RATIONALE: Virus-induced wheezing episodes in infancy often precede the development of asthma. Whether infections with specific viral pathogens confer differential future asthma risk is incompletely understood.
OBJECTIVES: To define the relationship between specific viral illnesses and early childhood asthma development.
METHODS: A total of 259 children were followed prospectively from birth to 6 years of age. The etiology and timing of specific viral wheezing respiratory illnesses during early childhood were assessed using nasal lavage, culture, and multiplex reverse transcriptase-polymeras
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The level of intra-species genetic variation in Entamoeba histolytica, Entamoeba dispar and Entamoeba moshkovskii populations in a localized geographic area, like Puducherry, India, remains unknown.
METHODS: In the present study the existence of genetic variation in the nested multiplex polymerase chain reaction (NM-PCR) amplified region of the 16S-like ribosomal RNA genes of E. histolytica, E. dispar and E. moshkovskii was investigated by riboprinting and single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis.
RESULTS: We found that 70 stool specimens were positive for E. histo…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/PURPOSE: Early mycosis fungoides (MF) is difficult to distinguish from other benign inflammatory dermatoses. We evaluated clonal T-cell receptor (TCR) gamma gene rearrangement by polymerase chain reaction (PCR) as a surrogate to histologic diagnosis in early MF.
METHODS: Twenty paraffin-embedded skin biopsies from nine patients diagnosed with MF were included. Two multiplex PCR encompassing various Vgamma and Jgamma regions were used to detect TCRgamma gene rearrangements. Histologic diagnoses were categorized as "diagnostic", "consistent", "suggestive", or "nondiagnostic". We comp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genital ulcer disease (GUD) is commonly caused by pathogens for which suitable therapies exist, but clinical and laboratory diagnoses may be problematic. This collaborative project was undertaken to address the need for a rapid, economical, and sensitive approach to the detection and diagnosis of GUD using noninvasive techniques to sample genital ulcers.
METHODS: The genital ulcer disease multiplex polymerase chain reaction (GUMP) was developed as an inhouse nucleic acid amplification technique targeting serious causes of GUD, namely, herpes simplex viruses (HSVs), H. ducreyi, Tre…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To assess the performance of a polymerase chain reaction (PCR) method in cerebrospinal fluid (CSF) for the diagnosis of nervous system infections caused by herpesvirus, and to estimate the incidence of encephalitis due to herpes simplex virus type 1 in the adult population of the island of Gran Canaria.
METHODS: We studied 330 CSF specimens from 312 patients (281 HIV-negative and 31 HIV-positive) remitted to investigate clinically suspected encephalitis or meningitis, or to study neuropathy or demyelinating disease. A multiplex PCR technique was used to detect herpes simplex virus
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To compare the mRNA levels of transforming growth factor beta (TGF-beta) isoforms 1, 2, and 3 among surgically injured peritoneum that healed with adhesions, surgically injured peritoneum that healed without adhesions, and uninjured peritoneum.
DESIGN: Prospective experimental study.
SETTING: University vivarium.
ANIMAL(S): Fourteen sexually mature female Sprague-Dawley rats, 226-250 grams.
INTERVENTION(S): Standardized cecal abrasion was performed on 120 Sprague-Dawley rats. The areas of abrasion and any resultant adhesions were harvested at necropsy 7 days later. Total RNA was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Overexpression and accumulation of extracellular matrix is central to peritoneal adhesion formation following surgically induced tissue trauma. Transforming growth factor-beta1 and hypoxia have been implicated in tissue fibrosis and postoperative adhesion formation. To extend this observation we examined whether transforming growth factor-beta1 and/or hypoxia regulate the expression of type I and III collagen in human peritoneal mesothelial cells. Cultured human mesothelial cells were maintained under hypoxia (2% oxygen), or treated with transforming growth factor-beta1 (1 ng/ml) or a combinat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Familial isolated hypoparathyroidism (FIH) is an inherited metabolic disorder characterized by hypocalcemia and hyperphosphatemia due to deficient secretion of biologically active PTH. We used denaturing gradient gel electrophoresis to screen for mutations in exon 1 and the coding region of the preproPTH gene. Exons 1, 2, and 3 of the preproPTH gene and flanking intronic regions were amplified by polymerase chain reaction using primers that were designed employing the MELT-MAP program. One oligonucleotide from each primer pair was synthesized with a 5'-GC-clamp. Screening of amplified DNA from
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Distinguishing between follicular lymphoma (FL) and nodal marginal zone lymphoma (NMZL) can be difficult when morphologic and phenotypic features are unusual and characteristic cytogenetic rearrangements are absent. We evaluated the diagnostic contribution of ancillary techniques-including fluorescence in situ hybridization (FISH)-detected 1p36 deletion; reverse-transcriptase, multiplex, ligation-dependent probe amplification (RT-MLPA); and next-generation sequencing (NGS)-for tumors that remain unclassified according to standard criteria. After review, 50 CD5-negative small B-cell lymphoid ne
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) is a major causative agent of severe infections, including sepsis, pneumonia, meningitis, and otitis media, and has become a major public health concern. We report the pneumococcal serotype and sequence type (ST) distribution, and antimicrobial resistance of 39 S. pneumoniae strains from seven hospitals in China.
METHODS: Blood/cerebrospinal fluid (CSF) and sputum isolates from patients were analyzed to determine S. pneumoniae serotypes by polymerase chain reaction (PCR) and the Neufeld Quellung reaction, the multilocus sequence types (MLST
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Conventional blood culture is the gold standard for pathogen identification for patients with sepsis, but its lengthy turnaround time-encompassing initial bottle incubation and subsequent phenotypic testing-may delay appropriate therapy. The multiplex PCR-based BIOFIRE Blood Culture Identification 2 (BCID2) panel enables earlier pathogen identification and improves patient outcomes. This study aimed to assess the impact of implementing the BCID2 panel versus conventional culture methods on clinical and microbiological outcomes in hospitalized pediatric patients. This case-control c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction. Gastrointestinal infections remain a leading cause of morbidity and mortality within the UK.Hypothesis. The Luminex® NxTAG® Gastrointestinal Pathogen Panel (NxTAG GPP) multiplex reverse transcriptase PCR assay performs equivalently to standard-of-care diagnostic approaches.Aim. To compare the analytical performance of the NxTAG GPP assay versus routine diagnostic testing methods in a district general hospital setting.Methodology. Gastrointestinal pathogens in 159 faecal specimens from hospital inpatients and outpatient clinics were comparatively analysed using the NxTAG GPP assay
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Molecular diagnosis of respiratory infections has made great progress following the advent of multiplex diagnostic methods allowing simultaneous detection of several targets at the same time.
METHODS: In this prospective study, a comparison of two respiratory multiplex diagnostic kits used in our laboratory was performed on samples of patients hospitalized for severe acute respiratory infection during 2023 - 2024: FilmArray® Respiratory Panel 2.1 plus and Xpert® Xpress SARS-CoV-2/Flu/RSV.
RESULTS: The results showed excellent agreement between the two tests, with a coefficient of
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The FilmArray Respiratory Panel RP 2.1 plus (FilmArray RP) is a point-of-care syndromic panel for respiratory pathogens. Although highly valuable in the clinical settings, the co-detection of pathogens in FilmArray RP may confound result interpretation.
METHODS: Nasopharyngeal swab specimens collected from patients with respiratory symptoms were analyzed by comparing co-detection results from FilmArray RP with those of Allplex Respiratory Panels (Allplex RP: Power-Chek for SARS-CoV-2).
RESULTS: Out of 765 FilmArray RP tests, 143 (18.7%) showed co-detections (two: 122 (85.3%), thr
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1), a retrovirus, integrates into host DNA and causes adult T-cell leukemia/lymphoma (ATL) in some individuals. Two types of defective proviruses, Type 1 and Type 2, are often observed in ATL cells. Here, we developed a 3-plex digital PCR (dPCR) method to detect HTLV-1 proviral deletions by comparing the ratios of copy numbers quantified using specific primer-probes for the LTR, pol, and pX regions. We analyzed HTLV-1-positive asymptomatic carriers (ACs) and AC samples at high risk for developing ATL due to high proviral load (ATL high-risk (HR) ACs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moderate to hyper-expansion of trinucleotide repeats at the FRAXA and FRAXE fragile sites, with or without concurrent hypermethylation, has been associated with intellectual disability and other conditions. Unlike molecular diagnosis of FMR1 CGG repeat expansions in FRAXA, current detection of AFF2 CCG repeat expansions in FRAXE relies on low-throughput and otherwise inefficient techniques combining Southern blot analysis and PCR. A novel triplet-primed PCR assay was developed for simultaneous screening for trinucleotide repeat expansions at the FRAXA and FRAXE fragile sites, and was validated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aneuploidy occurs within a significant proportion of childhood B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). Some copy number variations (CNV), associated with novel subtypes of childhood B-ALL, have prognostic significance. A total of 233 childhood B-ALL patients were enrolled into this study. Focal copy number alterations of ERG, IKZF1, PAX5, ETV6, RB1, BTG1, EBF1, CDKN2A/2B, and the Xp22.33/Yp11.31 region were assessed by Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA). The MLPA telomere kit was used to identify aneuploidy through detection of whole chromosome loss or gain. We carrie
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although the incidence of tuberculosis (TB) is decreasing, cases of multidrug-resistant (MDR) TB and extensively drug-resistant (XDR) TB continue to increase. As conventional phenotype drug susceptibility testing (pDST) takes six to eight weeks, molecular assays are widely used to determine drug resistance. we developed QuantaMatrix Multiplexed Assay Platform (QMAP) MDR/XDR assay (QuantaMatrix Inc., Seoul, Korea) that can simultaneously detect mutations related to both first- and second-line drug resistance (rifampin, isoniazid, ethambutol, fluoroquinolones, second-line injectable
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infectious meningitis is a serious disease and patient outcome relies on fast and reliable diagnostics. A syndromic panel testing approach like the FilmArray ME can accelerate diagnosis and therefore decrease the time to pathogen specific therapy. Yet, its clinical utility is controversial, mainly because of a remaining uncertainty in correct interpretation of results, limited data on its performance on clinical specimens and its relatively high costs. The aim of this study was to analyze clinical performance of the assay in a real life setting at a tertiary university hospital usi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Respiratory viruses, such as influenza viruses, initially infect the upper airways but can manifest as severe lower respiratory tract infections in high-risk patients with significant morbidity and mortality. For syndromic diagnosis, several multiplex nucleic acid amplification tests have been developed for clinics, of which SureX 13 Respiratory Pathogen Multiplex Kit (ResP) can simultaneously detect 13 pathogens directly from airway secretion specimens. The organisms identified are influenza virus A, influenza virus A pdmH1N1 (2009), influenza virus A H3N2, influenza virus B, aden
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.