The XPD gene is required for excision repair of UV-damaged DNA and is an important component of nucleotide excision repair (NER). Mutations in the XPD gene generate the cancer-prone syndrome xeroderma pigmentosum, Cockayne's syndrome, and trichothiodystrophy. XPD is a component of the TFIIH transcription factor, which is essential for RNA polymerase II elongation. In this work, we report the construction of transgenic flies overexpressing the antisense RNA of the Drosophila melanogaster XPD homolog (DmXPD). These flies show an increased sensitivity to UV radiation compared with the wild-type.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of the present study was to determine whether triptolide (T10) had any effect on major histocompatibility complex class II (MHC II) expression in kainic acid (KA)‑activated microglia, and to investigate the underlying molecular mechanism. BV‑2 microglia were pretreated with T10 prior to activation with KA. The expression level of MHC II and class II transactivator (CIITA) mRNA was determined via reverse transcription‑polymerase chain reaction. The expression of MHC II, CIITA and the phosphorylation level of c‑Jun and proto‑oncogene c‑Fos (c‑Fos) was determined by western blotting.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the last few years, polymerase chain reaction analysis is frequently required to improve the detection of pathogen infections in central nervous system as a potential cause of neurological disorders and neuropsychiatric symptoms. The goal of this paper is to set up a fast, cheap and reliable molecular approach for qualitative detection of six neurotropic pathogens. A method based on PCR has been designed and implemented to guarantee the qualitative DNA detection of herpes simplex virus types 1 and 2 (HSVI/II), Epstein-Barr virus (EBV), cytomegalovirus (CMV), varicella-zoster virus (VZV), ru
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate whether hypermethylation of calcitonin (CT) gene could serve as a transforming signal of myelodysplastic syndrome (MDS) to leukemia.
METHODS: Bone marrow aspirates from 35 MDS patients, including 25 refractory anemia (RA), 10 refractory anemia with excess of blasts (RAEB) or refractory anemia with excess of blasts in transformation (RAEBt) and 7 cases of acute myeloid leukemia (AML) transformed from MDS, were studied on methylation rate in 5' end of CT gene by polymerase chain reaction (PCR) technique using methylation-sensitive endonuclease Hpa II with external referen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The INO80 protein is the main catalytic subunit of the INO80-chromatin remodeling complex, which is critical for DNA repair and transcription regulation in murine spermatocytes. In this study, we explored the role of INO80 in silencing genes on meiotic sex chromosomes in male mice. INO80 immunolocalization at the XY body in pachytene spermatocytes suggested a role for INO80 in the meiotic sex body. Subsequent deletion of Ino80 resulted in high expression of sex-linked genes. Furthermore, the active form of RNA polymerase II at the sex chromosomes of Ino80 -null pachytene spermatocy
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Saliva is an easily-accessible and a non-invasive clinical specimen alternate to blood and liver pus. An attempt was made to detect Entamoeba histolytica DNA released in the saliva of amoebic liver abscess (ALA) patients by applying 16S-like rRNA gene-based nested multiplex polymerase chain reaction (NM-PCR). The NM-PCR detected E. histolytica DNA in the saliva of eight (28.6%) of 28 ALA patients. The NM-PCR result was negative for E. histolytica DNA in the saliva of all the eight ALA patients who were tested prior to treatment with metronidazole but was positive in the saliva of eight (40%) o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
After several weeks of treatment, levels of alanine aminotransferase (ALT) increase in 50% of patients treated with tacrine for Alzheimer's disease. We looked for progressive effects on DNA to explain delayed toxicity. We first studied the in vitro effects of tacrine on DNA replication and topoisomerase-mediated DNA relaxation. We then treated mice with doses of tacrine reproducing the human daily dose on a body area basis and studied the effects of tacrine administration for up to 28 days on hepatic DNA, mitochondrial function, and cell death. In vitro, tacrine impaired DNA polymerase gamma-m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr Virus (EBV) can infect B lymphocytes as well as epithelial cells of the oral cavity. Recently, infection of epithelial cells of the inflamed uterine cervix has been demonstrated, and EBV-DNA has been detected in urethral discharge of men suffering from genital infection. We investigated whether EBV can be found in the genital tract of both sexes independently from inflammatory disease states. Genital specimens of men and women of a sexually transmitted diseases outpatient clinic after excluding sexually transmitted diseases and clinically apparent signs of inflammation were invest
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salivary gland hypertrophy viruses (SGHVs) have been identified from different dipteran species, such as the tsetse fly Glossina pallidipes (GpSGHV), the housefly Musca domestica (MdSGHV) and the narcissus bulbfly Merodon equestris (MeSGHV). These viruses share the following characteristics: (i) they produce non-occluded, enveloped, rod-shaped virions that measure 500-1,000 nm in length and 50-100 nm in diameter; (ii) they possess a large circular double-stranded DNA (dsDNA) genome ranging in size from 120 to 190 kbp and having G + C ratios ranging from 28 to 44%; (iii) they cause overt saliva
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the correlation between infection of different human cytomegalovirus (HCMV) glycoprotein B (gB) genotypes and human chronic periodontitis.
METHODS: A nested-polymerase chain reaction (nPCR) was employed to detect HCMV gB gene in the subgingival plaque samples from 65 chronic periodontitis patients and in the gingival crevicular fluid samples from 24 periodontally healthy control. The amplification fragments of gB gene were further genotyped by restriction fragment length polymorphism (RFLP). The correlation among infection with the different HCMV genotypes and the se
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA interstrand cross-links are complex lesions that covalently bind complementary strands of DNA and whose mechanism of repair remains poorly understood. In Escherichia coli, several gene products have been proposed to be involved in cross-link repair based on the hypersensitivity of mutants to cross-linking agents. However, cross-linking agents induce several forms of DNA damage, making it challenging to attribute mutant hypersensitivity specifically to interstrand cross-links. To address this, we compared the survival of UVA-irradiated repair mutants in the presence of 8-methoxypsoralen-whi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA polymerase II (Pol II) and the replisome use the same DNA template during the S phase. How these two machineries pass each other is a quintessential biological question. In this study, we demonstrated that the de novo transcriptomes of G1- and S-phase mouse embryonic fibroblasts (MEFs) showed extensive overlap. Pol II density decreased somewhat in the S-phase-enriched MEFs according to ChIP-seq. Based on long-read sequencing, a minor fraction of replication forks showed codirectional bias. A quarter of the forks were aborted near the Pol II-dense transcription start site (TSS), but the maj
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Telomerase RNA (TERC) has a noncanonical function in myelopoiesis binding to a consensus DNA binding sequence and attracting RNA polymerase II (RNA Pol II), thus facilitating myeloid gene expression. The CR4/CR5 domain of TERC is known to play this role, since a mutation of this domain found in dyskeratosis congenita (DC) patients decreases its affinity for RNA Pol II, impairing its myelopoietic activity as a result. In this study, we report that two aptamers, short single-stranded oligonucleotides, based on the CR4/CR5 domain were able to increase myelopoiesis without affecting erythropoiesis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of base excision repair (BER) genes in Philadelphia-negative (PN)-myeloproliferative neoplasms (MPNs) susceptibility was evaluated by genotyping eight polymorphisms [apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 1, mutY DNA glycosylase, earlier mutY homolog (E. coli) (MUTYH), 8-oxoguanine DNA glycosylase 1, poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) 1, PARP4 and X-ray repair cross-complementing 1 (XRCC1)] in a case-control study involving 133 Caucasian Portuguese patients. The results did not reveal a correlation between individual BER polymorphisms and PN-MPNs when considered as a whole. Howe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA replication and centrosome duplication have to be strictly synchronized to guarantee genomic stability. p53, pRb, cyclin E, and cyclin A are reported to be involved in the synchronizing process. We investigated the relationship between papillomavirus infection, centrosome aberration and aneuploidy during genesis of cervical carcinoma. The number of centrosomes found in cells from normal cervical epithelium (n = 5), condyloma acuminata (n = 5), cervical intraepithelial neoplasia (CIN) I, II, and III (n = 14) and invasive cervical carcinoma (n = 5) was analyzed by gamma tubulin immunofluores
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Constitutive heterochromatin packages long stretches of repetitive DNA sequences at the centromere and telomere, and ensures genomic integrity at these loci by preventing aberrant recombination and transcription. The chromatin scaffold of heterochromatin is dynamically regulated in the cell cycle, and inheritance of the epigenetically silenced state is dependent on a transcriptional event imposed on the underlying non-coding RNA in conjunction with the DNA replicative phase. Heterochromatin becomes transiently loosened in response to a reduction in the binding of Swi6, a heterochromatin protei
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cockayne syndrome (CS) is caused by mutations in CSA and CSB. The CSA and CSB proteins have been linked to both promoting transcription-coupled repair and restoring transcription following DNA damage. We show that UV stress arrests transcription of approximately 70% of genes in CSA- or CSB-deficient cells due to the constitutive presence of ATF3 at CRE/ATF sites. We found that CSB, CSA/DDB1/CUL4A, and MDM2 were essential for ATF3 ubiquitination and degradation by the proteasome. ATF3 removal was concomitant with the recruitment of RNA polymerase II and the restart of transcription. Preventing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TFIIH is essential for both RNA polymerase II transcription and DNA repair, and mutations in TFIIH can result in human disease. Here, we determine the molecular architecture of human and yeast TFIIH by an integrative approach using chemical crosslinking/mass spectrometry (CXMS) data, biochemical analyses, and previously published electron microscopy maps. We identified four new conserved "topological regions" that function as hubs for TFIIH assembly and more than 35 conserved topological features within TFIIH, illuminating a network of interactions involved in TFIIH assembly and regulation of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polylobated lymphoma is a morphologic variant of malignant lymphoma characterized by large pleomorphic neoplastic cells with polylobated nuclei. We report an unusual case in a 57-year-old man with a 9-year history of an antecedent low-grade peripheral T-cell lymphoma with dermal involvement. The polylobated lymphoma expressed the CD2, 8, 45, and DR surface antigens and had a clonally rearranged T-cell receptor beta-chain gene. The DNA content analysis indicated that most of the neoplasm was DNA diploid and tetraploid, with a high S phase. Cytogenetic analysis demonstrated the presence of a clo
Клинический случайСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: A Salmonella enterica subsp. diarizonae (hereafter S. diarizonae) clinical strain S499 demonstrated unique genomic features. The strain S499 was treated with polymyxin B in vitro to investigate the mechanism of resistance.
METHODS: S499 was treated with polymyxin B by increasing concentration gradually to obtain a resistant mutant S499V. Whole genomes of the two strains were sequenced using Illumina HiSeq X-10 and PacBio RS II platforms. Reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) was performed to compare the gene expression.
RESULTS: The chromosome of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования