The implementation of polymerase chain reaction (PCR)-based diagnostics of intestinal protozoa has led to higher sensitivity and (subtype) specificity, more convenient sampling, and the possibility for high-throughput screening. PCR for routine detection of human intestinal protozoa in fecal samples is used by an increasing number of clinical laboratories. This paper discusses the recent developments in the diagnosis of intestinal protozoa, with an emphasis on PCR-based diagnostics. Although many reviews have described the technical aspects of PCR-based diagnostics, this review focuses on the …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serotype Typhi (S. Typhi) is the causative agent of typhoid fever and remains a major health threat in most of the developing countries. The prompt diagnosis of typhoid directly from the patient's blood requires high level of sensitivity and specificity. Some of us were the first to report PCR based diagnosis of typhoid. This approach has since then been reported by many scientists using different genomic targets. Since the number of bacteria circulating in the blood of a patient can be as low as 0.3 cfu ml(-1), there is always a room for improvement in diagnostic PCR. In t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Definitive diagnosis of unclear pulmonary lesions is mainly based on morphological methods. In addition to a neoplasm, inflammatory reactions, in particular tuberculosis (TB), have to be considered in most cases. Therefore, the aim of this work was to determine whether established methods used in general pathology can be efficiently used with cytological material.
MATERIALS AND METHODS: An established polymerase chain reaction (PCR) protocol for the detection of Mycobacterium tuberculosis complex (Mtc) DNA in fixed specimens was conducted on fixed material available as an assay fo…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In recent years, increasing evidence regarding the potential association between periodontal diseases and cardiovascular disease … rial 16S ribosomal-RNA gene were carried out for each sample with universal eubacteria primers by a polymerase chain reaction (PCR). A nested PCR with specific primers for the target bacteria was performed next. Statistical tests included the χ(2) test.
RESULTS: Forty-two atheromatous plaque were analyzed. All of them were positive for ≥1 target bacterial species. The bac …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Actinobaculum schaalii can cause urinary tract infections (UTIs) and occasionally septic complications. It is a carbon dioxide-requiring Gram-positive rod which is overlooked if urine is cultured in ambient air or if there is growth of conventional species. This study aimed to find the frequency of A. schaalii in consecutive cohorts of patients with kidney stones, children with suspected UTI and patients with indwelling catheters.
MATERIAL AND METHODS: A quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) assay was used to screen consecutive urine samples from of 76 patients wit…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Herpesviruses cause life-threatening diseases after hematopoietic stem cell transplantation (HSCT). It is necessary that viral diseases are identified early and safely diagnosed. The purpose of this study was to evaluate the efficacy of multiplex polymerase chain reaction (PCR) for qualitative detection of the six herpesviruses simultaneously: herpes simplex virus type 1 and type 2, varicella-zoster virus, cytomegalovirus, Epstein-Barr virus (EBV) and human herpesvirus 6B.
METHODS: Multiplex PCR was applied to patients with various clinical manifestations including central nervous…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A simple and reliable tool for the early diagnosis of leptospirosis is urgently needed. We report the development of a lyophilized reagent-based polymerase chain reaction (PCR) assay targeting lipL32 gene, which is present only in pathogenic leptospires. To determine the effectiveness of the newly developed assay in the early diagnosis of leptospirosis, the sensitivity and specificity was evaluated. In simulated clinical samples, the assay was able to detect 10² and 10³ leptospires/ml in spiked urine and blood samples, respectively. In experimentally infected animals, leptospiral DNA could be …
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: When treating lung cancer, pneumocystic pneumonia is a life-threatening complication seen during chemotherapy. Polymerase chain reaction is used to detect its cause, Pneumocystis jirovecii, but polymerase chain reaction positives without pneumocystic pneumonia are sometimes seen. The purpose of this study was to assess the frequency of pneumocystic pneumonia during cancer treatment.
METHODS: Fifty induced sputum specimens and 4 bronchoalveolar lavage specimens collected from 50 patients with acute respiratory symptoms during anticancer therapy were retrospectively studied after cla…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The aim of this study was to evaluate the effectiveness of polymerase chain reaction (PCR) in accurate and rapid diagnosis of fungal endophthalmitis in comparison with conventional Gram stain and culture in pediatric fungal endophthalmitis.
PATIENTS AND METHODS: This study included 26 cases with endophthalmitis. Age was less than 16 years old, and all were males with history of ocular trauma and with clinical picture suggestive of fungal endophthalmitis. A prospective nonrandomized study was done. For all cases pars plana vitrectomy was done and sample of vitreous wash was collected …
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microsporidium spp. may lead to a variety of clinical pictures like sinusitis, keratoconjunctivitis, hepatitis, myositis, peritonitis, nephr … ically and albendazole was added to the treatment. Presence of Microsporidium spp. was confirmed by polymerase chain reaction with the use of C1 and C2 primers (Metabion, Germany) targeted to Microsporidium spp. and besides a 270 bp band specific for Encephalitozoon intestinalis was also obtained. This case emphasized that in case of diarrhea the stool samples of the immun …
Клинический случайАннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Outbreaks of West Nile virus (WNV) have occurred intermittently in regions around the Mediterranean coast, and the virus may have become est … cephalitis virus, dengue virus, and Usutu virus has prompted us to design a novel pan-flavivirus RT-polymerase chain reaction for the purpose of surveillance for a range of flaviviruses. The assay utilizes degenerate primers targeting the flavivirus NS5 gene (RNA-dependent RNA polymerase) and detects a range of flaviviruses, including WNV. A small panel of WNV bird samples …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The international journal of tuberculosis and lung disease : the official journal of the International Union against Tuberculosis and Lung Disease2010eng
OBJECTIVE: To evaluate the efficacy of laparoscopic visual inspection vs. endometrial tuberculosis (TB) polymerase chain reaction (PCR) for an early diagnosis and management of female genital TB (GTB) in India.
DESIGN: Observational case study.
RESULTS: Both laparoscopy and endometrial (endo) TB-PCR were performed on 162 infertile women: 52 endo TB-PCR-positive patients were diagnosed as definite GTB, of whom 44 (84.6%) also showed laparoscopic findings suspicious of TB (Type I). Subgroup analysis showed a similar PCR positivity of 54.5% (24/44) in the strongly suspicious and 54.1% (20/37) i…
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total of 200 females of whom 120 had manifestations of vaginal trichomoniasis and 80 asymptomatic ones were studied. In 54/120 symptomatic female (45%) and in 28/80 asymptomatic ones (35%), T. vaginalis was diagnosed by wet mount of bedside vaginal swab samples. Of 120 samples from symptomatic females, T. vaginalis was detected in 93 (77.5%) when cultured onto InPouch & 95 (79.16%) in modified thioglycolate media. Culturing 80 samples of asymptomatic females showed T. vaginalis in 35 (43.75%) onto either media. T. vaginalis genomic DNAs was amplified by PCR from 130 (65%) by using TVA5-TVA6
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monitoring of rodents for Pasteurellaceae infection may be carried out by the polymerase chain reaction (PCR). We tested which of 17 rodent Pasteurellaceae strains were detected by three PCR primer sets. By phylogenetic analysis, 12 strains were assigned to the Rodent cluster and five strains to other clusters, namely the Somnus cluster, Pasteurella sensu stricto, Actinobacillus sensu stricto, the Mannheimia and Rossii cluster. A primer set developed to detect biotype Heyl [Pasteurella] pneumotropica produced amplicons from three strains and appeared specific for this taxon. A primer set devel…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A polymerase chain reaction (PCR) assay was evaluated for detection of Opisthorchis viverrini eggs in the stool specimens of light and heavily infected individuals in Khon Kaen province of Thailand. A total of 75 fecal specimens were analyzed by PCR following DNA extraction. All the microscopically positive samples were positive by PCR, while 23 of 30 (76.6%) microscopically negative samples were also PCR positive. The sensitivity of the assay was 5 eggs/g of stool. This method is potentially useful in the diagnosis of human opisthorchiasis in endemic areas for treatment and in epidemiological…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To evaluate the value of short tandem repeats (microsatellites) in the study of numerical chromosomal anomalies in spontaneous abortion.
METHOD: Multiplex quantitative fluorescent polymerase chain reaction (QF-PCR) was carried out on 61 spontaneous abortion samples and 48 controls using microsatellite markers from 8 chromosomes where aneuploids are commonly found.
RESULTS: Of the 61 samples, 65.6% were successfully karyotyped, and the call rate of the QF-PCR was 98.3%. The correspondence between PCR and karyotyping was 95%. The success rate of karyotyping in the inevitable aborti…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptobacillus moniliformis is an etiological agent of rat-bite fever and Haverhill fever in human infection. As the currently available methods for identifying the causative bacteria are not satisfactory, we attempted to establish them by PCR using newly designed primers for the 16S rRNA gene of S. moniliformis. We then determined the prevalence of Streptobacillus spp. in two species of feral rats that inhabit an urban region in Japan, because information on the prevalence of the bacteria in feral rats is obscure. The use of PCR with newly designed primers showed that an extremely high propo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Canines are the principal domestic reservoirs of visceral leishmaniasis in both the Old and New World. The development of highly sensitive and quantitative methods, such as real time reverse transcriptase polymerase chain reaction for measurement of canine cytokines has not been exploited in studies of visceral leishmaniasis.
OBJECTIVE: To standardize the relative quantification of canine IFN-gamma, IL-4, IL-10, IL-12p40 and IL-12p35 using real time reverse transcriptase polymerase chain reaction.
MATERIALS AND METHODS: RNA was isolated from PBMCs from 1 year-old foxhounds and …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a PCR based method to detect Aphanomyces astaci in North American crayfish. Primers were designed to specifically amplify parts of the internal transcribed spacer (ITS) regions and the 5.8 rRNA gene of A. astaci. A single round and a semi-nested assay were tested for their sensitivity and specificity. Specificity of the PCR assays was tested against several closely related Aphanomyces species, other Oomycetes and some non-A. astaci DNA that might be found in or on crayfish. The single round assay was fully specific against all DNA tested. In the semi-nested assay, cross-reaction was
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования