This study aims to identify pathogenic genes involved in diabetic nephropathy (DN) through multi-omics analysis of circadian rhythm disruptions to uncover targets for precision medicine. We conducted summary-data-based Mendelian Randomization (SMR) and colocalization analyses using multi-omics quantitative trait loci (QTL) data (methylation quantitative trait loci [mQTL] , expression quantitative trait loci [eQTL], protein quantitative trait loci [pQTL]) to explore genetic associations between circadian rhythm-related genes and DN. Genome-wide association study (GWAS) summary statistics were s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental toxicant exposures can induce widespread alterations in both the transcriptome and epigenome of mammals, and directly contribute to the increased risk of various diseases, including cardiovascular disorders, cancer, and neurological disorders. To evaluate how early-life toxicants produce long-term impacts on the transcriptome and epigenome in mice, the Toxicant Exposures and Responses by Genomic and Epigenomic Regulators of Transcription II (TaRGET II) Consortium generated a landmark resource comprising 3607 multi-omics datasets from longitudinal studies in mice. The molecular ch
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Irritable Bowel Syndrome (IBS) and Major Depressive Disorder (MDD) exhibit high comorbidity, driven by dysregulation of gut-brain axis interactions. Despite evidence of shared pathophysiology, the core molecular mechanisms and therapeutic targets remain elusive, largely due to clinical heterogeneity and fragmented research approaches.
METHODS: We established an integrated framework combining: (1) Bidirectional epidemiological analysis using the CHARLS cohort; (2) Multi-tissue transcriptomics (intestinal mucosa/prefrontal cortex) from GEO datasets using differential expression anal
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ecological viticulture with minimal intervention is increasingly emphasized for sustainable wine production, but its effects on grape microbial communities and wine flavor metabolism remain insufficiently understood. This study investigated vineyard soil/grape-associated microbiota and wine flavor metabolites under conventional management (CM) and extra-simplified eco-viticulture (ES) across 2023-2025 vintages. Results showed that ES positively influenced soil microbial diversity and grape epidermal bacterial diversity, while reducing epidermal fungal diversity relative to CM. Spontaneous ferm
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to characterize specific alterations in the salivary microbiome and metabolome associated with dental fluorosis (DF), using dental caries (DC) as a comparative pathology.
MATERIALS AND METHODS: A multi-omics analysis was performed on saliva samples from 99 individuals with DF, 100 with DC, and 100 healthy controls (HC). Lipidomic profiling and 16S rRNA gene sequencing were integrated, and the resulting datasets were analyzed using multivariate statistical approaches and correlation analyses.
RESULTS: Clear separation was observed in both the molecular and microbi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gut bacteria, metabolites and trace elements are involved in the whole process of the occurrence and development of colorectal cancer (CRC). The aim of this study was to explore the variety of gut microbes, metabolites and trace elements in the whole life cycle (from occurrence to metastasis to cachexia) of CRC. Stool samples from 302 volunteers (107 CRC, 69 adenoma dvanced, 126 controls) underwent DNA extraction and full-length 16S rDNA sequencing (PacBio Sequel II). Gut metabolites and trace elements were analysed by mass spectrometry to assess CRC-associated variations. The results found th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shoot flushing is a critical determinant of grafted seedling quality in Camellia oleifera, with key evaluation metrics including flushing timing, new shoot number and growth rate, and seedling height uniformity. To elucidate the molecular mechanisms governing shoot development, we conducted integrated analyses of endogenous hormones, metabolomics, and transcriptomics across three Camellia species (C. oleifera, C. meiocarpa, and C. weiningensis). Hormonal profiling revealed that shoot-flushing plants exhibited elevated levels of GA24, GA9, salicylic acid, IAA, IAAla, IPA, and abscisic acid comp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Sustainable swine production hinges on optimizing sow reproductive efficiency, yet mechanisms driving healthy litter size and weak piglet rates remain unclear. This study categorized sows into high (group H) and low (group L) healthy litter size groups based on median performance. Multi-omics analyses (16S rRNA sequencing, metagenomics, and serum metabolomics) revealed distinct fecal microbiota and metabolic profiles between groups. The results showed significant differences in microbiota composition between groups L and H. Group H exhibited a marked increase in Bacteroidetes abund
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Focal cortical dysplasia Type II (FCD II) is a major cause of drug-resistant epilepsy in children. Somatic mosaic variants affecting the PI3K-AKT-mTOR pathway are implicated in a substantial proportion of cases. The links between genotype, cellular pathology, epileptogenic networks, and clinical outcome remain incompletely defined.
METHODS: This review synthesizes evidence on somatic mTOR-pathway variants, lesion development, pathological cell populations, circuit mechanisms, single-cell and spatial multi-omics approaches in FCD II.
RESULTS: The developmental timing, lineage dist
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Flower color is a core ornamental trait in orchids (Orchidaceae), arising from the biosynthesis, accumulation, and spatial distribution of pigments under multilayered transcriptional regulation. Methods: We performed parallel RNA-seq transcriptomic and widely targeted metabolomic profiling of 15 samples representing five floral tissue/color categories from an F1 population of Cymbidium eburneum ('Duzhan Chun') × Cymbidium insigne ('Meihua Lan'). Results: Across four prespecified pairwise comparisons, 4891 non-redundant differentially expressed genes (DEGs) and 383 non-re
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To analyze the inhibitory effect of carbon ion (C-ion) radiation-induced biological effects on the proliferation of lung adenocarcinoma (LUAD) by multi-omics integration.
METHODS: We investigated C-ion radiation effects on LUAD cellular responses using A549 and LLC cell lines. Clonogenic survival assays, DNA damage, and metastasis quantified radiation sensitivity, while a multi-cell co-culture system (A549/Beas-2B/LLC/MLE-12) differentiated direct vs. bystander effects. Integrated transcriptomics and targeted metabolomics identified radiation-responsive genes/metabolites, with path
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Systemic lupus erythematosus (SLE) is a multiorgan disease with widespread immune dysregulation and significant unmet clinical need. Blood-based gene expression studies have advanced our understanding of SLE pathogenesis but may overlook critical tissue-specific mechanisms that drive disease heterogeneity and progression. We posited that integrated multidimensional profiling could reveal novel molecular patterns underlying distinct SLE pathologies.
METHODS: Here, we integrated immune cell, protein, and transcriptome data sets with disease activity and damage indices across 87 patie
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: Systemic lupus erythematosus is a complex autoimmune disease characterized by immune dysregulation and multisystem involvement. The primary cilium, a crucial cellular sensory organelle involved in immune signaling, has received limited attention in SLE. This study aims to characterize the expression patterns and potential regulatory features of primary cilium-related molecules in SLE and explore candidate compounds through integrated proteomic and phosphoproteomic analysis. Methods: Proteomic and phosphoproteomic data were obtained from peripheral blood mononuclear cells of 130 SLE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ischemic stroke (IS) is a leading cause of death and long-term disability worldwide, with a complex and multifactorial pathophysiology that is still incompletely understood. This study performed untargeted metabolomics and Olink proteomics on serum samples from IS patients and controls, and additionally analyzed single-nucleus RNA sequencing data from rat models of cerebral ischemia to explore cell-type-specific expression patterns. We identified 142 differentially expressed metabolites (FDR-corrected) and 24 proteins that were differentially expressed at nominal significance (P < 0.05). Using
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: During the scent secretion period, adult male muskrats (Ondatra zibethicus) produce a musk-like fragrance similar to that of the forest musk deers (Moschus berezovskii). However, the underlying mechanism of scent secretion in muskrats were not well understood. Scent glands and testicular tissues from 2-year-old muskrats during non-scenting and scenting periods were analyzed using transcriptomics and metabolomics to identify key genes, metabolites, and pathways involved in scent secretion.
RESULTS: Key findings include: (1) Significant differences were observed in the tissue struct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Secondary brain injury (SBI) following intracerebral hemorrhage (ICH) involves complex molecular events such as oxidative stress, inflammation, and immune cell infiltration. Understanding their spatiotemporal patterns is essential for identifying therapeutic targets and optimal intervention windows.
METHODS: We optimized an autologous blood-induced ICH mouse model and performed neuroimaging, behavioral testing, histological evaluation, and transcriptomic and proteomic analyses across multiple time points (Days 1, 3, 5, 8, and 12). Time-resolved analyses focused on dynamic changes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is characterized by persistent systemic inflammation. Candida colonization is frequently observed in patients with COPD, yet its systemic impact remains poorly understood. This study aimed to identify molecular alterations uniquely induced by Candida under COPD conditions.
METHODS: An interaction-based model incorporating COPD status, Candida colonization, and their interaction term was used to define COPD-context-dependent Candida-responsive genes and metabolites. Peripheral blood mononuclear cell transcriptomes were analyzed by RNA se
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The co-occurrence of liver cirrhosis (LC) and heart failure (HF) poses considerable clinical challenges, yet the cellular and molecular determinants of this comorbidity remain poorly characterized. To address this, we developed an integrative multi-omics pipeline encompassing GWAS meta-analysis, gsMap-based spatial transcriptomic projection, GeneEnrich functional annotation, single-cell atlas construction, seismicGWAS and ECLIPSER cell-type scoring, eCAVIAR and fastenloc colocalization, hdWGCNA network inference, scTenifoldKnk in silico gene perturbation, and GCTA-COJO fine-mapping. Quality-co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AB5 toxins are important virulence factors produced by Gram-negative bacteria and have been identified in many non-typhoidal Salmonella (NTS) serovars; however, their effects on host cell signaling and epithelial barrier function remain poorly understood. This study characterized the molecular and functional effects of purified ArtAB toxin and its binding subunit, ArtB, from multidrug-resistant Salmonella Typhimurium definitive type 104 (DT104). Equimolar concentrations of ArtAB (10 µg/mL) and ArtB (7.25 µg/mL) were evaluated in Chinese hamster ovary (CHO-K1) cells using cytotoxicity assays, q
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fungal balls (aspergillomas) are a debilitating complication of chronic pulmonary aspergillosis, but their functional biology as multi-kingdom ecosystems is poorly understood. Through integrated multi-omics analysis of 61 patient-derived fungal balls, we reveal their complex ecology. While Aspergillus fumigatus dominates the fungal niche (59% of patients), bacterial co-colonization is ubiquitous, primarily by Pseudomonas aeruginosa and Haemophilus influenzae. Metabolomics and metatranscriptomics unveil a structured division of labor and active warfare, including metabolic cross-feeding, compet
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования