The mapping of time-dependent densities on potentials in systems of identical quantum mechanical particles is examined. This mapping is of significance ever since Runge and Gross [Phys. Rev. Lett. 52, 997 (1984)] established its uniqueness, forming the theoretical basis for time-dependent density functional theory. Beyond uniqueness there are two important issues: existence, often called v-representability, and stability. We show that v-representability for localized densities in turn-on situations is not assured and we give a simple example of nonexistence. As for stability, we discuss an inv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how small molecule parameterization influences the outcomes of molecular dynamics (MD) simulations is crucial for accurately m … ne. We compared an analogy-based approach using CHARMM General Force Field (CGenFF ver. 4.0) with a quantum mechanics (QM)-based optimization protocol using Force Field Toolkit (ffTK). The results of in vitro experiments to assess changes in membrane dipole potential were compared with corresponding changes observed in MD simulations. Elastic properties of the memb …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We provide an extended account of the recent statistical mechanical theory of gauge invariance against operator shifting in quantum many-body systems [J. Müller and M. Schmidt, Phys. Rev. E 114, L022104 (2026)10.1103/dzz3-m28k]. The gauge transformation is enacted by a shifting superoperator that displaces the fundamental position and momentum degrees of freedom. The shifting superoperator constitutes a map between Hilbert space operators, and it features Lie algebra commutator structure. Averages of general observables remain invariant under the shifting both in and out of thermal equilibrium
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular mechanics methods can efficiently compute the macroscopic properties of a large molecular system but cannot represent the electron … tion of the whole system described at the molecular mechanical level, a strategy known as the mixed quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) approach. The accuracy of this embedding varies according to the types of interactions included, whether they are purely mechanical or classically electrostatic. This embedding can also introduce the induced polarization …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this communication, we report the development of a novel quantum mechanics-based scoring function to predict free energy of ligand binding in the zinc metalloenzymes carbonic anhydrase (CA) and carboxypeptidase A (CPA). In particular, the AM1 method is used in conjunction with solvation modeling to predict the relative binding affinities of 18 CA and 5 CPA inhibitors. The effect of metal-ligand charge transfer is also discussed and shown to be different in CPA and CA, providing a further challenge to computing metalloenzyme binding affinities.
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CO2 capture is an important process for mitigating CO2 emissions in the atmosphere. Recently, ionic liquids have been identified as possible … carbon dioxide capture in systems composed of L-arginine and glycerol using molecular dynamics and quantum mechanics simulations. Our findings indicate that, although both arginine and glycerol contain multiple atoms capable of acting as hydrogen bond donors and hydrogen bond acceptors, L-arginine primarily functions as the hydrogen bond acceptor while glycerol se …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this paper, we construct the metric tensor and volume for the manifold of purifications associated with an arbitrary reduced density operator ρS. We also define a quantum coarse-graining (CG) to study the volume where macrostates are the manifolds of purifications, which we call surfaces of ignorance (SOI), and microstates are the purifications of ρS. In this context, the volume functions as a multiplicity of the macrostates that quantifies the amount of information missing from ρS. Using examples where the SOI are generated using representations of SU(2), SO(3), and SO(N), we show two feat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study outlines the development of a series of quantitative mechanistic models enabling skin sensitization potency in the LLNA to be predicted for direct acting Michael acceptors. These models utilized several computational descriptors based on knowledge of the Michael addition reaction mechanism. The key descriptor was calculated using density functional theory and modeled the stability of the reaction intermediate. A second descriptor relating to the available surface area at the site of the reaction was also found to be important. Several poorly predicted compounds were identified, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present here a new approach to generalize supersymmetric quantum mechanics to treat multiparticle and multidimensional systems. We do this by introducing a vector superpotential in an orthogonal hyperspace. In the case of N distinguishable particles in three dimensions this results in a vector superpotential with 3N orthogonal components. The original scalar Schrödinger operator can be factored using a 3N-component gradient operator and introducing vector "charge" operators: Q(1) and Q(1)(dagger). Using these operators, we can write the original (scalar) Hamiltonian as H(1) = Q(1)(dagger) x…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mixed quantum states are the native description of many physically important quantum systems, making their generation a fundamental task in quantum information processing. However, constructing a diffusion process that generates density operators while keeping every reverse step physically valid remains nontrivial. This work introduces Quantum Generative Diffusion Model (QGDM), a fully quantum-mechanical model whose forward and backward processes are grounded in quantum channel theory. Through a non-unitary forward process, any target quantum state can be transformed into a completely mixed st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regio- and enantioselective hydroxylation of free fatty acids by human cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) plays an important role in metabolic regulation and has significant pathological implications. Despite extensive research, the detailed hydroxylation mechanism of CYP2E1 remains incompletely understood. To clarify the origins of regioselectivity and enantioselectivity observed for CYP2E1-mediated fatty acid hydroxylation, molecular dynamics (MD) simulations and quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) calculations were performed. MD simulations provided key insights into the proximity of ar…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) is mainly transmitted to humans by Aedes species mosquitoes and is associated with serious pathological disorders includin … that the substrate is in the active conformation for the cleavage reaction by ZIKV protease. Hybrid quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) umbrella sampling simulations (PM6/ff14SB) of acylation results reveal that proton transfer from S135 to H51 and nucleophilic attack on the substrate by S135 are concerted. The rate-limiting step involves the formation of …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A whole-exome capture and next-generation sequencing was applied to an 11 y/o patient with a clinical history of congenital hypotonia, gener … rgetic and stereochemical, (ii) the hydropathic indexes and polarity surfaces, and (iii) the hybrid Quantum Mechanics-Molecular Mechanics (QM-MM) analyses of the PURA molecular models demarcate, at the atomic resolution, the specific surrounding region affected by these mutations and pave the way for future cell-based functional analysis. To the best of our knowled …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We address gauge invariance in the statistical mechanics of quantum many-body systems. The gauge transformation acts on the position and momentum degrees of freedom, and it is represented by a quantum shifting superoperator that maps quantum observables onto each other. The shifting superoperator is anti-self-adjoint, and it has noncommutative Lie algebra structure. These properties induce exact equilibrium sum rules that connect locally resolved force and hyperforce densities for any given observable. We argue that the framework is amenable to tight integration into quantum hyperdensity funct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantum rate (QR) theory has previously shown that the charge-relaxation resistance of ferrocene redox monolayers is locked at Rq = h/2e2 ≈ 12.9 kΩ at room temperature, and that electron-transfer rates are accessible from equilibrium quantum capacitance without kinetic fitting. What has remained without a first-principles thermodynamic explanation is why a room-temperature ionic bath sustains rather than destroys quantum coherence. Here, we provide that mechanism. By applying the fluctuation-dissipation theorem to the grand canonical equilibrium of an electrochemical junction, we show that min
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chondroitin-6-sulfate (C6S) is a glycosaminoglycan (GAG) constituent in the extracellular matrix, which participates actively in crucial biological processes, as well as in various pathological conditions, such as atherosclerosis and cancer. Molecular interactions involving the C6S chain are therefore of considerable interest. A computational model for atomistic simulation was built. This work describes the design and validation of a force field for a C6S dodecasaccharide chain. The results of an extensive molecular dynamics simulation performed with the new force field provide a novel insight
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The excited state properties and deactivation pathways of two DNA methylation inhibitors, i.e., 5-azacytidine (5ACyd) and 2'-deoxy-5-azacytidine (5AdCyd) in aqueous solution, are comprehensively explored with the QM(CASPT2//CASSCF)/MM protocol. We systematically map the feasible decay mechanisms based on the obtained excited-state decay paths involving all the identified minimum-energy structures, conical intersections, and crossing points driving the different internal conversion (IC) and intersystem crossing (ISC) routes in and between the 1ππ*, 1nπ*, 3ππ*, 3nπ*, and S0 states. Unlike the 1n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования