Introduction. Chlamydia trachomatis (C. trachomatis, CT) is an obligatory intracellular bacterium that causes urogenital tract infections and leads to severe reproductive consequences. Therefore, a rapid and accurate detection method with high sensitivity and specificity is an urgent requirement for the routine diagnosis of C. trachomatis infections.Aim. In this study, we aimed to develop a multiplex quantitative real-time PCR (qPCR) assay based on two target regions for accurate detection of C. trachomatis in urogenital tract infections.Methodology. Primers and probes based on the conserved r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Human trichinellosis is a foodborne parasitic zoonotic disease caused by ingestion of raw or undercooked meat infected with nematode larvae of the genus Trichinella. In the USA, sporadic cases and outbreaks caused by the consumption of wild game meat infected with Trichinella have been reported. The current methods for diagnosis such as serology and microscopy are not specific, may result in false negative results, and cannot differentiate encapsulated Trichinella larvae to species level. The molecular protocols currently available for the differentiation of all encapsulate Trichine
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, three molecular assays (real-time multiplex polymerase chain reaction [PCR], merozoite surface antigen gene [MSP]-multiplex PCR, and the PlasmoNex Multiplex PCR Kit) have been developed for diagnosis of Plasmodium species. In total, 52 microscopy-positive and 20 malaria-negative samples were used in this study. We found that real-time multiplex PCR was the most sensitive for detecting P. falciparum and P. knowlesi. The MSP-multiplex PCR assay and the PlasmoNex Multiplex PCR Kit were equally sensitive for diagnosing P. knowlesi infection, whereas the PlasmoNex Multiplex PCR Kit a…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The Listeria genus comprises 10 recognized species. Listeria monocytogenes causes listeriosis in humans and other animals primarily via contaminated food or animal feed. Listeria ivanovii causes listeriosis in animals and on rare occasions in humans. The identification of nonpathogenic species of Listeria in foods indicates that conditions exist that support the growth of pathogenic strains and is used to facilitate the implementation of control and prevention measures. This study shows the development and evaluation of a 5'exonuclease real-time PCR assay for the rapid identificati
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The combination of an x-linked hematologic disorder with a heterozygous alpha-thalassemia-1 Southeast Asian (SEA) type deletion might lead to severe anemia in male infants. This study is to develop a simple and cost-effective single tube multiplex real-time PCR for the diagnosis of alpha-thalassemia-1 SEA type deletion and detect fetal gender.
METHODS: Multiplex real-time polymerase chain reaction (PCR) for the detection of alpha-thalassemia-1 SEA type deletion gene, wild type alpha-globin gene, and sex-determining region Y (SRY) gene was validated by analysis of 95 cord blood sam
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study includes the evaluation of multiplex real-time PCR (rPCR) kit, which was developed to provide rapid diagnosis of mastitis infections, by working with milk samples of 2 different sources of mastitis and comparing the results with the classical bacteriological culture method (BC). A total of 273 bacteria were isolated in 226 samples (47.88%) out of 472 samples by BC. These were 139 (50.91%) Staphylococcus spp., 61 (22.34%) Streptococcus spp., 15 (5.49%) E. coli, 8 (2.93%) Enterococcus spp., 50 (18.31%) other bacteria. When we look at the multiplex rPCR results; 1052 positive were obta
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate detection of schistosome infections in snails is vital for epidemiologic and laboratory studies. Traditional microscopy methods to detect schistosomes in snails are hindered by long prepatent periods and snail survivorship, leading to inaccurate assessment of infections. A rapid, multiplexed PCR assay targeting Biomphalaria sudanica or Biomphalaria glabrata (internal control) and Schistosoma mansoni DNA is described. The method takes less than 90 min starting from extracted snail DNA and is successful at amplifying schistosome DNA in snail tissue as soon as 30 min following exposure.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Syndromic testing for lower respiratory tract infections with BioFire® FilmArray® Pneumonia Panel Plus (BF) detects 27 pathogens with a turn-around-time of one hour. We compared the performance of BF with culture. Samples from 298 hospitalized patients with suspected pneumonia routinely sent for culture were also analyzed using BF. Retrospectively, patients were clinically categorized as having "pneumonia" or "no pneumonia." BF and culture were compared by analytical performance, which was evaluated by pathogen concordance, and by clinical performance by comparing pathogen detections in patien
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the aim of developing more simple diagnostic alternatives, a differential single-round and multiplex polymerase chain reaction (PCR) method was designed for the simultaneous detection of Babesia caballi and Babesia equi, by targeting 18S ribosomal RNA genes. The multiplex PCR amplified DNA fragments of 540 and 392 bp from B. caballi and B. equi, respectively, in one reaction. The PCR method evaluated on 39 blood samples collected from domestic horses in Mongolia yielded similar results to those obtained from confirmative PCR methods that had been established earlier. Thus, the single-roun…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Real-time polymerase chain reaction (qPCR) has become a prominent technique in life science research particularly for the detection and monitoring of biomarkers, pathogens, and environmental contaminants. Chlamydia trachomatis (CT) and Neisseria gonorrhoeae (NG) are among the major pathogens responsible for sexually transmitted diseases (STDs). Here, multiplex qPCR was utilized for the amplification and detection Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae within the same reaction tube.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To report a case of primary choroidal lymphoma that was confirmed by polymerase chain reaction-based clonality testing.
CASE REPOR … ed using the samples taken months before. First, we used a forensic DNA extraction kit, and then, a multiplex polymerase chain reaction was carried out using the IgH Rearrangements Molecular Analysis Kit. Clonal rearrangement was identified for the immunoglobulin heavy chain framework regions 1 and 2, and B-cell choroidal lymphoma was confirmed. The patient began treatment with intr …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Larvae of Trichinella sp. were identified in a golden jackal (Canis aureus) from Romania by both trichinelloscopy and artificial digestion. The larvae were identified as Trichinella britovi using a multiplex polymerase chain reaction biotyping method. This is the first report of Trichinella sp. in a jackal in Romania.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Redundant and low-value cerebrospinal fluid analysis for suspected meningitis can increase costs and antimicrobial use. Our diagnostic stewardship intervention limited available infectious disease cerebrospinal fluid assays to seven common tests, including a multiplex polymerase chain reaction panel. There was no significant difference in the cost of testing or clinical outcomes.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogen identification is key in septic arthritis. Culture-based techniques are challenging, especially when patients have been pretreated with antibiotics or when difficult-to-culture bacteria are encountered. The BioFire joint infection assay (BJA) is a multiplex PCR panel which detects 31 of the most prevalent bacterial and fungal pathogens causing septic arthritis. Here, 123 cryoconserved contemporary synovial fluid samples from 120 patients underwent BJA analysis. Results were compared to those of culture-based diagnostics (standard of care [SOC]). Clinical data were collected, and the p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichinella spp. are etiological zoonotic agents that spread throughout the world and affect mammals, birds, and reptiles. Within this genus, Trichinella pseudospiralis is the only recognized non-encapsulated species known to infect mammals and birds. This species has been reported in the majority of European countries, and the real epidemiological scenario of this species remains to be defined because its detection in mammals is much lower than that of the capsulated species. The aim of this study was to examine the presence of Trichinella larvae isolated from the muscles of a jackal from the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Opisthorchis felineus and Metorchis bilis are two common small worms that parasitize in the gallbladder and bile ducts of the liver of human … lly determine these two opisthorchiasis infections in one reaction. Two specific primer pairs for a multiplex polymerase chain reaction (PCR) were designed based on corresponding mitochondrial genome sequences. The multiplex assay detection limit was assessed by serial dilutions of the genomic DNAs of trematode worms examined. Naturally, infected samples of human bile and feces were …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rapid identification of microorganisms and resistance genes in positive blood cultures may help optimize early antibiotic therapy and improve outcomes. In this study, we compared the BioFire FilmArray Blood Culture Identification 2 (BCID2) panel results with routine microbiological examination methods in blood cultures that gave positive signals in an Oncology hospital.
METHODS: Gram stain results from positive blood culture bottles were reported to the clinic as panic value. After clinical evaluation, 93 positive blood cultures that met the inclusion criteria were evaluated with
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multiplex nucleic acid detection has emerged as an indispensable tool in modern diagnostics, with multiplex PCR established as the gold standard due to its high throughput, cost-effectiveness, and rapid turnaround time. Despite its advantages, conventional multiplex PCR remains constrained by persistent technical challenges-notably primer-dimer artifacts and nonspecific amplification. These limitations not only impose stringent requirements on primer design and reaction optimization but also restrict analytical throughput, ultimately hindering the technology's full potential in cri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования