This study aimed to establish and validate a novel detection method that combines padlock probe technology with fluorescence quantitative PCR (qPCR) for the rapid and specific detection of the SARS-CoV-2 Omicron S371L mutation in the spike protein. Padlock probes and amplification primers were designed and synthesized based on the Omicron S371L mutation site. The probe was designed to anneal with high specificity to the mutation, allowing ligase-mediated circularization only in the presence of the target sequence. The circularized probe then served as a template for qPCR amplification. Assay o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital cytomegalovirus (cCMV) is a leading cause of paediatric neurological and hearing deficits, yet there is currently no uniform public health strategy for cCMV screening. We investigated key outcomes of a 3-year universal cCMV screening programme using our newly developed saliva-pooling setup. The study objectives were to: assess the performance and feasibility of the pooled-saliva testing over time; determine the true burden of cCMV and the fraction of infants with cCMV missed by expanded-targeted screening; and define the attribution of cCMV and cCMV-related sequelae to p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fish in wild and cultured populations may be infected with numerous types of pathogens but the host responses vary dependent on both host and parasite species. The present study demonstrates how an experimental infection with endoparasitic nematode larvae (Anisakis simplex) induces cellular and humoral immune responses in rainbow trout Oncorhynchus mykiss. The nematode larvae invaded the peritoneal cavity of the fish following oral administration and became encapsulated by a range of host cells including macrophages, neutrophils, mast cells, fibroblasts, and lymphocytes. The main part (92.7%)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Institute of Cancer Research (ICR) mouse-Echinostoma caproni model is used to study mechanisms generating resistance against … ection and superimposed infection in anti (α)-interleuquin(IL)-25-treated mice were investigated by real-time polymerase chain reaction (PCR). Translocation and phosphorylation of STAT6 were studied by indirect immunofluorescence (IIF) on intestinal tissue sections. The IIF technique was also used to label M1 and M2 macrophages to confirm the activation pathways.
FINDINGS: Primary …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Surveillance and diagnostics are critical for the early detection, containment and eradication of exotic pests. For the screwworm fly, this is usually via targeted surveillance and exclusion testing of trap-caught flies, as well as the identification of larvae associated with myiasis wounds. We present a specific and sensitive real-time polymerase chain reaction (PCR) assay for the detection of the New World screwworm fly, Cochliomyia hominivorax Coquerel (Diptera: Calliphoridae). The assay targets the cytochrome oxidase subunit 1 (cox1) gene from adult flies or larvae and retains high analyti…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Canine Leishmaniasis (CanL) is a zoonotic vector-borne disease caused by Leishmania parasite in dogs. It represents a significant public hea … s and lymph aspiration. The rK39 dipstick test and ELISA were used to investigate the sera samples. Real-time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) was applied by performing DNA extraction from blood pellet sections, citrated blood, lymph node aspiration, conjunctival swabs, and reproductive medium. Leishmania amastigotes were not detected in examined blood smears, while amastigotes we …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Time- and cost-saving surveillance of viral pathogens is achieved by tiled sequencing in which a viral genome is amplified in overlapping PCR amplicons and qPCR. However, designing pan-specific primers for viral pathogens with high genomic variability represents a significant challenge. Here, we present a bioinformatics command-line tool, called varVAMP (variable virus amplicons), which addresses this issue. It relies on multiple sequence alignments of highly variable virus sequences and enables degenerate primer design for qPCR or tiled amplicon whole genome sequencing. We demonstrate the uti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The wide diversity of Salmonella serotypes poses challenges for traditional serotyping methods, which are labor-intensive and unsuitable for high-throughput testing, particularly in food safety contexts. Hence, this study aimed to develop and validate a real-time PCR method for detecting Salmonella spp., identifying the major public health serotypes (S. Enteritidis and S. Typhimurium), and differentiating monophasic S. Typhimurium variants. The method demonstrated high specificity and sensitivity, with 100 % inclusivity and 96.8 % exclusivity. Novel primers targeting fljB-hin allowed effective
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Goats are highly susceptible to Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) infection and can play an important role in the epidemiology of an … oats positive for official tuberculin skin tests (TST). The techniques evaluated were direct tissue real-time polymerase chain reaction (RT-PCR), culture, observation of gross and histopathological tuberculosis-like lesions (TBL), and Ziehl-Neelsen staining. Lung and retropharyngeal and mediastinal lymph node (LN) samples were taken from 205 TST-positive goats. Direct tissue RT-PCR …
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptosporidiosis is a significant public health disease associated with various water matrices. In response to the increase of outbreaks reported in several countries and the limitations of conventional detection methods, this study presents and validates a quantitative molecular protocol based on qPCR for the detection of Cryptosporidium spp. and Cryptosporidium parvum in different water matrices. Our method includes high-volume water filtration, thermal-mechanic-enzymatic cell disruption and an optimized qPCR assay, resulting in a highly sensitive and reproducible method. We evaluated the s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Probiotics are live beneficial bacteria to human health and their efficiency on oral health is still being investigated. The pur … after GA. The counts of cariogenic bacteria were determined by the analysis of saliva samples using real-time polymerase chain reaction. Statistical significance level was accepted as p < 0.05.
RESULTS: There was statistically significant difference between Group A and B for T0, T1, T2 and T3 regarding S. mutans (p = 0.001, p = 0.04, p = 0.04, p = 0.03; p < 0.05). However, there wa …
СтатьяРандомизированное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rat lungworm disease or neuroangiostrongyliasis is a cerebral parasitic infection that affects humans and animals alike. Its clinical signs and symptoms can range from mild self-resolving to serious life-threatening conditions. Studies suggest therapeutic interventions during the early stages of infection to be more effective than in later stages. However, early diagnosis of infection is usually problematic without the knowledge of exposure and/or detection of the parasite's DNA or antibody against the parasite in the cerebrospinal fluid. This requires a lumbar puncture, which is an invasive p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is one of the most complicated chronic inflammatory diseases in women of reproductive age and is one of the primary factors responsible for infertility. There is substantial dispute relating to the pathophysiology of PCOS. Consequently, there is a critical need for further research to identify the factors underlying the pathophysiology of PCOS. Three transcriptome profiles of granulosa cells from patients with PCOS and normal controls were obtained from the gene expression integration database. We also obtained relevant microarrays of granulocytes prepared from
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Minimal residual disease assessment of BCR-ABL messenger ribonucleic acid levels is crucial in Philadelphia chromosome-positive acute lymphoblastic leukemia for prognosis and treatment planning. However, accurately quantifying minor BCR-ABL transcripts, which comprise 70% of Philadelphia chromosome-positive acute lymphoblastic leukemia cases, lacks a national-approved method.
METHODS: We developed the "Otsuka" minor BCR-ABLmessenger ribonucleic acid assay kit with exceptional precision (0.00151%). Minor BCR-ABL messenger ribonucleic acid levels were analyzed in 175 adults, 36 child
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia albertii is an emerging enteropathogen. Although E. albertii-specific detection and isolation methods have been developed, their efficiency on food samples have not yet been systematically studied. To establish a series of effective methods for detecting E. albertii in food, an interlaboratory study was conducted in 11 laboratories using enrichment with modified E. coli broth supplemented with cefixime and tellurite (CT-mEC), real-time PCR assay, and plating on four kinds of selective agars. This study focused on the detection efficiency of an E. albertii-specific real-time PCR ass
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We performed whole genome sequencing (WGS) of 15 Palyam serogroup virus (PALV) strains isolated from cattle or Culicoides biting midges in Japan from 1984 to 2018. We found that the PALV strains consisted of Chuzan (Kasba) virus (CHUV), D'Aguilar virus (DAGV), Bunyip Creek virus, and another PALV, Marrakai virus (MARV). The Japanese MARV strains isolated in 1997 were closely related to Australian PALV strains isolated in 1968-1976 in genome segments 2 and 10, but they were most closely related to other Japanese PALV strains in the other genome segments. Our data suggest that the Japanese MARV
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate quantification of the BCR::ABL1 transcripts is essential for measurable residual disease (MRD) monitoring in chronic myeloid leukemia (CML) after tyrosine kinase inhibitor (TKI) treatment. This study evaluated the newly developed digital real-time PCR method, Dr. PCR, as an alternative reverse transcription-PCR (qRT-PCR) for MRD detection.
METHODS: The performance of Dr. PCR was assessed using reference and clinical materials. Precision, linearity, and correlation with qRT-PCR were evaluated. MRD levels detected by Dr. PCR were compared with qRT-PCR, and practical advanta
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: In the current investigation, the effects of the mTOR inhibitors, Rapa and Torin1 on the TGF-β2-induced conjunctival fibrogenesis were studied.
STUDY DESIGN: Experimental research.
METHODS: 2D and 3D cultures of HconF were subjected to the following analyses; (1) planar proliferation evaluated by TEER (2D), (2) Seahorse metabolic analyses (2D), (3) subepithelial proliferation evaluated by the 3D spheroids' size and hardness, and (4) the mRNA expression of ECM proteins and their regulators (2D and 3D).
RESULT: Rapa or Torin1 both significantly increased planar proliferation in the n
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Schistosomiasis is a relatively neglected parasitic disease that afflicts more than 250 million people worldwide, for which the control strategy relies mainly on mass treatment with the only available drug, praziquantel (PZQ). This approach is not sustainable and is a priority for developing novel drug candidates for the treatment and control of schistosomiasis.
METHODOLOGYS/PRINCIPAL FINDINGS: In our previous study, we found that DW-3-15, a kind of PZQ derivative, could significantly downregulate the expression of the histone acetyltransferase of Schistosoma japonicum (SjHAT). In
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Although monkeypox-related ophthalmic disease (MPXROD) is rare, visual impairing complications have been reported. At present, tecovirimat is the standard-of-care antiviral treatment. In this MPXROD case, the effect of tecovirimat was assessed with PCR analysis of tear samples and concurrent monitoring of inflammation with laser flare photometry (LFP).
CASE DESCRIPTION: The patient presented with a palpebral lesion and a corneal ulcer in his right eye, with complete absence of the corneal epithelium, high intraocular pressure and anterior uveitis. MPXV-DNA was detected in tear s
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.