Deep neural networks have improved many difficult prediction tasks in biology, but it remains challenging to interpret these networks and learn the molecular mechanisms. Here, we address interpretation challenges by building biophysical neural networks for predicting activation domains, the regions within transcription factors (TFs) that recruit coactivators to drive gene expression. Deep neural networks can now accurately predict acidic activation domains from protein sequences, but these predictors are difficult to interpret. We designed shallow neural networks that incorporated biophysical
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A tractable and computationally expedient electronic transition dipole moment time-correlation function of a tetrameric photosynthetic complex binding two pigment dimers, from which nonlinear optical time- and frequency-domain signals may be obtained, and the bath spectral density, which impacts the dynamics and the shape and symmetry of linear spectra, play key roles in extracting structural and dynamical information for condensed systems. Analytical expressions for the electronic transition dipole moment time-correlation function and the homogeneous absorption line shape function of excitoni
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The plastid stroma-localized chaperone HSP90C is essential for maintaining chloroplast proteostasis and facilitating protein translocation. Prior research has established HSP90C's imperative role in the SEC translocase-dependent transport of the photosystem II subunit PsbO1 and its interaction with the SEC1 translocase motor protein SecA1. However, the exact mechanism of this interaction remains to be explored. In this study, we delineated the interactional mode of HSP90C and SecA1 with the model client protein. Yeast two-hybrid and in vitro ATPase activity analyses with purified proteins reve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wilms' tumor (WT) is one of the most common pediatric abdominal malignancies. The RNA-binding protein heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D (hnRNPD) is related to cancer progression through regulating target mRNA stability. Nonetheless, its expression profile and value for WT are largely unexplored. Human renal proximal tubular epithelial cells (RPTEC) and WT cells (17.94, HFWT) were employed as experimental models for exploring hnRNPD's effect on WT progression. Subsequently, potential downstream targets of hnRNPD were identified through bioinformatics analysis. Functional validation was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the interactions between phenolic compounds from Israeli and Chilean white wines and human serum carrier proteins, including human serum albumin (HALB), gamma-globulin (HGLO), and fibrinogen (HFB), to characterize their antioxidant capacity and serum protein-binding behavior under controlled experimental conditions. The analyzed wines included Israeli Chardonnay (ICR), Chilean Chardonnay (CCR), Israeli Sauvignon Blanc (ISB), and Chilean Sauvignon Blanc (CSB). HPLC and FTIR fingerprinting revealed cultivar- and region-dependent differences in phenolic composition, with C
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proper forebrain development relies on precise spatial and temporal control of early neural stem cell (NSC) proliferation and later neurogenesis. Brain malformations can arise when these processes are defective. Joubert Syndrome (JS) is a neurodevelopmental disorder that is diagnosed by a mid-hindbrain malformation, but often includes forebrain defects such as microcephaly, which are less understood. One gene recently linked to Joubert Syndrome with microcephaly is Togaram1 , which encodes a TOG domain microtubule binding protein shown to affect primary cilia. In the embryonic dorsal forebrain
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N- and O-glycosylations are essential post-translational modifications involved in numerous physiological and pathological processes. Sulfated N- and O-glycans, commonly found on biologically important glycoproteins, serve as critical mediators of molecular recognition. However, their precise structure-function relationships remain poorly understood, primarily due to the limited accessibility of structurally well-defined glycans bearing branch-specific sulfation patterns. Herein, we report a versatile chemoenzymatic strategy that integrates chemical synthesis of editable glycan scaffolds with
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulator of calcineurin 1 (RCAN1) is an RNA-binding protein with diverse functions, the regulatory mechanisms underlying mitochondrial function in ischemic neuronal injury remain only partially understood. This study identified significantly elevated plasma RCAN1.1 levels in acute ischemic stroke (AIS) patients and demonstrated that mitochondrial translocation of RCAN1.1L within the ischemic penumbra aggravates cerebral infarction by promoting pathological mitochondrial fission and neuronal apoptosis. Mechanistically, in AIS cell and mouse models, multi-omics screening identified activati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Joint infections, including periprosthetic joint infection (PJI), remain difficult to diagnose because conventional markers such as C-reactive protein, erythrocyte sedimentation rate, white blood cell count, and procalcitonin may lack specificity, particularly after surgery or in inflammatory conditions. Heparin-binding protein (HBP), also known as azurocidin 1, is a neutrophil-derived mediator that is rapidly released during bacterial infection and may provide additional diagnostic value.
METHODS: A narrative review was conducted using major English- and Chinese-language database
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Necrotizing enterocolitis (NEC) is the most deadly gastrointestinal disease in preterm neonates, with up to 50% mortality. There is no cure for NEC. Enhancing our understanding of intestinal epithelial cell (IEC) responses to NEC will provide novel therapeutic targets. The RNA-binding protein insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 (IMP1) plays roles in intestinal development and repair. Notably, roles for IMP1 in NEC are unknown. Intestinal goblet cells produce protective mucus, and their function depends on the transcription factor SAM pointed domain containing ETS transcription
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Fatty acid-binding protein 4 (FABP4) has been reported to be involved in cerebral ischemia injury and neuropsychiatric disorders by modulating lipid metabolism and neuroinflammatory responses. But its effect on post-stroke depression (PSD) remains unclear. This study aimed to prospectively investigate the correlation between plasma FABP4 levels and PSD in a multicenter cohort study.
METHODS: This study included 611 ischemic stroke patients from the Chinese Acute Ischemic Stroke Antihypertensive Trial. The 24-item Hamilton Depression Rating Scale was used to assess depression at 3 mon
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives. Atherosclerosis contributes to higher mortality and morbidity in people with diabetes. Preventing future complications largely depends on the early detection of imminent atherosclerosis. This study aimed to explore the relationship between the subclinical atherosclerosis measured by carotid intima-media thickness (CIMT), ankle-brachial index (ABI), and circulating levels of adipocyte fatty acid-binding protein (AFABP) in individuals with type 2 diabetes mellitus (T2DM). Methods. A total of 80 participants evenly divided into two groups: 40 newly diagnosed patients with T2DM and 40
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fatty acid-binding proteins (FABPs) are intracellular lipid chaperones that regulate gene expression by controlling lipid trafficking within subcellular organelles. Among them, FABP4 is primarily expressed in adipocytes and macrophages and has been implicated in inflammatory responses in adipose tissue; however, its role in skin inflammation remains poorly understood. Here, we investigated the immunomodulatory role of FABP4 using human psoriatic skin samples, single-cell RNA sequencing, and an imiquimod-induced mouse model of psoriasis. We further employed pharmacologic inhibition and genetic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) are a major global health threat with limited treatment options. Aztreonam/avibactam is a promising therapy against metallo-β-lactamase (MBL)-producing and other CRE, but emerging resistance threatens its effectiveness. Insertions in penicillin-binding protein 3 (PBP3), which are well described in Escherichia coli, are linked to reduced aztreonam/avibactam susceptibility but remain poorly characterized in Klebsiella pneumoniae. We report clinical K. pneumoniae carbapenemase-producing K. pneumoniae sequence type 11 isolates carrying a novel PBP3 YRIT
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, a novel nanoparticle vaccine that can efficiently display the protective antigen TbpBY167A of Glaesserella parasuis was constructed using the self-assembly property of the capsid (Cap) protein of porcine circovirus type 3 (PCV3). Traditional subunit vaccines against Glässer's disease often suffer from insufficient immunogenicity and suboptimal protective efficacy. The vaccine developed in the present study efficiently elicits both humoral and cellular immune responses via multivalent antigen display, leading to substantially enhanced overall adaptive immunity. This work therefor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Celiac disease (CeD) is an autoimmune enteropathy triggered by gluten in genetically predisposed individuals, causing intestinal damage and impaired gut barrier integrity. Current diagnostic methods, such as serology and intestinal biopsy, are costly and invasive. Intestinal fatty acid binding protein (FABP2), exclusively expressed in the cytosol of mature enterocytes and released during injury, offers a potential non-invasive alternative biomarker. This study aimed to evaluate urinary FABP2 levels in pediatric patients undergoing gastrointestinal assessment or CeD follow-up to det
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica is a leading cause of gastroenteritis worldwide. Exacerbating this issue is the emergence of multi-drug-resistant strains, posing a major threat to human health. Type 5 secretion system proteins play a major role in virulence and are viable vaccine targets. However, only a limited number of these proteins have been functionally characterized to date. In this study, we characterized SeaB, which belongs to the Type 5a secretion system. We demonstrated that SeaB is localized to the cell surface and involved in binding to the extracellular matrix. Our results indicate that SeaB
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroinflammation, a key contributor to neurodegenerative diseases, results from excessive microglial activation. Microglia that respond to pathogenic molecules switch to the M1 type and secrete various immune cytokines, which can cause neuronal damage. Therefore, our study focused on molecules that can enhance the neuroprotective role of microglia and reduce neuronal damage. The adipocyte enhancer-binding protein 1 (AEBP1) gene is known for its role in regulating immune responses in macrophages. However, its role in neuroinflammation has not been fully explored. Therefore, we investigated the
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Olfactory impairment (OI) is an early symptom of neurodegenerative diseases (ND) and COVID-19 infection. Proteinopathies associated with ND include amyloid-β (Aβ), hyperphosphorylated τ (HPτ), α-synuclein (α-syn), and Tar DNA binding protein 43 (TDP43). It is unclear whether COVID-19 infection influences the listed proteinopathies in the olfactory bulb and tract (OB/OT) aggravating the OI.
OBJECTIVE: To study proteinopathies associated with ND in the brain and OB/OT in 32 subjects with COVID-19 infection and 10 age- and gender-matched controls.
METHODS: Postmortem brain tissue wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acyl-CoA binding protein (ACBP) exhibits the activity of autophagy and lipid metabolism regulation in mammals, but its indispensable role in appetite regulation has received great attention in recent years. However, its feeding regulation function in fish is unclear. In this study, we cloned the acbp gene of Siberian Sturgeon (Abacbp) which possesses high homology with those of other vertebrate species and extremely high expression in duodenum and hypothalamus. Interestingly, Abacbp mRNA was significantly increased by short-term fasting but decreased after long-term fasting and recovered after
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования