Although most characterized tumor antigens are encoded by canonical transcripts (such as differentiation or tumor-testis antigens) or mutations (both driver and passenger mutations), recent results have shown that noncanonical transcripts including long noncoding RNAs and transposable elements (TEs) can also encode tumor-specific neo-antigens. Here, we investigate the presentation and immunogenicity of tumor antigens derived from noncanonical mRNA splicing events between coding exons and TEs. Comparing human non-small cell lung cancer (NSCLC) and diverse healthy tissues, we identified a subset…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pathogenic variants responsible for Birt-Hogg-Dubé syndrome (BHDS) in folliculin (FLCN) gene mostly consist of point mutations. Although large intragenic deletions/duplications have been reported in several case reports, the relationship between large intragenic deletions/duplications and phenotype in BHDS remains unclear.
METHODS: We retrospectively identified and reviewed patients with a large intragenic deletion spanning exons 1-3 and analyzed their phenotypic features to compare with those of point mutation carriers in our hospital from January 1, 2017 to August 31, 2022.
…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spinal muscular atrophy (SMA) is an inherited neuromuscular disease affecting 1 in 8,000 newborns. The majority of patients carr … omic rearrangement in the SMN region.
RESULTS: We identified an Alu-mediated deletion encompassing exons 2a-5 of SMN1 on the paternal allele and a complete deletion of SMN1 on the maternal allele as the cause of SMA in this patient.
CONCLUSION: Alu-mediated rearrangements in SMN1 can escape routine diagnostic testing. Parallel analysis of SMN gene dos …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe a patient with palatal abnormalities-cleft palate and bifid uvula; distinctive facial features-long and triangular face, large e … nes involved in connective tissue disorders revealed the presence of a novel homozygous deletion of exons 2-7 in TGFB3 gene. Heterozygous pathogenic mutations in TGFB3 have been associated with Loeys-Dietz syndrome 5 (LDS5) and Arrhythmogenic Right Ventricular Dysplasia type 1. Here, we report the first case of a homozygous TGFB3 variant associated with …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Physical symptoms of myoclonus dystonia due to epsilon-sarcoglycan mutations are well documented; however, the progression of neuropsychiatric and cognitive symptoms remains unclear. We present a case of a 34-year-old woman with early childhood onset of myoclonic jerks, dystonic posture and developmental delay due to exons 2 to 5 deletion in the epsilon-sarcoglycan gene. Over time, she developed neuropsychiatric symptoms. She underwent bilateral deep brain stimulation of the ventral intermediate nucleus of the thalamus for her motor symptoms, which greatly improved but she exhibited slow deter…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alport syndrome (AS), a hereditary type IV collagen nephropathy, is a major cause of end-stage renal disease in young people. About 85% of the cases are X-linked (ATS), due to mutations in the COL4A5 gene. Rarely, families have a contiguous gene deletion comprising at least exon 1 of COL4A5 and the first exons of COL4A6, associated with the development of diffuse leiomyomatosis (ATS-DL). We report three novel deletions identified in families with AS, one of which challenges the current concepts on genotype-phenotype correlations of ATS/ATS-DL.
METHODS: In the setting of a multicen…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The polymorphic MICA (major histocompatibility complex class I chain-related gene A) (Gene ID: 100507436) gene products are a ligand of the activating natural killer cell receptor, NKG2D. Their clinical importance spans from solid organ transplantation to bone marrow transplantation and disease susceptibility. Typing of MICA genes by sequencing is hampered by an exon 5 short tandem repeat, the definition of which is critical for the final allelic and functional assignment. We present a novel sequencing approach, which uses group-specific (7T/8T) exon 5 polymerase chain reactions (PCRs) and fac
Оценочное исследованиеСтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibrillin is an important structural protein of the extracellular matrix. It is a large cysteine-rich glycoprotein with extensive intrachain … We demonstrate here that fibrillin molecules bind calcium. In addition, three alternatively spliced exons at the 5' end are described. Analysis of 5.8 kb of surrounding genomic sequence revealed a 1.8-kb CpG island spanning the alternatively spliced exons and the next downstream exon. Since FBN1 is the gene responsible for Marfan syndrome, the informati …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntingtin exon-1 (HTTex1) aggregation at cellular membranes contributes to the propagation of toxic protein assemblies in Huntington's disease. We explore the thermodynamic and structural mechanisms linking membrane binding, curvature sensing, and nucleation of the aggregates. Here, we use the OpenAWSEM coarse-grained force field code with an effective membrane potential to quantify the folding and surface aggregation behavior of three HTTex1 constructs on both flat lipid bilayers and spherical vesicles. The computed free energy profiles reveal a strong α-helical NT17-mediated affinity (ΔGbin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sunvozertinib received accelerated approval for use in later lines of therapy for patients with advanced non-small-cell lung cancer (NSCLC) with epidermal growth factor receptor (EGFR) exon 20 insertion mutations. Data are needed on the efficacy and safety of sunvozertinib as a first-line treatment for NSCLC.
METHODS: In this phase 3, international trial, we randomly assigned, in a 1:1 ratio, patients with advanced nonsquamous NSCLC with EGFR exon 20 insertions to receive sunvozertinib or chemotherapy (carboplatin-pemetrexed). The primary end point was progression-free survival as
СтатьяРандомизированное исследованиеКлиническое исследование III фазыМногоцентровое исследованиеСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoparathyroidism is a rare endocrine condition characterized by insufficient secretion of parathyroid hormone (PTH), resulting in abnormally low calcium levels (hypocalcemia) and elevated phosphate levels (hyperphosphatemia) in the blood. This report describes a man in his late 30s with a chronic skin condition marked by dryness and desquamation. He occasionally experienced mild perioral numbness. Over the past year, he developed recurrent neuromuscular irritability, including worsening perioral numbness, tingling or numbness in the hands and feet, and muscle spasms consistent with tetany. H
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patient-derived disease-specific induced pluripotent stem cells (iPSCs) have opened the door to recreating pathological conditions in vitro using differentiation into diseased cells corresponding to each target tissue. To investigate muscular diseases, we have established a myogenic differentiation protocol mediated by inducible MYOD1 expression that drives human iPSCs into myocytes. This highly reproducible differentiation protocol yields a homogenous skeletal muscle cell population, reaching efficiencies as high as 90%. Such high efficiency enables us to evaluate the efficacy of exon skippin
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Donohue syndrome (DS) is a rare autosomal recessive disorder caused by homozygous or compound heterozygous mutations in insulin receptor (INSR), leading to severe insulin resistance. It is characterized by extreme hyperinsulinemia, fasting hypoglycemia, postprandial hyperglycemia, severe growth restriction, and dysmorphic features, with a high mortality rate in the first year due to metabolic instability and infections. We report the case of a 3-month-old Honduran girl with a homozygous exon 14 deletion in INSR who presented with severe insulin resistance, metabolic dysregulation, and dysmorph
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in the OCA2 gene result in oculocutaneous albinism. In humans and several other mammalian species, OCA2 is transcribed into two coding mRNAs, a major transcript that encodes the full-length protein and a minor transcript that skips in-frame exon 10 and has no identified function. By contrast, rodents and non-mammalian vertebrates only express the major transcript. Several rare variants of human OCA2 have been reported to be pathogenic due to increased exon 10 skipping. To understand the vulnerability of human OCA2 to exon 10 skipping and its impact on pigmentation, we first
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Solid pseudopapillary neoplasm (SPN) of the pancreas demonstrates an indolent disease course; however, some patients present with a "malignant" phenotype, including distant metastases resistant to chemotherapy. This analysis identifies molecular drivers of metastatic SPN using the world's largest clinicogenomics database.
METHODS: The American Association for Cancer Research Project Genomics Evidence Neoplasia Information Exchange was queried for primary and metastatic SPN samples. Sample-level genomic alterations were compared. A pan-pancreatic cancer analysis asse
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Enamelin is the largest enamel matrix protein encoded by the ENAM gene. The primary purpose of this study was to identify genetic variants in ENAM exon 10 that can alter susceptibility to early childhood caries (ECC).
METHODS: This case-control study included 248 children aged 3-6 years, with 124 children diagnosed with ECC in the case group and 124 children without caries in the control group. Questionnaires were used to record demographic data, socioeconomic status, hygienic practices, and feeding practices, and a 24-h diet diary was kept. Seven polymorphisms (rs7671281, rs173866
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aggregation, mislocalization, and phosphorylation of TDP-43 are pathologic hallmarks of several neurodegenerative diseases and provide a defining criterion for the neuropathologic diagnosis of Limbic-predominant Age-related TDP-43 Encephalopathy (LATE). LATE neuropathologic changes (LATE-NC) are often comorbid with other neurodegenerative pathologies including Alzheimer's disease neuropathologic changes (ADNC). We examined whether TDP-43 regulated cryptic exons accumulate in the hippocampus of neuropathologically confirmed LATE-NC cases. We found that several cryptic RNAs are robustly expr…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования