PURPOSE: Clinicians and researchers must contextualize a patient's genetic variants against population-based references with detailed phenotyping. We sought to establish globally scalable technology, policy, and procedures for sharing biosamples and associated genomic and phenotypic data on broadly consented cohorts, across sites of care.
METHODS: Three of the nation's leading children's hospitals launched the Genomic Research and Innovation Network (GRIN), with federated information technology infrastructure, harmonized biobanking protocols, and material transfer agreements. Pilot studies in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parental concerns over the safety or necessity of childhood vaccination have increased over the past decades. At the same time, there has been a proliferation of vaccine-related information available through a range of health information sources. This study investigates the associations between evaluations of health information sources, parental perceptions of childhood vaccination benefits, and the maintenance of vaccination schedules for their children. Specifically, this study aims to (a) incorporate social media into the battery of health information sources and (b) differentiate household
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In the past, many data collection systems were in operation for different HIV/AIDS projects in China. We describe the creation of a unified, web-based national HIV/AIDS information system designed to streamline data collection and facilitate data use.
METHODS: Integration of separate HIV/AIDS data systems was carried out in three phases. Phase 1, from January 2006 to December 2007, involved creating a set of unified data collection forms that took into account existing program needs and the reporting requirements of various international organizations. Phase 2, from January to Oct
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to assess the cognitive functions of patients with spinocerebellar ataxia type 3(SCA3). We examined 15 patients with genetically confirmed SCA3 and 15 healthy control subjects matched for age, years of education, and intellectual ability. We administered verbal memory (word recall and word recognition) and executive function tasks (word fluency test, forward and backward digit and visual span tests, Kana Pick-out Test, Trail Making Test, and conflicting instructions and a Go/NoGo task from the Frontal Assessment Battery). We found that patients with SCA3 had significa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Accurate clinical coding is fundamental to large-scale epidemiological studies, hospital billing, and the development of robust clinical decision support systems. Conventional methods for structured data extraction often rely on manual curation, which is prohibitively labor-intensive. Goal of this project is to determine whether current state-of-the-art open-weight LLM models are suitable for extraction of structured data from non-English (German) clinical notes.
METHODS: We anonymized 35 German doctor's notes of five patients from our hospital and developed one pipeline to extr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference2025eng
Large multimodal models are now extensively used worldwide, with the most powerful ones trained on massive, general-purpose datasets. Despite their rapid deployment, concerns persist regarding the quality and domain relevance of the training data, especially in radiology, medical research, and neuroscience. Additionally, healthcare data privacy is paramount when querying models trained on medical data, as is transparency regarding service hosting and data storage. So far, most deep learning algorithms in radiologic research are designed to perform a specific task (e.g., diagnostic classificati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Radiology reports contain valuable information for research and audits, but relevant details are often buried within free-text fields. This makes them challenging and time-consuming to extract for secondary analyses, including training artificial intelligence (AI) models.
MATERIALS AND METHODS: This study presents a rule-based RAdiology Data EXtraction tool (RADEX) to enable biomedical researchers and healthcare professionals to automate information extraction from clinical documents. RADEX simplifies the translation of domain expertise into regular-expression models, enabling con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To quantify levels of coexisting obesity and caries experience in children in Scotland, and any associated socioeconomic inequalities over the years 2011/2012-2017/2018.
DESIGN: A multicohort population-wide data linkage study.
SETTING: Local authority primary schools in Scotland.
PATIENTS: 335 361 primary 1 (approximately 5 years old) schoolchildren in Scotland between 2011/2012 and 2017/2018.
MAIN OUTCOME MEASURES: Prevalence and inequalities in coexisting caries and obesity.
RESULTS: The prevalence of coexisting obesity and caries experience was 3.4% (n=11 494 of 335 361) a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To compare parent/carer proxy-reported dental caries experience of their 5-year-old child with epidemiological survey clinician examination of caries experience in the same children. To determine any differences in the accuracy by area-based socioeconomic group.
METHODS: A cross-sectional data linkage study linked data from the Growing Up in Scotland (GUS) study and the National Dental Inspection Programme (NDIP) school epidemiology survey. Parent/carer proxy-reported caries experience was compared with clinician-measured caries experience on n=3008 children, and data were stratif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: International studies have shown shifting demographic data and rising hospitalizations for alcohol-related cirrhosis (ARC), with a paucity of data from Australia. We examined hospitalizations, mortality and demographic data for people admitted with ARC over the last decade in Queensland, Australia.
STUDY DESIGN: Data linkage study.
METHODS: A retrospective analysis of adults hospitalized with ARC during 2008-2019 was performed using state-wide admissions data. International Classification of Diseases, 10th revision, codes identified admissions with the principal diagnosis of ARC
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lack of stable, affordable housing is an important social determinant of health. Federal housing assistance may buffer against housing vulnerabilities among low-income households, but research examining the association of housing assistance and cancer care has been limited. We introduce a new linkage of Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) program-Medicare and US Department of Housing and Urban Development (HUD) administrative data.
METHODS: Individuals enrolled in HUD public and assisted housing programs between 2006 and 2021 were linked with cancer diagnoses betwee
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Risk-taking behaviours are a major contributor to youth morbidity and mortality. Vulnerability to these negative outcomes is constructed from individual behaviour including risk-taking, and from social context, ecological determinants, early life experience, developmental capacity and mental health, contributing to a state of higher risk. However, although risk-taking is part of normal adolescent development, there is no systematic way to distinguish young people with a high probability of serious adverse outcomes, hindering the capacity to screen and intervene. This study aims to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prospective malaria public health interventions are initially tested for entomological impact using standardised experimental hut trials. In some cases, data are collated as aggregated counts of potential outcomes from mosquito feeding attempts given the presence of an insecticidal intervention. Comprehensive data i.e. full breakdowns of probable outcomes of mosquito feeding attempts, are more rarely available. Bayesian evidence synthesis is a framework that explicitly combines data sources to enable the joint estimation of parameters and their uncertainties. The aggregated and com
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
People living with HIV (PLHIV) are a priority population to receive hepatitis C virus (HCV) screening and treatment. We aimed to characterize the HCV care cascade among PLHIV between 2010 and 2018 and to compare HCV testing and treatment uptake pre- and post-availability of direct-acting antivirals (DAAs) in New South Wales (NSW), Australia. Records of all HCV notifications (1993-2017) were linked to HIV notifications, deaths, hospitalizations, incarcerations, opioid agonist therapy, HCV RNA testing and treatment databases. Numbers and proportions were calculated for all stages of the care cas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Although chronic HCV infection increases mortality, thousands of patients remain diagnosed-but-untreated (DBU). We aimed to (1) develop a DBU phenotyping algorithm, (2) use it to facilitate case finding and linkage to care, and (3) identify barriers to successful treatment.
APPROACH AND RESULTS: We developed a phenotyping algorithm using Java and SQL and applied it to ~2.5 million EPIC electronic medical records (EMRs; data entered January 2003 to December 2017). Approximately 72,000 EMRs contained an HCV International Classification of Diseases code and/or diagnostic tes
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is increasing interest in developing prediction models capable of identifying rare disease patients in population-scale databases such as electronic health records (EHRs). Deriving these models is challenging for many reasons, perhaps the most important being the limited number of patients with 'gold standard' confirmed diagnoses from which to learn. This paper presents a novel cascade learning methodology which induces accurate prediction models from noisy 'silver standard' labeled data - patients provisionally labeled as positive for the target disease based upon unconfirmed evidence.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Traumatic spinal cord injuries have significant consequences both for the injured individual and the healthcare system, usually resulting in lifelong disability. Evidence has shown that timely medical and surgical interventions can lead to better patient outcomes with implicit cost savings. Potentially preventable secondary complications are therefore indicators of the effectiveness of acute care following traumatic injury. The extent to which policy and clinical variation within the healthcare service impact on outcomes and acute care costs for patients with traumatic spinal cor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In collaboration with the health ministries that we serve and other partners, we set out to complete the multiple-country Global Trachoma Mapping Project. To maximize the accuracy and reliability of its outputs, we needed in-built, practical mechanisms for quality assurance and quality control. This article describes how those mechanisms were created and deployed. Using expert opinion, computer simulation, working groups, field trials, progressively accumulated in-project experience, and external evaluations, we developed 1) criteria for where and where not to undertake population-based preval
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adoption and use of Electronic Medical Records (EMRs) is continuing to rise across Canada, leading to more data being generated. These data, however, are not being captured in a standardized manner, they are not available for research, surveillance or health system management, and they are not having a real-time impact on healthcare providers at the point of care. Multiple stakeholders, including researchers and system evaluators, require easy access to high quality, structured data. As current EMRs are not able to effectively meet their needs, we engaged multiple stakeholders to assist in des
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: There is an increasing demand to assemble and align large-scale biological sequence data sets. The commonly used multiple sequence alignment programs are still limited in their ability to handle very large amounts of sequences because the system lacks a scalable high-performance computing (HPC) environment with a greatly extended data storage capacity.
RESULTS: We designed ClustalXeed, a software system for multiple sequence alignment with incremental improvements over previous versions of the ClustalX and ClustalW-MPI software. The primary advantage of ClustalXeed over other mult
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.