BACKGROUND: Anoikis plays a crucial role in thyroid carcinoma (THCA). Recent evidence has suggested CDKN2A as a key anoikis-related gene (ARG) associated with THCA. However, the multi-omics regulatory landscape of ARGs and their potential to define molecular subtypes with distinct therapeutic vulnerabilities remain unexplored.
METHODS: We utilized multi-omics data from The Cancer Genome Atlas including transcriptomic, methylation, and miRNA profiles, to analyze ARG expression and survival outcomes in THCA patients. Single-cell sequencing and clustering analyses were conducted to identify dist
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although astrocytes are known to contribute to Alzheimer's disease (AD) progression, their dynamic molecular alterations remain poorly characterized, particularly in early stages of the disease.
METHODS: We performed multi-omics profiling (transcriptomics, proteomics, spatial metabolomics) of astrocytes from APP/PS1 and WT mice to characterize dynamic changes during AD progression. To assess similar changes in early human AD, we analyzed single-nucleus RNA sequencing data from human samples.
RESULTS: Transcriptomic analysis of astrocytes from APP/PS1 and WT mice at five time poin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To address rising demand for dairy products, dairy goats are often fed high-concentrate diets, which lead to subacute rumen acidosis (SARA). The mechanisms behind individual variation in SARA tolerance are not well understood. This study aims to elucidate roles of rumen microbiome-host interactions in SARA-susceptibility and tolerance.
RESULTS: Goats susceptible or tolerant to SARA were selected by feeding diets with different levels of rumen degradable starch. SARA-susceptible goats present prolonged periods of rumen pH below 5.8 and volatile fatty acids (VFAs) accumulation. Meta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clearance of human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) remains a significant public health challenge due to impaired cellular immune responses and HIV-1 maintenance during acute infection. However, the genetic and epigenetic changes influencing the immune response on host infected cells remain unclear. Here, this study analyzes HIV-1-infected CD4+ T cells from peripheral blood mononuclear cells from people living with HIV-1 during early infection (<6 months) using single-cell RNA and ATAC sequencing. It is observed that HIV-1 hinders the antiviral response, particularly by interfering with th
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schizophrenia (SCZ) is a complex psychiatric disorder with heterogeneous molecular underpinnings that remain poorly resolved by conventional single-omics approaches, limiting biomarker discovery and mechanistic insights. To address this gap, we applied an artificial intelligence (AI)-driven multi-omics framework to an open access dataset comprising plasma proteomics, post-translational modifications (PTMs), and metabolomics to systematically dissect SCZ pathophysiology. In a cohort of 104 individuals, comparative analysis of 17 machine learning models revealed that multi-omics integration sign
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study of ubiquitous circadian rhythms in human physiology requires regular measurements across time. Repeated sampling of the different internal tissues that house circadian clocks is both practically and ethically infeasible. Here, we present a novel unsupervised machine learning approach (COFE) that can use single high-throughput omics samples (without time labels) from individuals to reconstruct circadian rhythms across cohorts. COFE can simultaneously assign time labels to samples and identify rhythmic data features used for temporal reconstruction, while also detecting invalid orderin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic metabolic dysregulation in sepsis critically impacts patient survival. To better understand its onset, untargeted serum metabolomics and lipidomics are analyzed from 152 presymptomatic patients undergoing major elective surgery, and identified key metabolites, including serine and aminoadipic acid, that differentiate postoperative uncomplicated infection from sepsis. Using single-nucleus RNA sequencing data from an in vivo mouse model of sepsis, tissue-independent down-regulation and tissue-specific differences of serine and energy-related genes including key module roles for the mito
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PM2.5, recognized as a potential pathogenic factor for nervous system diseases, remains an area with many unknowns, particularly regarding its effects on human health. After five-month real-ambient PM2.5 exposure, we observed no significant pathological damage to the lung, liver, spleen, or kidney tissues. However, PM2.5 exposure led to neuronal degeneration in the hippocampal CA1 region of Brown Norway (BN) rats. The level of IL-6, IL-13, IL-1β, IL-12, IL-4, GRO/KC, MIP-1α, CM-CSF significantly increased in lung lavage fluid (P < 0.05 for all). Notably, we detected a slight impairment in spat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY OBJECTIVES: To examine the joint effect of obstructive sleep apnea (OSA) and objective excessive daytime sleepiness (EDS) on glucose metabolism and the underlying mechanisms.
METHODS: We included 127 patients with OSA. The multiple sleep latency test (MSLT) and Epworth sleepiness scale (ESS) were used to assess objective and subjective EDS, respectively. Disordered glucose metabolism was defined as either a physician diagnosis or having fasting blood glucose levels ≥5.6 mmol/L. Values of fasting insulin and homeostasis model assessment of insulin resistance (HOMA-IR) higher than the med
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Obesity is a prevalent disease, but its influence on post-injury biology remains unclear. In this study, we aimed to characterize the independent effect of obesity on the proteomic and metabolomic signatures of trauma.
METHODS: Plasma was obtained on arrival from injured patients at a Level 1 Trauma Center and analyzed with modern mass spectrometry-based proteomics and metabolomics. Samples obtained after start of transfusion were excluded. Patients were stratified by "obesity" (body mass index [BMI]≥30 kg/m2) vs. "no obesity" (BMI < 30 kg/m2). In sub-group analyses, patients were su
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid cancer (TC) is an endocrine malignancy characterized by metabolic abnormalities, with its incidence continually on the rise. Understanding the pathogenesis of this cancer would help develop better diagnostic and therapeutic methods. We aimed to integrate single-cell transcriptomics, bulk transcriptomics, and GWAS data to identify causal associations with thyroid cancer at the gene level. We intended to utilize single-cell atlases to identify malignant cells and their characteristics, and employed SMR to search for genetic loci causally associated with thyroid cancer. We validated the e
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human body comprises many different microenvironments, each with their own challenges for microorganisms to overcome in order to survive and possibly cause infection. The human pathogen Streptococcus pneumoniae is notoriously flexible in this regard, and can adapt to a wide range of host niches, including the nasopharynx, lungs, and cerebrospinal fluid. However, the molecular and genetic foundation of this ability remain largely uncharted. In this work, we demonstrate that niche adaptation imposes genome-wide changes on multiple levels, including gene essentiality, expression and membrane
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Perform proteomic and metabolomic analysis on bilateral renal pelvis urine of patients with unilateral calcium oxalate kidney stones to identify the specific urinary microenvironment associated with stone formation.
METHODS: Using cystoscopy-guided insertion of ureteral catheters, bilateral renal pelvis urine samples are collected. Liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) is employed to identify differential proteins and metabolites in the urine microenvironment. Differentially expressed proteins and differential metabolites are further analyzed for their biologic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phalloidin is a lethal toxin found in highly toxic mushrooms of the genus Amanita; it causes severe liver injury, yet its molecular mechanism has not been systematically elucidated. In this study, Male Kunming mice received a single intraperitoneal injection of Phalloidin (0.3 mg/kg and 0.6 mg/kg). we predicted Phalloidin targets by network toxicology and explored its toxicity mechanism by combining metabolomics and proteomics in the livers of Phalloidin-toxicized mice. Metabolomic and proteomic profiling revealed that Phalloidin broadly perturbed hepatic metabolism. Specifically, it down-regu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Emilia sonchifolia is a very widely used traditional Chinese medicine, with the efficacy of heat-clearing, detoxicating, dissipating blood stasis, reducing swelling and relieving pain. As a widely used traditional miao herb, Emilia sonchifolia is often used to treat upper respiratory tract infections, oral ulcer, pneumonia, mastitis, enteritis, bacillum, urinary tract infection, sores, eczema, falls and injuries, etc. In fact, many cases of liver injury caused by Emilia sonchifolia have been reported clinically. However, the mechanisms underlying hepatotoxicity
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer-related lymphedema (CRL) is a common chronic complication following cancer treatment, characterized by impaired lymphatic drainage, interstitial fluid retention, and progressive fibrosis. Although the mechanisms of hypertrophic scar (HTS) fibrosis have been extensively investigated, the molecular drivers of fibrosis in CRL remain unclear. Identification of reliable biomarkers and novel therapeutic targets is essential for enabling early intervention.
METHODS: Transcriptomic datasets of CRL and HTS from the Gene Expression Omnibus (GEO) were integrated to identify fibrosis-a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gout is a systemic metabolic disease with rising prevalence and complex etiology, yet its molecular mechanisms remain incompletely defined. Multi-omics Mendelian randomization (MR) enables causal prioritization of genes implicated in gout. Because the gut microbiota (GM) can modulate urate metabolism and inflammation, integrating microbiome analyses may help nominate potential therapeutic candidates. This study aimed to nominate candidate targets for gout by integrating multi-omics MR, clinical validation, GM analysis, and in-silico druggability assessment.
METHODS: We performed m
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Okadaic acid (OA), a prevalent marine biotoxin found in shellfish, is known for causing acute gastrointestinal symptoms. Despite its potential to reach the bloodstream and the liver, the hepatic effects of OA are not well understood, highlighting a significant research gap. This study aims to comprehensively elucidate the impact of OA on the liver by examining the transcriptome, proteome, and phosphoproteome alterations in human HepaRG liver cells exposed to non-cytotoxic OA concentrations. We employed an integrative multi-omics approach, encompassing RNA sequencing, shotgun proteomics, phosph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hypoxic-ischemic brain injury is a common cause of mortality after cardiac arrest (CA) and cardiopulmonary resuscitation; however, the specific underlying mechanisms are unclear. This study aimed to explore postresuscitation changes based on multi-omics profiling.
METHODS: A CA swine model was established, and the neurological function was assessed at 24 h after resuscitation, followed by euthanizing animals. Their fecal, blood, and hippocampus samples were collected to analyze gut microbiota, metabolomics, and transcriptomics.
RESULTS: The 16S ribosomal DNA sequencing showed tha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Down syndrome (DS) is the most common genetic cause of cognitive disability. However, it is largely unclear how triplication of a small gene subset may impinge on diverse aspects of DS brain physiopathology. Here, we took a multi-omic approach and simultaneously analyzed by RNA-seq and proteomics the expression signatures of two diverse regions of human postmortem DS brains. We found that the overexpression of triplicated genes triggered global expression dysregulation, differentially affecting transcripts, miRNAs, and proteins involved in both known and novel biological candidate pathways. Am
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования