Prostate cancer is one of the leading causes of cancer-related morbidity and mortality among men worldwide and is characterized by substantial molecular heterogeneity and the development of therapeutic resistance. Recent advances in genome-editing technologies, particularly CRISPR-Cas systems, have expanded opportunities for precise investigation and modification of genetic and epigenetic determinants involved in prostate cancer progression. This review comprehensively describes the evolution of CRISPR-based genome-editing tools, including Cas9 nucleases, base editing, prime editing, and CRISP
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the advent of spatial multi-omics, mosaic integration of diverse datasets with partially overlapping modalities enables the construction of comprehensive multimodal spatial atlases from heterogeneous sources. Here we present SpaMosaic, a tool that uses contrastive learning and graph neural networks to build a modality-agnostic, batch-corrected latent space for spatial domain identification and missing-modality imputation. We systematically benchmarked SpaMosaic against existing integration methods using simulated data and experimentally acquired datasets spanning RNA and protein abundance
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitiligo is a chronic acquired depigmenting disorder characterized by progressive loss of functional melanocytes and is commonly associated with other autoimmune diseases. Although genome-wide association studies have identified multiple susceptibility loci, incomplete concordance among monozygotic twins and variable onset indicate strong contributions from environmental triggers and gene-environment interactions. A convergent pathogenic sequence is emerging: oxidative stress and defective cytoprotective responses render melanocytes vulnerable, promote release of danger signals, and activate i
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Differences in immune responses and infectious disease have been described in children exposed to human immunodeficiency virus (HIV) but uninfected (CHEU), compared with children unexposed to HIV (CHU). We hypothesized that maternal HIV exposure modifies the transcriptome and epigenome of innate immune cells in CHEU that may contribute to dysregulation of antimicrobial immune responses.
METHODS: Monocytes and natural killer (NK) cells were evaluated in peripheral blood mononuclear cells from CHEU and CHU in Kenya at 6-10 weeks and 12 months of age. Monocyte and NK cell subsets wer
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer arises from extensive genetic and epigenetic alterations that reshape chromatin, transcriptional regulation, and malignant cell states. To systematically chart cancer-intrinsic regulatory programs, we constructed a pan-cancer single-cell transcriptomic and epigenomic atlas encompassing 60 human cell lines representing 16 tissue origins and 20 cancer types, comprising 240,957 single-nucleus RNA-seq and 223,347 single-nucleus ATAC-seq profiles. Integrative analyses revealed extensive pan-cancer cell-state heterogeneity, core gene-regulatory networks, and a conserved epithelial-mesenchymal
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allergen and nanoparticle exposure generate reactive oxygen species (ROS) that endanger genome integrity, yet airway epithelial cells survive repeated exposures. Here we show that environmental allergens from Alternaria alternata and polyethyleneimine (PEI) nanoparticles induce oxidative stress, triggering the rapid release of double-stranded DNA fragments enriched for repetitive elements (SINEs, LINEs, and LTRs), centromeric sequences, and late-replicating, origin-poor fragile site-containing genes. Nanopore sequencing, along with a multiomics approach, was used to analyze fragments of extrac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Class switch recombination (CSR) is a fundamental mechanism of humoral immunity that enables activated B lymphocytes to switch from the expression of IgM to other immunoglobulin isotypes, such as IgG, IgA, or IgE, thereby changing the effector functions while preserving antigen specificity. Traditionally, CSR has been considered a late event in B-cell differentiation, occurring predominantly in germinal centers following antigen encounter and activation-induced cytidine deaminase (AID) expression. In this classical model, B-cell development in the bone marrow is largely separated from antigen-
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary liver cancer is a major global cause of cancer death, and hepatocellular carcinoma (HCC) is the predominant histological subtype. This literature review synthesizes current evidence on the exposome, multi-omics landscape, and artificial intelligence (AI)-based integration strategies relevant to biomarker discovery in liver cancer, with a focus on biological rationale, emerging clinical applications, and translational limitations. Key etiologic drivers include viral hepatitis, alcohol-related liver disease, and metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease, all of which inter
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is a heterogeneous disease shaped by genetic and epigenetic alterations. Approximately 20% of CRCs exhibit widespread CpG island hypermethylation, termed the CpG Island Methylator Phenotype (CIMP), frequently accompanied by MLH1 promoter hypermethylation, deficient mismatch repair (dMMR) and microsatellite instability (MSI). However, methylation patterns associated with MSI, independent of CIMP and MLH1 silencing, and the influence of anatomical location and patient age on the CRC methylome remain incompletely defined. We performed epigenome-wide DNA methylation profili
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Colorectal cancer (CRC) remains a leading cause of cancer-related morbidity and mortality worldwide. Although immunotherapy has improved outcomes for a subset of patients, its limited efficacy in many cases highlights the need for a more comprehensive understanding of the CRC immune microenvironment. This study aimed to characterize the molecular landscape of the CRC immune microenvironment using an integrated multi-omics approach and to identify candidate regulatory molecules associated with immune remodelling.
MATERIALS AND METHODS: We integrated structural variation, DNA me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation serves as an essential epigenetic mechanism for the regulation of gene expression. One of the earliest and most common changes seen in cancer is abnormal DNA methylation at CpG sites, which may encourage tumor development by silencing tumor suppressor gene transcription. The DNMT1 inhibitor AZA can delay cancer progression by inhibiting DNA methylation and enhancing tumor immunogenicity, yet its clinical efficacy in gastric cancer is limited by poor specificity, instability, and low retention. To address this, we developed a light-triggered engineered microbe, AM@Ec, utilizing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In utero exposure to per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) presents significant health concerns, primarily through their role in inducing epigenetic modifications that have lasting consequences. This review aims to elucidate the impact of prenatal PFAS exposure on epigenetic mechanisms, including DNA methylation, histone modification, and non-coding RNA regulation, focusing on developmental and long-term health outcomes. The review synthesizes findings from various studies that link PFAS exposure to alterations in DNA methylation in fetal tissues, such as changes in the methylation of gen
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The human placenta plays an important role in pregnancy and offspring health. The paternal genome contributes significantly to placental growth and development. While the maternal factors affecting gestational health are thoroughly investigated, the paternal factors are often overlooked. Thus, it is important to understand various paternal factors affecting placental development and function.
OBJECTIVE: To assess the effect of various paternal factors on placental development, function, and pregnancy-related disorders.
MATERIALS AND METHODS: This review was registered in PROSPERO
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An increasing number of epigenome-wide association studies report tobacco smoking-associated DNA methylation levels. However, comprehensive replication studies remain scarce, particularly in placenta, despite their crucial interest in such a large-scale context. Using DNA methylation data from the EPIC array of 341 new placentas (85 smokers, 219 non-smokers, and 37 former smokers) from the EDEN cohort, we used a candidate approach to replicate maternal smoking-associated CpGs and regions previously identified using the 450K array, and an exploratory approach to discover new associations within
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The regenerative response of retinal cells to injury and aging depends on the epigenomic plasticity that enables the dedifferentiation and neuronal differentiation capacities of Müller glial cells (MG). In mammals, this regenerative ability is extremely limited, and disruptions in epigenetic mechanisms, particularly those involving DNA methylation and demethylation, may underlie this restricted potential. To explore this possibility, we aimed to develop DNA methylation-targeting molecular tools to enhance the dedifferentiation and neurogenic capacity of primary MG cultures derived from mouse r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid cancer is one of the most common endocrine gland malignancies in China. During gene transcription, the bromodomain and extraterminal domain (BET) proteins perform epigenome interpretation tasks. Bromodomain-containing protein 9 (BRD9) is one of the BET family members. Increasing evidence has implicated that BRD9 plays significant roles in multiple malignancies. However, its role in thyroid cancer is still not fully understood. In this research, our results demonstrated that high expression of BRD9 can facilitate the malignant phenotype of thyroid cancer cell lines, while low expression
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmania modulate the host cell epigenome, including DNA methylation. This work aimed to explore the DNA methylation pattern in infected macrophages with L. (Viannia) braziliensis, L. (Leishmania) amazonensis and L. (L.) infantum. We performed a genome-wide methylation analysis in macrophages, cultured in presence/absence of interleukin 6 (IL-6) and infected with the three species for a period of 72hs. Upon 72hs infection, sample groups of L. (V.) braziliensis - and L. (L.) infantum-infected macrophages were treated with Glucantime and Amphotericin B for 48hs, respectively. Uninfected macrop
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Impaired insulin secretion contributes to the pathogenesis of type 1 diabetes mellitus through autoimmune destruction of pancreatic β-cells and the pathogenesis of severe forms of type 2 diabetes mellitus through β-cell dedifferentiation and other mechanisms. Replenishment of malfunctioning β-cells via islet transplantation has the potential to induce long-term glycemic control in the body. However, this treatment option cannot widely be implemented in clinical due to healthy islet donor shortage. Emerging β-cell replacement with human-induced pluripotent stem cell (iPSC) provides high remedia
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electroconvulsive therapy (ECT) is an effective antidepressant treatment. The mechanisms behind the therapeutic effect are not fully understood, and reliable biomarkers for response are needed. Epigenetic modifications, such as DNA methylation (DNAm), can reflect both genetic and environmental impacts; they may shed light on the mechanisms behind treatment effects and they have the potential to inform response prediction. We performed an epigenome-wide association study (EWAS) in peripheral blood from patients before and after ECT in a Norwegian cohort (n = 65). The methylation levels of 12 di
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Valproic acid (VPA) is an antiepileptic and mood-stabilizing drug with well-established teratogenic risks when taken during pregnancy. While its harmful effects on fetal development are well known, less attention has been given to its impact on placental development and function, despite the placenta's critical role in pregnancy.
AIM: This narrative review examines how VPA exposure affects placental growth, morphology, nutrient transport, and epigenetic modifications. It also considers whether placental dysfunction may contribute VPA's teratogenic effects.
RESULTS: Evidence sugge
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования