Ab initio theoretical evidence of hexacoordinate planar main group atoms centered in hexagonal hydrocopper complexes Cu(6)H(6)X (X = Si, P, As) is presented at the density functional theory level in this work. The results obtained extend the bonding capacity of silicon, phosphorus, and arsenic to planar hexacoordination in hydrocopper complexes which are important in fundamental research and may shed new insight into catalyst chemistry.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, machine learning was used to predict electronic properties of anticancer drugs using molecular descriptors. Four machine learning models were employed to understand and predict the relationship between molecular structure and properties of the molecules. The results showed that extreme gradient boosting (XGBoost) gave good prediction performance in handling complex and nonlinear patterns in the data. In all cases, the feature importance analysis showed a consistent ranking. It shows how molecular descriptors had an influence on property prediction. This study shows how molecular
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Animal models of Down syndrome (DS) provide an essential resource for understanding genetic, cellular, and molecular contributions to traits associated with trisomy 21 (Ts21). Recent genetic enhancements in the development of DS models, including the new TcHSA21rat model (Kazuki et al.), have potential to transform our understanding of and potential therapies for Ts21.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The quality of several atomic charge models based on different definitions has been analyzed using cumulative atomic multipole moments (CAMM). This formalism can generate higher atomic moments starting from any atomic charges, while preserving the corresponding molecular moments. The atomic charge contribution to the higher molecular moments, as well as to the electrostatic potentials, has been examined for CO and HCN molecules at several different levels of theory. The results clearly show that the electrostatic potential obtained from CAMM expansion is convergent up to R-5 term for all atomi
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amine transaminases (ATAs) are pyridoxal-5'-phosphate (PLP)-dependent enzymes that catalyze the transfer of an amino group from an amino donor to an aldehyde and/or ketone. In the past decade, the enzymatic reductive amination of prochiral ketones catalyzed by ATAs has attracted the attention of researchers, and more traditional chemical routes were replaced by enzymatic ones in industrial manufacturing. In the present work, the influence of the presence of an α,β-unsaturated system in a methylketone model substrate was investigated, using a set of five wild-type ATAs, the (R)-selective from A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The environmental impacts of energetic compounds can be minimized through the design and selection of new energetic materials with favorable fate properties. Building predictive models to inform this process, however, is difficult because of uncertainties and complexities in some major fate-determining transformation reactions such as the alkaline hydrolysis of energetic nitroaromatic compounds (NACs). Prior work on the mechanisms of the reaction between NACs and OH(-) has yielded inconsistent results. In this study, the alkaline hydrolysis of 2,4,6-trinitrotoluene (TNT) and 2,4-dinitroanisole
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To build self-supervised foundation models for multicontrast MRI of the whole brain and evaluate their efficacy in assisting diagnosis of brain tumors.
METHODS: In this retrospective study, foundation models were developed using 57,621 enhanced head MRI scans through self-supervised learning with a pretext task of cross-contrast context restoration with two different content dropout schemes. Downstream classifiers were constructed based on the pretrained foundation models and fine-tuned for brain tumor detection, discrimination, and molecular status prediction. Metrics including a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular sieves used in catalytic and adsorptive processes in the petroleum/petrochemical industry are subject to deactivation by coke deposition. Here, we apply CO2 adsorption isotherms associated with molecular simulation models to extract additional information from the coke deactivation process. We developed a predictive molecular simulation model for naturally occurring zeolite CHA with multiple cation mixtures. The model was validated based on experimental CO2 adsorption isotherms. N-heptane, benzene and naphthalene were tested as model coke molecules to describe deactivation as a funct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increase in antimicrobial resistance presents a major challenge in treating bacterial infections, underscoring the need for innovative drug discovery approaches and novel inhibitors. Bacterial RNA polymerase (RNAP) has emerged as a crucial target for antibiotic development due to its essential role in transcription. RNAP is a molecular motor, and its function relies heavily on the dynamic shifts between multiple conformational states. While biochemical and structural experimental methods offer crucial insights into static RNAP-drug interactions, they fall short in capturing the dynamics at
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dissection of the molecular interactions between nutrition and immunity to nematodes is of strategic importance to predict the risk of infection, define disease predisposition and develop sustainable measures for parasite control in ruminants. Despite the evidence on the effects of nutrition on the manifestations of immunity to gastrointestinal parasites at phenotypic level, the lack of progress on the characterisation of the molecular interactions is directly related to the current lack of appropriate tools for such advancements, including fully sequenced and annotated genomes and immunol
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory viral co-infections by viruses such as influenza virus, SARS-CoV-2, and respiratory syncytial virus (RSV) are a significant clinical issue in high-risk populations such as children, elderly patients, and immunocompromised individuals. Sequential and simultaneous co-infections exacerbate disease severity, leading to acute respiratory distress syndrome (ARDS), prolonged hospitalization, and increased mortality. Molecular and immunological interactions are complex, context-dependent, and largely unknown. Experimental models of infection that accurately mimic human respiratory physiolo
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in protein structure prediction have transformed the landscape of structure-based drug discovery, enabling deep learning models to incorporate spatial constraints into the design of target-specific ligands. This review provides a comprehensive synthesis of structure-aware molecular modeling from a task-centric perspective, focusing on binding pocket identification, interaction prediction, pose estimation, and complex modeling. We highlight the technological evolution from traditional docking and scoring frameworks toward geometry-informed deep learning architectures that encode protei
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of tuberculosis infections that are resistant to conventional drug therapy has risen steadily in the last decade. Several of the quinolone antibacterials have been examined as inhibitors of M. tuberculosis infection as well as other mycobacterial infections. However, not much has been done to examine specific structure-activity relationships of the quinolone antibacterials against mycobacteria. The present paper describes quantitative structure-activity relationship modeling for a series of antimycobacterial compounds. Most of the antimycobacterial compounds do not have sufficien
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent integration of natural language processing into chemistry has advanced drug discovery. Molecule representations in language models (LMs) are crucial to enhance chemical understanding. We explored the ability of models to match the same chemical structures despite their different representations. Recognizing the same substance in different representations is an important component of emulating the understanding of how chemistry works. We propose Augmented Molecular Retrieval (AMORE), a flexible zero-shot framework for the assessment of chemistry LMs of different natures. The framewor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pediatric patients with recurrent and refractory cancers are in most need for new treatments. This study developed patient-derived-xenograft (PDX) models within the European MAPPYACTS cancer precision medicine trial (NCT02613962). To date, 131 PDX models were established following heterotopical and/or orthotopical implantation in immunocompromised mice: 76 sarcomas, 25 other solid tumors, 12 central nervous system tumors, 15 acute leukemias, and 3 lymphomas. PDX establishment rate was 43%. Histology, whole exome and RNA sequencing revealed a high concordance with the primary patient's tumor pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peritoneal adhesions are poorly understood but highly prevalent conditions that can cause intestinal obstruction and pelvic pain requiring surgery. While there is consensus that stress-induced inflammation triggers peritoneal adhesions, the molecular processes of their formation still remain elusive. We performed murine models and analyzed human samples to monitor the formation of adhesions and the treatment with DNases. Various molecular analyses were used to evaluate the adhesions. The experimental peritoneal adhesions of the murine models and biopsy material from humans are largely based on
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibrils formed by assembly of human islet amyloid polypeptide (hIAPP) are found in most patients with type II diabetes. Structurally, these fibrils are composed of multiple protofilaments and are characterized by extended beta sheets, variable helical twists, and different morphologies. We have previously derived models for the hIAPP protofilament using simulations constrained by data from EPR spectroscopy. In the current work, these models were used as a basis for generating idealized hIAPP protofilaments with symmetrical geometrical properties using a new algorithm, MFIBRIL. We show good agr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The combination of genomic, proteomic and other data, enables to reconstruct the evolution of complex cellular units thus transcending the more reductionistic view of traditional molecular phylogeny. However, most models which try to investigate the evolution of protein interaction networks so far are based on the analysis of their global statistical properties, such as their scale-free behaviour. We have investigated phylogenies of three families of ancient eukaryotic transcription factors for which fairly reliable interaction data are available. For all three families, bZIP, bHLH and NR (nuc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current hypotheses suggest that autoimmune hepatitis (AIH) is triggered by an environmental factor in a genetically susceptible host. Multiple genes may interact to produce a "permissive gene pool" that determines both disease risk and phenotype. Studies of type 1 AIH have focused on the major histocompatibility complex (MHC), mapping susceptibility to the DRB1 region. Three different molecular models have been proposed based on histidine at DRbeta13, lysine at DRbeta71, and valine at DRbeta86. Although the lysine-71 model has been adapted to explain data from several other studies, the DRbeta
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Significant efforts have been made to dissect the molecular pathways involved in the carcinogenesis of thymic malignancies. Research is hampered by the rarity of the tumor, controversies about histopathologic classification, and the lack of established cell lines and animal models. Insights into the biology of these tumors have been made following anecdotal clinical responses to targeted therapies. This article reviews current knowledge about the molecular data that define molecular subsets and support the use of targeted therapies in thymic tumors.
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.