Increased expression of cyclin D1 is notoriously associated with mantle cell lymphoma because of translocation t(11;14)(q13;q32) or variants involving the cyclin D1 gene. We present an unusual case of CD5-negative diffuse large B-cell lymphoma expressing cyclin D1 in the absence of translocation by fluorescence in situ hybridization analysis. Using array-comparative genomic hybridization, we found a complex karyotype without the characteristic chromosomal aberrations accompanying cyclin D1 translocation in mantle cell lymphoma; instead, there was monoallelic deletion of AKT interacting protein
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diclofenac is a widely used analgesic drug that can cause serious adverse drug reactions. We used Saccharomyces cerevisiae as a model eukaryote with which to elucidate the molecular mechanisms of diclofenac toxicity and resistance. Although most yeast cells died during the initial diclofenac treatment, some survived and started growing again. Microarray analysis of the adapted cells identified three major processes involved in diclofenac detoxification and tolerance. In particular, pleiotropic drug resistance (PDR) genes and genes under the control of Rlm1p, a transcription factor in the prote…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The glutamate dehydrogenase RocG of Bacillus subtilis is a bifunctional protein with both enzymatic and regulatory functions. Here we show that the rocG null mutant is sensitive to β-lactams, including cefuroxime (CEF), and to fosfomycin but that resistant mutants arise due to gain-of-function mutations in gudB, which encodes an otherwise inactive glutamate dehydrogenase. In the presence of CEF, ΔrocG ΔgudB mutant cells exhibit growth arrest when they reach mid-exponential phase. Using microarray-based transcriptional profiling, we found that the σ(W) regulon was downregulated in the ΔrocG Δgu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive infection with Entamoeba histolytica causes intestinal and hepatic amoebiasis. In liver, parasites cross the endothelial barrier before abscess formation in the parenchyma. We focussed on amoebae interactions with human hepatic endothelial cells, the latter potentially playing a dual role in the infection process: as a barrier and as modulators of host defence responses. We characterized early responses of a human liver sinusoidal endothelial cell line to virulent and virulence-attenuated E. histolytica. Within the first minutes human cells start to retract, enter into apoptosis and d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Newcastle disease virus (NDV) is an avian paramyxovirus that causes significant economic losses to the poultry industry worldwide. There is limited knowledge about the avian immune response to infection with virulent NDVs, and how this response may contribute to disease. In this study, pathogenesis and the transcriptional host response of chickens to a virulent NDV strain that rapidly causes 100% mortality was characterized. Using microarrays, a strong transcriptional host response was observed in spleens at early times after infection with the induction of groups of genes involved in innate a
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Chemokines coordinate leukocyte trafficking in homeostasis and during immune responses. Prior studies of their role in arthritis have used animal models with both an initial adaptive immune response and an inflammatory effector phase. We undertook analysis of chemokines and their receptors in the effector phase of arthritis using the K/BxN mouse serum-transfer model.
METHODS: A time-course microarray analysis of serum-transferred arthritis was performed, examining ankle tissue, synovial fluid, and peripheral blood leukocytes. Up-regulation of chemokines was confirmed by quantitativ…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput cell-based screens of genome-size collections of cDNAs and siRNAs have become a powerful tool to annotate the mammalian genome, enabling the discovery of novel genes associated with normal cellular processes and pathogenic states, and the unravelling of genetic networks and signaling pathways in a systems biology approach. However, the capital expenses and the cost of reagents necessary to perform such large screens have limited application of this technology. Efforts to miniaturize the screening process have centered on the development of cellular microarrays created on micros
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Because relevant biochemical changes are known to begin at the choriodecidual interface some weeks before actual clinical onset of labor, we hypothesized that the preterm choriodecidua may display gene and protein expression patterns specific to preterm labor. Transcriptomic (microarray) and proteomic (2-dimensional gel electrophoresis [2DGE]) profiling methodologies were used to compare changes in choriodecidual tissue collected from women who delivered before 35 weeks of gestation following spontaneous preterm labor (n = 12) and gestation-matched nonlaboring controls (n = 7). Additionally, 2
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian carcinogenesis, as in most cancers, involves multiple genetic alterations. A great deal has been learned about proteins and pathways important in the early stages of malignant transformation and metastasis, as derived from studies of individual tumors, microarray data, animal models, and inherited disorders that confer susceptibility. However, a full understanding of the earliest recognizable events in epithelial ovarian carcinogenesis is limited by the lack of a well-defined premalignant state common to all ovarian subtypes and by the paucity of data from early-stage cancers. Evidence
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: In mammals, endogenous, noncoding RNAs, designated as microRNAs (miRNAs), inhibit the translation of a target messenger RNA, thereby silencing protein production. MiRNAs have been shown to regulate many aspects of development and differentiation in a wide range of tissues. Surprisingly, little consideration has been directed towards characterizing the expression of miRNAs in mammalian ocular tissues.
METHODS: Low molecular weight (LMW) RNA isolated from the adult mouse corneal epithelium, lens/ciliary body, and a retina fractions of the eye was analyzed by miRNA arrays. The validity
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, we used a panel prokaryote/eukaryote K+ channel chimeras to generate K+ channel arrays. Their behaviour in solution was compared with that when spotted on a nitrocellulose-supported film and their responses to selective high affinity ligands, including polypeptide toxins and TEA, were studied.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Suture placement and alkali burn to the cornea are often used to induce inflammatory corneal neovascularization (CorNV) models in animals. This study compares the changes in genome-wide gene expression under these two CorNV conditions in mice.
METHODS: CorNV were induced in Balb/c mice by three interrupted 10-0 sutures placed at sites about 1 mm from the corneal apex, or by alkali burns that were 2 mm in size in the central area of the cornea. At the points in time when neovascularization progressed most quickly, some eyeballs were subjected to histological staining to examine CorNV
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sensitive and multiplexed RNA analysis at the single-molecule level remains a key challenge in molecular diagnostics. Conventional fluorescence microarrays provide high throughput but lack molecular resolution, whereas single-molecule sensors such as nanopores offer exquisite precision but limited scalability. Here, we present a DNA carrier-based nanoarray that integrates programmable nucleic acid hybridization with solid-state nanopore readout for direct, multiplexed RNA detection. Each modular DNA carrier is pre-assembled with spatially defined probe sites that sequence-specifically capture
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neisseria gonorrhoeae is a major sexually transmitted pathogen with rising antimicrobial resistance. Epidemiological studies suggest meningococcal outer membrane vesicle (OMV) vaccines, eg 4CMenB (Bexsero), offer partial cross-protection, but immune correlates remain undefined.
METHODS: Using a murine genital tract infection model, we compared systemic and mucosal responses after immunization with Bexsero, gonococcal OMVs (Ng OMVs) with alum, or alum alone. Vaccinated mice were challenged intravaginally with N. gonorrhoeae. Serum bactericidal activity (SBA) was measured, and antig
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylmercury (MeHg) is a well-known environmental neurotoxicant that preferentially affects sensory neurons in the peripheral nervous syste … neurons (NF, TrkA, FAM19A1, TAC1, SST) decreased at Day 14 and gradually recovered thereafter. DNA microarray analysis at Day 14 revealed a broad downregulation of DRG neuronal subtype marker genes. The mercury concentration in the DRG peaked at Day 14 and declined to the control level by Day 70, with in situ imaging confirming preferential accumulation in DRG neuro …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA microarrays provide informative data for transcriptional profiling and identifying gene expression signatures to help prevent progression of latent tuberculosis infection (LTBI) to active disease. However, constructing a prognostic model for distinguishing LTBI from active tuberculosis (ATB) is very challenging due to the noisy nature of data and lack of a generally stable analysis approach.
METHODS: In the present study, we proposed an accurate predictive model with the help of data fusion at the decision level. In this regard, results of filter feature selection and wrapper
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons2017eng
The authors conducted a prospective trial to assess the feasibility of real time central molecular assessment of kidney transplant biopsy samples from 10 North American or European centers. Biopsy samples taken 1 day to 34 years posttransplantation were stabilized in RNAlater, sent via courier overnight at ambient temperature to the central laboratory, and processed (29 h workflow) using microarrays to assess T cell- and antibody-mediated rejection (TCMR and ABMR, respectively). Of 538 biopsy samples submitted, 519 (96%) were sufficient for microarray analysis (average length, 3 mm). Automated…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene fusions resulting from structural rearrangements are an established mechanism of tumorigenesis in pediatric cancer. In this clinical co … of hematologic and solid tumors in children are characterized by CNAs and gene fusions. Chromosomal microarray analysis is therefore a robust platform to identify diagnostic and prognostic markers in the clinical setting.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) secretes excess of a second messenger molecule, 3',5'-cyclic AMP (cAMP), which plays a critical role in the survival of Mtb in host macrophages. Although Mtb produces cAMP in abundance, its exact role in the physiology of mycobacteria is elusive. In this study we have analyzed the expression of 16 adenylate cyclases (ACs) and kinetics of intracellular cAMP levels in Mtb during in vitro growth under the regular culture conditions, and after exposure to different stress agents. We observed a distinct expression pattern of these ACs which is correlated with intrac
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The hereditary hemorrhagic telangiectasia syndrome (HHT), also known as the Rendu-Osler-Weber syndrome is a multiorganic vascular disorder inherited as an autosomal dominant trait. Diagnostic clinical criteria include: epistaxis, telangiectases in mucocutaneous and gastrointestinal sites, arteriovenous malformations (AVMs) most commonly found in pulmonary, hepatic and cerebral circulations, and familial inheritance. HHT is transmitted in 90% of the cases as an autosomal dominant condition due to mutations in either endoglin (ENG), or activin receptor-like kinase 1 (ACVRL1/ALK1) gen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.