The nanocomposites based on aminopropylsilanol (Si~NH2) and polylysine-anatase (Ans/PL) nanoparticles bearing DNAzymes (Dz) and oligodeoxyribonucleotides (ON) can effectively inhibit the replication of the influenza A/H5N1 virus in cell culture. Nanocomposites based on both types of nanoparticles exhibit high activity. The Dz-containing nanocomposites exhibited higher antiviral activity than those containing ON, reducing influenza A/H5N1 virus production by 3.5 log versus 2.4-3.0 log, respectively. Notably, the effect of Dz incorporated into the nanoparticles was an order of magnitude higher t…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatic fibrosis leading to cirrhosis remains a global health problem. The most common etiologies are alcoholism and viral infections. Liver … Earlier, we demonstrated efficient triplex formation between the exogenously added triplex-forming oligodeoxyribonucleotides (TFOs) and a specific sequence in the promoter region of the COL1A1 gene. In this study we used a rat model of liver fibrosis, induced by dimethylnitrosamine, to test whether these TFOs prevent liver fibrosis. Our results indicate that both the 25-m …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paracoccidioidomycosis (PCM) is caused by the dimorphic fungus Paracoccidioides brasiliensis. Immunostimulatory effects of P. brasiliensis DNA and CpG-oligodeoxyribonucleotides (CpG-ODN) have shown a Th2-Th1 immunomodulation of the isogenic murine model of susceptibility, which develops a progressive and disseminating disease. In this study, we investigated the optimum time interval and doses of CpG-ODN which are able to induce Th2-Th1 immunomodulation. The optimum concentrations for the induction of a decrease in antibody production were 0.5 and 1 microg. Mice immunized twice with CpG-ODN and…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pyrimidine(6-4)pyrimidone photoproduct, a major UV lesion formed between adjacent pyrimidine bases, is transformed to its Dewar valence isomer upon exposure to UVA/UVB light. We have synthesized a phosphoramidite building block of the Dewar photoproduct formed at the thymidylyl(3'-5')thymidine site and incorporated it into oligodeoxyribonucleotides. The diastereoisomers of the partially protected dinucleoside monophosphate bearing the (6-4) photoproduct, which were caused by the chirality of the phosphorus atom, were separated by reversed-phase chromatography, and the (6-4) photoproduct wa…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Raf proteins are key elements of growth-related cellular signaling pathways and are a component of cancer cell resistance to radiation therapy. Antisense oligonucleotides to c-raf-1 permit highly selective inhibition of the gene product and offer a strategy for sensitizing cancer cells to radiation therapy. In this dose escalation study, we evaluated the safety of combined liposomal formulation of raf antisense oligonucleotide (LErafAON) and radiation therapy in patients with advanced malignancies.
EXPERIMENTAL DESIGN: Patients with advanced solid tumors were treated with LErafAON in
Клиническое исследование I фазыСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cloning full length cDNAs is a difficult task especially if mRNAs are not abundant or if tissue is only available in limited amounts. Current strategies are based on in vitro amplification of cDNAs after adding a homopolymeric tail at the 3' end of the ss-cDNA. Since subsequent amplification steps yield unspecific amplified DNA mostly due to non-specific annealing of the reverse primer containing a homopolymeric tail, we have devised a new strategy based on the ligation of single-stranded oligodeoxyribonucleotide to the 3' end of single-stranded cDNAs. The efficiency of the strategy was assess
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the location of expression of mouse glandular kallikrein genes in the submandibular gland of adult male mice at the ultrastructural level by hybridization histochemistry, using 32P- and 3H-labeled oligodeoxyribonucleotide probes. Vibratome slices were hybridized, flat-embedded, sectioned, and autoradiographs prepared. The 32P-labeled probe, which was specific for a region common to all mouse glandular kallikrein mRNAs, provided resolution at the cellular and subcellular level, demonstrating mRNA transcripts encoded by the majority of the 12 mouse glandular kallikrein genes in t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conversion of cholesterol to pregnenolone is mediated by the cholesterol side-chain cleavage (SCC) enzyme, P450scc. Deficient SCC activity causes congenital lipoid adrenal hyperplasia (also known as 20,22 desmolase deficiency), a potentially lethal defect in the synthesis of all steroid hormones. To probe for possible genetic defects causing this disease we synthesized four oligodeoxyribonucleotides containing 63 to 72 bases corresponding to portions of the bovine complementary DNA (cDNA) sequence for P450scc. The bovine oligonucleotides were labeled and used directly to probe Southern blots o…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heptadecadeoxynucleotides containing 5-(N-aminoethyl- or N-aminohexyl)carbamoyl-2'-deoxyuridines (E or H) were synthesized using a newly developed postsynthetic modification method. As a convertible nucleoside unit, 5-methoxycarbonyl-2'-deoxyuridine (1) was initially incorporated into oligodeoxynucleotides (ODNs) according to the phosphoramidite method at various positions using a DNA synthesizer. Fully protected ODNs attached to a solid support were treated with alkyldiamines such as ethylenediamine and 1,6-hexanediamine to give the above modified ODNs. The thermal stability, resistance towar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Site-specifically modified oligonucleotides were obtained in milligram quantities by reacting racemic 3t,4r-dihydroxy-1,2t-epoxy-1,2,3,4-tetrahydrobenzo[c]phenanthrene (B[c]PhDE-2, or anti-B[c]PhDE) with the single deoxyadenosine (dA) residue in the oligodeoxynucleotide d(CTCTCACTTCC). Enzyme digestion of the covalently modified oligonucleotides with the exonuclease spleen phosphodiesterase yielded covalently linked B[ca]PhDE-N6-deoxyadenosyl monophosphate (dAMP) adducts. Comparisons of the reverse phase HPLC retention times and CD spectra of these B[c]PhDE-3'-dAMP mononucleotide adducts, with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Four fully base protected phosphodiester building blocks have been synthesised and fully characterised. The phosphate protecting group used was the 2-(1-methylimidazol-2-yl)phenyl group, enabling intramolecular catalysis of the condensation step in oligodeoxyribonucleotide synthesis by the solid phase phosphotriester method. Cycle times of about 12 min could thus be achieved. Moreover, the used of extra protecting groups on deoxythymidine and 2'-deoxyguanosine resulted in much cleaner oligodeoxyribonucleotides as evidenced by ion-exchange and reversed phase h.p.l.c.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Incorporation of positively charged C5-amino acid functionalized LNA uridines into oligodeoxyribonucleotides (ONs) results in extraordinary RNA affinity, binding specificity and stability towards 3'-exonucleases.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have designed and synthesized mixed backbone oligonucleotides (MBOs) containing 2'-5'-ribo- and 3'-5'-deoxyribonucleotide segments. Thermal melting studies of the phosphodiester MBOs (three 2'-5'linkages at each end) with the complementary 3'-5'-DNA and -RNA target strands suggest that 2'-5'-ribonucleoside incorporation into 3'-5'-oligodeoxyribonucleotides reduces binding to the target strands compared with an all 3'-5'-oligodeoxyribonucleotide of the same sequence and length. Increasing the number of 2'-5'linkages (from six to nine) further reduces binding to the DNA target strand more tha…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Effect of antisense oligodeoxyribonucleotides on in vitro translation of RNAs corresponding to fragments of the tick-borne encephalitis virus genome has been investigated. Sequences optimal for oligonucleotide binding and translation arrest have been identified. The most efficient oligonucleotide (17-mer) at a concentration of 2.5 microM completely arrests translation of the RNA coding for the NS3 protein.
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During in situ hybridisation on frozen and paraffin-embedded sections of bowel for IkappaB alpha, oligodeoxyribonucleotide probes were found to bind more avidly to eosinophils than target mRNA. This binding could not be obviated using strategies previously employed to block either binding of long DNA probes (200-mers) to eosinophils in bone marrow smears, or of riboprobes to eosinophils in sections of bowel, without removing specific hybridisation of probes. That this binding could arise through interaction of anionic oligodeoxyribonucleotides with eosinophil cationic protein, which has an unu…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A simple one-step technique for the analysis of nucleotide composition of oligodeoxyribonucleotides is described. The method is based on enzymatic hydrolysis and subsequent separation of hydrolysate on a "combined" column with Aminex A 28 anionite, on which top immobilyzed on DEAE cellulose snake venom phosphodiesterase is layed. The method is tested using a number of synthetic di- and tri-deoxyribonucleotides.
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have designed a new type of antisense oligodeoxyribonucleotide. These oligonucleotides are able to form hairpin loop structures at the 3'-ends. The stability to nuclease degradation was observed by incubation of these hairpin oligonucleotides with snake venom phosphodiesterase, DNA polymerase, and fetal bovine serum. Of particular interest is the hairpin antisense oligonucleotide containing 2'-methoxynucleosides with base-pairing in the stem region at the 3'-end, which has increased nuclease resistance.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To explore gene regulation by double stranded oligonucleotides as decoy molecules for transcriptional factors, oligodeoxyribonucleotides (ODN) and the complementary oligo(deoxyribonucleoside phosphorothioate)s (OPT) were photo-crosslinked by use of psoralen. UV melting curves showed that the thermal stability of crosslinked duplexes increased compared with that of non-crosslinked ones. CD spectra showed that the photo-crosslinked duplexes formed B-DNA structure. In addition, cross-linked duplexes were resistant against digestion by snake venom phosphodiesterase. These results suggest that the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A simple approach has been developed to prepare conjugates between oligodeoxyribonucleotides (ODNs) and linear copolymers of N-vinylpyrrolidone (NVP)/N-acryloxysuccinimide (NAS). These conjugates were of higher than expected molecular weight, as determined by light scattering. Side reactions between amino groups on heterocyclic bases, especially of cytosine, are proposed to explain the formation of aggregates. ODN-NVP/NAS conjugates used in both capture and detection steps in sandwich hybridization increased assay sensitivity. Sensitivity to 10(7) DNA molecules/mL was reached for a 2.3 kb PCR …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oligodeoxyribonucleotides incorporating non-hydrolyzable dialkyl sulfide linked thymidine dimers (TsT) were synthesized chemically by the solid-phase approach. The sulfide dimer TsT was stable to degradation by snake-venom phosphodiesterase, calf spleen phosphodiesterase, Nuclease P1 and Nuclease S1. Thermal denaturation analysis indicated that the incorporation of TsT dimers into DNA weakened, but did not prevent, binding to complementary DNA and RNA over a wide range of salt concentrations (10 mM to 2 M NaCl).
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования