable tool to study the mech
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.