OBJECTIVE: Microecological and metabolic disorders of the gut may be involved in the pathogenesis of generalized anxiety disorder (GAD), but clinical multi-omics evidence of this is lacking. Our study aimed to investigate characteristic alterations in the gut microbiota and plasma metabolome of patients with GAD and evaluate their clinical diagnostic value.
PATIENTS AND METHODS: Ninety subjects (60 patients with GAD and 30 healthy volunteers) were included. We employed 16S rRNA gene sequencing to characterize the gut microbiota and targeted liquid chromatography-mass spectrometry to analyze p
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Type 1 diabetes mellitus (T1DM) frequently leads to severe complications, which can result in patient mortality or disability, imposing significant economic and psychological burdens on both individuals and society. In recent years, the incidence and prevalence of T1DM have been steadily increasing. However, the pathogenesis of the disease remains not fully understood; preventive measures are still lacking, and current treatments do not address the underlying causes. Mendelian randomization (MR) has recently gained widespread application in the identification of novel therapeutic t
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer, a common malignancy, is driven by androgen receptor (AR) signaling. Understanding the function of AR signaling is critical for prostate cancer research.
METHODS: We performed multi-omics data analysis for the AR+, androgen-sensitive LNCaP cell line, focusing on gene expression (RNAseq), chromatin accessibility (ATACseq), and transcription factor binding (ChIPseq). High-quality datasets were curated from public repositories and processed using state-of-the-art bioinformatics tools.
RESULTS: Our analysis identified 1004 up-regulated and 707 down-regulated genes in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Ascending aortic aneurysm (AsAA) is a high-risk cardiovascular condition; recent research indicates a possible association between gut microbiota, plasma metabolites, and the pathogenesis of AsAA.
OBJECTIVE: This study aims to investigate the compositional and metabolic alterations in the gut microbiota of AsAA patients to identify potential biomarkers for AsAA.
METHODS: This study enlisted 72 participants, comprising 44 individuals with AsAA and 28 healthy controls. All participants underwent examination for clinical features, and fecal and plasma samples were obtained for met
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Advanced prostate cancer (PCa) displays significant genetic heterogeneity and therapy resistance, yet the role of sensory perception pathways in its progression remains unclear.
METHODS: We performed an integrative multi-omics analysis of sensory perception-linked mRNAs and lncRNAs from TCGA and scRNA-seq data. Unsupervised consensus clustering defined three molecular subtypes (CS1-CS3). Key biomarkers were validated in patient tissues and serum. Immune and stromal infiltration were quantified using TIDE and ESTIMATE. Single-cell trajectories characterized TSC22D3-positive T cells
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While radiation and burn injury have distinct local and systemic effects, they both negatively impact intestinal permeability/function. In a nuclear attack, combined thermal burns and radiation exposure (e.g., combined injury (CI)) would be a dominant injury pattern. Despite this, how burns affect gastrointestinal acute radiation syndrome, and vice versa, has been largely unstudied. Next-generation sequencing has revealed a strong bidirectional link between the liver and gut. Here, we used a porcine model to evaluate the impact of burn, radiation, and CI on the gut microbiota and liver transcr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis-associated encephalopathy (SAE) is a major complication in intensive care units, characterized by diffuse brain dysfunction due to systemic inflammation. Despite advances in critical care medicine, SAE remains a key factor in poor patient outcomes, with its pathogenesis closely related to mitochondrial damage and the release of mitochondrial DNA (mtDNA). In this study, we integrated multiple transcriptomic and single-cell sequencing datasets to comprehensively analyze mitochondrial-associated differentially expressed genes (MitoDEGs) in SAE brain tissues. Using machine learning algorith
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To explore protein molecular markers and therapeutic targets for gestational diabetes mellitus (GDM). Methods: Based on transcriptomic, proteomic, and genomic data, we performed Mendelian randomization and colocalization analyses to preliminarily identify candidate proteins whose expression levels are associated with GDM risk and to evaluate whether the same causal variants drive protein levels and GDM. Protein-protein interaction (PPI) network analysis was then applied to elucidate interactions among these proteins, and gene ontology (GO) enrichment analysis was conducted to summar
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Mycoplasma pneumoniae pneumonia (MPP) poses a severe threat to the health of children, yet its molecular alterations and pathogenic mechanisms remain poorly understood. In this study, we performed a multi-omics analysis to investigate the interactions between Mycoplasma pneumoniae and the pediatric host.
METHODS: We enrolled children with MPP and healthy controls (HC), constructing two independent cohorts. Plasma samples were analyzed using untargeted metabolomics and Olink proteomics to identify key metabolites and associated pathways. Targeted metabolomics was applied to validat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intensification of livestock farming and plastic consumption has led to widespread co-contamination of agricultural soils with veterinary antibiotics (e.g., doxycycline, DOX) and microplastics (MPs). This study employed an integrative multi-omics approach (transcriptomics, metabolomics, microbiome analysis, qPCR) to investigate the synergistic effects of fragmented oversized microplastics (OMPs; 5-20 mm) and manure-borne DOX on pak choi growth and antibiotic resistance gene (ARG) dissemination in a realistic rhizobox system simulating manure-amended soil. We observed that co-exposure to DO
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis (OP) is characterized by imbalanced bone homeostasis, which is difficult to precisely regulate with current therapeutic strategies. Macrophages play a significant role in bone remodeling due to their complex interactions with osteoclasts and osteoblasts, suggesting that targeting macrophage-related pathways could offer novel therapeutic opportunities. To explore this, we combined bulk RNA-seq and scRNA-seq data to identify macrophage-related genes. Using bioinformatic tools, including CIBERSORT, WGCNA, and machine learning algorithms, we identified 1705 macrophage marker genes and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Migraine is a complex neurological disorder with poorly understood molecular mechanisms. Despite advances in genetic and omics research, the shared mechanisms between central and peripheral nervous systems in migraine pathogenesis remain unclear.
METHODS: We employed a multi-omics approach, integrating human trigeminal ganglion (TG) single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) data and expression quantitative trait loci (eQTL) data from eight major cortical cell types. Mendelian randomization (MR) analysis was used to prioritize susceptibility genes, followed by functional enrichment
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic low back pain (CLBP) and fibromyalgia (FM) are leading causes of suffering, disability, and social costs. Current pharmacological treatments do not target molecular mechanisms driving CLBP and FM, and no validated biomarkers are available, hampering the development of effective therapeutics. Omics research has the potential to substantially advance our ability to develop mechanism-specific therapeutics by identifying pathways involved in the pathophysiology of CLBP and FM, and facilitate the development of diagnostic, predictive, and prognostic biomarkers. We will conduct a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intratumoral heterogeneity (ITH) is a critical factor associated with treatment failure and disease relapse in hepatocellular carcinoma (HCC). However, decoding ITH in a noninvasive and comprehensive manner remains a notable challenge. In this study involving 851 patients from five centers, we developed a noninvasive prognostic classification for ITH using radiomics based on multisequence MRI, termed radiomics ITH (RITH) phenotypes. The RITH phenotypes highly correlated with prognosis and pathological ITH. In addition, through an integrated multi-omics analysis, we uncovered the molecular mech
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Though open chromatin may promote active transcription, gene expression responses may not be directly coordinated with changes in chromatin accessibility. Most existing methods for single-cell multi-omics data focus only on learning stationary, shared information among these modalities, overlooking modality-specific information delineating cellular states and dynamics resulting from causal relations among modalities. To address this, the epigenome-transcriptome relationship can be characterized in relation to time as coupled (changing dependently) or decoupled (changing independently). We prop
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Juvenile idiopathic arthritis (JIA) is a rare autoimmune disease arising from a complex interplay between genetic and environmental factors. Epigenetic modifications such as DNA methylation (DNAm) have been described as potential mediators in gene-environment interactions, contributing to immune system dysregulation. Emerging evidence suggests that DNAm profiles also predict therapeutic responses in autoimmune diseases. This study aims to identify epigenetic biomarkers and epigenetic-driven gene expression changes associated with JIA clinical activity.
METHODS: We reanalyzed a pub
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cirrhosis is a form of end-stage liver disease characterized by extensive hepatic fibrosis and loss of liver parenchyma. It is most commonly the result of long-term alcohol abuse in the United States. Large animal models of cirrhosis, as well as of one of its common long-term sequelae, HCC, are needed to study novel and emerging therapeutic interventions. In the present study, liver fibrosis was induced in the Oncopig cancer model, a large animal HCC model, via intrahepatic, intra-arterial ethanol infusion. Liver sections from five fibrosis induced and five age-matched controls were harvested
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aims to understand the differences in cellular and molecular patterns between the Main and Accessory (Acc) regions of pterygium tissue, with a focus on inflammation and mitochondrial energy metabolism.
METHODS: We collected bulk RNA sequencing (RNA-seq) data from six pterygium patients and single-cell RNA-seq data from two pterygium patients. Subsequently, we investigated pathway enrichment, pathway correlation, differential gene expression, protein-protein interactions, and cell-cell communication in pterygium.
RESULTS: Bulk RNA-seq analysis revealed distinct expression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxia disrupts the endocrine system of teleosts. The liver plays important roles in the endocrine system, energy storage, and metabolic processes. The aim of this study was to investigate the sex-specific hepatic response of yellow catfish under chronic hypoxia at the multi-omics level. Common hepatic responses in both sexes included the HIF-1 signaling pathway, glycolysis/gluconeogenesis, and steroid biosynthesis. Hypoxia dysregulated primary bile acid biosynthesis, lipid metabolism, and vitellogenin levels in female fish. Endoplasmic reticulum function in females also tended to be disrupte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-altitude hypoxia acclimatization requires whole-body physiological regulation in highland immigrants, but the underlying genetic mechanism has not been clarified. Here we use sheep as an animal model for low-to-high altitude translocation. We generate multi-omics data including whole-genome sequences, time-resolved bulk RNA-Seq, ATAC-Seq and single-cell RNA-Seq from multiple tissues as well as phenotypic data from 20 bio-indicators. We characterize transcriptional changes of all genes in each tissue, and examine multi-tissue temporal dynamics and transcriptional interactions among genes.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования