Aim: Impaired methylation of the mitochondrial DNA and particularly in the regulatory displacement loop (D-loop) region, is increasingly observed in patients with neurodegenerative disorders. The present study aims to investigate if common polymorphisms of genes required for one-carbon metabolism (MTHFR, MTRR, MTR and RFC-1) and DNA methylation reactions (DNMT1, DNMT3A and DNMT3B) influence D-loop methylation levels. Materials & methods: D-loop methylation data were available from 133 late-onset Alzheimer's disease patients and 130 matched controls. Genotyping was performed with PCR-RFLP or hi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: To investigate the associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) in miRNA regulome and nonsyndromic orofacial clefts. Materials & methods: The associations were evaluated by logistic regression model in stage I (504 cases and 455 controls) and stage II (1500 cases and 1386 controls). Functional experiments including luciferase activity assay, cell apoptosis and proliferation, serum miRNA expression, and mouse embryo RNA sequencing were performed. Results: Rs3830766 in the enhancer of hsa-miR-4260 was associated with cleft lip only (CLO) and enhancer activity. Hsa-miR-4260 ex
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: First-degree relatives (FDR) of individuals with Type 2 diabetes (T2D) feature restricted adipogenesis, which render them more vulnerable to T2D. Epigenetics may contribute to these abnormalities. Methods: FDR pre-adipocyte Methylome and Transcriptome were investigated by MeDIP- and RNA-Seq, respectively. Results:Methylome analysis revealed 2841 differentially methylated regions (DMR) in FDR. Most DMR localized into gene-body and were hypomethylated. The strongest hypomethylation signal was identified in an intronic-DMR at the PTPRD gene. PTPRD hypomethylation in FDR was confirmed by bisu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methamphetamine (MA), a psychostimulant, has become a serious problem in recent years. It is one of the most widely abused psychostimulants in the world. In the Czech Republic, ecstasy is the most commonly used non-cannabis drug, followed by hallucinogenic fungi, LSD, MA, cocaine, and finally heroin. The prevalence of the usage of all addictive substances is highest in the age category of 15-34. Approximately 17.2% of registered drug addicts, both male and female, in the Czech Republic use MA as their first-choice drug. This group consists mostly of women who are unemployed and addicted to MA
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the pathophysiologic setting of acute and chronic kidney injury, the excessive activation and recruitment of blood-borne monocytes prompts their differentiation into inflammatory macrophages, a process that leads to progressive glomerulosclerosis and interstitial fibrosis. Importantly, this differentiation of monocytes into macrophages requires the meticulous coordination of gene expression at both the transcriptional and post-transcriptional level. The transcriptomes of these cells are ultimately determined by RNA-binding proteins such as QUAKING (QKI), that define their pre-mRNA splicing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aims: To identify the clinical roles of CLDN10 in clear cell renal cell carcinoma (ccRCC). Materials & methods: Using data from TCGA-KIRC, GEO DataSets and laboratory experiments to determine the prognostic and clinicopathological characteristics of CLDN10. Results: CLDN10 expression was remarkably reduced in ccRCC. Downregulated CLDN10 was related to metastasis and poor prognosis. Multivariate Cox analysis determined that elevated CLDN10 expression was independently correlated with longer OS and DFS. Moreover, CLDN10 expression was negatively associated with the methylation levels of cg103053
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
After the increasing number of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infections all over the world, researchers and clinicians are struggling to find a vaccine or innovative therapeutic strategies to treat this viral infection. The severe acute respiratory syndrome coronavirus infection that occurred in 2002, Middle East respiratory syndrome (MERS) and other more common infectious diseases such as hepatitis C virus, led to the discovery of many RNA-based drugs. Among them, siRNAs and antisense locked nucleic acids have been demonstrated to have effective antiviral effect
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: We aimed to understand the individual and shared features of Type 1 diabetes (T1D) and Type 2 diabetes (T2D) by analyzing the gene expression profile. Materials & methods: An integrated analysis was performed with microarray datasets for T1D and T2D. Compared with normal control, shared and specific differentially expressed genes (DEGs) in T1D and T2D were obtained. Functional annotation, further validation and receiver operating characteristic curve analysis were performed. Results: Five and three datasets for T1D and T2D were downloaded, respectively. In total, 141 (85 T1D vs 56 normal
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: We aim to identify differentially expressed long noncoding RNAs (lncRNAs) and explored their functional roles in stomach adenocarcinoma. Materials & methods: Based on public omics data, we identified disregulated lncRNAs and investigated their prognostic values and potential functions based on ceRNA hypothesis. Results: Among the 52 differentially expressed lncRNAs, upregulated RP11-169F17.1 and RP11-669N7.2 were significantly associated with both poor overall survival and disease-free survival. RP11-169F17.1 and RP11-669N7.2 strongly correlated with microRNAs in cancer, cell proliferatio
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tumor microenvironment (TME) plays a central role in tumor development and drug resistance. Within TME, the stromal cell subset, called cancer-associated fibroblasts, is a heterogeneous population originating from poorly characterized precursors. Since cancer-associated fibroblasts do not acquire somatic mutations, other mechanisms like epigenetic regulation, could be involved in the development of these cells and in the acquisition of tumor supportive phenotypes. Moreover, such epigenetic modulations have been correlated to the emergence of an immunosuppressive microenvironment facilitati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: This study was carried out to identify the expression profile and role of circRNAs in cisplatin-induced acute kidney injury (AKI). Materials & methods: In this study, an AKI model was established in cisplatin-treated mice, and the expression of circRNAs was profiled by next-generation sequencing. The differential expression levels of selected circRNAs were determined by quantitative real-time polymerase chain reaction. Bioinformatics analysis was conducted to predict the functions. Results: In total, 368 circRNAs were detected to be differentially expressed in response to cisplatin treatm
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: To investigate DNA methylation changes in placenta tissues associated with small for gestational age (SGA). Materials & methods: A prospective cohort study consisting of 1292 pregnant women from China (including 39 SGA with placenta tissues) was performed, microarray and pyrosequencing were conducted. Results: Total 2012 methylation variable positions stood out from all probes (p < 0.05; Δβ > 0.2). In SGA cases, a CpG site within ANKRD20B showed lower methylation level (p = 0.032) than appropriate for gestational age in validation cohort. Five sites within FAM198A (p = 0.047, 0.050, 0.039
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: This study was aimed to understand if Zika virus (ZIKV) alters the DNA methylome of human neural progenitor cells (hNPCs). Materials & methods: Whole genome DNA methylation profiling was performed using human methylationEPIC array in control and ZIKV infected hNPCs. Results & conclusion: ZIKV infection altered the DNA methylation of several genes such as WWTR1 (TAZ) and RASSF1 of Hippo signaling pathway which regulates organ size during brain development, and decreased the expression of several centrosomal-related microcephaly genes, and genes involved in stemness and differentiation in h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: To assess cartilage-derived stem/progenitor cells (CSPCs) in osteoarthritis (OA) by employing mRNA-miRNA-circRNA-lncRNA network biology approach. Methods: Differentially expressed (DE) RNAs in CSPCs from 2-/4-/8-month-old STR/Ort and CBA mice were identified to construct networks via RNA sequencing. Results: Compared with age-matched CBA mice, 4-/8-month-old STR/Ort mice had cartilage lesions and their CSPCs exhibited lower proliferative and differentiation capacity (decreased CD44 and CD90), and identified 7082 DE RNAs in STR/Ort mice were associated with strain differences or OA progres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To investigate the effects of m6A-single nucleotide polymorphisms (SNPs) on coronary artery disease (CAD).
METHODS: We examined the association of m6A-SNPs with CAD in about 185,000 cases and controls and further performed eQTL and differential expression analyses to support the identified m6A-SNPs.
RESULTS: Among the 4390 m6A-SNPs detected, 304 seemed to be associated with CAD (p < 0.05). SNP rs12286 was significantly associated with CAD at genome-wide level (p = 4.5 × 10-9). rs12286 was predicted to influence m6A methylation and have the potential to alter regulatory motifs binding, w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Investigate associations of leisure time physical activity (LTPA) with DNA methylation and miRNAs during pregnancy. Patients & methods: LTPA, candidate DNA methylation and circulating miRNAs were measured (average 15 weeks gestation) in pregnant women (n = 92).
RESULTS: Each additional hour of prepregnancy LTPA duration was associated with hypermethylation in C1orf212 (β = 0.137, 95% CI: 0.004-0.270) and higher circulating miR-146b-5p (β = 0.084, 95% CI: 0.017-0.151). Each additional metabolic equivalent hour of early-pregnancy LTPA energy expenditure was associated with higher circulati
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: We examined methylation patterns with aggressive tumor phenotypes and investigated demographic, socioeconomic and reproductive predictors of gene methylation.
MATERIALS & METHODS: Pyrosequencing quantified methylation of BRCA1, EGFR, GSTM2, RASSF1, TFF1 and Sat 2. We used quantile regression models to calculate adjusted median methylation values by estrogen and progesterone receptor (ER/PR) status. Bivariate associations between participant characteristics and methylation were examined.
RESULTS: Higher percent methylation of GSTM2 was observed in ER/PR-negative compared with ER/PR-posit
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Long noncoding RNAs serve critical regulatory functions highly specific for a tissue and its developmental stage. Antisense long ncRNA (AS-lncRNA) methylation changes in acute lymphoblastic leukemia (ALL) versus normal pre-B-cell lymphoblasts were evaluated to identify potential differential methylation in this group of genes.
MATERIALS & METHODS: The methylome of ALL and normal lymphoblasts was examined by the methylated CpG island recovery assay followed by NGS.
CONCLUSION: The potential effect of trans regulation by AS-lncRNA through DNA/RNA binding is significant as sequence alignme
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Methotrexate (MTX) is administered to treat childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL). It acts by inhibiting dihydrofolate reductase which reduces methyltetrahydrofolate, a key component in one carbon metabolism, thus reducing cell proliferation. Further perturbations to one carbon metabolism, such as reduced vitamin B12 levels via the use of nitrous oxide for sedation during childhood ALL treatment, may increase neurotoxicity risk. With B12 as an enzymatic cofactor, methyltetrahydrofolate is essential to produce methionine, which is critical for DNA methylation. We investigated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic exposure to arsenic has been associated with the development of diabetes mellitus (DM), a disease characterized by hyperglycemia resulting from dysregulation of glucose homeostasis. This review summarizes four major mechanisms by which arsenic induces diabetes, namely inhibition of insulin-dependent glucose uptake, pancreatic β-cell damage, pancreatic β-cell dysfunction and stimulation of liver gluconeogenesis that are supported by both in vivo and in vitro studies. Additionally, the role of polymorphic variants associated with arsenic toxicity and disease susceptibility, as well as ep
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования