The cashmere fibers produced by the secondary hair follicles of cashmere goats are precious textile raw materials. The secondary hair follic … The DEGs were predominantly involved in biological processes such as regulation of transcription by RNA polymerase II, proteolysis, and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Significantly enriched cellular components included the plasma membrane, membrane, and extracellular space, and molecular functions were mainly related to protein binding, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Cyclin-dependent kinases (CDK) dynamically regulate RNA Polymerase (Pol) II during each stage of transcription. Phosphorylation of RNA Pol II and associated transcription factors by CDKs enables stage-specific exchange of factors. CDK9 and a cyclin partner (CYCT1, T2 or K) comprise the Positive Transcription Elongation Factor-b (P-TEFb) complex, which is responsible for releasing RNA Pol II from promoter proximal pausing into processive elongation. P-TEFb activity is stimulated by bromodomain-containing Protein 4 (BRD4); however, the structural basis for BRD4 association with P-TEF
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptions of nascent HIV-1 RNA from the integrated proviral DNA, and HBV RNAs from a stably formed minichromosome of cccDNA, are carried out by cellular RNA polymerase II, and strongly regulated by viral transactivation proteins Tat and HBx, respectively. Both Tat and HBx are intrinsically disordered proteins with promiscuous gene transactivation activities and regulate HIV-1 and HBV transcription by multiple, but similar mechanisms. The antiviral therapies of HIV-1 and HBV effectively suppress viral replication and enable the infection into latent states. The viral life cycles of HIV-1 a…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Diabetes mellitus is often associated with cardiovascular complications, which is the leading cause of morbidity and mortality am … on quantitive polymerase chain reaction analysis of Ago2 (argonaute RISC catalytic component 2) and RNA polymerase II in response to miR-320 induction, we identified CD36 (fatty acid translocase) as a key target gene for this miRNA and showed that the induced expression of CD36 is responsible for increased fatty acid uptake, thereby causing lipotoxicity in the hear …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Adeno-associated virus (AAV) has long been known to inhibit helper adenovirus (Ad) replication independently of AAV Rep protein … n intrans, like small polypeptides or microRNAs. Our data point to an inhibitory mechanism in which RNA polymerase II (Pol II) pauses directly downstream of the p40 promoter, leading to interference of the stalled Pol II transcription complex with the adenoviral replication machinery. Whereas inhibition by RIS-Ad is mediated exclusively incis, it can be overcome by …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic cellular mRNA is believed to be synthesized exclusively by RNA polymerase II (pol II), whereas pol I produces long rRNAs and pol III produces 5S rRNA, tRNA, and other small RNAs. To determine whether this functional differentiation is obligatory, we examined the translational potential of an artificial pol III transcript. The coding region of the human immunodeficiency virus type 1 tat gene was placed under the control of a strong pol III promoter from the adenovirus type 2 VA RNAI gene. The resultant chimera, pVA-Tat, was transcribed accurately in vivo and in vitro and gave rise to…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
R-loops are three-stranded nucleic acid structures consisting of an RNA:DNA hybrid and a displaced single-stranded DNA, typically formed dur … ed degradation of RNA:DNA hybrids. Moreover, FUS depletion reduces RNase H1 proximity to elongating RNA polymerase II, suggesting altered engagement of RNase H1 with the transcription machinery. These findings highlight a crucial role for FUS-RNase H1 axis in regulating R-loop levels, providing insights into the potential mechanisms underlying R-loop-associated pat …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coordinated RNA and protein synthesis is fundamental to cell function and survival. Here, we show that TANGO6, a nucleocytoplasmic RNA binding protein, is an integral component of the proteostasis control axis, regulating both transcription and translation. In the nucleus, TANGO6 is recruited to gene promoters alongside RNA polymerase II, where it controls the transcriptional activation of essential genes, including those required for G1-S cell cycle progression and cell differentiation. Cytoplasmic TANGO6 associates with polysomes to promote protein synthesis. Under stress conditions, the org…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immune-mediated necrotizing myopathy (IMNM) is an autoimmune myopathy characterized by severe proximal weakness and muscle fiber necrosis, yet its pathogenesis remains unclear. So far, there are few bioinformatics studies on underlying pathogenic genes and infiltrating immune cell profiles of IMNM. Therefore, we aimed to characterize differentially expressed genes (DEGs) and infiltrating cells in IMNM muscle biopsy specimens, which may be useful for elucidating the pathogenesis of IMNM.
METHODS: Three datasets (GSE39454, GSE48280 and GSE128470) of gene expression profiling related
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNA (lncRNA) SNHG16 has been reported to be significant regulators in multiple cancers. However, never has the relationship between it and cardiac hypertrophy been studied until now. In this study, angiotensin II (Ang II)-treated cardiomyocytes isolated from neonatal mice were used as a model of cardiac hypertrophy in vitro. Real-time quantitative polymerase chain reaction was performed to measure the expression of SNHG16, miR-182-5p, and insulin-like growth factor 1 (IGF1). The relationship between SNHG16 and its downstream genes were corroborated by RNA pull-down and lucifera
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aspergillus fumigatus is the main etiological agent of aspergillosis. The antifungal drug caspofungin (CSP) can be used against A. fumigatus, and CSP tolerance is observed. We have previously shown that the transcription factor FhdA is important for mitochondrial activity. Here, we show that FhdA regulates genes transcribed by RNA polymerase II and III. FhdA influences the expression of tRNAs that are important for mitochondrial function upon CSP. Our results show a completely novel mechanism that is impacted by CSP.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most cervical cancers are caused by human papillomavirus (HPV) infection. In HeLa cells, the HPV18 viral genome is integrated at chromosome … bed HPV18 RNAs form a liquid-like condensate at chromosome 8q24.21 locus, which in turn accumulates RNA polymerase II. Moreover, we focused on a relatively uncharacterized transcript from the upstream region of CCAT1, named URC. The URC RNA is transcribed as a chimera RNA with HPV18 and is composed of the 3'-untranslated region of the HPV18 transcript. We experimen …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular stresses regulate transcriptional readthrough, whereby RNA polymerase II elongates past a gene's polyadenylation cleavage site without RNA cleavage. Readthrough has been reported in several cancer types. Here, we use long-read sequencing of nascent RNA to quantify transcriptional readthrough in chronic myeloid leukemia (CML) cells and characterize early responses to the targeted therapeutic, imatinib. We show that the amount, length, and gene specificity of readthrough increase within 1 hour, before gene expression and alternative splicing alterations emerge. Notably, imatinib-depende…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene expression is determined by the right region and at the right time to shape a cellular function. To understand the landscape of gene expression, large-scale transcriptomic analyses for transcription start sites (where to start) have been employed. However, transcription termination sites (where to stop) and the regulatory mechanisms involved remain largely unclear. Recent studies with state-of-the-art technologies have revealed that RNA polymerase II (Pol II) termination sites are not exact gene ends, but rather within broad downstream-of-gene (DoG) regions. Restriction of DoG transcripti…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription is spatially organized in the nucleus, concentrating transcription factors, coactivators, and RNA polymerase II into dynamic, membraneless compartments. Such assemblies have been described in many ways, from small complexes of defined stoichiometry to membraneless biomolecular condensates. We argue that these are not competing descriptions but positions along a single continuum, and propose "transcriptional compartment" as an umbrella term for it. We then turn to the functional literature and ask what these compartments have been shown to do, and what they have not. The clearest …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interstrand crosslinks (ICLs) block transcription by mechanisms that remain incompletely understood. Cisplatin induces ICLs that suppress transcription and contribute to its antitumor activity but these effects can be mitigated by transcription-coupled repair. Using reconstituted transcription systems and cryo-electron microscopy, we investigated how RNA polymerase II (Pol II) processes cisplatin-ICLs and captured eight sequential transcriptional states. Pol II unexpectedly remodels the crosslinked guanines into a novel conformation positioned above the bridge helix. This rearranged ICL preven…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Powassan virus, a North American tick-borne flavivirus, can cause severe neuroinvasive disease in humans. While Ixodes scapularis are the primary vectors of Powassan virus lineage II (POWV II), also known as deer tick virus, recent laboratory vector competence studies showed that other genera of ticks can horizontally and vertically transmit POWV II. One such tick is the Haemaphysalis longicornis, an invasive species from East Asia that recently established populations in the eastern USA and already shares overlapping geographic range with native vector species such as I. scapulari
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequence analysis of the Zaire ebolavirus (EBOV) polymerase (L gene) mRNA, using online tools, identified a highly ranked -1 programmed ribosomal frameshift (FS) signal including an ideal slippery sequence heptamer (UUUAAAA), with an overlapping coding region featuring two tandem UGA codons, immediately followed by an RNA region that is the inverse complement (antisense) to a region of the mRNA of the selenoprotein iodothyronine deiodinase II (DIO2). This antisense interaction was confirmed in vitro via electrophoretic gel shift assay, using cDNAs at the EBOV and DIO2 segments. The formation o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In eukaryotic cells, transcription and replication each occur on DNA templates that are incorporated into nucleosomes. Formation of chromati … his chapter describes the factor known variously as FACT in humans, where it promotes elongation of RNA polymerase II on nucleosomal templates in vitro (Orphanides et al. 1998, 1999), DUF in frogs, where it is needed for DNA replication in oocyte extracts (Okuhara et al. 1999), and CP or SPN in yeast, where it is linked in vivo to both transcription and replication …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования