Traditional bulk-level transcriptomic sequencing cannot link cell type-specific gene expression to patient survival. In this study, we integrate single-nucleus RNA-seq and longitudinal data from 152 patients with pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), profiling 1.2 million cells to construct a prognostic map connecting cell type-resolved gene expression with overall survival. Using a single-cell-resolved spatial transcriptomic platform, we further analyze 3.1 million cells and correlate their spatial distribution with therapeutic response. To empower the translational research community, we
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Regulated cell death (RCD) pathways influence tumor progression and immune modulation. We previously constructed a signature database mapping 25 RCD forms across seven multi-omic layers and 33 tumor types (CancerRCDShiny). Despite their ability to identify risk populations, translating these signatures into personalized clinical workflows requires a shift from cohort stratification to individualized risk mapping by modeling patient risk (survival topologies) to capture the non-linear dynamics of RCD signatures.
METHODS: We engineered a pan-cancer multi-omic SuperLearner pipeline
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wound repair is an essential biological process that occurs both in tissues and single cells. In free-living, single-celled ciliates such as … troduce reproducible bisection wounds. We identified a Stentor syntaxin gene that was necessary for cell survival, particularly post-wounding, with only ∼37% of syntaxin-deficient cells surviving compared with ∼98% of control cells. Syntaxin-deficient cells were more susceptible to hypoosmotic shock and became increasingly vacuolated in the hours post-wounding, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural killer (NK) cells are the primary innate lymphoid cells responsible for antiviral defense and tumor immunosurveillance. However, further clarification is needed on how to prevent their over-activation and maintain their quiescence during development. In this study, we present evidence that liver kinase B1 (Lkb1) functions as a critical metabolic checkpoint, regulating NK cell survival and preserving their effective tumor immunosurveillance capabilities. Genetic ablation of Lkb1 led to mitochondrial dysfunction and impaired autophagy, resulting in reactive oxygen species (ROS)-dependent…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Second primary malignancies (SPMs) increasingly affect mantle cell lymphoma (MCL) survivors. In nationwide Danish and Swedish cohorts (2000-2020), we evaluated overall survival among MCL patients with SPMs versus matched non-lymphoma individuals with comparable malignancies and MCL patients without SPMs, respectively. Of 3094 MCL survivors, 19% in Denmark and 15% in Sweden developed an SPM, with a median of three years from MCL diagnosis to first SPM. MCL patients with SPMs had about double the mortality risk compared with non-lymphoma counterparts (pooled HR 2.1, 95% confidence interval (CI)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate clinicopathological factors associated with survival and recurrence in patients with T1N0 lower lip squamous cell carcinoma (LSCC), with particular attention to depth of invasion (DOI), perineural invasion (PNI), and neck management.
METHODS: This retrospective single-center cohort included 61 surgically treated patients with T1N0 lower LSCC. Overall survival (OS) and disease-free survival (DFS) were analyzed using Kaplan-Meier methods and Cox regression. A prespecified multivariable model included age, tumor diameter, and DOI. Exploratory recurrence analyses were also
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: B-cell prolymphocytic leukemia (B-PLL) is a rare, aggressive leukemic B-cell malignancy historically associated with poor outcomes and recently reclassified in the WHO Fifth Edition but retained as a distinct entity in the ICC.
METHODS: We analyzed 950 patients labeled as B-PLL in the National Cancer Database (2004-2019), identified using ICD-O-3 morphology code 9833/3.
RESULTS: Median age was 72 years, and 72% received systemic therapy at diagnosis. Median overall survival (OS) was poor (2.8 years) and did not improve over time. Patients initially managed with active surveilla
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Circadian rhythms modulate immune function and drug response, prompting interest in chronotherapy for immune checkpoint inhibitors (ICIs). This study aimed to evaluate the prognostic impact of ICI infusion timing in metastatic renal cell carcinoma (mRCC), particularly in the second-line setting after tyrosine kinase inhibitor (TKI) therapy.
PATIENTS: This retrospective cohort study included adult patients with histologically confirmed mRCC who progressed on first-line TKI therapy and received second-line nivolumab.
METHODS: Patients were classified as early (Group A; ≥ 20% of i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer cells remodel blood vessels to create a tumor-supportive environment; however, the spatial distribution of these vessels and their prognostic significance in oral squamous cell carcinoma (OSCC) remain poorly defined.
METHODS: We established an open-source pipeline to quantify vascular area (VA) in both the inner tumor (InT) and invasive tumor front (ITF) regions from CD31-stained whole-slide images (discovery cohort, n = 66). The associations between VA and patient survival were assessed via univariate and multivariate analyses. Findings were validated in an independent coh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Estrogen receptors (ERs), ERα and ERβ, are frequently detected in lung cancers, yet their prognostic impact on non-small cell lung cancer (NSCLC) outcomes remains uncertain. This study aims to assess the pooled prevalence and prognostic significance of ERα and ERβ in NSCLC, with a focus on gender differences.
METHODS: We performed a systematic review and meta-analysis, identifying studies from major databases, including PubMed, Cochrane Library, and Embase, that reported ERα and ERβ expression and survival outcomes in NSCLC. Hazard ratios (HRs) with 95 % confidence intervals (CIs) were c
СтатьяСистематический обзорМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Medicaid expansion under the Affordable Care Act broadened eligibility for government-funded health coverage. This may have improved access to early diagnosis and rapid treatment, potentially impacting survival in patients with resectable non-small cell lung cancer (NSCLC), a leading cause of cancer-related death in the US.
OBJECTIVE: To evaluate the association between state-level Medicaid expansion and all-cause mortality in patients with resectable NSCLC.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: This cohort study of patients aged 20 to 64 years who were diagnosed with stage I to III
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: The unclear relationship between body mass index (BMI) and post-hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) mortality was investigated, including the impact of metabolic diseases.
METHODS: This retrospective study conducted at a Korean tertiary hospital (2009-2021) included patients who underwent HSCT. Patients were categorized as underweight (BMI < 18.5 kg/m2, n = 106), normal (BMI 18.5-22.9 kg/m2, n = 1,345), overweight (BMI 23.0-24.9 kg/m2, n = 980), or obese (BMI ≥ 25.0 kg/m2, n = 1,471). Diabetes mellitus (DM), hypertension, and dyslipidemia were identified by disease
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Implant-retained auricular prostheses are a well-established reconstructive option for patients with facial defects resulting from congenital anomalies, trauma, or oncologic resections. Most temporal implants are 3.0 to 4.0 mm in length. Longer implants could result in improved implant survival, but risk mastoid cell perforation.
PURPOSE: The study purpose was to measure the association of implant mastoid cell perforation and implant survival.
STUDY DESIGN, SETTING, SAMPLE: A retrospective cohort study was conducted, including all patients treated with temporal endosseous implant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) is characterized by the expansion of CD19+ CD5+ B cells but its origin remains debated. Mutated CLL may originate from post-germinal center B cells and unmutated CLL from CD5+ mature B cell precursors. Irrespective of precursor types, events initiating CLL remain unknown. The cytokines BAFF and APRIL each play a significant role in CLL cell survival and accumulation, but their involvement in disease initiation remains unclear.
METHODS: We generated novel CLL models lacking BAFF or APRIL. In vivo experiments were conducted to explore the impact of…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In small cell lung cancer (SCLC), the pathological N category is identical to it in non-small cell lung cancer (NSCLC) and remains unchanged over a decade. Here we verified the discriminability of number of involved nodal stations (nS) in SCLC and compared its efficacy in predicting survival with currently used pathological nodal (pN) staging.
METHODS: We retrospectively analyzed the patients who received operations and were pathologically diagnosed as SCLC at Shanghai Pulmonary Hospital between 2009 and 2019. X-tile software was adopted to determine optimal cut-off values for nS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The survival and suppressive function of regulatory T (Treg) cells rely on various intracellular metabolic and physiological processes. Our study demonstrates that Vps34 plays a critical role in maintaining Treg cell homeostasis and function by regulating cellular metabolic activities. Disruption of Vps34 in Treg cells leads to spontaneous fatal systemic autoimmune disorder and multi-tissue inflammatory damage, accompanied by a reduction in the number of Treg cells, particularly eTreg cells with highly immunosuppressive activity. Mechanistically, the poor survival of Vps34-deficient Treg cells
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: A clinically meaningful attribute of some immune-oncology (IO) regimens is potential durable clinical benefit during a treatment-free interval. We characterize treatment-free survival (TFS) with and without ongoing toxicity in trials of frontline IO-VEGF tyrosine kinase inhibitor (TKI) combinations in patients with advanced renal cell carcinoma (aRCC).
EXPERIMENTAL DESIGN: Individual patient data were pooled by treatment arm from randomized trials submitted to the FDA evaluating IO-TKI combination in treatment-naïve aRCC with at least 30 months of median follow-up. OS, TFS, TFS with
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Cancers often overexpress multiple clinically relevant oncogenes, but it is not known if combinations of oncogenes in cellular subpopulations within a cancer influence clinical outcomes. Using quantitative multispectral imaging of the prognostically relevant oncogenes MYC, BCL2, and BCL6 in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), we show that the percentage of cells with a unique combination MYC+BCL2+BCL6- (M+2+6-) consistently predicts survival across four independent cohorts (n = 449), an effect not observed with other combinations including M+2+6+. We show that the M+2+6- percent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gestational choriocarcinoma (GC) is a highly malignant trophoblastic tumor that often develops from a complete hydatidiform mole … NLRP7 controls these processes in malignant (JEG-3) and non-tumor (HTR8/SVneo) trophoblastic cells. Cell survival, dedifferentiation, camouflage, and aggressiveness were compared between normal JEG-3 cells or knockdown for NLRP7, JEG-3 Sh NLRP7. In addition, HTR8/SVneo cells overexpressing NLRP7 were used to determine the impact of NLRP7 overexpression on non-t …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования