We describe here a multiplexed protein quantitation strategy that provides relative and absolute measurements of proteins in complex mixtures. At the core of this methodology is a multiplexed set of isobaric reagents that yield amine-derivatized peptides. The derivatized peptides are indistinguishable in MS, but exhibit intense low-mass MS/MS signature ions that support quantitation. In this study, we have examined the global protein expression of a wild-type yeast strain and the isogenic upf1Delta and xrn1Delta mutant strains that are defective in the nonsense-mediated mRNA decay and the gene
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human XPA and XRCC1 DNA repair proteins have been expressed in a series of novel yeast episomal vectors. Expression of XPA cDNA resulted in synthesis of anti-XPA crossreacting polypeptides of 40 and 42 kDa, the status of the native protein found in human cells. Likewise, the majority of the recombinant XRCC1 found in the yeast intracellular fraction corresponded to the molecular mass of the full-length human protein. Recombinant XPA protein expressed as an NH(2)-terminal polyhistidine fusion could be affinity purified using Ni(2+) agarose.
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purine-cytosine permease is a carrier localized in the plasma membrane of the yeast Saccharomyces cerevisiae. The energetics of cytosine transport catalyzed by this permease has been studied in an artificial system obtained by fusion between proteoliposomes containing beef heart cytochrome c oxidase and plasma membrane-enriched fractions of a S. cerevisiae strain overexpressing the permease. Upon addition of an energy donor, a proton-motive force (inside alkaline and negative) is created in this system and promotes cytosine accumulation. By using different phospholipids, it is shown that c…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphomannose isomerase (PMI) from Saccharomyces cerevisiae is a zinc-dependent metalloenzyme. Besides its role in catalysis, zinc is also a potent inhibitor of the enzyme. The inhibition is competitive with the substrate mannose 6-phosphate, with Kis = 6.4 microM in 50 mM Tris-HCl buffer, pH 8.0, at 37 degrees C. This inhibition constant is 4 orders of magnitude smaller than for group II divalent cations, indicating that the binding is not primarily electrostatic. Micromolar inhibition is also observed with ions of the other metals of the electronic configuration d10. Under identical conditi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The isolation and biochemical properties of a Saccharomyces cerevisiae mutant (acc1-167) defective in acetyl-CoA carboxylase [acetyl-CoA:carbon-dioxide ligase (ADP forming), EC 6.4.1.2] activity are described. The mutant is deficient in de novo biosynthesis of long-chain fatty acids and specifically requires a saturated fatty acid of chain length 14-16 C atoms for growth. Fatty acid synthetase levels were normal, but the acetyl-CoA carboxylase specific activity of the purified enzyme was reduced to approximately 5% compared to wild-type yeast. Upon sodium dodecyl sulfate/polyacrylamide gel ele…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1) An isolation and purification procedure is reported for an active cytochrome b-c1 complex from Saccharomyces cerevisiae. The complex acts as an antimycin A-sensitive duroquinone-cytochrome c reductase and contains cytochromes b and c1 at a concentration of 8 nmol/mg protein and non-heme iron at a concentration of 15 nmol/mg protein. 2) Difference spectra at room temperature and at 70 degrees K show that the preparation is free from contamination with cytochromes c or aa3. Assays of enzyme activity indicate the absence of any of the other catalytic functions normally associated with the mito…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peroxisomes are eukaryotic organelles primarily known for their conserved roles in fatty acid β-oxidation and hydrogen peroxide detoxification. These organelles are also involved in a diverse range of other metabolic and non-metabolic functions. We recently compared the transcriptome and proteome of Saccharomyces cerevisiae wild-type and peroxisome-deficient (pex3) cells. This study uncovered the major processes and metabolic pathways that are influenced by peroxisomes. Here we performed a mass spectrometry-based analysis of intracellular metabolites of the same two strains. This led to the id…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic regulation plays a central role in metabolic gene expression in eukaryotes. Focusing on Saccharomyces cerevisiae as a model, this review systematically examines how histone modifications, including acetylation, methylation, phosphorylation, ubiquitination, and SUMOylation, and ATP‑dependent chromatin remodeling regulate metabolic genes. It also summarizes the crosstalk between metabolic signals and epigenetic states. On this basis, practical progress, advantages, and limitations of applying these mechanisms in metabolic engineering are then discussed, including industrial strain opt…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clostridioides difficile infection (CDI) is a major cause of antibiotic-associated diarrhea and colitis, driven by toxin-mediated epithelial injury and inflammation. While antibiotics such as vancomycin remain the primary treatment, they can further disrupt the gut microbiota and promote recurrence. Probiotics, including yeast strains, have emerged as potential adjunctive therapies for mitigating CDI. In this study, several Saccharomyces cerevisiae strains were evaluated for their probiotic potential, and strain 48338 was identified as the most promising candidate based on its gastrointestinal…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The skin serves as a vital barrier against environmental and biological stressors, and its impairment leads to premature aging and various dermatological disorders. The growing demand for natural, sustainable cosmetic ingredients has drawn attention to food industry byproducts as potential bioactive sources. Production of distilled soju generates substantial byproducts that are typically discarded but possess valuable metabolites. This study investigated the skin health-related functions of distilled soju byproducts fermented with the Saccharomyces cerevisiae MGE 3400 as a starter culture, whi…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inactivated non-Saccharomyces yeasts offer a promising way to exploit their unique metabolic features, already valued in their active state for bioprotection or bioacidification in winemaking. Producing efficient yeast derivatives at industrial scale requires precise characterization, for which metabolomics provides a powerful analytical framework. This study investigates how biomass nutrition and inactivation by high-pressure or heat affected the composition and antioxidant capacity of derivatives prepared from three non-Saccharomyces strains. Although strain specificity remained the dominant…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dormant microbial spores provide one of the clearest and most extreme examples of how cells can pause life for extended periods and then reliably restart it. Although bacterial and fungal spores are often grouped under "dormancy," the physical strategies by which they suspend and resume life differ fundamentally. Here, I compare two canonical systems-Bacillus subtilis endospores and Saccharomyces cerevisiae ascospores-using a dynamical-systems framework from a physicist's perspective. I propose that dormancy is not simply "low metabolism," but a dynamical reconfiguration that decouples local m…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The yeast prion [PSI+] is a self-propagating amyloid of the translation termination factor Sup35p (eRF3). Among 79 ribosomal proteins in Saccharomyces cerevisiae, through a genetic screen for novel anti-prion factors, we identified RPL24B, a 60S ribosomal subunit protein, as a key determinant of prion generation. Our findings revealed that the functional distinction between the ribosomal paralogs RPL24A and RPL24B is the primary driver of ribosomal heterogeneity-based anti-prion generation. Heterogeneity establishes a critical genetic checkpoint that strictly regulates the emergence and herita…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the effects of acetic acid (AA) on the central carbon metabolism of S. cerevisiae ATCC 9804 and ATCC 13,007 under aerobic or static cultivation at pH 3.0. 10 mM AA caused only minor physiological changes, whereas 20 mM AA stimulated respiratory activity, increasing oxygen consumption up to 3.0-fold. In contrast, 50 mM AA markedly impaired metabolism, reducing biomass formation ∼ 110.0-fold under static cultivation, decreasing CO₂ production ∼ 250-fold, and suppressing glucose utilization and ethanol production. ATCC 9804 maintained higher respiratory capacity, acetate u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Optimization of microbial production by synthetic biology is essential for industrial and sustainable biotechnology applications. β-carotene is a high-value compound that can be heterologously produced in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae, providing an alternative to natural extraction. In this study, we aimed to enhance β-carotene production by machine learning-guided combinatorial strain engineering and transcriptomic analyses. We fine-tuned the expression of rate-limiting enzymes in the mevalonate (MVA) pathway through combinatorial engineering of promoters and terminators. XGBoost…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To assess the efficacy of Saccharomyces boulardii combined with minocycline quadruple therapy in treating patients with Helicobacter pylori (Hp) infection. Data from patients who underwent initial eradication treatment for Hp infection were retrospectively collected from Zhongda Hospital of Southeast University, Liangjiang Hospital of Southeast University, and the Second Affiliated Hospital of Zhejiang University School of Medicine from January 1, 2023 to April 30, 2024. The patients were divided into two groups according to the sterilization regimen: bismuth quadruple group (combined applicat…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xylose, the second most abundant sugar in nature, has garnered increasing attention as a promising carbon source for microbial fermentation in recent years. However, the unpredictable and inefficient metabolism of xylose in Saccharomyces cerevisiae has limited its practical application. In this study, we developed a xylotrophic strain through strategic integration of the xylose isomerase pathway, increasing xylose isomerase activity and identifying optimal transporters. Characterization of the modified strain demonstrated an 11.84-fold increase in ATP content under xylose conditions compared t…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Global bioethanol production exceeds 110 billion liters annually, yet its expansion remains constrained by the limited range of carbon sources fermentable by Saccharomyces cerevisiae. Glycerol-a major byproduct of biodiesel production-has recently gained attention as both a biomass pretreatment solvent and a fermentable substrate in emerging integrated biorefineries. However, native S. cerevisiae cannot efficiently ferment glycerol, xylose, or acetic acid, and no single engineered strain has previously demonstrated co-fermentation of all these substrates with glucose. In this study, we expande…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The process of selecting indigenous Saccharomyces cerevisiae strains as a starter culture for specific fermentation has several requisites, including the assessment of distinct parameters based on desirable and traditional enological criteria. In most wineries, commercial S. cerevisiae strains are used for wine fermentation. However, it is rare to find indigenous S. cerevisiae strains used in wine production, even though these isolates are better adapted to specific regions and are often preferred for producing local fruit wines. Here, the identification and characterization of indigenous S. c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melatonin synthesis by yeast has been described on several occasions, mainly in a fermentative context. However, the genetic determinants involved in its synthesis remain undefined. Understanding melatonin synthesis in yeast is important because it can provide insights into the broader mechanisms of indolamine production, which has implications for both basic biological research and industrial applications. Although two genes with N-acetyltransferase (NAT) activity (PAA1 and HPA2) have been identified in Saccharomyces cerevisiae, these genes do not seem to be major contributors to the producti…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования