IMPORTANCE: Individuals genetically predisposed to pancreatic cancer may benefit from early detection. Genes that predispose to pancreatic cancer and the risks of pancreatic cancer associated with mutations in these genes are not well defined.
OBJECTIVE: To determine whether inherited germline mutations in cancer predisposition genes are associated with increased risks of pancreatic cancer.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Case-control analysis to identify pancreatic cancer predisposition genes; longitudinal analysis of patients with pancreatic cancer for prognosis. The study included 3030
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To characterize mitochondrial sequence variants present in a nationwide hereditary deafness DNA repository of samples from deaf subjects and to define the clinical presentation and audiometric characteristics of individuals with a mitochondrial sequence variant.
STUDY DESIGN: Retrospective review of results for select mitochondrial mutations performed on DNA samples from subjects compiled from 1997 to 2009.
SETTING: National hereditary deafness DNA repository.
SUBJECTS AND METHODS: Available samples from subjects in the repository were screened to identify those with mitochondri
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: High-density DNA microarray measures the activities of several thousand genes simultaneously and the gene expression profiles have been used for the cancer classification recently. This new approach promises to give better therapeutic measurements to cancer patients by diagnosing cancer types with improved accuracy. The Support Vector Machine (SVM) is one of the classification methods successfully applied to the cancer diagnosis problems. However, its optimal extension to more than two classes was not obvious, which might impose limitations in its application to multiple tumor type
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is one of the most lethal malignancies worldwide, and the precise identification of biomarkers from colonic adenoma to cancer is of great significance for preventing the development of adenocarcinoma. Given that existing methods inadequately capture the topological network relationships among genes, this study proposes a graph neural network model based on multifeature learning, named ChebTs, to investigate the correlation between key genes involved in the colorectal "adenoma-cancer" transition. The GSE41657 and GSE31905 datasets from the GEO database were stratified in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to explore the common differentially expressed genes (DEGs) between atherosclerosis (AS) and nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) through bioinformatics. The GSE89632 and GSE100927 datasets from the open-source GEO database were selected for analysis in this study. DEGs between the control and disease groups were identified from the datasets of NAFLD and AS, leading to the identification of genes that are commonly dysregulated in both conditions. Gene set enrichment analysis (GSEA) was performed on 2 datasets, followed by Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Pancreatic adenocarcinoma (PAAD) is one of the most lethal cancers worldwide, with more than 95% of PAAD patients not surviving beyond 5 years. Due to its rapid progression, in most cases there is no time for treatment by the time the disease is diagnosed, and metastases have developed in many organs. Therefore, there is currently a need to discover prognostic markers. Anillin actin-binding protein (ANLN) is an actin-binding protein involved in cell division. Its increased expression has been reported in many types of cancer, suggesting that it may be strongly involved in the p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background & Aims: Pancreatic adenocarcinoma (PAAD) remains a highly lethal malignancy with limited therapeutic options, primarily due to the absence of reliable prognostic biomarkers. Immunogenic cell death (ICD) plays a pivotal role in anti-tumor immunity and has potential as both a prognostic marker and a predictor of immunotherapy response. This study aimed to identify ICD-related hub genes and establish a robust prognostic gene signature for PAAD using weighted gene co-expression network analysis (WGCNA). Methods & Results: Transcriptomic and clinical data of PAAD patients were obtained f
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early detection of lung nodules (LNs) is critical for prevention and treatment of lung cancer. However, current noninvasive diagnostic methods face significant challenges in reliably distinguishing benign from malignant nodules. Thus, there is an urgent need for novel molecular biomarkers or pathways to facilitate accurate identification of truly malignant LNs. Using the Gene Expression Omnibus (GEO) database and the "limma" package, we identified differentially expressed genes (DEGs) in lung nodules (LNs) by comparing benign and malignant samples. The oxidative stress-related genes were downl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is a prevalent form of cancer globally. This disease is characterized by its complex genetic underpinnings, involving the intricate regulation of multiple genes. Genetic factors influence cellular processes such as growth, differentiation, and apoptosis of oral mucosal cells, thereby promoting or inhibiting tumor formation and progression. Furthermore, environmental factors-including smoking, alcohol consumption, and human papillomavirus (HPV) infection-can significantly increase the risk of developing OSCC. These external influences can impact the disease i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BRCA) is one of the most common neoplastic diseases among the female population. There were 43,780 BRCA-related deaths, with a mortality rate of 15% in the United States in 2022. Therefore, it is necessary to screen and validate potential diagnostic and prognostic biomarkers related to BRCA through bioinformatics technology. The GSE42568 and GSE5364 datasets were obtained from the Gene Expression Omnibus database, and the Cancer Genome Atlas BRCA dataset was sourced from the Xena functional genomics platform. Differentially expressed genes were identified across these 3 BRCA dat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leukemia is a type of malignant tumor affecting hematopoietic system. Cervical cancer is a malignant tumor of female reproductive tract. The relationship between Calmodulin 3 (CALM3) and leukemia, cervical cancer remains unclear. Leukemia dataset GSE26294 and cervical cancer dataset GSE173097 profiles were downloaded from gene expression omnibus. Principal component analysis, differentially expressed genes (DEGs) screening, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), functional enrichment analysis, gene set enrichment analysis, immune infiltration analysis, protein-protein interactio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anoikis and immune cell infiltration are pivotal factors in the pathophysiological mechanism of diabetic nephropathy (DN), yet a comprehensive understanding of the mechanism is lacking. This work aimed to pinpoint distinctive anoikis-related genes (ARGs) in DN and delve into their impact on the immune landscape. Three datasets (GSE30528, GSE47184, and GSE96804) were downloaded from the gene expression omnibus (GEO) dataset. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using the "limma" package, while ARGs were obtained from GSEA, GeneCard, and Harmonizome datasets. The intersection of
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Disulfidptosis, a recently identified form of regulated cell death, plays a potential role in secondary injury following spinal cord injury (SCI). However, its regulatory mechanisms and therapeutic targets during the subacute phase remain unclear. This study aimed to systematically identify core disulfidptosis-related genes (DRGs) in subacute SCI and explore potential diagnostic biomarkers and therapeutic compounds.
METHODS: Two GEO datasets-GSE151371 and GSE45006 were analyzed. Differentially expressed genes (DEGs) were intersected with known DRGs to obtain disulfidptosis-relat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Underactive bladder (UAB) is a common disorder that significantly affects patients' quality of life, necessitating the exploration of underlying molecular mechanisms for more effective management. This study aims to elucidate the gene expression profiles associated with UAB by employing a combination of bioinformatics analyses and experimental validation to identify pivotal hub genes and potential therapeutic targets. We accessed the GSE122060 and GSE100219 datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) database to identify differentially expressed genes (DEGs), followed by functional enrichm
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Recurrent spontaneous abortion (RSA) seriously affects women's reproductive health, and its pathogenesis is complex and varied. The aim of this study is to identify key molecular markers closely associated with RSA to rapidly and effectively predict the RSA, and to provide simple and practical indicators for clinical diagnosis and treatment.
METHOD: We obtained mRNA expression profiles from the GSE26787 and GSE165004 datasets of the Gene Expression Omnibus (GEO) database, immune-related genes (IRGs) from the ImmPort database (https://www.immport.org), and genes related to inflamma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to identify autophagy-related biomarkers in rheumatoid arthritis (RA) synovium, analyze their immune infiltration characteristics, and validate therapeutic potential through multi-level experimental approaches.
METHODS: We used public datasets to obtain synovial tissue genes of healthy people and RA patients, screened differentially expressed genes (DEGs) of RA, and intersected with the human autophagy gene database (HADb) to obtain RA autophagy genes. GO and KEGG enrichment analysis and single-gene genome enrichment analysis were performed. The diagnostic value of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) is an autoimmune disease with chronic presentation, involving symmetric joints and systemic involvement. Ferroptosis is iron-dependent programmed cell death through lipid peroxide accumulation, implicated in inflammatory diseases, including RA. However, its underlying mechanisms and gene-level contributions to RA pathogenesis remain largely unexplored. Therefore, this study emphasizes identifying ferroptosis-related genes associated with RA, evaluating their diagnostic, prognostic, and therapeutic potential, and exploring their role in immune modulation.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The purpose of this study is to explore the common differentially expressed genes (DEGs) between multiple myeloma (MM) and osteoporosis and the associated molecular mechanisms.
RESEARCH DESIGN AND METHODS: We obtained the overlapping DEGs between MM and osteoporosis with the GEO2R online tool. Then, the DEGs were clustered on the MetaCore website to identify the biological process and pathway. In addition, the STRING database and Cytoscape were used to construct the protein-protein interaction (PPI) network and identify hub genes. Finally, miRNA-gene and transcriptional factor (TF
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVES: Alzheimer's disease (AD) and type 2 diabetes mellitus (T2DM) share considerable similarities in their proposed patho mechanisms. Autophagy, an intrinsic cellular process involved in the degradation of dysfunctional organelles and abnormal proteins, has been implicated in the pathogenesis of both AD and T2DM. This study aims to identify potential shared biomarkers related to autophagy in AD and T2DM by analyzing hub differentially expressed autophagy-related genes (DEARGs) and examining their potential functions.
METHODS: Gene expression profiles for AD and T2DM were a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Premature ovarian failure (POF), which is often comorbid with dry eye disease (DED) is a key issue affecting female health. Here, we explored the mechanism underlying comorbid POF and DED to further elucidate disease mechanisms and improve treatment. Datasets related to POF (GSE39501) and DED (GSE44101) were identified from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and subjected to weighted gene coexpression network (WGCNA) and differentially expressed genes (DEGs) analyses, respectively, with the intersection used to obtain 158 genes comorbid in POF and DED. Kyoto Encyclopedia of Genes and G
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.